一种夹板核酸分子及其试剂盒制造技术

一种夹板核酸分子及其试剂盒，夹板核酸分子的长度≥27nt。所述夹板核酸分子包括5

【技术实现步骤摘要】
一种夹板核酸分子及其试剂盒


[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及一种夹板核酸分子及其试剂盒。

技术介绍

[0002]环化试剂盒是针对华大智造(MGI)高通量测序平台量身打造的模块化试剂盒。使用该试剂盒可以将构建好的文库制备成适用于MGI高通量测序仪专用的单链环状DNA文库。目前市面在售的环化试剂盒存在环化效率较低，对文库投入需求量高等缺点，限制了cfDNA等低浓度样本以及Small RNA等短片段样本的检测。另一方面，有些环化试剂盒的环化效率虚高，导致数据产出量少，进而导致补测比例大，增加了成本，影响交付周期以及客户体验。因此亟需提高环化试剂盒的环化效率以及数据量产出。

技术实现思路

[0003]根据第一方面，在一实施例中，提供一种用于文库环化的夹板核酸分子，所述夹板核酸分子的长度≥27nt。所述夹板核酸分子包括5
’
端片段以及3
’
端片段，所述5
’
端片段用于与变性后的单链文库5
’
末端序列形成第一互补区，所述3
’
端片段用于与变性后的单链文库3
’
末端序列形成第二互补区，且第一互补区的长度与第二互补区长度相同或不同。
[0004]根据第二方面，在一实施例中，提供一种对单链核酸分子进行环化处理的方法，包括：
[0005]将含有第一方面任意一项所述的夹板核酸分子、单链核酸分子、连接酶的反应混合物置于适于连接的条件下，获得所述单链核酸分子的环化产物。
[0006]根据第三方面，在一实施例中，提供一种构建测序文库的方法，包括：
[0007]环化步骤，获取携带插入片段的单链核酸分子，根据第二方面任意一项所述的方法，获得所述单链核酸分子的环化产物；
[0008]文库构建步骤，包括对所述单链核酸分子的环化产物进行消化处理，获得环化测序文库。
[0009]在一实施例中，所述携带插入片段的单链核酸分子包括插入片段、连接在所述插入片段5
’
端的第一接头以及连接在所述插入片段3
’
端的第二接头。
[0010]根据第四方面，在一实施例中，提供一种测序文库，所述测序文库由第三方面任意一项所述的方法构建得到。
[0011]根据第五方面，在一实施例中，提供一种序列分析方法，包括：
[0012]测序步骤，包括对第四方面所述的测序文库进行测序，获得包括多个测序读段(reads)的测序结果。
[0013]根据第六方面，在一实施例中，提供一种试剂盒，包含第一方面任意一项所述的夹板核酸分子。
[0014]依据上述实施例的一种夹板核酸分子及其试剂盒，本专利技术可以显著提高环化效率，并提高数据产出量。
附图说明
[0015]图1为一种实施例的环化过程示意图；
[0016]图2为实施例中的电泳结果图；
[0017]图3为实施例中的环化效率结果图；
[0018]图4为实施例中的Reads产出结果图；
[0019]图5为实施例中的GC含量(％)结果图。
具体实施方式
[0020]下面通过具体实施方式结合附图对本专利技术作进一步详细说明。在以下的实施方式中，很多细节描述是为了使得本申请能被更好的理解。然而，本领域技术人员可以毫不费力的认识到，其中部分特征在不同情况下是可以省略的，或者可以由其他材料、方法所替代。在某些情况下，本申请相关的一些操作并没有在说明书中显示或者描述，这是为了避免本申请的核心部分被过多的描述所淹没，而对于本领域技术人员而言，详细描述这些相关操作并不是必要的，他们根据说明书中的描述以及本领域的一般技术知识即可完整了解相关操作。
[0021]另外，说明书中所描述的特点、操作或者特征可以以任意适当的方式结合形成各种实施方式。同时，方法描述中的各步骤或者动作也可以按照本领域技术人员所能显而易见的方式进行顺序调换或调整。因此，说明书和附图中的各种顺序只是为了清楚描述某一个实施例，并不意味着是必须的顺序，除非另有说明其中某个顺序是必须遵循的。
[0022]本文中为部件所编序号本身，例如“第一”、“第二”等，仅用于区分所描述的对象，不具有任何顺序或技术含义。
[0023]本文中，“夹板核酸分子”亦称陪伴序列，英文全称为splint oligo，用于对带接头的PC R产物进行环化。
[0024]根据第一方面，在一实施例中，提供一种用于文库环化的夹板核酸分子，所述夹板核酸分子的长度≥27nt。所述夹板核酸分子包括5
’
端片段以及3
’
端片段，所述5
’
端片段用于与变性后的单链文库5
’
末端序列形成第一互补区，所述3
’
端片段用于与变性后的单链文库3
’
末端序列形成第二互补区，且第一互补区的长度与第二互补区长度相同。
[0025]在一实施例中，所述夹板核酸分子的长度≥29nt。
[0026]在一实施例中，所述夹板核酸分子的长度为29～38nt，具体可以为29nt、30nt、31nt、32nt、33nt、34nt、35nt、36nt、37nt、38nt等等。
[0027]在一实施例中，所述夹板核酸分子的长度为32～38nt。
[0028]在一实施例中，所述夹板核酸分子的长度为34～38nt。
[0029]在一实施例中，所述夹板核酸分子用于对单链核酸分子进行环化处理。所述单链核酸分子的两端连接有接头。
[0030]在一实施例中，所述夹板核酸分子包括5
’
端片段以及3
’
端片段，所述5
’
端片段用于与所述单链核酸分子的5
’
末端序列形成第一互补区，所述3
’
端片段用于与所述单链核酸分子的3
’
末端序列形成第二互补区。
[0031]在一实施例中，第一互补区与第二互补区的长度相同或不同。
[0032]在一实施例中，第一互补区的长度与第二互补区的长度相同。
[0033]在一实施例中，所述单链核酸分子包括插入片段、连接在所述插入片段5
’
端的第一接头以及连接在所述插入片段3
’
端的第二接头。
[0034]在一实施例中，所述插入片段来源于基因组片段的至少一部分。
[0035]在一实施例中，所述基因组片段是由基因组DNA进行打断和变性处理后获得。
[0036]在一实施例中，所述夹板核酸分子为DNA。
[0037]在一实施例中，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:1～8所示核苷酸序列中的至少一种。
[0038]在一实施例中，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:3～8所示核苷酸序列中的至少一种。
[0039]在一实施例中，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:3～6所示核苷酸序列中的至少一种。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于文库环化的夹板核酸分子，其特征在于，所述夹板核酸分子的长度≥27nt。2.如权利要求1所述的夹板核酸分子，其特征在于，所述夹板核酸分子的长度≥29nt。3.如权利要求1所述的夹板核酸分子，其特征在于，所述夹板核酸分子的长度为29～38nt。4.如权利要求1所述的夹板核酸分子，其特征在于，所述夹板核酸分子的长度为32～38nt；优选地，所述夹板核酸分子的长度为34～38nt；优选地，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:1～8所示核苷酸序列中的至少一种；优选地，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:3～8所示核苷酸序列中的至少一种；优选地，所述夹板核酸分子含有SEQ ID NO:3～6所示核苷酸序列中的至少一种；优选地，所述夹板核酸分子包括5
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端片段以及3
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端片段，所述5
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端片段用于与单链核酸分子的5
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末端序列形成第一互补区，所述3
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端片段用于与单链核酸分子的3
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【专利技术属性】
技术研发人员：王波，吴炜，羊春爱，赵美茹，易鑫，
申请(专利权)人：深圳吉因加医学检验实验室长沙吉因加生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：