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医学样本数据和/或样本数据库的搜索查询处理方法和搜索平台设备技术

技术编号:38635123 阅读:11 留言:0更新日期:2023-08-31 18:31
一种用于处理对包含多个人的医学样本数据和/或样本的数据库的搜索查询的方法,包括以下步骤:向AI处理器装置中输入包含需求概述的搜索查询,旨在找到至少一个包含具有预定的查询搜索参数的样本数据的样本;利用所述AI处理器装置搜索至少一个选定的样本,其中,所述至少一个选定的样本至少以规定的概率满足所述需求概述;以及输出所述至少一个选定的样本的识别数据。还提供了一种搜索平台设备,其被配置用于处理发送给包含多个人的医学样本数据和/或样本的数据库的搜索查询。据和/或样本的数据库的搜索查询。据和/或样本的数据库的搜索查询。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】医学样本数据和/或样本数据库的搜索查询处理方法和搜索平台设备


[0001]本专利技术涉及一种用于处理对数据库的搜索查询的方法和一种搜索平台设备,该数据库包含来自许多人(尤其是患者)的医学样本数据和/或样本。本专利技术尤其是涉及用于构建智能的自动学习平台的应用的方法以及设备,其一方面在数据库(例如实验室、生物库和/或诊所)和其样本数据和/或样本存储在数据库中的人、以及另一方面研究实体(如制药行业和(生物)医学研究机构)之间提供多方向的中介服务。例如在运行包含许多人的样本数据和/或样本的数据库时,和/或在尤其是通过机器学习和/或人工智能(AI)处理搜索查询时,存在本专利技术的许多应用场合。

技术介绍

[0002]在进行调查时,例如出于研究或研学的目的,感兴趣的研究实体(单位),像是例如制药行业的公司和/或(生物)医学研究机构,依赖于来自受试者群体的样本和数据。受试者群体包括针对某些研究具有特定特征(参数)的受试者,像是例如具有某种特定的、共同的疾病状况和/或特定的基因共同点。
[0003]来自潜在适合纳入某个群体的受试者的样本和数据存在于医学实验室设施和/或生物库中。然而迄今为止,对于寻找受试者的实体来说,彻底搜索大量的医学实验室和生物库中所需的数据和患者是非常耗时费力的。此外还存在法律限制:未经授权,实体不得访问或使用个人数据,例如患者的个人数据。
[0004]商业运作的医学实验室和生物库对将其拥有的样本和数据出售给提出查询的研究机构有着浓厚的兴趣。然而,对于某些样本的销售,需要对样本材料进行基因测序,因为只有这样,研究机构才能确定相应样本与自身研究的相关性。然而,完整的基因测序对于各个实验室或生物库来说成本高且耗时。因此,只有当相应的样本也能引起研究的兴趣,进行基因全测序才是值得的。
[0005]因此,人们对一种能够预测的工具感兴趣,该工具可以帮助拥有这些样本和数据的机构确定,哪些样本值得昂贵的测序或其他方式的样本处理。
[0006]众所周知,一些搜索引擎具有特殊的过滤系统,在这些系统的帮助下,公司和研究机构可以找到合适的患者样本,像是例如商业供应商iSPECIMEN。然而,这样的搜索引擎只能使用特殊数据库中的标准化数据,无法做出预测性的结论。提出查询的研究机构只能找到那些已经被提供标志(被标记)并已进行过基因组测序的样本。
[0007]因此,传统的搜索引擎既不能帮助实验室/生物库选择哪些样本可能会引起研究机构的兴趣(尤其是是否值得进行昂贵的基因组测序),也不能为研究机构的查询生成信息,使研究机构更容易进行群体研究,并就哪些样本值得标记向实验室/生物库提供反馈。

技术实现思路

[0008]本专利技术的任务是提供一种用于处理对包含多个人的样本数据和/或样本的数据库
的搜索查询的改进方法和/或提供一种相应的、用来避免传统技术的缺点的搜索平台设备。对数据库的搜索查询进行处理尤其是应该使得能够以更快的速度和/或更少的工作量来识别出令人感兴趣的样本。此外,对数据库的搜索查询的处理还要尤其是能够提供对样本数据和/或样本的加速的和/或简化的访问,和/或保护样本数据和/或样本所属个人的隐私。
[0009]所述任务通过一种用于处理对数据库的搜索查询的方法和一种搜索平台设备得以实现,该方法和该搜索平台设备具有独立权利要求所述的特征。本专利技术的有利实施方式和应用由从属权利要求中得出。
[0010]根据本专利技术的第一个一般方面,通过一种用于处理对包含多个人的医学样本数据和/或样本的数据库的搜索查询的方法来实现上述任务,所述方法执行以下步骤:向AI处理器装置中输入包含需求概述的搜索查询,旨在找到至少一个包含具有预定的查询搜索参数的样本数据的样本;利用所述AI处理器装置搜索至少一个选定的样本,其中,所述至少一个选定的样本满足上述的需求概述;以及输出所述至少一个选定的样本的识别数据。该数据库例如通过医学机构、实验室和/或生物样本的样本库(生物库)提供。上述需求概述优选地至少以规定的概率得到满足,该可能性由AI处理器装置的功能决定。
[0011]根据本专利技术的第二个一般方面,上述任务由一种搜索平台设备得以解决,该搜索平台设备被配置为用于处理对包含多个人的医学样本数据和/或样本的数据库的搜索查询,其中,该搜索平台设备包括输入装置,其被设置用于接收含有需求概述的搜索查询,其旨在找到至少一个包含具有预定的查询搜索参数的样本数据的样本,还包括与输入装置耦合并被配置用于搜索至少一个选定样本的AI处理器装置,其中,所述至少一个选定的样本满足所述需求概述,并且还包括被输出装置,其设置成用于输出所述至少一个选定的样本的识别数据。优选地,所述搜索平台设备或者它的其中一种实施方式被设置用于执行根据本专利技术的第一个一般方面或其实施方式之一的方法。
[0012]本专利技术的技术有利地提供了比传统搜索引擎更多的功能。它是一种具有集成人工智能的、能够自动学习的预测性工具。根据本专利技术的技术例如可以帮助制药行业/(生物)医学研究机构寻找适合研究的患者群体,另一方面还帮助数据库设施(像是例如实验室/生物库)评估,哪些样本值得投入尤其是工作时间和成本进行样本处理、例如进行基因组测序。反之,研究实体又可以通过他们的查询内容对由该平台的、自主学习的人工智能(AI)进行的评估产生直接的影响。
[0013]利用本专利技术,有利地将研究实体的查询内容数字化,并由AI处理器装置处理。所述AI处理器装置包括计算机设备,其被设置用于例如通过至少一个人工神经网络应用基于机器学习的程序。AI处理器装置这个概念在下文中也被称为由计算机设备提供的人工智能。用于构建AI的方法在专利文件WO 2020/233850Al(“人工学习单元的递归耦合”)和WO 2020/235851Al(“多个人工学习单元与投影层级的耦合”)中进行了描述,其中,除了构建由多个AI单元组成的学习系统外,还引入了AI系统对伦理原则/规则的存储和自主应用。
[0014]AI处理器设备通过单独的训练和/或优选地通过对寻址到AI处理器装置的查询的评估和数据库的相对应的识别结果进行学习。
[0015]根据本专利技术的一种优选实施方式,利用所述AI处理器装置搜索一组选定的样本,其中,所有选定的样本至少以规定的概率满足需求概述。所选定的这组样本有利地相对于各种多样的存储数据提供有限数量的样本,这些样本可以针对相应的查询请求被进一步处
理、检查或输出,由此大大简化了运行数据库的工作量。
[0016]根据本专利技术的方法或搜索平台设备优选地满足以下两个功能中的至少一个:
[0017](a)根据研究的相关性自动生成样本的排序;
[0018](b)对研究机构感兴趣的参数(患者的哪些数据与研究相关)进行自动评估(评级)。
[0019]根据第一个功能,优选地将这组选定的样本的识别数据与排序信息(定位信息)一起输出,该排序信息为每个选定的样本分配满足需求概述的命中概率。
[0020]根据第二个功能,优选地输出额外的评级搜索参数,这些参数与搜索查询匹配,使得可以选出一组本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于处理对包含多个人的医学样本数据和/或样本的数据库的搜索查询的方法,包括以下步骤:向AI处理器装置中输入包含需求概述的搜索查询,旨在找到至少一个包含具有预定的查询搜索参数的样本数据的样本,利用所述AI处理器装置搜索至少一个选定的样本,其中,所述至少一个选定的样本至少以规定的概率满足所述需求概述,以及输出所述至少一个选定的样本的识别数据。2.根据权利要求1所述的方法,其中,利用所述AI处理器装置搜索一组选定的样本,其中,所有选定的样本都至少以规定的概率满足所述需求概述。3.根据权利要求2所述的方法,其中,将这组选定的样本的识别数据与排序信息(定位信息)一起输出,所述排序信息为每个选定的样本分配满足需求概述的命中概率。4.根据以上权利要求中任一项所述的方法,包括步骤:输出额外的评级搜索参数,评级搜索参数与搜索查询匹配,使得能够选出一组以更高的命中概率满足需求概述的样本。5.根据权利要求4所述的方法,其中,评级搜索参数包括基因图谱、关于临床治疗的数据、病史、家庭疾病倾向、个人诊断结果、生活方式习惯的特征、饮食习惯、消费行为、运动和锻炼特征、关于吸食药品或其他麻醉品的数据、关于药物摄入的数据、关于辐射暴露的数据、表观遗传学数据、地理信息、年龄、性别、种族、过敏和/或精神疾病。6.根据以上权利要求中任一项所述的方法,其中,所述需求概述旨在找到一组包含样本数据的样本,其中,属于这一组样本的人构成受试者群体。7.根据以上权利要求中任一项所述的方法,其中,所述AI处理器装置处理来自专业文献的信息、来自工业部门的商业市场信息、尤其是关于医药品的信息、和/或来自关于医药品的批准数据库的信息。8.根据以上权利要求中任一项所述的方法,包括以下步骤:利用编码函数将搜索查询转换为分段的搜索查询。9.根据以上权利要求中任一项所述的方法,包括以下步骤:请求相关人员同意使用数据和/或样本。10.根据权利要求9所述的方法,其中,通过使用问卷和/或知情同意书和/或由虚拟化身设备来请求同意。11.根据以上权利要求中任一项所述的方法,包括以下步骤:输出信息,尤其是向其样本数据存储在数据库中的人输出信息,其中,输出的信息涉及医药品、疾病、研究结果和/或行动建议。...

【专利技术属性】
技术研发人员:海科
申请(专利权)人:萨尔大学
类型:发明
国别省市:

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