用于测定病毒例如冠状病毒的RNA分离和相关技术制造技术

本公开内容的某些方面一般地涉及用于测定病毒例如冠状病毒的系统和方法。例如，一些方面涉及使用分配系统来测定病毒的系统和方法。在分配系统内，游离RNA或其他核酸可以优先分配至一个相中，而完整的病毒可以存在于另一个相或同时存在于两个相中。因此，在一些情况下，例如与病毒内存在的完整的RNA或其他核酸相比，可以优先移出游离的RNA或其他核酸。在一些情况下，可以测定包含完整病毒的相以测定例如来自对象的样品的感染性。这可用于例如将能够传播感染的对象与不具有感染性的对象区分开。开。开。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于测定病毒例如冠状病毒的RNA分离和相关技术
[0001]相关申请
[0002]本申请要求Chait等于2021年3月17日提交的题为“RNA Separation and Related Techniques for Determining Viruses such as Coronaviruses”的美国临时专利申请序列号63/162,485的权益，其通过引用整体并入本文。


[0003]本公开内容的某些方面一般地涉及用于测定病毒例如冠状病毒的系统和方法。

技术介绍

[0004]冠状病毒是在哺乳动物和鸟类中导致疾病的一组病毒。在人中，冠状病毒导致通常轻微的呼吸道感染，例如普通感冒，但是较罕见的形式如SARS、MERS和COVID
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19可以是致命的。冠状病毒是具有正义单链RNA基因组和螺旋对称核壳的包膜病毒。冠状病毒的基因组大小为约27至34千碱基。冠状病毒这个名字来源于拉丁语corona，意思是“皇冠”或“光环”，其是指病毒颗粒的特征外观：它们的边缘让人联想到皇冠或日冕。
[0005]专利技术概述
[0006]本公开内容的某些方面一般地涉及用于测定病毒例如冠状病毒的系统和方法。在一些情况下，本公开内容的主题涉及相互关联的产品、特定问题的替代解决方案和/或一个或更多个系统和/或制品的多种不同用途。
[0007]在一组实施方案中，该方法包括在水性多相分配系统中分配包含病毒和游离核酸的生物流体，以及在分配系统内测定病毒。在一些情况下，至少95％的游离核酸分配在分配系统的第一相中。
[0008]在另一组实施方案中，该方法包括在水性多相分配系统中分配包含病毒和游离核酸的生物流体，移出第一相的等分试样，以及对等分试样内的游离核酸进行测序。在一些情况下，至少95％的游离核酸分配在分配系统的第一相中。
[0009]在另一个方面中，本公开内容包括制造本文所述的一个或更多个实施方案的方法。在又一个方面中，本公开内容包括使用本文描述的一个或更多个实施方案的方法。
[0010]当结合附图考虑时，本公开内容的其他优点和新的特征将从以下对本公开内容的多种非限制性实施方案的详细描述中变得显而易见。
[0011]附图简述
[0012]将参考附图以示例的方式描述本公开内容的一些非限制性实施方案，这些附图是示意性的并且不旨在按比例绘制。在图中，所示出的每个相同或几乎相同的组件通常由单一附图标记表示。为清楚起见，在不需要图示以使得本领域普通技术人员能够理解本公开内容的情况下，并非在每幅图中都标记了每个组件，也没有示出本公开内容的每个实施方案的每个组件。在图中：
[0013]图1示出了根据某些实施方案的用于测定病毒的示例性装置；
[0014]图2示出了在一个实施方案中用于不同病毒的分配系统的一个实例。
[0015]图3示出了在另一个实施方案中对两种不同的病毒进行不同地分配的分配系统的另一个实例。
[0016]图4示出了在又一个实施方案中的分配系统的另一个实例，在该分配系统中相并非全部基本上均匀分布；以及
[0017]图5示出了在又一个实施方案中将核酸分配至一个相的分配系统的又一个实例。
[0018]专利技术详述
[0019]本公开内容的某些方面一般地涉及用于测定病毒例如冠状病毒的系统和方法。例如，一些方面涉及使用分配系统来测定病毒的系统和方法。在该分配系统内，游离RNA或其他核酸可以优先分配至一个相中，而完整的病毒可以存在于另一个相或同时存在于两个相中。因此，在一些情况下，例如与病毒内存在的完整的RNA或其他核酸相比，可以优先移出游离的RNA或其他核酸。在一些情况下，可以测定包含完整病毒的相以测定例如来自对象的样品的感染性。这可用于例如将能够传播感染的对象与不具有感染性的对象区分开。
[0020]本公开内容的一个方面涉及在生物样品中检测完整病毒颗粒，所述生物样品包含所述完整病毒颗粒、可被分子检测系统(例如RT
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PCR)识别为属于病毒的其他病毒组分例如RNA(或其他核酸)、以及不被分子检测系统识别为属于所述病毒的其他生物或非生物组分的混合物。一些实施方案包括用于使用相同分子检测系统区分完整病毒颗粒和病毒组分的阳性分子检测的技术。这可以提供用于测定能够进一步感染的样品和不能进一步感染的样品，这可以例如可用于在临床上将能够传播感染的患者与患病但相反地没有感染性的患者分离。
[0021]某些实施方案依赖于完整病毒颗粒与相同病毒的其他组分(例如RNA)的空间分离。虽然完整病毒颗粒可以在分配系统(例如水性多相分配系统)的水相之间分配，但游离核酸(例如RNA)(例如，不包含在病毒中)可以优先分配至一个相，例如主要是由于它们的净负电荷。水性多相分配系统可以包括两个相或更多个相，例如如本文所讨论的。在一些情况下，如果样品包含来自死亡病毒的游离RNA和能够进一步感染的完整功能性病毒体二者，则可以通过对其中基本上不存在游离RNA的相进行简单的分子测试来检测该样品。如果在该相发现RNA，则它可以有助于测定样品中完整的功能性病毒体的存在。
[0022]在一些实施方案中，可能不需要测定或以其他方式定量使用水性多相分配系统的分配系数。例如，分配系统本身可以能够例如通过优先将游离RNA分配至分配系统的一个相中而将游离RNA(例如，从死亡或受损病毒中释放的)与完整的功能性病毒颗粒分离。然后可以分析基本上不含RNA的其他相，例如以测定病毒颗粒的存在。当然，应当理解，在另一些实施方案中，可以测定游离RNA和/或病毒颗粒的分配系数，例如如本文所述。
[0023]在一组实施方案中，完整病毒可以分布到两个相。然而，在另一些实施方案中，完整病毒可以选择性地或优先地分配例如至分配系统的相之一。例如，在分配系统的每个相中可以存在至少20％、至少30％、至少40％或至少50％的病毒。另外，在一些实施方案中，游离RNA(或其他核酸)可以优先分配至分配系统的相之一。例如，分配系统内游离核酸分子的至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％等的游离RNA(或其他核酸)可以存在于一个相中。
[0024]在某些实施方案中，对分配系统的一个(或更多个)相的测定可用于测定核酸的存在。这样的测定的实例包括但不限于RT/PCR或本领域普通技术人员已知的其他测序技术。
可以使用的测序和其他测定技术包括本文所述的那些中的任一种。在一些实施方案中，可移出分配系统的相的等分试样以用于分析，但是在另一些实施方案中，可在分配系统本身内原位测定相，即不需要移出分配系统的相的等分试样并使用它们进行分析。
[0025]在本公开内容的一些方面中，描述了用于测定病毒的系统和方法。可以测定的病毒的实例包括但不限于冠状病毒、流感病毒或其他病毒，例如本文所述的那些。在一组实施方案中，使用了分配系统，例如水性多相分配系统。可以对例如取自对象的生物流体的样品进行分析以测定是否本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.方法，其包括：在水性多相分配系统中分配包含病毒和游离核酸的生物流体，其中至少95％的所述游离核酸分配在所述分配系统的第一相中；以及在所述分配系统内测定所述病毒。2.权利要求1所述的方法，其包括测定所述分配系统的第二相中的病毒。3.权利要求1或2中任一项所述的方法，其中测定所述病毒包括原位测定所述分配系统内的病毒。4.权利要求1至3中任一项所述的方法，其中测定所述病毒包括从所述分配系统中移出等分试样以及测定所述等分试样中的病毒。5.权利要求1至4中任一项所述的方法，其包括使用包含信号传导部分和病毒结合部分的试剂来测定所述病毒。6.权利要求5所述的方法，其中所述病毒结合部分包含抗体。7.权利要求5或6中任一项所述的方法，其中所述信号传导部分包含金纳米颗粒。8.权利要求7所述的方法，其中所述金纳米颗粒包含病毒结合部分。9.权利要求1至8中任一项所述的方法，其包括在所述分配系统内通过比色法测定所述病毒。10.权利要求1至9中任一项所述的方法，其还包括从所述病毒中释放核酸。11.权利要求1至10中任一项所述的方法，其中至少99％的所述游离核酸分配在所述分配系统的第一相中。12.权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述游离核酸来自所述病毒。13.权利要求1至12中任一项所述的方法，其还包括测定所述分配系统内的游离核酸。14.权利要求13所述的方法，其还包括测定所述分配系统的第一相内的游离核酸。15.权利要求13或14中任一项所述的方法，其中测定所述游离核酸包括对所述游离核酸进行测序。16.权利要求15所述的方法，其包括使用PCR对所述游离核酸进行测序。17.权利要求13至16中任一项所述的方法，其中测定所述游离核酸包括测定所述游离核酸的浓度。18.权利要求17所述的方法，其包括测定所述分配系统的第一相中所述游离核酸的浓度。19.权利要求13至18中任一项所述的方法，其中测定所述游离核酸包括原位测定所述分配系统内的游离核酸。20.权利要求13至19中任一项所述的方法，其中测定所述游离核酸包括从所述分配系统中移出等分试样以及测定所述等分试样中的游离核酸。21.权利要求1至20中任一项所述的方法，其中所述分配步骤发生在少于15分钟内。22.权利要求1至21中任一项所述的方法，其中所述分配步骤发生在少于5分钟内。23.权利要求1至22中任一项所述的方法，其中所述生物流体来自怀疑感染了病毒的对象。24.权利要求1至23中任一项所述的方法，其中所述生物流体是血液。25.权利要求1至23中任一项所述的方法，其中所述生物流体是唾液。
26.权利要求1至23中任一项所述的方法，其中所述生物流体是鼻液。27.权利要求1至26中任一项所述的方法，其中所述对象是人。28.权利要求1至27中任一项所述的方法，其中所述病毒是冠状病毒。29.权利要求28所述的方法，其中所述冠状病毒是COVID
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19。30.权利要求1至29中任一项所述的方法，其中所述分配系统由两个相组成。...

【专利技术属性】
技术研发人员：阿尔农，
申请(专利权)人：安纳利扎有限公司，
类型：发明
国别省市：