本发明专利技术公开了一种检测牛腺病毒3型的荧光定量PCR试剂盒及应用,该试剂盒含有:a)DNA提取试剂,b)热启动Taq DNA聚合酶,c)引物和TaqMan探针,d)标准阳性DNA模板,e)PCR荧光定量反应液,其特征是:引物序列分别为正义引物:5′-CCTGAATTCTCTTGCAGCCAGA-3′,反义引物:5′-CCTACCGAACCGACGCAGAT-3′,扩增子大小为100bp,荧光探针序列为:5′-FAM-TGAGAAGGTACTCCTCGTCGCTGGACCA-TAMRA-3′,探针的5′端标记荧光发射基团FAM,靠近3′端标记荧光淬灭基团TAMRA,标准阳性DNA模板由已插入腺病毒3型pol蛋白100bp片段的pGEM-T载体转化大肠杆菌DH5α,增殖后提取质粒制备,并于紫外分光光度计测A↓[260]定量并10倍梯度稀释。高效方便地对血清制品中的牛腺病毒3型污染进行实时监控,可广泛用于该病毒感染的流行病学调查,还能为相关基础研究提供技术支持,应用前景十分广泛。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物
,涉及一种检测牛腺病毒3型的荧光定量PCR试 剂盒,同时还涉及荧光定量PCR试剂盒的用途,适用于对血清制品中的牛腺病 毒3型污染进行实时监控,同时广泛用于该病毒感染的流行病学调査,还可以为 相关基础研究提供技术支持。
技术介绍
牛腺病毒3型属于腺病毒属腺病毒科,基因组是双链的DNA分子,主要引 起牛的呼吸道和肠道疾病。其主要特征为肺炎、肠炎、结膜炎和多发性关节炎, 是犊牛死亡的重要原因之一,病和隐性感染的牛均可排毒,并能使与其接触的易 感牛感染。其易感和潜伏性给畜牧业及其国际贸易带来严重的经济损失。因此, 该病历来都是国际社会最为关注的传染病之一。牛腺病毒的快速检测是控制和消 灭该病的前提,但腺病毒的常规检测方法有一些不足之处,检测技术一般来说有 血清学诊断技术、生物学试验、分子生物学诊断技术三类1. 血清学诊断技术包括补体结合实验、中和实验、凝集实验、免疫扩散、 沉淀实验、免疫电泳技术、免疫荧光技术、放射免疫试验和免疫电镜技术等。在这些方法中得到普遍承认、采用并且广泛应用的有补体结合实验、间接血凝实验、琼脂扩散实验、中和实验。但由于所有实验均用到抗血清和抗原免疫反应, 反应时间长,材料多,准备周期长,检测具有明显的滞后性,只能定性不能定量,而且重复性差。2. 生物学试验包括动物实验、鸡胚接种和细胞培养。这种检测方法存在不敏感问题,而且有些样品中存在抗补体活性,影响检测效果。动物实验成本高, 周期长,浪费生物资源和人力物力。3. 分子生物学诊断技术包括核酸杂交、等电点聚焦电泳、寡核苷酸指纹图 谱分析、聚丙烯酰胺凝胶电泳、聚合酶链式反应、单克隆抗体技术等。核酸杂交、等电点聚焦电泳、寡核苷酸指纹图谱分析、聚丙烯酰胺凝胶电泳 等检测方法更适用于对病毒特性进行更加深入的研究,由于整个系统操作复杂,过程繁多,成本高,不适宜同时迸行大批量检测,因而受到很大限制。相比之下, 普通PCR方法特异性好,检测灵敏度高,不但可以检测活病毒核酸,也能直接 检测灭活的核酸片段。样品可以是牛血清,也可以是扁桃体、淋巴结、脊髓、肌 肉和皮肤等组织,这是免疫学方法无法替代的。但这种传统的定量方法测定的都 是PCR的终产物,而不是起始DNA拷贝数。由于PCR的终产物量与起始模板 量之间没有线性关系,所以根据最终的PCR产物量不能计算出起始DNA拷贝数。 因此,如何快速、准确测定牛腺病毒是面临的主要难题之一。近年来发展起来的荧光定量PCR (Fluorogenetic Quantitative PCR, FQ-PCR) 技术以其灵敏度高、速度快、特异性强等优点在基因表达水平分析(Nellemann C, Vinggaard AM, Dalgaard M, et al, Quantification of Antiandrogen Effect Determined by LightCycler Technology. Toxicology, 2001, 163:29-38)、病原体的定性 (McGoldrick A, Lowings JP, Ibata G, et al. A Novel Approach to the Detection of Classical Swine Fever Vims by RT-PCR with a Fluorogenic Probe (TaqMan) . J. Virol. Methods,1998, 72:125-135.; Bhudevi B, Weinstock D. Fluorogenic RT-PCR assay (TaqMan) for Detection and Classification of Bovine Viral Diarrhea Virus . Vet. Microbiol. , 2001, 83:1-10.)和定量检测(Kathy F丄Tang,Jun Wang, Donald V丄ightner. Quantitation of Taura syndrome virus by real-time RT-PCR with a TaqMan assay . J. Virol. Methods, 115(2004) 109-114.;Michaela Schwaiger, Pascal Cassinotti. Development of a quantitative real-time RT-PCR assay with internal control for the laboratory detection of tick borne encephalitis virus (TBEV) RNA . J. Clin. Microbiol" 27(2003) 136-145.;R.Frank Cook", S丄Cooka, et al. Development of a multiplex real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction for equine infectious anemia virus(EIAN) .丄Virol. Methods, 105(2002) 171-179.; Birgit Liss* . Improved quantitative real-time RT-PCR for expression profiling of individual cells . Nucleic Acids Res" 2002,Vol.30 No.17 e89.;Franck Housseau al imberly R丄indsey a,1, et al. Quantitative real-time RT陽PCR as a method for monitoring T lymphocyte reactivity to full-length tyrosinase protein in vaccinated melanoma patients . J. Immunol. Methods 266(2002) 87-103.; Desire N, Dehee A, Schneider V, et al, Quantification of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Proviral Load by a TaqMan Real-Time PCR Assay . J. Clin. Microbiol, 2001, 39:1303-1310.; Martell M, Gomez J, Esteban JI, et al. High-Throughput Real-Time Reverse Transcription-PCR Quantitation of Hepatitis C Virus RNA . J. Clin. Microbiol, 1999, 37:327-332.; Kearns AM, Turner AJL, Eltringham GJA, et al. Rapid Detection and Quantif本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种检测牛腺病毒3型的荧光定量PCR试剂盒,该试剂盒含有:a)DNA提取试剂,b)热启动Taq DNA聚合酶,c)引物和TaqMan探针,d)标准阳性DNA模板,e)PCR荧光定量反应液,其特征是:引物序列分别为正义引物:5′-CCTGAATTCTCTTGCAGCCAGA-3′,反义引物:5′-CCTACCGAACCGACGCAGAT-3′,扩增子大小为100bp,荧光探针序列为:5′-FAM-TGAGAAGGTACTCCTCGTCGCTGGACCA-TAMRA-3′,探针的5′端标记荧光发射基团FAM,3′端标记荧光淬灭基团TAMRA,标准阳性DNA模板由已插入腺病毒3型pol蛋白100bp片段的pGEM-T载体转化大肠杆菌DH5α,增殖后提取质粒制备,并于紫外分光光度计测A260定量并10倍梯度稀释。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:郑从义,郭佳,张国荣,
申请(专利权)人:武汉三利生物技术有限公司,
类型:发明
国别省市:83[中国|武汉]
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