制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用制造技术

本发明专利技术提供制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用，属基因工程技术领域。本发明专利技术对泛癌中SARS

【技术实现步骤摘要】
制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用


[0001]本专利技术涉及基因工程领域，特别是涉及制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用。

技术介绍

[0002]由新型冠状病毒SARS
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CoV
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2引起的新冠感染持续大流行正在影响全球健康。在2020年，全球有1930万例癌症新发病例，近1000万例死亡。面对这两个人类健康的重大威胁，探索新的治疗方法已刻不容缓。根据以往经验，病毒与肿瘤之间有密切关系，据估计，15
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20％的癌症是由病毒感染引起的。大量的研究发现多种公认的人类肿瘤病毒，例如人乙型肝炎(HBV)和丙型(HCV)病毒，人瘤病毒(HPV)，EB病毒(EBV)和卡波西肉瘤疱疹病毒(KSHV)等。
[0003]最新研究表明SARS
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2可以抑制霍奇金淋巴瘤发展。针对SARS
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CoV
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2的RNA疫苗可以刺激宿主免疫系统进而抑制肿瘤的发展进程，但肿瘤与SARS
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CoV
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2之间的关系尚未明确。

技术实现思路

[0004]为了解决上述问题，本专利技术提供了制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用，本专利技术揭示了新型冠状病毒的目标基因与肿瘤的关系图景，靶向这些目标基因可能是治疗癌症的一种重要方法，为肿瘤的靶向治疗策略提供新的思路。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
[0006]本专利技术提供了制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用。
[0007]本专利技术还提供了制备新型冠状病毒的目标基因的试剂调控肿瘤免疫微环境影响肿瘤进展中的应用。
[0008]本专利技术还提供了制备新型冠状病毒的目标基因的异常表达的试剂在介导肿瘤对化疗和靶向药物治疗耐药性中的应用。
[0009]本专利技术还提供了制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在促进肿瘤免疫途径影响肿瘤进展中的应用。
[0010]优选的，所述新型冠状病毒包括新型冠状病毒SARS
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CoV
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2。
[0011]优选的，所述目标基因包括ACE2基因、NRP1基因、SCARB1基因、AXL基因和TMPRSS2基因中的一种或几种。
[0012]优选的，所述肿瘤包括膀胱尿路上皮癌、急性髓系白血病、肾上腺皮质癌、乳腺癌浸润性癌、肾嫌色细胞瘤、宫颈鳞状细胞癌、宫颈内膜腺癌、胆管癌、结肠腺癌、食管癌、多形性胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、低级别胶质瘤、嗜铬细胞瘤、副神经节瘤、肝癌细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、淋巴样肿瘤扩散大B细胞淋巴瘤、
间皮瘤、卵巢浆液性囊腺癌、前列腺腺癌、直肠腺癌、肉瘤、葡萄膜黑色素瘤、胃腺癌、胰腺腺癌、睾丸生殖细胞瘤、胸腺瘤、甲状腺癌、子宫体子宫内膜癌、子宫癌肉瘤、和皮肤黑色素瘤中的一种或多种。
[0013]本专利技术综合评估了33种实体肿瘤中SARS
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2目标基因(SARS
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2Target Genes,STGs)的基因组学和临床特征。本专利技术发现，基因组和表观遗传学的改变，导致了STGs的异常表达，这与肿瘤标志性相关通路的激活、临床生存和免疫浸润显著相关。本专利技术揭示了STGs与肿瘤的关系图景，靶向这些STGs可能是治疗癌症的一种重要方法，为肿瘤的靶向治疗策略提供新的思路。
附图说明
[0014]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍。
[0015]图1，(A)正常样本与肿瘤样本之间的STGs表达差异，(B)STGs的生存分析，点的大小代表基因对每种癌症类型生存影响的显著性，p值通过Kaplan
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Meier分析获得。红点表示该表达在癌症类型中的存活率较差，蓝点表示该表达在癌症类型中的存活率较好；
[0016]图2，(A)STGs的突变频率。数字代表了对某一特定癌症具有相应突变基因的样本的数量，“0”表示该基因编码区没有突变，没有数字表示该基因的任何区域都没有突变，(B)一个显示STGs的突变分布和SNV类型的分类的肿瘤分布瀑布图，(C)STGs的SNV与生存的关系，通过气泡颜色和大小显示风险比和Cox p值，气泡颜色从蓝色到红色表示从低到高的危害比，气泡大小与Cox P值显著性呈正相关。黑色轮廓边框表示Cox P值≤0.05；
[0017]图3，(A)CNV在33种癌症中的分布，CNV饼图显示了每种癌症中每个基因的杂合CNV或纯合CNV，饼状图表示一个基因在一种癌症中不同类型的CNV的比例，不同的颜色代表不同类型的CNV，(B)气泡图表示STGs表达与CNV水平之间的图谱，蓝色气泡代表负相关，红色气泡表示正相关，颜色越深，相关性越高，气泡大小与FDR显著性呈正相关，黑色轮廓边框表示FDR≤0.05，(C)癌症中STGs的CNV与生存率的关系，通过气泡颜色和大小显示Log
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rankp值，气泡颜色从蓝色到红色表示Log
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rank P值从低到高的显著性，气泡大小与Log
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rankP值的显著性呈正相关，黑色轮廓边框表示Log
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rankP值≤0.05；
[0018]图4，(A)甲基化与STGs表达的相关性，蓝点表示负相关，红点表示正相关，其中颜色越深，相关性越高，(B)高甲基化和低甲基化STGs样本之间的生存差异，通过气泡颜色和大小显示风险比和Coxp值，气泡颜色从蓝色到红色表示从低到高的危害比，气泡大小与Cox P值显著性呈正相关，黑色轮廓边框表示CoxP值≤0.05；
[0019]图5，(A)STGs表达对通路活性具有潜在影响的癌症百分比，在癌症类型中，基因对通路有影响(FDR<＝0.05)的癌症百分比，每个单元格中的数字表示百分比(特定基因与特定途径显示出显着关联的癌症占总分析癌症数目的百分比)(B)气泡图总结STGs表达与药物IC50(肿瘤耐药性)的相关性，蓝色气泡表示负相关，红色气泡表示正相关，颜色越深，相关性越高，气泡大小与FDR显著性呈正相关，黑色轮廓边框表示FDR≤0.05；
[0020]图6，(A)免疫细胞浸润与STGs的之间的关联，热图总结了P值和FDR对输入基因集GSA评分与免疫细胞浸润之间Pearman相关性分析的意义，蓝点表示负相关，红点表示正相关，其中颜色越深，相关性越高，*：P值≤0.05；#：FDR≤0.05，(B)STGs与免疫刺激剂免疫途
径的相关性，R代表相关性，R>0为正相关，(C)STGs与MHC免疫途径的相关性，R代表相关性，R>0为正相关，(D)STGs与趋化因子免疫途径的相关性，R代表相关性，R&a本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤发生和预后中的应用。2.制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在调控肿瘤免疫微环境影响肿瘤进展中的应用。3.制备新型冠状病毒的目标基因的异常表达的试剂在介导肿瘤对化疗和靶向药物治疗耐药性中的应用。4.制备新型冠状病毒的目标基因的试剂在促进肿瘤免疫途径影响肿瘤进展中的应用。5.根据权利要求1～4任一项所述的应用，其特征在于，所述新型冠状病毒包括新型冠状病毒SARS
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CoV
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2。6.根据权利要求1～4任一项所述的应用，其特征在于，所述目标基因包括ACE2基因、NRP1基因、SCARB1基因、AXL基因...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄遵楠，廖泳，刘志平，王娇娇，邹佳蜜，
申请(专利权)人：广东医科大学，
类型：发明
国别省市：