溃疡性结肠炎标志微生物及其应用制造技术

本发明专利技术提出了溃疡性结肠炎标志微生物及其应用，该溃疡性结肠炎标志微生物包括第一微生物集，进一步提出一种试剂盒，包括适于检测第一微生物集中至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)、节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。本发明专利技术提出的微生物相较于健康群体，在溃疡性结肠炎患者群体中显著富集，能够作为健康群体和溃疡性结肠炎患者群体的区分标志，可以作为检测和/或治疗溃疡性结肠炎的标志物。的标志物。

【技术实现步骤摘要】
溃疡性结肠炎标志微生物及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体的，本专利技术涉及溃疡性结肠炎标志微生物及其应用，更具体的，本专利技术涉及一种试剂盒、试剂在制备试剂盒中的用途、用于预防或者治疗溃疡性结肠炎的药物组合物或者食品组合物、确定个体是否患有溃疡性结肠炎的方法、确定个体是否患有溃疡性结肠炎的装置、一种装置、一种筛选药物的方法。

技术介绍

[0002]溃疡性结肠炎是一种病因尚不十分清楚的结肠和直肠慢性非特异性炎症性疾病，病变局限于大肠黏膜及黏膜下层。病变多位于乙状结肠和直肠，也可延伸至降结肠，甚至整个结肠。病程漫长，常反复发作。本病见于任何年龄，但20～30岁最多见。溃疡性结肠炎的病因至今仍不明。基因因素可能具有一定地位。有认为溃疡性结肠炎是一种自身免疫性疾病。
[0003]除少数患者起病急骤外，一般起病缓慢，病情轻重不一。症状以腹泻为主，排出含有血、脓和黏液的粪便，常伴有阵发性结肠痉挛性疼痛，并里急后重，排便后可获缓解。
[0004]诊断上主要依靠纤维结肠镜检，因为90％～95％患者直肠和乙状结肠受累，因此事实上通过纤维乙状结肠镜检已能明确诊断。镜检中可看到充血、水肿的黏膜，脆而易出血。在进展性病例中可看到溃疡，周围有隆起的肉芽组织和水肿的黏膜，貌似息肉样，或可称为假息肉形成。在慢性进展性病例中直肠和乙状结肠腔可明显缩小，为明确病变范围，还是应用纤维结肠镜作全结肠检查，同时作多处活组织检查以便与克隆结肠炎鉴别。
[0005]气钡灌肠双重对比造影也是一项有助诊断的检查，特别有助于确定病变范围和严重程度。在钡灌造影中可见到结肠袋形消失，肠壁不规则，假息肉形成以及肠腔变细、僵直。虽然钡剂灌肠检查是有价值的，但检查时应谨慎，避免肠道清洁准备，因为它可使结肠炎恶化。无腹泻的病例检查前给3天流质饮食即可。有腹部征象的病例忌作钡剂灌肠检查，而应作腹部X线平片观察有无中毒性巨结肠、结肠扩张以及膈下游离气体征象。
[0006]随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为溃疡性结肠炎诊断的方向，对于发现溃疡性结肠炎潜在人群很有优势。有研究表明与溃疡性结肠炎相关的多基因在肠道免疫中起重要作用。到目前为止，还没有溃疡性结肠炎患者肠道微生物标记物的相关报道。

技术实现思路

[0007]本申请是基于专利技术人对以下事实和问题的发现和认识作出的：
[0008]本申请的申请人通过前期大量研究，意外地发现一些微生物可以作为检测溃疡性结肠炎的标志微生物，为早期发现溃疡性结肠炎提供一种非侵入性方法；合理有效地应用标志微生物，扶持肠道有益菌的生长，抑制肠道潜在致病菌，可以治疗或减轻溃疡性结肠炎的临床症状。
[0009]为此，在本专利技术的第一方面，本专利技术提出了一种试剂盒。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒包括适于检测第一微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下
菌种组成：远缘链球菌 (Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp. Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)、节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。本专利技术实施例的标志微生物是专利技术人通过对大量患溃疡性结肠炎个体和大量健康个体的粪便样本中微生物的丰度进行差异比较分析和验证而确定下来的，从而明确了溃疡性结肠炎相关的微生物标志物，根据本专利技术实施的包含检测所述标志微生物中第一微生物集的至少之一菌种的试剂的试剂盒可以非侵入性的在早期发现或辅助检测溃疡性结肠炎，准确确定个体患有溃疡性结肠炎的概率高低或者处于健康状态的概率高低。
[0010]在本专利技术的第二方面，本专利技术提出了试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一微生物集中的至少一种菌种。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒用于诊断溃疡性结肠炎或检测溃疡性结肠炎的治疗效果，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌 (Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp. Soil531)、节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。根据本专利技术具体实施例的试剂制备的试剂盒，可以准确的检测所述第一微生物集中的至少一种菌种，极准确的区分溃疡性结肠炎患者和健康个体，由此，可以有效的在早期进行溃疡性结肠炎诊断，或用于检测治疗过程中溃疡性结肠炎的变化。
[0011]在本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种用于预防或者治疗溃疡性结肠炎的药物组合物或者食品组合物。根据本专利技术的实施例，含有拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5。根据本专利技术实施例的溃疡性结肠炎标志微生物中拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5可以非侵入性的在早期发现或辅助检测溃疡性结肠炎，确定个体患有溃疡性结肠炎的概率高低或者个体处于健康状态的概率高低；同时，提高溃疡性结肠炎高风险人群或已溃疡性结肠炎患者肠道内的所述拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5的含量，可以降低患溃疡性结肠炎的概率或减缓、治愈溃疡性结肠炎，因此，所述包含所述拟杆菌(Bacteroidalesbacterium)H5的药物或者食品组合物能够用于平衡肠道菌群，有效预防或治疗溃疡性结肠炎。
[0012]在本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有溃疡性结肠炎的方法。根据本专利技术的实施例，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5中的至少一种菌种；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有溃疡性结肠炎；其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostocsp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌 (Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)、节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。根据本专利技术实施例的方法可以依据个体的粪便样本中的所述标志微生物中的各种菌种的丰度确定个体是否患有溃疡性结肠炎，所述标志微生物是发本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)和节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5的试剂。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一微生物集中全部所述菌种的试剂。4.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一微生物集中的至少一种菌种，所述试剂盒用于诊断溃疡性结肠炎或者检测溃疡性结肠炎的治疗效果，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)和节杆菌(Arthrobacter sp.Soil736)。5.根据权利要求4所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5。6.一种用于预防或者治疗溃疡性结肠炎的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5。7.一种确定个体是否患有溃疡性结肠炎的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和拟杆菌(Bacteroidales bacterium)H5中的至少一种菌种；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有溃疡性结肠炎；其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：远缘链球菌(Streptococcus sobrinus)、土壤芽孢杆菌(Solibacillus silvestris)、明串珠菌(Leuconostoc sp.DORA_2)、屎肠球菌(Enterococcus faecium)、蓝丝菌(Cyanothece sp.CCY0110)、黄色柄杆菌(Caulobacter sp.Root656)、芽孢杆菌(Bacillus sp.Soil531)和节杆菌(Arthrobacter ...

【专利技术属性】
技术研发人员：王广冬，万佳渭，刘强，
申请(专利权)人：上海锐翌生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：