COL24A1突变在预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用制造技术

本申请涉及COL24A1基因突变在预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用。患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用。患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用。

【技术实现步骤摘要】
COL24A1突变在预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用


[0001]本申请涉及分子诊断领域，具体涉及COL24A1突变在预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用。

技术介绍

[0002]基于PD
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1/PD
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L1、CTLA
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4等新兴的免疫检查点抑制剂(Immune checkpoint inhibitors,ICIs)的治疗方案在多种实体瘤得到了广泛的研究，并已进入肺腺癌(NSCLC)一线治疗。尽管免疫检查点抑制剂效果不错，但整体客观缓解率(ORR)依然只有20％左右，因此开发合适的生物标志物，精确筛选更多免疫治疗获益人群，是未来肿瘤免疫治疗发展亟待解决的关键问题。基于免疫组织化学染色检测肿瘤PD
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L1表达是目前免疫治疗应用最为广泛的生物标志物。在某些肿瘤类型，如肺腺癌，PD
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L1的表达可以作为抗PD
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1/PD
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L1治疗反应的预测标志物。但是，多个临床试验结果显示PD
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L1表达对免疫治疗疗效的预测能力并不一致，部分PD
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L1阴性患者依然能从免疫治疗获益，虽然PD
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L1阴性患者整体有效率更低，但持续缓解时间不逊于PD
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L1阳性的患者。并且，PD
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L1的检测标准依然存在诸多争议，而且PD
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L1在肿瘤的不同的解剖以及随着治疗的进展都会发生改变。
[0003]肿瘤突变负荷(TMB)已证明与多种肿瘤类型包括黑色素瘤，肺腺癌和膀胱癌的免疫检查点抑制剂的治疗疗效相关。不过TMB作为预测因子的应用仍面临一些问题，比如高TMB患者能从免疫治疗中获益，但有研究表明无论TMB的高或低，帕博利珠单抗联合化疗在鳞状和非鳞状NSCLC患者的一线治疗中均显示出生存获益；其次，国内不同检测机构因检测产品不同及算法各异，TMB的检测尚没有标准的方法。此外，TMB阈值问题仍然是区分有效或者无效患者的难点。
[0004]研究表明对肿瘤微环境中免疫细胞，特别是CD8+T细胞的浸润程度，能够预测肿瘤对免疫治疗反应的可能性，但目前缺少简便、有效的分子标志物来反映肺腺癌的免疫特征。另外，近期研究表明，DNA错配修复(DDR)通路基因突变，导致癌细胞中DNA损伤的增加和DNA修复能力的降低，这能提高免疫治疗的有效性。然而，DDR通路涉及基因众多，目前缺少简便的检测方式。
[0005]越来越多的二代测序肿瘤精准治疗中研究发现，特定基因的体细胞突变可能影响肿瘤免疫功能或对免疫治疗的响应，即提示特定体细胞突变可能是潜在的免疫治疗预测因子。因此现有技术中仍然需要更高效、准确地鉴定适用于免疫检查点抑制剂治疗肺癌患者的方法和工具，有鉴于此，特提出本申请。

技术实现思路

[0006]为了实现本申请的上述目的，特采用以下技术方案：
[0007]本申请首先提供一种获取样本中COL24A1突变水平的检测剂或组件在制备用于预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的产品中的应用。
[0008]本申请还提供一种COL24A1突变在预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性中的应用。
[0009]进一步的，所述COL24A1突变的存在是所述肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感的指征。
[0010]本申请还提供了一种获取样本中COL24A1突变水平的检测剂或组件在制备用于预测肺腺癌患者肿瘤突变负荷程度的产品中的应用；
[0011]本申请还提供一种COL24A1在预测肺腺癌患者肿瘤突变负荷程度中的应用。
[0012]进一步的，所述COL24A1点突变的存在是高肿瘤突变负荷的指征。
[0013]本申请还提供了一种获取样本中COL24A1突变水平的检测剂或组件在制备用于预测肺腺癌患者DDR通路基因突变频率的产品中的应用；
[0014]本申请还提供一种COL24A1在预测肺腺癌患者DDR通路基因突变频率的应用；
[0015]进一步的，所述COL24A1突变的存在是所述肺腺癌患者DDR通路基因突变频率高的指征。
[0016]本申请还提供了一种获取样本中COL24A1突变水平的检测剂或组件在制备用于预测肺腺癌患者肿瘤内免疫细胞浸润水平的产品中的应用；
[0017]本申请还提供一种COL24A1在预测肺腺癌患者肿瘤内免疫细胞浸润程度的应用；
[0018]进一步的，所述产品为试剂盒类产品。
[0019]进一步的，所述COL24A1突变的存在是所述肺腺癌患者肿瘤内免疫细胞浸润程度高的指征。
[0020]进一步的，上述免疫检查点抑制剂为PD1抑制剂和/或PD
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L1抑制剂。
[0021]进一步的，所述突变为点突变；优选的，所述点突变包括但不限于单核苷酸多态性，碱基取代/插入/缺失，或沉默突变。
[0022]本申请还提供一种COL24A1在预测肺腺癌患者肿瘤突变负荷程度中的应用。
[0023]进一步的，所述检测剂于核酸水平进行检测；
[0024]优选的，所述检测剂用于执行以下任一种方法：聚合酶链反应、变性梯度凝胶电泳、核酸测序法、核酸分型芯片检测、变性高效液相色谱法、原位杂交、生物质谱法以及HRM法。
[0025]进一步的，所述检测剂于蛋白水平进行检测；
[0026]优先的，所述检测剂用于执行以下任一种方法：生物质谱法、氨基酸测序法、电泳法以及用特异性针对突变位点所设计的抗体进行检测。
[0027]进一步的，所述试剂盒中还包括检测其他基因突变的试剂；
[0028]优选的，所述其他基因包括但不限于：FGFR4、POLE、POLD1、ARID1A、ARID1B、FGFR4、MUC16或NOTCH1
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4之一或多个；
[0029]进一步的，所述试剂盒还包括样品的处理试剂，所述样品的处理试剂包括样品裂解试剂、样品纯化试剂以及样品核酸提取试剂中的至少一种。
[0030]进一步的，所述样品选自所述肺腺癌患者的血液、血清、血浆、脑脊髓液、组织或组织裂解液、细胞培养上清、精液以及唾液样品中的至少一种。
[0031]本申请还提供一种用于预测、评估或筛查肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性试剂盒，所述试剂盒中包含用于COL24A1基因突变检测的试剂；
[0032]优选的，还包括其他基因突变检测的试剂，所述其他基因包括但不限于：FGFR4、POLE、POLD1、ARID1A、ARID1B、FGFR4、MUC16或NOTCH1
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4之一或多个。
[0033]本申请还提供一种用于预测、评估或筛查肺腺癌患者肿瘤突变负荷程度的试剂盒，所述试剂盒中包含用于COL24A1其他基因突变检测的试剂；
[0034]优选的，还包括其它基因突变检测的试剂，所述基因包括但不限于：FGFR4、POL本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.获取样本中COL24A1突变水平的检测剂或组件在制备用于预测肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感性的产品中的应用；所述COL24A1突变的存在是所述肺腺癌患者对免疫检查点抑制剂疗法敏感的指征。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品为试剂盒。3.根据权利要求1
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2任一项所述的应用，其特征在于，所述免疫检查点抑制剂为PD1抑制剂和/或PD
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L1抑制剂。4.根据权利要求1
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3任一项所述的应用，其特征在于，所述突变为点突变；优选的，所述点突变包括但不限于单核苷酸多态性，碱基取代/插入/缺失。5.根据权利要求1
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3任一项所述的应用，其特征在于，所述检测剂于核酸水平进行检测；优选的，所述检测剂用于执行以下任一种方法：聚合酶链反应、变性梯度凝胶电泳、核酸测序法、核酸分型芯片检测、变性高效液相色谱法、原位杂交、生物质谱法以及HRM法。6.根据权利要求1
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5任一项所述的应用，其特征在于，所述检测剂于蛋白水平进行检测，优先的，所述检测剂用于执行以下任一种方法：生物质谱法、氨基酸测序法、电泳法以及用特异性针对突变位点所设计...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘满姣，张贝，郭昊，颜林林，夏思健，任用，李诗濛，
申请(专利权)人：北京先声医学检验实验室有限公司南京先声医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：