一种用于预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物及其应用，涉及生物医学领域。所述生物标志物为CRTAM基因，核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。本发明专利技术分析发现，CRTAM表达水平与免疫检查点阻断治疗不良事件发生显著正相关，非肿瘤组织高表达CRTAM的配体CADM1与CRTAM

【技术实现步骤摘要】
一种用于预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及生物医学领域，特别是涉及一种用于预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]免疫检查点阻断(immune checkpoint blockade，ICB)治疗，特别是靶向程序性死亡受体(programmed death
‑
1，PD
‑
1)及其配体(programmed death
‑
ligand 1)治疗已经成为多种晚期肿瘤的二线甚至一线治疗模式。然而，随着ICB在临床上的广泛应用，越来越多的免疫相关不良事件(immune
‑
related adverse event，irAE)被报道。ICB治疗在激活机体抗肿瘤免疫的同时，也常诱发全身各器官系统的炎症性副作用，诱发结肠炎、肺炎、心肌炎等毒性反应，其中重度不良事件的发生将导致患者被迫停药，更甚者导致患者死亡。
[0003]目前，免疫检查点阻断治疗不良事件的发生机制仍未得到充分阐明，且其发生发展具有不可预测性，临床上仍然缺乏理想的预测指标与干预手段，被动地应对免疫检查点阻断治疗不良事件将会削弱抗肿瘤治疗效果，降低患者临床获益甚至导致死亡。
[0004]因此，临床上亟待识别可靠的irAE特异性分子靶标用于irAE高危人群的早期识别以及irAE的早期预警，为临床最优治疗决策提供科学依据，具有重要的临床意义。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种用于预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术提供的生物标志物可以有效预测免疫检查点阻断治疗不良事件。
[0006]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0007]本专利技术提供一种预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物，所述生物标志物为CRTAM基因，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
[0008]进一步地，所述CRTAM基因的表达水平与所述肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的发生呈正相关。
[0009]CRTAM基因的表达水平的检测方法如下：
[0010]S1.收集肿瘤患者基线血液活检标本；
[0011]S2.对S1所收集的血液活检标本提取外周血单个核细胞(PBMC)；
[0012]S3.对S2所提取的PBMC进行qRT
‑
PCR，检测CRTAM表达水平。S3的具体步骤：
[0013](1)提取PBMC的总RNA；
[0014](2)去除RNA模板中残留的基因组DNA污染；
[0015](3)逆转录；
[0016](4)qRT
‑
PCR检测CRTAM表达水平。
[0017]可选CRTAM引物序列(5
’→3’
)：
[0018]Forwardprimer AATGGCCAATCTTCCCACCC；
[0019]Reverse primer CTCTCTGGTACTTGGATGTGCT。
[0020]可选内参GAPDH引物序列(5
’→3’
)：
[0021]Forwardprimer GCTGAGAACGGGAAGCTTGT；
[0022]Reverse primer GACTCCACGACGTACTCAGC。
[0023]本专利技术还提供检测CRTAM基因表达的试剂在制备预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的产品中的应用。
[0024]进一步地，所述产品为试剂或试剂盒。
[0025]本专利技术还提供一种预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的产品，包括检测CRTAM基因表达的试剂。
[0026]进一步地，所述产品为试剂或试剂盒。
[0027]本专利技术公开了以下技术效果：
[0028]1.本专利技术提供了一种预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物，即CRTAM基因，其表达水平与免疫检查点阻断治疗不良事件发生显著正相关。
[0029]2.本专利技术丰富了预测免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物，并且阐述了CRTAM与免疫检查点阻断治疗不良事件发生的内在联系。
[0030]3.本专利技术所提供的预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物，目前在国内和国际上尚未见报道，该生物标志物为肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的预测预警提供了科学依据和实践基础，对于早期识别免疫检查点阻断治疗不良事件的高危人群、制定个体化的诊疗方案以及早期预警免疫检查点阻断治疗不良事件的发生，最终提高肿瘤患者的生存率和生活质量具有重要的临床价值和意义。
附图说明
[0031]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0032]图1为CRTAM表达水平与免疫检查点阻断治疗不良事件报告比值比的相关性分析；
[0033]图2为CRTAM表达水平与对应肿瘤免疫检查点阻断治疗客观缓解率的相关性分析；
[0034]图3为肿瘤单细胞测序数据集中CRTAM在不同细胞群的表达热图；
[0035]图4为PBMC单细胞数据集中CRTAM在不同细胞亚群的表达热图；
[0036]图5为健康人PBMC(A)与Jurkat T细胞(B)激活48小时后CRTAM蛋白的膜表达丰度水平，以及Jurkat T细胞激活不同时间后的CRTAM转录本水平(C)；
[0037]图6为共聚焦显微镜显示CADM1的膜表面定位；其中，绿色部分显示的是CADM1，蓝色部分显示的是细胞核(Nucleus)；红色的部分显示的是细胞微管(Microtubules)；
[0038]图7为TCGA泛癌数据CADM1和CRTAM转录本在癌旁组织(N)与癌症组织(T)的差异；
[0039]图8为免疫组化显示CADM1在正常组织和肿瘤组织的表达情况；
[0040]图9为自身免疫性皮炎单细胞转录组测序分析(A)以及CADM1(B)和CRTAM(C)在不同细胞群的表达情况；
[0041]图10为TCGA泛癌数据CADM1转录本在呼吸系统、消化系统和泌尿生殖系统的癌旁组织(N)与癌症组织(T)的差异；其中，LUSC：肺鳞状细胞癌；LUAD：肺腺癌；COAD：结肠腺癌；READ：直肠腺癌；STAD：胃癌；KIRC：肾透明细胞癌；KIRP：肾乳头状细胞癌；BLCA：膀胱尿路上皮癌；
[0042]图11为转基因小鼠自发成瘤肺癌模型单细胞转录组测序分析(A)以及多个marker基因(B：Cd8a，C：Cd4，D：Epcam，E：Cd34，F：Crtam，G：Cadm1)在不同细胞群的表达情况；
[0043]图12为自身免疫性皮炎C本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种预测肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为CRTAM基因，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述CRTAM基因的表达水平与所述肿瘤免疫检查点阻断治疗不良事件的发生呈正相关。3.检测CRTAM基因表达的试...

【专利技术属性】
技术研发人员：董忠谊，吴德华，马思聪，容子轩，白雪，林嘉润，
申请(专利权)人：南方医科大学南方医院，
类型：发明
国别省市：