用于检测SARS-COV-2刺突蛋白的组合物和方法技术

本公开涉及用于检测SARS

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测SARS
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COV
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2刺突蛋白的组合物和方法
[0001]相关申请数据
[0002]本申请要求2020年8月18日提交的题为“用于检测SARS
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2刺突蛋白的组合物和方法(Compositions and methods for detecting SARS
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2spike protein)”的澳大利亚专利申请第2020902948号和2021年1月22日提交的题为“用于检测SARS
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2刺突蛋白的组合物和方法(Compositions and methods for detecting SARS
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2spike protein)”的澳大利亚专利申请第2021900143号的优先权。这两个申请的全部内容据此通过引用并入。
[0003]序列表
[0004]本申请与电子形式的序列表一起提交。序列表的全部内容据此通过引用并入。


[0005]本公开涉及用于检测SARS
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2刺突蛋白和诊断SARS
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2感染的组合物和方法。本公开还涉及用于检测SARS
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2刺突蛋白和诊断SARS
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2感染的试剂盒和装置。<br/>
技术介绍

[0006]严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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2)是冠状病毒病2019(COVID
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19)的病因，这是一种急性呼吸综合征，其在首次被鉴定后迅速演变为疫情。快速和早期诊断COVID
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19，结合隔离和追踪，是世界各地卫生保健系统用于控制疫情的主要策略。
[0007]迄今为止，对SARS
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2疫情的第一线响应是聚合酶链式反应(PCR)测试。PCR是用于诊断传染性病原体的金标准，并且其优点是一旦病毒序列已知，就可以相对快速地生产出此类测试所需的引物。在鉴定SARS
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2病毒后不久，由世界卫生组织(WHO)设计并分发了第一个基于逆转录酶的定量PCR(RT
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PCR)测试以用于检测SARS
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2感染。然而，RT
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PCR方案复杂且昂贵，因此主要适用于大型的集中式诊断实验室。测试通常需要4
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6小时才能完成，但将临床样本运送到集中式实验室的物流要求意味着周转时间最多为24小时。
[0008]因此，需要一种更快速和方便的用于检测SARS
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2的测试。

技术实现思路

[0009]本专利技术的专利技术人已经生产了基于纳米颗粒的探针，用于使用与SARS
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2刺突蛋白结合的DNA适体检测SARS
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2。专利技术人发现DNA适体与SARS
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2刺突蛋白的结合诱导了DNA适体与纳米颗粒的分离，产生了灵敏度在低纳摩尔范围内的可检测信号。
[0010]因此，在一个方面，本公开提供了一种包括纳米颗粒的组合物，所述纳米颗粒可分离地结合到能够结合至SARS
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2刺突蛋白的DNA适体上。
[0011]在另一方面，本公开提供了一种包括纳米颗粒的组合物，所述纳米颗粒可分离地结合到能够结合至SARS
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2刺突蛋白的DNA适体上，其中所述DNA适体包括具有与SEQ ID NOs:1至8中任一者至少90％相同的序列的核苷酸。
[0012]在另一方面，本公开提供了一种包括纳米颗粒的组合物，所述纳米颗粒可分离地
结合到能够结合至SARS
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2刺突蛋白的DNA适体上，其中所述DNA适体包括具有与SEQ ID NOs:1至8中任一者至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。
[0013]在一些实例中，百分比同一性存在于长度为至少约20个核苷酸，或长度为至少约30、40、50、60、70或更多个核苷酸的区域上。在一些实例中，百分比同一性存在于所述的整个SEQ ID上。
[0014]在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NOs:1至8中任一者提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NOs:1
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8中任一者提供的序列的核苷酸组成。
[0015]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:7至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:7中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NO:7中提供的序列的核苷酸组成。
[0016]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:1至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:1中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NO:1中提供的序列的核苷酸组成。
[0017]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:5至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:5中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NO:5中提供的序列的核苷酸组成。
[0018]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:2至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:2中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NO:2中提供的序列的核苷酸组成。
[0019]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:3至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:3中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有SEQ ID NO:3中提供的序列的核苷酸组成。
[0020]在一些实例中，DNA适体包括具有与SEQ ID NO:4至少70％、至少80％、至少90％或至少95％相同的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体包括具有SEQ ID NO:4中提供的序列的核苷酸。在一些实例中，DNA适体由具有S本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种包括纳米颗粒的组合物，所述纳米颗粒可分离地结合到能够结合至SARS
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2刺突蛋白的DNA适体，其中所述DNA适体包括具有与SEQ ID NOs:1至8中任一者至少90％相同的序列的核苷酸。2.根据权利要求1所述的组合物，其中所述DNA适体包括具有SEQ ID NO:7中提供的序列的核苷酸。3.根据权利要求1或权利要求2所述的组合物，其中所述纳米颗粒是贵金属纳米颗粒。4.根据权利要求1至3中任一项所述的组合物，其中所述纳米颗粒是金纳米颗粒。5.根据权利要求1至4中任一项所述的组合物，其中所述纳米颗粒具有在10nm至30nm范围内的平均直径。6.根据权利要求1至5中任一项所述的组合物，其中所述纳米颗粒具有小于20％的粒径分散度。7.根据权利要求1至6中任一项所述的组合物，其中所述DNA适体被生物素化。8.根据权利要求7所述的组合物，其中所述DNA适体在其5'端处被生物素化。9.根据权利要求1至6中任一项所述的组合物，其中所述DNA适体未被生物素化或硫醇化。10.根据权利要求1至9中任一项所述的组合物，其中所述DNA适体被吸附到所述纳米颗粒的表面上。11.根据权利要求1至9中任一项所述的组合物，其中所述组合物包括：i)与第一多核苷酸接头缀合的纳米颗粒；和ii)与第二多核苷酸接头缀合的纳米颗粒，其中所述DNA适体包括与所述第一多核苷酸接头杂交的区域和与所述第二多核苷酸接头杂交的区域。12.根据权利要求11所述的组合物，其中i)所述第一多核苷酸接头和所述第二多核苷酸接头被硫醇化；ii)所述纳米颗粒是金纳米颗粒；并且iii)所述第一多核苷酸接头和所述第二多核苷酸接头经由硫醇
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金键与所述金纳米颗粒缀合。13.根据权利要求11或权利要求12所述的组合物，其中所述第一多核苷酸接头或所述第二多核苷酸接头被生物素化。14.根据权利要求11至13中任一项所述的组合物，其中所述DNA适体包括不与所述第一多核苷酸接头或所述第二多核苷酸接头杂交的区域。15.根据权利要求11至14中任一项所述的组合物，其中所述第一多核苷酸接头和所述第二多核苷酸接头具有在10至20个核苷酸范围内的长度。16.根据权利要求11至15中任一项所述的组合物，其中所述第一多核苷酸接头包括具有SEQ ID NO:9中提供的序列的核苷酸，和/或所述第二多核苷酸接头包括具有SEQ ID NO:10中提供的序列的核苷酸。17.根据权利要求1至16中任一项所述的组合物，其为水溶液。18.根据权利要求17所述的组合物，其中可分离地结合到所述DNA适体的所述纳米颗粒以在200nM至500nM范围内的浓度存在。
19.根据权利要求17或权利要求18所述的组合物，其进一步包括浓度在50mM至500mM范围内的氯化钠。20.根据权利要求1至16中任一项所述的组合物，其为干燥组合物。21.根据权利要求20所述的组合物，其被干燥到固体支持物上。22.根据权利要求21所述的组合物，其中所述固体支持物包括玻璃纤维、聚酯、纤维素或人造丝。23.一种用于在样本中检测SARS
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2刺突蛋白的方法，其包括使所述样本与根据权利要求1至22中任一项所述的组合物接触，其中所述SARS
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2刺突蛋白与所述DNA适体的结合诱导所述DNA适体与所述纳米颗粒分离，从而产生指示在所述样本中存在SARS
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2刺突蛋白的可检测信号。24.一种用于在受试者中诊断SARS
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2感染的方法，其包括使来自所述受试者的样本与根据权利要求1至22中任一项所述的组合物接触，其中SARS
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2刺突蛋白与所述DNA适体的结合诱...

【专利技术属性】
技术研发人员：M，
申请(专利权)人：雷根纳塞尔克斯有限责任公司，
类型：发明
国别省市：