本发明专利技术涉及一种细菌筛选和鉴定方法,属于生化鉴定技术领域。它包括如下步骤:(1)确定细菌筛选和鉴定所需生化试验项目;(2)搜集各种菌株生化试验项目的阳性概率;(3)建立细菌筛选和鉴定数据库,计算各分类单元的若干项生化试验阳性概率;(4)确定生化试验项目的优先顺序;(5)选定待鉴定细菌的若干生化试验项目,进行生化试验;(6)在获得待鉴定细菌生化试验结果后,比较各分类单元与待鉴定细菌的可能性和相似性,从而获得鉴定或筛选结果。本发明专利技术在进行细菌筛选和鉴定时,不需要提前对待鉴定微生物做染色、氧化酶、TSI等粗筛试验,而可以直接选取生化项目对纯培养物做筛选和鉴定,一般就能获得较理想的鉴定结果。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及,属于生化鉴定
技术介绍
细菌筛选和鉴定应用最广泛、最基础的方法是生化鉴定方法。目前的细菌生化筛选和鉴 定方法所涵盖的分类单元数量较少, 一般仅有几十种,其中未囊括一些重要的细菌种类,如 大肠埃希氏菌0157:H7 、椰毒假单胞酵米面亚种(BwA/wWe〃'a cocoww"a附subsp. /"r/"o/er/^"to朋)等;而且,随着细菌名称的改变,有些筛选和鉴定方法对细菌的命名已经 不够准确;此外,多数筛选和鉴定方法都需要先进行繁琐的染色、氧化酶等试验。
技术实现思路
针对上述筛选和鉴定方法存在的缺点,本专利技术的目的是提出一种更全面、更准确、更便 捷的细菌筛选和鉴定方法。本专利技术技术方案的步骤如下(1) 确定细菌筛选和鉴定所需生化试验项目。选用常用的、方便配制的生化试验项目, 舍弃操作繁琐的诸如硝酸盐还原、苯丙氨酸脱氨酶等常用试验。另外,考虑到鉴定时可以借 用商业化生化鉴定条,因此尽量使用商业化生化鉴定系统中包括的生化项目。最终确定如下20项e-半乳糖苷酶(ONPG)、精氨酸双水解酶(ADH)、赖氨酸脱羧酶(LDC)、鸟氨 酸脱羧酶(ODC)、柠檬酸盐利用(CIT)、硫化氢产生(H2S)、尿素酶(URE)、喷哚(IND)、 伏普(VP)、明胶液化(GEL)、甘露醇(MAN)、肌醇(INO)、山梨醇(SOR)、鼠李 糖(RHA)、蔗糖(SAC)、蜜二糖(MEL)、苦杏仁苷(AMY)、阿拉伯糖(ARA)、乳 糖(LAC)、木糖(XYL)。(2) 搜集各种菌株上述20项生化试验项目的阳性概率。通过查阅权威的鉴定手册和检 测标准,如《伯杰氏细菌鉴定手册》(第九版)、《伯杰氏细菌系统手册》(第二版)、《全国临床检验操作规程》(第三版)、《临床微生物学手册》(第七版)等,最终获得288 个分类单元的20项生化试验结果,该288个分类单元如下Jcz'"etoZ)a"er 6awma朋/i/A5w/wowz'aWa subsp. ac/ 尸owoge"es' 乂ero附cwas sfl/ no"/cf(ia subsp. mflwowcz'c a' 4e "owo"ay*9r3Y/s>s/.y ica、 8tyscQ、 ^7e&5/Q//a sqysca ornithine P5sitivp A7e6.yz>//Q / /awn.co/a、w《/5/7iser/、z/5、57va: iww0cwa、i/53r/a j*ee//gen.、.zi.y、57.a Ssra.y/、z/.s-、c5e//a <wwg^NY/arws、z/5-、ow。//a/ e/ag/w5, Moe//e,e〃a M^coweraz、, Morgawe//" worg"m7, Morga"e〃"附org"m7 subsp. ^owz7,尸a"/oea Wew"厂ri/,尸fl"/oea wre^fovon7,尸a^ew/^〃a 尸as,ewre/Z" awaris,尸"Wewre〃aPa.stewre//" (ymp/^"g/"'c/z、, ^ay/ew/^//"附"z'r/Z, Pastew/^//" subsp. ^as^ewre//"mw/foc/c/a subsp. ww/focz't/a' mw/foaW" subsp. se/ ric",尸ay/^wre,/" / wew附o/n9pic",尸ay/^w/^Z/" 尸"欣,〃",e加^'"/s, 尸"5^wre〃" /V 欲wre〃" vo/"wrfw附,subsp. d"奶5e/", 尸/;ofo6ac/^n'ww z7iq/ z、car/w/7 , P/zo/^6ac/eriw附 /e/ogw"f/z/, 尸Aofo6""er/w附/7/w^/ /zorew附,尸Ao/or/ "6^/ws 尸/zo,wAa》dz^ /w附/"esre"i", /Vej/o/wo"ay j/z/ge/Zo/^fey,/V"g7'" ybwn'wm,尸r0&wA' m&a6///51,尸rofew5附jKxoy^cfe/w, Pn^ew5 / e"we〃', iVo/ews vw/g"n、'尸n vkfewa'" a/ca/,ybc/e/iy, /Vov/tfe"".a Z^im6"c/zae, iVov/t/e"ci" re/fgen.,尸n9v/dewd" rwW/g/aw/z',/Vov/^fewc/a j/w"厂/i/, i^ewcfo附oway "erwg/was^/ /^ewdo/wowas1 T7wo尸^ycew5/P / wrtd", i^ewcfowowa 5fwfem', 7 "/me〃" a《waf船,ASaZ/m'vz力n'o cayfeo/", subsp. an'^ w"e,Sa/mc^Z/a c/zo/erae纖、subsp. c/zo/era^t^, c/zo/era^w^y subsp. d/"r/z(9wae,SW,we//(3 c/zo/eraes^ subsp. /zow加"e, c/20/erae,、 subsp. zW/ra'c/zo/e/Y/eyw^ subsp. sa/"附ae, (Sa/mowe//" Ga///w"rww, iSa//wowe//a尸a厂a(y/ /// X, Sa/w^oweZ/aybwrtcc^", 5fe/r""》gr/附es//, 5fe 7Y7ria marcescews, 5fe/T"/ia ocfon)fer", S^/r"ria; fy/ww^u'c", Se^7Y^/a戸/;^ c/ews,幼扭〃at , iS7n'^〃a 6o>v&',幼扭〃a咖e她r^, 57z扭/Za^Zexwr/,幼/ge/," so"腦',iS/ /2/wgo6acfen'wm ww/rivo/*w/n, iSj7/n>igomo"as* 77awc/附oZ //^, iS^wofrcp/zo附oway wa/fo; / ///",F 6n'o /oge/, 附edzYem3weZ, me"c/zm'A:ovz7, W6"'o附少"7〖'WZ rz'o附/wicws' F 6r^ w"/^egew51, WZ^/o "/gn》w/c7/r/rt^fo, W^7'o WZv/o t 〃'ew^r/", W力〃'oj^^她6ercw/m/5v lfera'm'" raMez', Ifera'm'" 1bfe脱〃a reg^m^w广ge/。(3) 收集288个分类单元名称以及对应的20项生化试验结果,建立细菌筛选和鉴定数据库,计算各分类单元的若干项生化试验阳性概率;(4) 确定生化试验项目的优先顺序。不同生化试验的阳性率大多数情况下是不相同的,这就意味着每项生化试验对鉴别细菌的分辨能力是有差异的。采用蒙特卡罗模拟(Monte-Carlo simulations)方法来确定20项生化试验项目的选取顺序。具体步骤如下首先将288个分类单元的阳性概率为0和1的值全部分别取近似值0.01和0.99,然后将各分类单元对应的20项生化试验项目阳本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种细菌筛选和鉴定方法,其特征在于它包括如下步骤: (1)确定细菌筛选和鉴定所需生化试验项目; (2)搜集各种菌株生化试验项目的阳性概率; (3)建立细菌筛选和鉴定数据库,计算各分类单元的若干项生化试验阳性概率; ( 4)确定生化试验项目的优先顺序; (5)选定待鉴定细菌的若干生化试验项目,进行生化试验; (6)在获得待鉴定细菌生化试验结果后,比较各分类单元与待鉴定细菌的可能性和相似性,从而获得鉴定或筛选结果。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:贾俊涛,吴振兴,赵丽青,王丹,岳志芹,刘云国,房保海,袁涛,
申请(专利权)人:山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心,
类型:发明
国别省市:95[中国|青岛]
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