抗稻瘟病基因的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种抗稻瘟病基因的分子标记，其为选自包含用于筛选抗稻瘟病基因Pi

【技术实现步骤摘要】
抗稻瘟病基因的分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于基因检测领域，具体涉及一种抗稻瘟病基因的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的粮食作物之一，世界上超过一半的人口以稻米为食。在中国，水稻种植约占全国耕地面积的25％，产量约占全国粮食总产量的50％，水稻是我国粮食安全和农业可持续发展的重要战略资源。稻瘟病是一种世界性的水稻病害，由稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)引起，稻瘟病既降低水稻的产量，同时也降低水稻的品质，稻瘟病严重危害水稻的产量和品质。
[0003]选育抗稻瘟病水稻品种是控制稻瘟病的有效途径。空育131和龙粳31是黑龙江水稻主栽品种，但是种植时间长了后，水稻的抗稻瘟病能力有所下降。为了提高空育131和龙粳31对稻瘟病的抗性，解决农业生产中对种质的需求，保证水稻的高产和稳产，需要对空育131和龙粳31进行品种改良以提高他们抗稻瘟病的能力。

技术实现思路

[0004]我们通过杂交方法将抗稻瘟病基因导入到空育131和龙粳31，利用与水稻抗稻瘟病基因连锁的分子标记筛选含有Pi
‑
I、Pi
‑
b、Pi
‑
zt、Pi
‑
z、Pi
‑
kp、Pi
‑
km和Pi
‑
a等7个抗稻瘟病基因的个体，通过多代的杂交及回交，最终得到抗稻瘟病的空育131和龙粳31。上述研究的成果构成了本专利技术的基础。具体而言，本专利技术包括如下技术方案。
[0005]一种抗稻瘟病基因的分子标记，其为选自包含用于筛选抗稻瘟病基因Pi
‑
i、Pi
‑
b、Pi
‑
zt、Pi
‑
z、Pi
‑
kp、Pi
‑
km和Pi
‑
a的基因panel的SNP(Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性)位点序列配对。具体而言，其为选自如下基因panel的SNP位点序列配对：
[0006]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
I的SNP序列SEQ ID NO:1/SEQ ID NO:2，本文中命名为“S0313_2k”；或者SEQ ID NO:3/SEQ ID NO:4，本文中命名为“S1879_4k”；
[0007]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
b的SNP序列SEQ ID NO:5/SEQ ID NO:6，本文中命名为“S0380_300R”；或者SEQ ID NO:7/SEQ ID NO:8，本文中命名为“S1899
‑
1k”；
[0008]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
zt的SNP序列SEQ ID NO:9/SEQ ID NO:10，本文中命名为“Pizt
‑
shy
‑
3”；或者SEQ ID NO:11/SEQ ID NO:12，本文中命名为“S0268_2”；
[0009]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
z的SNP序列SEQ ID NO:13/SEQ ID NO:14，本文中命名为“Piz
‑
shy
‑
1”；或者SEQ ID NO:15/SEQ ID NO:16，本文中命名为“Piz
‑
xy
‑
2”；
[0010]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
kp的SNP序列SEQ ID NO:17/SEQ ID NO:18，本文中命名为“Pik
‑
shy
‑
4”；或者SEQ ID NO:19/SEQ ID NO:20，本文中命名为“S0712_6k”；
[0011]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
km的SNP序列SEQ ID NO:21/SEQ ID NO:22，本文中命名为“Pik
‑
xy
‑
2”；
[0012]判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
a的SNP序列SEQ ID NO:23/SEQ ID NO:24，本文中命名为“Pia
‑
shy
‑
1”；或者SEQ ID NO:25/SEQ ID NO:26，本文中命名为“S0346_8k”。
[0013]当以水稻基因组DNA为模板，进行PCR扩增所述分子标记时，使用的引物对分别为：
[0014]扩增SNP序列SEQ ID NO:1/SEQ ID NO:2即“S0313_2k”的正/反向引物SEQ ID NO:27/SEQ ID NO:28(S0313_2k_F、S0313_2k_R)；
[0015]扩增SNP序列SEQ ID NO:3/SEQ ID NO:4即“S1879_4k”的正/反向引物SEQ ID NO:29/SEQ ID NO:30(S1879_4k_F、S1879_4k_R)；
[0016]扩增SNP序列SEQ ID NO:5/SEQ ID NO:6即“S0380_300R”的正/反向引物SEQ ID NO:31/SEQ ID NO:32(S0380_300R_F、S0380_300R_R)；
[0017]扩增SNP序列SEQ ID NO:7/SEQ ID NO:8即“S1899
‑
1k_F”的正/反向引物SEQ ID NO:33/SEQ ID NO:34(S1899
‑
1k_F、S1899
‑
1k_R)；
[0018]扩增SNP序列SEQ ID NO:9/SEQ ID NO:10即“Pizt
‑
shy
‑
3”的正/反向引物SEQ ID NO:35/SEQ ID NO:36(Pizt
‑
shy
‑
3_F、Pizt
‑
shy
‑
3_R)；
[0019]扩增SNP序列SEQ ID NO:11/SEQ ID NO:12即“S0268_2”的正/反向引物SEQ ID NO:37/SEQ ID NO:38(S0268_2_F、S0268_2_R)；
[0020]扩增SNP序列SEQ ID NO:13/SEQ ID NO:14即“Piz
‑
shy
‑
1”的正/反向引物SEQ ID NO:39/SEQ ID NO:40(Piz
‑
shy
‑
1、Piz
‑
shy
‑
1_R)；
[0021]扩增SNP序列SEQ ID NO:15/SEQ ID NO:16即“Piz
‑
xy
‑
2”的正/反向引物SEQ ID NO:41/SEQ I本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种抗稻瘟病基因的分子标记，其为选自如下基因panel的SNP位点序列配对：判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
i的SNP序列SEQ ID NO:1/SEQ ID NO:2；或者SEQ ID NO:3/SEQ ID NO:4；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
b的SNP序列SEQ ID NO:5/SEQ ID NO:6；或者SEQ ID NO:7/SEQ ID NO:8；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
zt的SNP序列SEQ ID NO:9/SEQ ID NO:10；或者SEQ ID NO:11/SEQ ID NO:12；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
z的SNP序列SEQ ID NO:13/SEQ ID NO:14；或者SEQ ID NO:15/SEQ ID NO:16；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
kp的SNP序列SEQ ID NO:17/SEQ ID NO:18；或者SEQ ID NO:19/SEQ ID NO:20；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
km的SNP序列SEQ ID NO:21/SEQ ID NO:22；判断无/有抗稻瘟病基因Pi
‑
a的SNP序列SEQ ID NO:23/SEQ ID NO:24；或者SEQ ID NO:25/SEQ ID NO:26。2.如权利要求1所述的分子标记，其特征在于，以水稻基因组DNA为模板，进行PCR扩增所述分子标记时，使用的引物对分别为：扩增SNP序列SEQ ID NO:1/SEQ ID NO:2的正/反向引物SEQ ID NO:27/SEQ ID NO:28；扩增SNP序列SEQ ID NO:3/SEQ ID NO:4的正/反向引物SEQ ID NO:29/SEQ ID NO:30；扩增SNP序列SEQ ID NO:5/SEQ ID NO:6的正/反向引物SEQ ID NO:31/SEQ ID NO:32；扩增SNP序列SEQ ID NO:7/SEQ ID NO:8的正/反向引物SEQ ID NO:33/SEQ ID NO:34；扩增SNP序列SEQ ID NO:9/SEQ ID NO:10的正/反向引物SEQ ID NO:35/SEQ ID NO:36；扩增SNP序列SEQ ID NO:11/SEQ ID NO:12的正/反向引物SEQ ID NO:...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩斌，刘晓辉，王子轩，张弛，冯旗，翁崎峻，
申请(专利权)人：中国科学院分子植物科学卓越创新中心，
类型：发明
国别省市：