检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用制造技术

本发明专利技术公开了检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用，涉及生物医学诊断技术领域，应用中的所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190

【技术实现步骤摘要】
检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用


[0001]本专利技术涉及生物医学诊断
，具体而言，涉及检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用。

技术介绍

[0002]肺鳞状细胞癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一。全球每年有超40万人死于肺鳞状细胞癌及其并发症。由于肺癌的发病机制上不明确，且病早期肺癌一般没有明显症状，许多患者失去了临床治疗的最佳时机。另外，肺鳞状细胞癌的总体预后较差，在采取手术治疗和其他疗法后，患者的5年生存率也只有16％左右。
[0003]靶向治疗药物的研究在多个癌症当中取得突破性进展。由于肺鳞状细胞癌在基因层面的编码区缺乏可操作的驱动因素，针对肺鳞状细胞癌的靶向治疗迄今没能成功。为了探索导致LUSC发病机制的编码和非编码基因组事件的全部，我们在109例原发性肺鳞癌中进行了靶向测序，包括全外显子组和全启动子组区域。经检测，我发现WDR74基因5
’
端附近的一个约1kb的窗口中存在启动子改变，其中大部分聚集在5
’
侧翼区的起始处，包括单核苷酸变异、小的插入和缺失。此外，我们还在231种其他类型的癌症中鉴定了WDR74启动子突变，包括肺腺癌、头颈部鳞状细胞癌、食管鳞状细胞癌、胸腺鳞状细胞癌、宫颈鳞状细胞癌和鼻咽癌，表明在各种癌症中可能存在WDR74启动子突变并驱动致癌作用。此外，Kaplan
‑
Meier分析发现，具有WDR74启动子突变的肺鳞状细胞癌患者具有更差的无进展生存期，并通过联合多变量回归分析进一步证实。
[0004]因此，早期诊断对与癌症的治疗起着关键的作用，开发相关的靶向疗法将有助于战胜肺鳞状细胞癌这一顽疾。
[0005]鉴于此，特提出本专利技术。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的在于提供检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用。
[0007]本专利技术是这样实现的：
[0008]第一方面，本专利技术实施例提供了检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190
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62608191插入突变中的至少一种。
[0009]第二方面，本专利技术实施例提供了一种用于癌症诊断或癌症预后评估的产品，其包括用于检测WDR74启动子突变的试剂，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190
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62608191插入突变中的至少一种。
[0010]第三方面，本专利技术实施例提供了一种用于癌症诊断或癌症预后评估的装置，其包
括获取模块和预测模块。获取模块，用于获取样本WDR74启动子突变的检测结果，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190
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62608191插入突变中的至少一种；预测模块，用于根据所述检测结果，获得样本癌症诊断或癌症预后评估的预测结果。
[0011]第四方面，本专利技术实施例提供了一种电子设备，其包括处理器和存储器；所述存储器用于存储程序，当所述程序被所述处理器执行时，使得所述处理器实现以下方法：获取样本WDR74启动子突变的检测结果；根据所述检测结果，获得样本癌症诊断或癌症预后评估的预测结果。
[0012]第五方面，本专利技术实施例提供了一种计算机可读介质，所述计算机可读介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现以下方法：获取样本WDR74启动子突变的检测结果；根据所述检测结果，获得样本癌症诊断或癌症预后评估的预测结果。
[0013]本专利技术具有以下有益效果：
[0014]本专利技术对297例肺鳞状细胞癌样本进行了全启动子基因组测序，发现了一个假定的原癌基因WDR74，它在启动子区域发生了显著突变，启动子区域有多个热点突变。基因表达谱进一步证明WDR74功能性非编码突变可以增加mRNA表达，并在报告基因检测中优先被激活。这些WDR74启动子区域突变的核酸与肺鳞状细胞癌等多种癌症存在密切相关，通过检测这些突变的核酸可以对这些癌症进行发病的预测和预后情况的预估，并指导开展相关的靶向治疗。
附图说明
[0015]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
[0016]图1为在WDR全基因序列中，多种癌症在WDR74启动子区域中突变的强烈富集，条形图总结了其他癌症类型中热点突变的频率；
[0017]图2为Kaplan
‑
Meier分析结果；
[0018]图3为多变量Cox回归分析结果；
[0019]图4为根据是否携带启动子突变，对不同组的肿瘤样品进行差异表达分析的结果；
[0020]图5为WDR74基因的转录物在正常组织样本、野生型肿瘤样品和、启动子突变的肿瘤样本的表达水平；
[0021]图6荧光素酶报告基因分析结果；其中，单个数据点(黑色)与汇总统计箱线图(灰色)重叠，中间值由黑色水平条表示；
[0022]图7为免疫组织化学(IHC)分析结果。
具体实施方式
[0023]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产
品。
[0024]WDR74是一种蛋白编码基因，其功能异常与肺鳞状细胞癌和脑膜癌等多种癌症的发生发展有关。本专利技术对297例肺鳞状细胞癌样本进行了全启动子基因组测序，发现了一个假定的原癌基因WDR74，它在启动子区域发生了显著突变，启动子区域有多个热点突变。基因表达谱进一步证明WDR74功能性非编码突变可以增加mRNA表达，并在报告基因检测中优先被激活。因此，WDR74启动子区域包含的热点突变，在肺鳞状细胞癌等癌症中具有功能性后果，并有助于对于肺鳞状细胞癌新的癌症驱动因素的理解。
[0025]本专利技术实施例提供了检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测WDR74启动子突变的试剂在制备癌症诊断或癌症预后评估的产品中的应用，其特征在于，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190
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62608191插入突变中的至少一种。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述癌症选自肺鳞状细胞癌、肺腺癌、食管鳞状细胞癌、宫颈鳞状细胞癌、头颈鳞状细胞癌、鼻咽癌、胸腺鳞状细胞癌中的任意一种；优选地，所述癌症包括肺鳞状细胞癌。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测WDR74启动子突变的试剂包括：引物对、探针和芯片中的至少一种。4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测WDR74启动子突变的试剂包括：序列如SEQ ID No.1～42中的至少一条引物；优选地，所述产品包括试剂和/或试剂盒。5.一种用于癌症诊断或癌症预后评估的产品，其特征在于，其包括用于检测WDR74启动子突变的试剂，所述WDR74启动子突变包括：chr11:62609212G>A、chr11:62609179A>T、chr11:62609131G>T和chr11:62608190
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62608191插入突变中的至少一种。6.根据权利要求5所述的用于癌症诊断或癌症预后评估的产品，其特征在于，所述癌症选自肺鳞状细胞癌、肺腺癌、食管鳞状细胞癌、宫颈鳞状细胞癌、头颈鳞状细胞癌、鼻咽癌、胸腺鳞状细胞癌中的任意一种；优选地，所述癌症包括肺鳞状细胞癌。7.根据权利要求5所述的用于癌症诊断或癌症预后评估的产品，其特征在于，所述产品包括：引物对、...

【专利技术属性】
技术研发人员：李文斌，钱志荣，江政云，宋朋，吴小璇，
申请(专利权)人：北斗生命科学广州有限公司，
类型：发明
国别省市：