三级淋巴结构在预后疾病进展和治疗癌症中的应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于对患有癌症或处于患癌症风险的患者预后疾病进展的体外方法，所述方法包括以下步骤：在来自所述患者的怀疑包含肿瘤性或癌组织的样本中确定所述样本是否包含三级淋巴样结构(TLS)；以及对疾病进展进行预后，其中所述预后是评估免疫疗法改善患者生存期的可能性和/或更好的临床结果(图4a)。存期的可能性和/或更好的临床结果(图4a)。存期的可能性和/或更好的临床结果(图4a)。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】三级淋巴结构在预后疾病进展和治疗癌症中的应用


[0001]本申请涉及一种在患有癌症或有患癌症风险的患者中预后疾病进展的体外方法。

技术介绍

[0002]肿瘤疾病的治疗在现代社会仍然是一个悬而未决的问题。这也适用于确定特定癌症类型的适当治疗方式的工具和方法，以提高患者的存活率和生活质量。
[0003]这些和其它问题由本专利技术的独立权利要求的特征来解决。从属权利要求公开了在特定情况下可能优选的本专利技术的实施方案。同样，本说明书公开了在特定情况下可能优选的本专利技术的其它实施方案。
附图说明
[0004]图1：用于癌症治疗的免疫检查点抑制的原理。
[0005]图2：通过检测PD
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L1阴性NSCLC组织中的CD3/CD20进行TLS的免疫组织学检测。图2A：CD3/CD20染色
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(CD3，棕色；CD20，紫色)，图2B：PD
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L1/CD8染色
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(CD8，棕色；PDL1，紫色)。
[0006]图3：PD
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L1阳性结直肠癌组织中TLS CD3/CD20的免疫组织学检测。图3A：CD3/CD20表达，图3B：PD
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L1/CD8染色－(CD8，棕色；PDL1，紫色)。根据CPS评分的PDL1阳性。
[0007]图4：NSCLC患者的免疫组织化学分析，以及同一患者的两次CT扫描。在一名呈现TLS+/PD
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L1
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NSCLC的62岁男性中可显示出持久的部分应答(>29个月)。图4A显示了如CD3/CD20免疫组织化学所示的NSCLC组织中TLS的存在。图4B显示NSCLC组织中不存在PD
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L1表达(TPS和CPS阴性)。图4C显示了用PD
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L1抑制剂派姆单抗(Pembrolizumab)(2mg/kg，每三周一次)治疗开始时患者上半身CT扫描。在CT扫描中可见较大的肿瘤病灶(箭头所指)。图4D显示了42天后同一患者上半身的CT扫描。肿瘤病灶明显缩小(直径从14mm缩小至8mm)。
[0008]图5：A：在低倍率(上图)和高倍率(下图)下基于免疫组织学检测TLS的图示。B：在机器学习和图像分析步骤后获得的突出了TLS和肿瘤区域的组织分割图。肿瘤区域表面为21.2mm2，而TLS计数为4，因此TLS密度为0.19TLS/mm2。
[0009]图6：确定一组332名接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者中TLS密度的阈值。临床终点为无进展生存期。该图突出显示了0.023TLS/mm2的最佳截止值。
[0010]图7
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9：具有不同的TPC/CSP评分的不同肿瘤类型(“泛肿瘤”)的中位无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)，取决于TLS密度(高：上曲线，低：下曲线)。TLS密度截止值：0.023TLS/mm2。
[0011]图7
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12：具有不同的TPC/CSP评分的非小细胞肺癌(NSCLC)的中位无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)，取决于TLS密度(高：上曲线，低：下曲线)。TLS密度截止值：0.023TLS/mm2。
[0012]图14
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16：具有不同的TPC/CSP评分的不同肿瘤类型(“泛肿瘤”)的中位无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)，取决于TLS密度(高：上曲线，低：下曲线)。成熟TLS密度截止值0.03TLS/mm2。
[0013]图17
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19：具有不同的TPC/CSP评分的非小细胞肺癌(NSCLC)的中位无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)，取决于TLS密度(高：上曲线，低：下曲线)。成熟TLS密度截止值0.03TLS/mm2。
[0014]图7显示Kaplan Meyer曲线，表明无论PDL1表达状态如何，肿瘤中的高密度三级淋巴结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p<0.001和p＝0.003)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算332名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0015]图8显示Kaplan Meyer曲线，表明在TPS评分<1％的肿瘤患者中，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.003和0.01)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算261名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0016]图9显示Kaplan Meyer曲线，表明在TPS评分≥1％的肿瘤患者中，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.08和0.1)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算71名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0017]图10显示Kaplan Meyer曲线，表明无论PDL1表达状态如何，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后NSCLC患者改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.01和0.02)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算128名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0018]图11显示Kaplan Meyer曲线，表明在TPS评分<1％的NSCLC肿瘤患者中，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.16和0.13)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算79名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0019]图12显示Kaplan Meyer曲线，表明在TPS评分≥1％的NSCLC肿瘤患者中，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.023TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.02和0.03)。根据TLS计数与肿瘤病灶表面的比值，计算49名患者的成熟TLS密度；即每平方毫米的成熟TLS数量。
[0020]图13：确定一组332名接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者中成熟TLS密度的阈值。临床终点为无进展生存期。图中突出显示了0.03成熟TLS/mm2的最佳截止值。
[0021]图14显示Kaplan Meyer曲线，表明无论PDL1表达状态如何，肿瘤中的高密度三级淋巴样结构(TLS)(即>0.03TLS/mm2)与免疫检查点治疗后改善的无进展生存期和总生存期相关(分别为p＝0.01和0.01)。根据T本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种在患有癌症或有处于患癌症风险的患者中预后疾病进展的体外方法，所述方法包括以下步骤：
·
在来自怀疑包含肿瘤性或癌组织的所述患者的样本中，确定所述样本是否包含三级淋巴样结构(TLS)，和
·
预后疾病进展，其中所述预后是评估免疫疗法或用免疫治疗剂治疗的
·
患者生存期改善的可能性，和/或
·
更好临床结果。2.根据权利要求1的体外方法，其中确定所述样本是否包含三级淋巴样结构包括以下至少一项：
·
用组织化学染色对所述样本进行染色，和/或
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确定所述样本中是否存在T淋巴细胞和/或B淋巴细胞。3.根据权利要求1或2的方法，其中在蛋白质或mRNA基础上检测至少一种选自CD3、CD4、CD8、CD20、CD19和Pax5的标记物的表达、存在或不存在。4.根据权利要求1至3中任一项所述的体外方法，其进一步包括以下步骤：
·
在来自所述患者的相同样本中确定TLS密度。5.根据权利要求1至4中任一项所述的体外方法，其进一步包括以下步骤：
·
在来自所述患者的相同样本中确定TLS的成熟状态和/或成熟TLS的密度。6.根据权利要求5的体外方法，其中确定所述TLS的成熟状态包括基于蛋白质或mRNA检测
·
至少一种选自CD35和CD23的标记物的表达、存在或不存在，或
·
DC
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Lamp+成熟树突细胞(mDCs)的存在或不存在。7.根据前述权利要求中任一项所述的体外方法，其进一步包括以下步骤：
·
在来自所述患者的相同或第二个样本中确定PD
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L1(程序性细胞死亡配体1)的表达状态。8.根据权利要求7所述的体外方法，其中确定PD
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L1表达状态包括基于蛋白质或mRNA检测样本中PD
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L1的表达、存在或不存在。9.根据权利要求7至8中任一项所述的体外方法，其中确定PD
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L1的表达状态包括确定以下至少一项：
·
肿瘤比例评分(TPS)，
·
免疫细胞评分(IC)，和/或
·
合并阳性评分。10.根据权利要求7至9中任一项所述的体外方法，其中确定PD
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L1表达状态包括进行原位杂交(ISH)。11.根据权利要求7至9中任一项所述的体外方法，其中确定PD
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L1表达状态包括进行原位PCR。12.根据前述权利要求中任一项所述的体外方法，其中在怀疑包含肿瘤性或癌组织的样本中，认为以下至少一项：a)样本中TLS的存在，
b)TLS密度≥0.005TLS/mm2，c)成熟TLS的存在，d)成熟TLS的密度≥0.005TLS/mm2，和/或e)PD
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L1(程序性细胞死亡配体1)表达的不存在或低表达，是应答免疫治疗的以下指标的指征：
·
患者生存期改善的高可能性，和/或
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更好的临床结果。13.根据前述权利要求中任一项所述的体外方法，其中所述患者患有或处于发生风险中的癌症是肺癌或消化器官癌症。14.根据前述权利要求中任一项所述的体外方法，其中所述免疫疗法是其中施用免疫检查点抑制剂的疗法。15.根据权利要求14所述的体外方法，其中所述免疫检查点抑制剂是CTLA
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4、PD
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1、PD
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L1、LAG 3、TIM3、OX40、4
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1BB和/或TIGIT中的至少一种的结合剂、抑制剂或拮抗剂。16.根据权利要求15所述的体外方法，其中所述结合剂、抑制剂或拮抗剂是抗体或其靶结合片段或衍生物。17.根据权利要求16所述的体外方法，所述抗体是选自易普利姆玛(Ipilimumab)(抗CTLA
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4)，纳武单抗(Nivolumab)(抗PD
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1)，派姆单抗(Pembrolizumab)(抗PD
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1)，西米普利单抗(Cemiplimab)(抗PD
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1)，斯巴达珠单抗(Spartalizumab)(抗PD
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1)，阿特朱单抗(Atezolizumab)(抗PD
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L1)，阿维单抗(Avelumab)(抗PD
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L1)，德瓦鲁单抗(Durvalumab)(抗PD
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L1)，依吉利单抗(Etigilimab)(抗TIGIT)，BGB
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A1217(抗TIGIT)，BMS
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986207(抗TIGIT)，AB154(抗TIGIT)，ASP8374(抗TIGIT)，MK 7684(抗TIGIT)和/或替戈鲁单抗(Tirgolumab)(抗TIGIT)中的至少一种抗体。18.根据前述权利要求中任一项所述的体外方法，其进一步包括以下步骤：
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通过检测肿瘤标记物的存在或不存在或对样本进行组织化学染色，确定样本中肿瘤组织或病变的存在、体积、面积、大小或轮廓中的至少一项。19.一种用于治疗患有癌症或被诊断患有癌症的患者的免疫检查点抑制剂(免疫检查点抑制剂用于制备治疗患有癌症或被诊断患有癌症的患者的药物)，所述癌症的特征在于以下至少一项：a)样本中TLS的存在，b)TLS密度≥0.005TLS/mm2，c)成熟TLS的存在，d)成熟TLS的密度≥0.005TLS/mm2，和/或e)PD
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L1(程序性细胞死亡配体1)表达的不存在或低表达，20.一种用免疫检查点抑制剂治疗患有癌症或处于患癌症风险的患者的方法，所...

【专利技术属性】
技术研发人员：A，
申请(专利权)人：贝尔戈尼研究所，
类型：发明
国别省市：