基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用制造技术

本发明专利技术属于癌症检测制剂技术领域，具体涉及一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用。该乳腺癌标志物包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CA

【技术实现步骤摘要】
基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用


[0001]本专利技术属于癌症检测制剂
，具体涉及一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用。

技术介绍

[0002]目前社会上基于循环肿瘤DNA的乳腺癌筛查技术主要为CancerSEEK，CancerSEEK是一种依赖ctDNA检测的非侵入性多基因检测，用于早期筛查包括乳腺癌在内的八种癌症。
[0003]Nickolas等首先从网上公布的数据中，从16个癌症相关基因中筛选出61个扩增子和41个癌症相关蛋白，然后通过进一步验证，筛选出41个癌症相关蛋白中的8个。之后，他们对1005名确诊的癌症患者和812名健康人进行了CancerSEEK测试。结果发现卵巢癌敏感性最高为98％，乳腺癌敏感性最低为33％，中位敏感性为70％，特异性为＞99％。但本研究纳入的肿瘤患者多为有临床表现的肿瘤患者，无症状患者CancerSEEK检出率可能较低。此外，他们的对照组都是健康的人，但在实践中，慢性疾病和炎症可能导致较高的假阳性。而且，CancerSEEK由于其检测癌种的多样性，其检测靶点较多有61个基因靶点以及8个癌种相关蛋白，且在检测后的癌种定位中会存在一定的误差。单纯针对某一种癌种来说，病人所承担的经济负担较重，诊断的准确性也会随之降低。
[0004]因此，亟需一种检测靶点少，且检测准确的乳腺癌检测制剂。

技术实现思路

[0005]针对以上问题，本专利技术目的之一在于提供一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，该乳腺癌标志物在TCGA中进行筛查发现其对乳腺癌的诊断敏感性可高达79.39％，可以准确定位乳腺癌。
[0006]为达到上述目的，可以采用以下技术方案：
[0007]本专利技术一方面提供了一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CA
H1047R
、PIK3CA
E542K
、PIK3CA
E545K
、TP53
R175C
、TP53
R248W
、TTN
R6745C
、GATA3
M294K
、GATA3
S238R
、CDH1
L630V
、KMT2C
K339N
或KMT2C
G315S
。
[0008]本专利技术另一方面提供了一种检测制剂，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂。
[0009]本专利技术再一方面提供了一种检测试剂盒，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂或上述的检测试剂。
[0010]本专利技术再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备乳腺癌检测制剂中的应用。
[0011]本专利技术再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备乳腺癌检测试剂盒中的应用。
[0012]本专利技术再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备用于检测乳腺癌的微流控芯片中的应用。
[0013]在某些示例性实施例中，上述应用中，乳腺癌检测制剂或乳腺癌检测试剂盒或用于检测乳腺癌的微流控芯片的检测样本可以为机体液体组织。
[0014]在某些示例性实施例中，上述应用中，液体组织可以为血液。
[0015]本专利技术有益效果至少包括：该乳腺癌标志物在TCGA中进行筛查发现其对乳腺癌的诊断敏感性可高达79.39％，可以准确定位乳腺癌；相对于CancerSEEK，用更少的检测靶点(11vs69)，得到了乳腺癌检测更高的敏感性(79.39％vs 33％)。
附图说明
[0016]图1为20例乳腺癌患者ctDNA与肿瘤组织一致性对比；
[0017]图2为6种基因突变在TCGA中检测乳腺癌的敏感性。
具体实施方式
[0018]所举实施例是为了更好地对本专利技术进行说明，但并不是本专利技术的内容仅局限于所举实施例。所以熟悉本领域的技术人员根据上述
技术实现思路
对实施方案进行非本质的改进和调整，仍属于本专利技术的保护范围。
[0019]本文中使用的术语仅用于描述特定实施例，并且无意于限制本公开。除非在上下文中具有明显不同的含义，否则单数形式的表达包括复数形式的表达。如本文所使用的，应当理解，诸如“包括”、“具有”、“包含”之类的术语旨在指示特征、数字、操作、组件、零件、元件、材料或组合的存在。在说明书中公开了本专利技术的术语，并且不旨在排除可能存在或可以添加一个或多个其他特征、数字、操作、组件、部件、元件、材料或其组合的可能性。如在此使用的，根据情况，“/”可以被解释为“和”或“或”。
[0020]本专利技术实施例提供了一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CA
H1047R
、PIK3CA
E542K
、PIK3CA
E545K
、TP53
R175C
、TP53
R248W
、TTN
R6745C
、GATA3
M294K
、GATA3
S238R
、CDH1
L630V
、KMT2C
K339N
或KMT2C
G315S
。
[0021]具体地，通过从临床中收集了20例乳腺癌患者的初诊时的血液及肿瘤组织、正常腺体组织进行二代测序，发现二者ctDNA与肿瘤组织基因突变谱一致性较高为89％(73.2％
‑
97.4％)(图1)；之后，根据这20例患者的易感基因、驱动基因以及高频突变谱中筛选出6个基因的11个突变位点PIK3CA
H1047R
、PIK3CA
E542K
、PIK3CA
E545K
、TP53
R175C
、TP53
R248W
、TTN
R6745C
、GATA3
M294K
、GATA3
S238R
、CDH1
L630V
、KMT2C
K339N
、KMT2C
G315S
。
[0022]另外，上述突变基因的扩增引物对如下表1所示。
[0023]表1突变基因的扩增引物对
[0024][0025]本专利技术另一实施例提供了一种检测制剂，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂。具体地，上述的乳腺癌标志物的检测试剂可以和一些本领域所已知的检测辅助试剂组合成用于检测乳腺癌的检测制剂，本领域所已知的的检测辅助试剂比如稀释剂等。
[0026]本专利技术再一方面提供了一种检测试剂盒，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂或上述的检测试剂。具体地，基于上述的乳腺癌标志物的检测试剂可以制备成检测试剂盒；需要说明的是，检测试剂盒的组成为本领域所已知的常规形式，比如检测试剂盒会设置试剂盒说明书，比如会有盛装各种检测试剂的试剂瓶，比如会设置成若干小本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，其特征在于，包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CA
H1047R
、PIK3CA
E542K
、PIK3CA
E545K
、TP53
R175C
、TP53
R248W
、TTN
R6745C
、GATA3
M294K
、GATA3
S238R
、CDH1
L630V
、KMT2C
K339N
或KMT2C
G315S
。...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵远，熊盾，张新志，夏绍才，罗正永，
申请(专利权)人：普洱市人民医院，
类型：发明
国别省市：