用于检测生物样品中严重急性呼吸综合征冠状病毒2的存在的方法技术

本发明专利技术涉及一种用于检测生物样品中SARS

【技术实现步骤摘要】
用于检测生物样品中严重急性呼吸综合征冠状病毒2的存在的方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求享有2020年4月29日提交的美国临时专利申请号63/017043和2020年8月10日提交的美国临时专利申请号63/063731的优先权，本申请是2020年9月4日提交的PCT国际专利申请PCT/US20/49394的部分继续申请，PCT国际专利申请PCT/US20/49394要求2019年9月6日提交的美国临时专利申请号62/897057的优先权，它们的公开内容以全文引用的方式并入本文。


[0003]本专利技术总体上涉及用于识别病原微生物的方法。更具体地，本专利技术涉及，例如，用于经由特定RNA序列的基于核酸序列的扩增(NASBA)在生物样品中实时识别病原微生物和/或其抗生素抗性的方法。

技术介绍

[0004]导致Covid 19的新型冠状病毒(SARS
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CoV
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2)是全球感染的原因，并且目前被分类为流行病。虽然Covid 19发病率和死亡率的完全范围可能永远无人知晓，但是目前被估计为在全世界有数百万。由于无症状病毒携带者不知不觉地扩散病毒极为普遍，因此降低SARS
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2病毒扩散的一个重要工具是快速且可靠的检测。虽然存在一些现有的检测，但这些可能需要数天来提供结果。这种在结果方面的长延迟能够允许发生另外的感染。
[0005]因此，仍然需要快速且灵敏的方法，优选地需要最少的或不需要样品制备，用于检测病原体相关分析物的存在，以识别SARS
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2和随后诊断Covid
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19。

技术实现思路

[0006]通过本专利技术，在很大程度上满足上述需要，其中提供了裂解溶液和Covid
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19检测系统的各方面。
[0007]本公开的一个方面涉及一种用于检测生物样品中严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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2)的存在的方法，所述方法包括以下步骤：将所述生物样品进行裂解以形成裂解物；通过在正向引物、反向引物和分子信标存在的情况下对裂解物中的靶核酸序列进行基于核酸序列(NASBA)的扩增来生成扩增裂解物。所述正向引物具有选自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:17组成的组的寡核苷酸序列。所述反向引物具有选自由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:18组成的组的寡核苷酸序列。所述分子信标具有选自由SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:19组成的组的寡核苷酸序列和荧光团。扩增裂解物暴露于激发源。检测暴露于激发源的扩增裂解物中荧光团的荧光。响应于检测荧光团的荧光，确定SARS
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2是否存在于所述生物样品中。
[0008]因此已经相当广泛地概述了本专利技术的某些实施例，以便可以更好地理解本专利技术中
的详细描述，并且可以更好地理解对本领域的当前贡献。当然，本专利技术的其他实施例将在下面描述并且将形成所附权利要求的主题。
[0009]在这方面，在详细解释本专利技术的至少一个实施例之前，应当理解，本专利技术在其应用中不限于在以下描述中阐述或在附图中示出的构造细节和部件布置。除了所描述的那些实施例之外，本专利技术还能够有其他实施例，并且能够以各种方式实践和执行。此外，应当理解的是，本申请所采用的措辞和术语以及摘要是为了描述的目的，而不应被认为是限制性的。
[0010]因此，本领域技术人员将理解，本申请所基于的概念可以容易地用作设计用于实现本专利技术的若干目的的其他结构、方法和系统的基础。因此，重要的是，权利要求被认为包括这样的等同构造，只要它们不脱离本专利技术的精神和范围。
附图说明
[0011]为了可以容易地理解本专利技术，通过附图中的示例的方式示出了本专利技术的各方面；然而，本专利技术的主题不限于所公开的方面。
[0012]图1示出了根据本专利技术的方面的示意性感染检测系统。
[0013]参照附图描述根据本专利技术的方面的感染检测系统的特征，其中相同的附图标记始终表示相同的部分。
具体实施方式
[0014]本公开的一个方面涉及一种用于检测生物样品中严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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2)的存在的方法，所述方法包括以下步骤：将所述生物样品进行裂解以形成裂解物；通过在正向引物、反向引物和分子信标存在的情况下对裂解物中的靶核酸序列进行基于核酸序列(NASBA)的扩增来生成扩增裂解物。所述正向引物具有选自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:17组成的组的寡核苷酸序列。所述反向引物具有选自由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:18组成的组的寡核苷酸序列。所述分子信标具有选自由SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:19组成的组的寡核苷酸序列和荧光团。扩增裂解物暴露于激发源。检测暴露于激发源的扩增裂解物中荧光团的荧光。响应于检测荧光团的荧光，确定SARS
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2是否存在于所述生物样品中。
[0015]图1示出了根据本专利技术的方面的示例性SARS
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2感染检测系统10的示意图。SARS
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2感染检测系统被配置成处理样品并确定所述样品是否含有一个或多个预定病原体。根据本专利技术的实施方式的SARS
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2感染检测系统包括采样装置20、裂解室30、过滤器40、计量器50、基于核酸序列的(NASBA)流体网络60和仪器70。SARS
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2感染检测系统还包括样品处理器80，诸如盒，其至少包括NASBA流体网络并且可以包括裂解室、过滤器和计量器中的任一个或全部。所述样本处理器配置为连接到所述采样装置且接收及处理包含于所述采样装置内的样本。样品处理器可以是一次性的和可替换的，并且可以适于使用至少一个NASBA测定处理所收集的样品。SARS
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2感染检测系统可迅速例如在一小时、30分钟或更短时间内处理样品并确定样品是否含有一个或多个预定病原体。SARS
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2感染检测系统可以在护理点(例如在与患者相同的建筑物、房间等内)处本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测生物样品中严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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2)的存在的方法，所述方法包括：将所述生物样品进行裂解以形成裂解物；通过在正向引物、反向引物和分子信标存在的情况下对裂解物中的靶核酸序列进行基于核酸序列(NASBA)的扩增来生成扩增裂解物，其中，所述正向引物具有选自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:17组成的组的寡核苷酸序列；所述反向引物具有选自由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:18组成的组的寡核苷酸序列；所述分子信标具有选自由SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:19组成的组的寡核苷酸序列和荧光团；将扩增裂解物暴露于激发源；检测暴露于激发源的扩增裂解物中荧光团的荧光；响应于检测荧光团的荧光，确定SARS
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2是否存在于所述生物样品中。2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述正向引物具有由SEQ ID NO:1组成的寡核苷酸序列，所述反向引物具有由SEQ ID NO:2组成的寡核苷酸序列，并且所述分子信标具有由SEQ ID NO:3组成的寡核苷酸序列。3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述正向引物具有由SEQ ID NO:5组成的寡核苷酸序列，所述反向引物具有由SEQ ID NO:6组成的寡核苷酸序列，并且所述分子信标具有由SEQ ID NO:7组成的寡核苷酸序列。4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述正向引物具有由SEQ ID NO:9组成的寡核苷酸序列，所述反向引物具有由SEQ ID NO:10组成的寡核苷酸序列，并且所述分子信标具有由SEQ ID NO:11组成的寡核苷酸序列。5.根据权利要求1所述的方法，其中，所述正向引物具有由SEQ ID NO:13组成的寡核苷酸序列，所述反向引...

【专利技术属性】
技术研发人员：迈克尔，
申请(专利权)人：泰利福医疗公司，
类型：发明
国别省市：