本发明专利技术公开了一种ZMIZ1基因突变序列,属于基因工程技术领域。该ZMIZ1基因突变序列与野生型的ZMIZ1基因序列相比,为c.910G>C突变,该突变位点属于全球首次发现,也是我国第一例ZMIZ1基因突变。本发明专利技术提供的ZMIZ1致病新突变,具有可用于基因突变检测、早期产前基因突变筛查的优点。本发明专利技术通过对一个NEDDFSA病患者家系进行全外显子测序发现新的ZMIZ1基因杂合突变c.910G>C,该突变位于11号外显子区域,该突变导致氨基酸发生错义变异(p.A304P)。其为新发突变,只在先证者身上发现,先证者亲生父母身上未发现,该突变与NEDDFSA病有关,该病的遗传模式为常染色体显性遗传。的遗传模式为常染色体显性遗传。的遗传模式为常染色体显性遗传。
【技术实现步骤摘要】
一种ZMIZ1基因突变序列
[0001]本专利技术属于基因工程
,具体涉及一种ZMIZ1基因突变序列。
技术介绍
[0002]神经发育障碍
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面部畸形
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远端骨骼异常(NEDDFSA)是一种表型高度可变的全身性神经发育障碍。患者通常表现为喂养困难、全面发育不良和婴儿期起病的肌张力低下,其次表现为轻度运动发育迟缓、语言学习困难和行为异常。智力发育从严重的失语到轻度的能上特殊学校不等。常见的特征包括眼部明显异常的容貌畸形,关节过度活动,以及轻微的手部和脚部骨骼异常。
[0003]Carapito等(2019)通过跨大西洋的合作努力首次报道了17例有类似的神经发育障碍的患者,其中14例无亲缘关系,3例为有亲缘关系的同胞。共享了经基因分析发现有ZMIZ1基因变异的患者信息。几乎所有的患者都有明显的颅面异常,包括面部肌张力低下、面中部发育不全、眼睛突出或深陷、眼距过宽等特征。约一半的患者出现关节过度活动,甚至有某种类型的手或足畸形。许多患者有其他轻微的先天性心脏或泌尿生殖统畸形。我国目前还未有报道ZMIZ1基因变异导致的NEDDFSA。
技术实现思路
[0004]为了解决现有技术存在的上述问题,本专利技术目的在于提供一种ZMIZ1基因突变序列。
[0005]本专利技术所采用的技术方案为:一种ZMIZ1基因突变序列,所述ZMIZ1基因突变序列与野生型的ZMIZ1基因序列相比,其突变为c.910G>C突变,其核苷酸序列如SEQ NO.1所示。<br/>[0006]上述ZMIZ1基因突变序列的检测方法包括如下步骤:
[0007]1)提取离体样本基因组DNA,构建基因组文库,全外显子组探针捕获与富集,对富集的文库进行质量控制,并测序;
[0008]2)对测序数据经严格质量控制,确定合格之后进行序列比对;
[0009]3)之后进行变异位点检测;
[0010]4)检测后采用标准的Sanger测序方法进行验证。
[0011]该ZMIZ1基因突变序列还可以在检测或辅助检测神经发育障碍
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面部畸形
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远端骨骼异常中非诊断目的的应用。
[0012]该ZMIZ1基因突变序列还可以在制备检测或辅助检测神经发育障碍
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面部畸形
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远端骨骼异常试剂盒中的应用。
[0013]本专利技术的有益效果为:
[0014]本专利技术提供了一种ZMIZ1基因突变序列,该序列ZMIZ1基因突变序列与野生型的ZMIZ1基因序列相比,其突变为c.910G>C突变,该突变位点属于全球首次发现,这也是我国第一例ZMIZ1基因突变。
[0015]本专利技术提供的该ZMIZ1致病的新突变,具有可用于基因突变检测、早期产前基因突
变筛查的优点。
[0016]本专利技术通过对一个NEDDFSA病患者一家三口(先证者及其父母)进行了全外显子测序发现了新的ZMIZ1基因杂合突变c.910G>C位于11号外显子区域,该突变导致氨基酸发生错义变异(p.A304P)。该突变属于新发突变,只在先证者身上发现,在先证者的亲生父母身上并没有发现,该突变与NEDDFSA病有关,该病的遗传模式为常染色体显性遗传。
附图说明
[0017]图1为实施例家系图;
[0018]图2为实施例先证者家系中先证者ZMIZ1基因c.910G>C位点Sanger测序峰图;
[0019]图3为实施例先证者家系中先证者母亲ZMIZ1基因c.910G>C位点Sanger测序峰图;
[0020]图4为实施例先证者家系中先证者父亲ZMIZ1基因c.910G>C位点Sanger测序峰图。
具体实施方式
[0021]下面结合具体实施例对本专利技术做进一步阐释。本领域技术人员将会理解,下列所描述的实施例是本专利技术一部分实施例,而不是全部的实施例,仅用于说明本专利技术,而不应视为限制本专利技术的范围。所用试剂均为可以通过市售购买获得的常规产品。
[0022]本研究中,专利技术人对来自NEDDFSA患者的家庭三个人进行了全外显子测序,在国际上首次发现一种ZMIZ1基因致病性变异。
[0023]本专利技术的目的在于公开了一种ZMIZ1基因突变序列,其核苷酸序列如SEQ NO.1所示;ZMIZ1基因野生型核苷酸序列如SEQ NO.2所示。
[0024][0025][0026][0027][0028][0029]ZMIZ1(Zinc finger MIZ
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type containing 1),又称为ZIMP10,是一种包括MIZ域(一个核定位信号序列和两个富含脯氨酸的区域)的STAT蛋白抑制剂(PIAS)相关蛋白。ZMIZ1被证明是一种转录激活因子,编码PIAS家族蛋白。ZMIZ1中特有的锌指蛋白结构域、核定位信号序列(NLS)和富脯氨酸区域(Pro Rich)能调节多种转录因子的转录活性,同时能使蛋白间相互作用加强,促进蛋白SUMO(small ubiquitin related modifier)化,参与黑色素细胞的发育。除此重要作用外,ZMIZ1还能调节TGF
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β/SMAD的信号传导,对免疫系统具有一定的抑制作用。2019年,Carapito研究首次发现ZMIZ1基因突变与神经发育障碍
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面部畸形
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远端骨骼异常(NEDDFSA)有关。
[0030]本专利技术通过对一个NEDDFSA病患者一家三口(先证者及其父母)进行了全外显子测序发现了新的ZMIZ1基因杂合突变c.910G>C位于11号外显子区域,该突变导致氨基酸发生错义变异(p.A304P)。该突变属于新发突变,只在先证者身上发现,在先证者的亲生父母身上并没有发现,该突变与NEDDFSA病有关,该病的遗传模式为常染色体显性遗传。
[0031]根据ACMG指南,患者属于新发变异,且无家族史(满足PS2);该变异在gnomAD数据库东亚对照人群中未发现(满足PM2_Supporting);多种统计方法预测出该变异会对基因或基因产物造成有害的影响(满足PP3),最终确定该变异为可能致病性变异。
[0032]实施例
[0033]为使本专利技术的技术方案便于理解,以下结合具体试验例对本专利技术一种ZMIZ1基因突变序列作进一步的说明。
[0034](1)样本来源:
[0035]在中国四川省一个NEDDFSA病患者一家三口(先证者及其父母),先证者因为关节挛缩就诊于北京市积水潭医院。父母完全健康,且无家族史(图1,表1)。该研究通过了伦理委员会的审查,并且所有步骤都遵循赫尔辛基宣言原则的指导。在受检者充分知情同意后对所有参与者进行静脉血样本采集,使用标准方法提取他们的外周血基因组DNA,进行全外显子测序,测序结果进一步通过sanger测序进行确认。
[003本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种ZMIZ1基因突变序列,其特征在于,所述ZMIZ1基因突变序列与野生型的ZMIZ1基因序列...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨征,徐云峰,吴文立,于超计,冯超,张骥,李闪,魏星,
申请(专利权)人:北京华诺奥美基因生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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