使用糖-凝集素偶联来检测元素制造技术

本发明专利技术提供了一种用于检测元素的方法。该方法包括将元素

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用糖
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凝集素偶联来检测元素
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年9月11日提交的并且名称为
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Detecting Elements Using Sugar
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Lectin Couplings
″
的美国临时专利申请号63/077,416的权益，该美国临时专利申请的全部内容以引用方式并入本文。

技术介绍

[0003]生物样本中存在的特定核酸序列的检测已被用作例如鉴定和分类微生物、诊断传染病、检测和表征遗传异常、鉴定与癌症相关联的遗传变化、研究对疾病的遗传易感性以及测量对各种类型的治疗的反应的方法。用于检测生物样本中的特定核酸序列的常用技术是核酸测序。
[0004]核酸测序方法已从Maxam和Gilbert所使用的化学降解方法以及Sanger所使用的链延长方法得到了发展。现在使用了允许在单个芯片上并行处理数千个核酸的若干测序方法。一些平台包括基于小珠的形式和微阵列形式，其中二氧化硅小珠用探针官能化，这取决于此类形式在包括测序、基因分型或基因表达谱分析在内的应用中的应用。
[0005]一些测序系统使用基于荧光的检测，无论是用于
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边合成边测序
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还是用于基因分型，其中给定的核苷酸用荧光标签标记，并且基于检测来自该标签的荧光来鉴定核苷酸。

技术实现思路

[0006]在本文的一些示例中提供了一种用于检测元素的方法。该方法可包括将第一元素
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糖复合物偶联至第一基底。第一元素
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糖复合物包括偶联至第一糖的第一元素。该方法可包括将第一凝集素偶联至第一糖；以及至少使用第一凝集素的检测来检测第一元素。
[0007]在一些示例中，第一元素包括分析物。在一些示例中，分析物包括第一核苷酸。在一些示例中，将第一元素
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糖复合物偶联至第一基底包括将第一核苷酸掺入偶联至第一基底的第一寡核苷酸中。在一些示例中，第一寡核苷酸与第二寡核苷酸杂交，并且将第一核苷酸掺入第一寡核苷酸中包括至少使用第二寡核苷酸的序列来延伸第一寡核苷酸。在一些示例中，将第一元素
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糖复合物偶联至第一基底包括使溶液在基底上流动。溶液可包括第一元素
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糖复合物；以及第二元素
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糖复合物，该第二元素
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糖复合物包括偶联至第二糖的第二元素。第一凝集素选择性地结合第一糖而不结合第二糖。第一元素和第二元素可包括彼此不同的核苷酸类型。在一些示例中，第一糖和第二糖包括彼此不同的糖类型。
[0008]在一些示例中，该方法还包括将该第二元素
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糖复合物偶联至第一基底或偶联至第二基底；将第二凝集素偶联至第二糖；以及至少使用第二凝集素的检测来检测第二元素。在一些示例中，溶液还包括第三元素
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糖复合物，该第三元素
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糖复合物包括偶联至第三糖的第三元素；以及第四元素
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糖复合物，该第四元素
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糖复合物包括偶联至第四糖的第四元素。该方法还可包括将第三元素
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糖复合物偶联至第一基底、偶联至第二基底或偶联至第三基底。该方法还可包括将第三凝集素偶联至第三糖；以及至少使用第三凝集素的检测来检测第三元素。该方法还可包括将第四元素
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糖复合物偶联至第一基底、偶联至第二基底、偶
联至第三基底或偶联至第四基底。该方法还可包括将第四凝集素偶联至第四糖；以及至少使用第四凝集素的检测来检测第四元素。
[0009]在一些示例中，第一元素糖
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复合物还包括偶联至元素的第五糖。在一些示例中，该方法还包括将第一凝集素偶联至第五糖。
[0010]在一些示例中，该方法还包括将第一荧光团偶联至第一凝集素，并且检测第一凝集素包括检测来自第一荧光团的荧光。在一些示例中，第一荧光团包括第一多个荧光团。在一些示例中，将第一荧光团偶联至第一凝集素包括将聚合物偶联至第一凝集素，聚合物包括第一荧光团和第六糖，并且第一凝集素偶联至第六糖。在一些示例中，聚合物包括小珠。在一些示例中，聚合物包括多肽。在一些示例中，在将第一凝集素偶联至第一糖之前，第一荧光团偶联至第一凝集素。在一些示例中，在将第一凝集素偶联至第一糖之后，第一荧光团偶联至第一凝集素。
[0011]在一些示例中，第七糖偶联至第一凝集素，第二凝集素偶联至第七糖，并且检测第一凝集素包括检测第二凝集素。在一些示例中，第二荧光团偶联至第二凝集素，并且检测第一凝集素包括检测来自第二荧光团的荧光。在一些示例中，第一荧光团是与第二荧光团不同类型的荧光团。在一些示例中，第一凝集素包括伴刀豆球蛋白A(Con A)，第七糖包括N
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乙酰半乳糖胺(GalNAc)，并且第二凝集素包括大豆凝集素(SBA)。
[0012]在一些示例中，第一基底包括小珠。
[0013]在一些示例中，第一糖包括烷基糖。
[0014]在一些示例中，第一糖包括单糖。
[0015]在一些示例中，第一糖包括二糖。
[0016]在一些示例中，第一凝集素包括伴刀豆球蛋白A(Con A)，并且第一糖包括甘露糖(Man)或葡萄糖(Glc)；第一凝集素包括麦胚凝集素(WGA)，并且第一糖包括N
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乙酰葡糖胺(GlcNAc)或N
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乙酰神经氨酸(Neu5Ac)；第一凝集素包括大豆凝集素(SBA)，并且第一糖包括半乳糖(Gal)或N
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乙酰半乳糖胺(GalNAc)；第一凝集素包括双花扁豆(DBA)，并且第一糖包括GalNAcα3GalNAc或GalNAc；第一凝集素包括蓖麻毒素，并且第一糖包括半乳糖；第一凝集素包括花生凝集素(PNA)，并且第一糖包括半乳糖或Galβ3GalNAcα(T
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抗原)；第一凝集素包括豌豆(PSA)，并且第一糖包括甘露糖或葡萄糖；第一凝集素包括兵豆(LCA)，并且第一糖包括甘露糖或葡萄糖；第一凝集素包括雪花莲(GNA)，并且第一糖包括甘露糖；第一凝集素包括马铃薯(STA)，并且第一糖包括(GlcNAc)
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；第一凝集素包括去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)H1，并且第一糖包括半乳糖；第一凝集素包括半乳糖凝集素
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3，并且第一糖包括半乳糖；第一凝集素包括唾液酸粘附素，并且第一糖包括Neu5Ac；第一凝集素包括阳离子依赖性甘露糖
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磷酸受体(CD
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MPR)，并且第一糖包括Man6P；或者第一凝集素包括C
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反应蛋白(CRP)，并且第一糖包括半乳糖、Gal6P或半乳糖醛酸。
[0017]在本文的一些示例中提供了一种系统。该系统可包括基底以及偶联至基底的第一元素
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糖复合物。第一元素
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糖复合物可包括偶联至第一糖的第一元素。该系统可包括偶联至第一糖的第本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于检测元素的方法，所述方法包括：将第一元素
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糖复合物偶联至第一基底，所述第一元素
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糖复合物包括偶联至第一糖的第一元素；将第一凝集素偶联至所述第一糖；以及至少使用所述第一凝集素的检测来检测所述第一元素。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一元素包括分析物。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述分析物包括第一核苷酸。4.根据权利要求3所述的方法，其中将所述第一元素
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糖复合物偶联至所述第一基底包括将所述第一核苷酸掺入偶联至所述第一基底的第一寡核苷酸中。5.根据权利要求4所述的方法，其中所述第一寡核苷酸与第二寡核苷酸杂交，并且其中将所述第一核苷酸掺入所述第一寡核苷酸中包括至少使用所述第二寡核苷酸的序列来延伸所述第一寡核苷酸。6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中将所述第一元素
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糖复合物偶联至所述第一基底包括使溶液在所述基底上流动，所述溶液包括：所述第一元素
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糖复合物；以及第二元素
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糖复合物，所述第二元素
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糖复合物包括偶联至第二糖的第二元素，其中所述第一凝集素选择性地结合所述第一糖而不结合所述第二糖。7.根据权利要求6所述的方法，其中所述第一元素和所述第二元素包括彼此不同的核苷酸类型。8.根据权利要求6或权利要求7所述的方法，其中所述第一糖和所述第二糖包括彼此不同的糖类型。9.根据权利要求6至8中任一项所述的方法，还包括：将所述第二元素
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糖复合物偶联至所述第一基底或偶联至第二基底；将第二凝集素偶联至所述第二糖；以及至少使用所述第二凝集素的检测来检测所述第二元素。10.根据权利要求9所述的方法，其中所述溶液还包括：第三元素
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糖复合物，所述第三元素
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糖复合物包括偶联至第三糖的第三元素，以及第四元素
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糖复合物，所述第四元素
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糖复合物包括偶联至第四糖的第四元素，所述方法还包括：将所述第三元素
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糖复合物偶联至所述第一基底、偶联至所述第二基底或偶联至第三基底；将第三凝集素偶联至所述第三糖；至少使用所述第三凝集素的检测来检测所述第三元素；将所述第四元素
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糖复合物偶联至所述第一基底、偶联至所述第二基底、偶联至所述第三基底或偶联至第四基底；将第四凝集素偶联至所述第四糖；以及至少使用所述第四凝集素的检测来检测所述第四元素。11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法，其中所述第一元素糖
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复合物还包括偶联至所述元素的第五糖。
12.根据权利要求11所述的方法，还包括将所述第一凝集素偶联至所述第五糖。13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，还包括将第一荧光团偶联至所述第一凝集素，其中检测所述第一凝集素包括检测来自所述第一荧光团的荧光。14.根据权利要求13所述的方法，其中所述第一荧光团包括第一多个荧光团。15.根据权利要求13或权利要求14所述的方法，其中将所述第一荧光团偶联至所述第一凝集素包括将聚合物偶联至所述第一凝集素，其中所述聚合物包括所述第一荧光团和第六糖，其中所述第一凝集素偶联至所述第六糖。16.根据权利要求15所述的方法，其中所述聚合物包括小珠。17.根据权利要求15所述的方法，其中所述聚合物包括多肽。18.根据权利要求13至17中任一项所述的方法，其中在将所述第一凝集素偶联至所述第一糖之前，所述第一荧光团偶联至所述第一凝集素。19.根据权利要求13至17中任一项所述的方法，其中在将所述第一凝集素偶联至所述第一糖之后，所述第一荧光团偶联至所述第一凝集素。20.根据权利要求1至19中任一项所述的方法，其中：第七糖偶联至所述第一凝集素，第二凝集素偶联至所述第七糖，并且检测所述第一凝集素包括检测所述第二凝集素。21.根据权利要求20所述的方法，其中第二荧光团偶联至所述第二凝集素，并且其中检测所述第一凝集素包括检测来自所述第二荧光团的荧光。22.根据权利要求21所述的方法，其中所述第一荧光团是与所述第二荧光团不同类型的荧光团。23.根据权利要求20至22中任一项所述的方法，其中所述第一凝集素包括伴刀豆球蛋白A(Con A)，所述第七糖包括N
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乙酰半乳糖胺(GalNAc)，并且所述第二凝集素包括大豆凝集素(SBA)。24.根据权利要求1至22中任一项所述的方法，其中：所述第一凝集素包括伴刀豆球蛋白A(Con A)，并且所述第一糖包括甘露糖(Man)或葡萄糖(Glc)；所述第一凝集素包括麦胚凝集素(WGA)，并且所述第一糖包括N
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乙酰葡糖胺(GlcNAc)或N
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乙酰神经氨酸(Neu5Ac)；所述第一凝集素包括大豆凝集素(SBA)，并且所述第一糖包括半乳糖(Gal)或N
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乙酰半乳糖胺(GalNAc)；所述第一凝集素包括双花扁豆(DBA)，并且所述第一糖包括GalNAcα3GalNAc或GalNAc；所述第一凝集素包括蓖麻毒素，并且所述第一糖包括半乳糖；所述第一凝集素包括花生凝集素(PNA)，并且所述第一糖包括半乳糖或Galβ3GalNAcα(T
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抗原)；所述第一凝集素包括豌豆(PSA)，并且所述第一糖包括甘露糖或葡萄糖；所述第一凝集素包括兵豆(LCA)，并且所述第一糖包括甘露糖或葡萄糖；所述第一凝集素包括雪花莲(GNA)，并且所述第一糖包括甘露糖；所述第一凝集素包括马铃薯(STA)，并且所述第一糖包括(GlcNAc)
n
；
所述第一凝集素包括去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)H1，并且所述第一糖包括半乳糖；所述第一凝集素包括半乳糖凝集素
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3，并且所述第一糖包括半乳糖；所述第一凝集素包括唾液酸粘附素，并且所述第一糖包括Neu5Ac；所述第一凝集素包括阳离子依赖性甘露糖
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磷酸受体(CD
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MPR)，并且所述第一糖包括Man6P；或者所述第一凝集素包括C
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反应蛋白(CRP)，并且所述第一糖包括半乳糖、Gal6P或半乳糖醛酸。25.根据权利要求1至24中任一项所述的方法，其中所述第一基底包括小珠。26.根据权利要求1至25中任一项所述的方法，其中所述第一糖包括烷基糖。27.根据权利要求1至26中任一项所述的方法，其中所述第一糖包括单糖。28.根据权利要求1至27中任一项所述的方法，其中所述第一糖包括二糖。29.一种系统，所述系统包括：基底；第一元素
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【专利技术属性】
技术研发人员：R，
申请(专利权)人：伊鲁米纳新加坡有限公司，
类型：发明
国别省市：