年龄相关性黄斑变性诊断用生物标记物及其用途制造技术

本发明专利技术涉及一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的标记物组合物、试剂盒、基因套餐、方法。本发明专利技术作为能够提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的新的工具，不仅灵敏度优异，而且无需利用活组织检查而能够简便地进行分析，因此能够有效地用于年龄相关性黄斑变性的早期诊断等。断等。断等。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】年龄相关性黄斑变性诊断用生物标记物及其用途


[0001]本专利技术涉及一种能够预测或诊断年龄相关性黄斑变性的发生的生物标记物及其用途。

技术介绍

[0002]黄斑变性是在黄斑部分发生变性而导致视力障碍的眼球疾病，在发病初期，视野变得模糊，近处的视物变形，最后导致失明。黄斑变性的主要原因为老化，其次为遗传因素，并且，作为环境因素，可以举出紫外线、抽烟、高脂肪和高热量的西化饮食等。
[0003]已知年龄相关性黄斑变性(age
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related macular degeneration，AMD)引起重症的不可逆的视力丧失，是在50岁以上的人群中失明的主要原因。年龄相关性黄斑变性可划分为干性(atrophic)和湿性(exudative)这两种类型，在干性黄斑变性中，废物堆积在黄斑部，可能在早期发生视力变化，但已知是简单地由老化引起的症状。并且，湿性是已进展为重症的形态的黄斑变性，异常血管在黄斑和视网膜下生长，导致渗出物或血液流出，对黄斑产生损伤，破坏健康的细胞，其结果，可能会导致视力丧失。
[0004]一般来说，年龄相关性黄斑变性一旦开始出现视力障碍，很多情况下无法恢复之前的视力，因此早期发现非常重要。通过眼科医生的定期的眼科检查，能够在早期发现，当通过包括眼底检查在内的眼科检查怀疑是年龄相关性黄斑变性时，能够进行眼底荧光素血管造影术、光学相干断层成像等眼科精密检查来确诊。治疗方法中有激光凝固术(photocoagulation)、光动力疗法(photodynamic therapy，PDT)、anti
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VEGF制剂的玻璃体内注射方法。
[0005]这样的年龄相关性黄斑变性初期没有主观症状，很多情况下会被误认为是其他原因所引起，因此很难在初期发现，而且存在为了进行诊断而需要高价设备的问题点。并且，上述的诊断方法非常不方便且存在危险性，因此现状是受试者不愿接受这样的诊断方法。因此，要求开发能够简便且迅速地诊断出年龄相关性黄斑变性的发病可能性或其与否的检查方法。
[0006]另一方面，克隆性造血(CH)被定义为在白血病相关基因中携带体细胞突变的克隆衍生的造血干细胞(HSC)的扩增，其能够通过第二代测序(NGS)来检测出(参考文献[Genovese G，Kahler AK，Handsaker RE，et al:Clonal hematopoiesis and blood
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cancer risk inferred from blood DNA sequence。N Engl J Med 371:2477
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87，2014]；文献[Park SJ，Bejar R:Clonal hematopoiesis in cancer。Exp Hematol 83:105
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112，2020]；及文献[Jaiswal S，Ebert BL:Clonal hematopoiesis in human aging and disease。Science366，2019])。已报道CH的产生与老化有相关性，并且与心血管疾病及血液恶性肿瘤的发病有很大的相关性。

技术实现思路

[0007]专利技术要解决的技术课题
[0008]本专利技术的目的在于解决上述的以往技术的问题点。
[0009]本专利技术的另一目的在于提供一种年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用生物标记物。
[0010]本专利技术的又一目的在于提供一种年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用组合物、试剂盒或面板。
[0011]本专利技术的又一目的在于提供一种提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的方法。
[0012]用于解决技术课题的手段
[0013]为了实现上述目的，本专利技术人为了确保年龄相关性黄斑变性的早期诊断用生物标记物而进行了研究，其结果，确认到克隆性造血(CH)诱发基因变异的存在为重要的因子，从而完成了本专利技术。
[0014]本专利技术的一方面提供一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的组合物，所述组合物包含能够利用从个体分离出的生物试样来检测出克隆性造血诱发突变的制剂。
[0015]本专利技术的另一方面提供一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的试剂盒，所述试剂盒包含所述组合物。
[0016]本专利技术的又一方面提供一种基因分析用面板，其提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息，所述基因分析用面板包含所述组合物。
[0017]本专利技术的又一方面提供一种提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的方法，所述方法包括如下步骤：通过从个体分离出的生物试样的基因分析来确认在个体中是否存在克隆性造血诱发突变。
[0018]专利技术效果
[0019]基于本专利技术的提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的标记物组合物、试剂盒、面板及方法作为能够诊断或预防或治疗年龄相关性黄斑变性的新的工具，不仅灵敏度优异，而且无需利用活组织检查而能够简便地进行分析，因此尤其能够有效地用于年龄相关性黄斑变性的早期诊断、预防或治疗。
附图说明
[0020]图1是用条形图示出在实施例3.1.1中确认到的显示出VAF1.5％以上的体细胞序列变异的各基因的检测频率的图。
[0021]图2是用条形图示出在实施例4.1.1中确认到的显示出VAF2％以上的体细胞序列变异的各基因的检测频率的图。
具体实施方式
[0022]以下，对本专利技术进行详细说明。
[0023]本专利技术的一方面提供一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的组合物，所述组合物包含能够利用从个体分离出的生物试样来检测出克隆性造血诱发突变的制剂。
[0024]在本说明书中使用的术语“克隆性造血(Clonal haematopoiesis)”是指在造血干
细胞中发生体细胞突变而获得选择性增殖的机会时，发生突变的克隆扩增而占据白细胞的一定部分的现象。作为发生与所述克隆性造血相关的体细胞突变的基因(克隆性造血诱发突变)，有APC、ASXL1、ASXL2、ATM、BCL11B、BCOR、BCORL1、BIRC3、BRAF、BRCC3、CARD11、CASP8、CBL、CD58、CD79B、CNOT3、CREBBP、CUX1、DDX3X、DNMT3A、EP300、ETV6、EZH2、FAM46C、FBXW7、FLT3、FOXP1、GNAS、GNB1、GPS2、HIST1H1C、IDH2、IKZF1、IKZF2、JAK1、JAK2、JAK3、JARID2、KDM6A、KIT、KLHL6、KMT2D、KRAS、LUC7L2、MAP3K1、MPL、MYD88、NF1、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NRAS、PDS5B、PDSS2、PHF6、PHIP、PIK3CA、PIK3R1、PPM1D、PRDM1、PRPF40B、PT本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的组合物，所述组合物包含能够利用从个体分离出的生物试样来检测出克隆性造血诱发突变的制剂。2.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变包括选自由APC、ASXL1、ASXL2、BCOR、CD58、CHEK2、CUX1、DNMT3A、EP300、EZH2、GNB1、JAK1、JAK2、JARID2、KMT2D、NF1、NOTCH2、PPM1D、RIT1、SETD2、SF1、SF3B1、SRSF2、STAG1、STAT3、SUZ12、TBL1XR1、TET2、TNFAIP3及U2AF1组成的组中的一种以上基因的突变。3.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变包括选自由APC、ASXL1、ASXL2、CD58、CHEK2、CUX1、DNMT3A、EP300、EZH2、GNB1、JAK1、JAK2、JARID2、KMT2D、NF1、NOTCH2、PPM1D、RIT1、SETD2、SF1、SF3B1、SRSF2、STAT3、SUZ12、TBL1XR1、TET2、TNFAIP3及U2AF1组成的组中的一种以上基因的突变。4.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变包括选自由DNMT3A、TET2、ASXL1、APC、ASXL2、BCOR、CHEK2、CUX1、EP300、EZH2、GNB1、JAK1、JAK2、KMT2D、NF1、NOTCH2、RIT1、SETD2、SF3B1、SRSF2、STAG1、STAT3、SUZ12及TNFAIP3组成的组中的一种以上基因的突变。5.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变包括选自由DNMT3A、TET2、ASXL1、SETD2、KMT2D、NF1、NOTCH2、SF3B1、ASXL2、CHEK2、CUX1、EZH2、GNB1、JAK1、JAK2、RIT1、SRSF2、SUZ12、APC、STAT3及TNFAIP3组成的组中的一种以上基因的突变。6.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变包括选自由DNMT3A、TET2及ASXL1组成的组中的一种以上基因的突变。7.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述突变为错义(missense)突变、移码(frameshift)突变、无义(nonsense)突变或剪接(splice)突变。8.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述制剂包含用于检测所述突变的引物、探针或反义核酸。9.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述年龄相关性黄斑变性为湿性黄斑变性。10.一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的试剂盒，所述试剂盒包含权利要求1至9中任一项所述的组合物。11.一种用于提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗中所需要的信息的基因分析用套餐，所述基因分析用套餐包含权利要求1至9中任一项所述的组合物。12.一种提供年龄相关性黄斑变性的发生预测、诊断或治疗用信息的方法，所述方法包括如下步骤：通过从个体分离出的生物试样...

【专利技术属性】
技术研发人员：宣忠贤，金秀卿，任晧均，宋韩，吴百禄，崔琇然，
申请(专利权)人：首尔大学医院，
类型：发明
国别省市：