一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用制造技术

本发明专利技术公开了一个小麦籽粒长度相关的KASP分子标记的应用。本发明专利技术所保护的一个技术方案是检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在制备鉴定或辅助鉴定籽粒长度产品中的应用。可将检测QTLqGL3B.1位点多态性和基因型的组合物与其它物质(如检测其它与小麦籽粒长度相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备高通量鉴定长粒小麦品种产品。一起制备高通量鉴定长粒小麦品种产品。一起制备高通量鉴定长粒小麦品种产品。

【技术实现步骤摘要】
一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用


[0001]本专利技术涉及KASP分子标记的应用，特别涉及一种与小麦籽粒长度相关的KASP分子标记与应用。

技术介绍

[0002]小麦作为全球重要的粮食作物，为人类消耗提供了约五分之一的卡路里。但是，随着人口的不断增长与耕地面积的逐渐减小之间的矛盾加剧，加之全球变暖带来的极端气候现象频发，严重制约了小麦的生产。因此，提高小麦产量是保障全球粮食和营养安全的一项紧迫任务。
[0003]小麦产量主要由粒重、穗粒数和单位面积的穗数构成。小麦粒重主要由籽粒大小决定，而小麦籽粒大小又可以进一步分解为粒长、粒宽、粒厚等构成要素。小麦粒重主要受加性效应控制，遗传力高达59
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92％，是受多基因控制的数量性状。研究表明，小麦粒长、粒宽与粒重呈极显著正相关。小麦粒长主要在籽粒发育前期形成，受环境影响较小。因此，挖掘小麦粒长相关QTL，并开发与其紧密连锁的分子标记对于增加小麦粒长、提高小麦产量具有重要意义，也是小麦育种的重要目标之一。
[0004]分子标记辅助选择(marker assisted selection MAS)是基于基因型的选择，不受外界环境因素的影响，被越来越广泛地应用于育种实践中。常用的分子标记类型有RFLP、AFLP、 DArT、SSR等，但这些标记类型检测周期长、步骤繁琐、成本高，不易对育种后代材料进行大规模筛选。KASP(Kompetitive Allele
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Specific PCR)标记，即竞争性等位基因特异性 PCR，是近年前发展起来的标记类型，它根据目标等位基因中包含的特定SNP(单碱基核苷酸多态性)或InDels(插入/缺失)设计引物，利用在引物末端加入不同的荧光集团，基于 PCR终端荧光信号的读取判断对目标序列进行分型，具有准确性高、操作简单、鉴定高效、成本低的优点，并且能够实现高通量分析，极大地加快了分子标记辅助选择的进程，在作物育种中有着广阔的应用前景。因此，开发用于鉴定小麦多环境下增加籽粒长度的KASP标记，将为培育高产小麦品种提供有效的检测手段，对于确保小麦高产、稳产以及国家粮食安全和农业可持续发展具有十分重要的战略意义。

技术实现思路

[0005]本专利技术所要解决的一个技术问题是如何高通量鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度。
[0006]为了解决上述技术问题，本专利技术提供了下述A1
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A3的任一种应用、A4的方法：
[0007]A1、检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个 SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述 PCR引物，所述PCR引物为P1或P2：
[0008]P1、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的第22
‑
43位单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的第22
‑
43位的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的的单链DNA组成的
引物组；
[0009]P2、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA、核苷酸序列是SEQ IDNo.3的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组。
[0010]A2、检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在制备鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
[0011]A3、检测小麦基因组中所述QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在小麦育种中的应用或在制备小麦育种产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
[0012]所述育种的目的包括选育长粒小麦。
[0013]A4、鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的方法，包括检测待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度；所述基因型为小麦基因组中所述QTL qGL3B.1 位点的基因型；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为 G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述检测利用PCR引物进行，所述PCR引物为上述P1或上述P2。
[0014]本专利技术所要解决的另一个技术问题是如何进行小麦育种。
[0015]为了解决上述技术问题，本专利技术提供了下述技术方案：
[0016]B1、A4所述的方法在小麦育种中的应用。
[0017]所述育种的目的包括选育长粒小麦。
[0018]B2、小麦育种的方法，包括：检测小麦基因组A1所述QTLqGL3B.1的多态性，选择小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A的纯合型的小麦作为亲本进行育种。
[0019]所述育种的目的包括选育长粒小麦。
[0020]下述含有检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物的1)
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3)中任一种产品也属于本专利技术的保护范围：
[0021]4)检测与小麦籽粒长度相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
[0022]5)鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的产品；
[0023]6)用于小麦育种的产品。
[0024]上述应用、方法和产品中，所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸。所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型(即等位基因)具体可为检测QTLqGL3B.1位点的核苷酸种类。小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的基因型可为GG、AA或AG。所述GG是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为G的纯合型，所述AA是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A的纯合型，所述AG是小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点为A和G的杂合型。
[0025]A4所述方法中，所述根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度可为基因型为GG的待测小麦籽粒长度短于或候选短于基因型为AA的待测小麦籽粒长度。
[0026]上述应用、方法和产品中，所述小麦育种为培育长粒小麦。
[0027]上述应用、方法和产品中，所述检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基
因型 (即等位基因)的组合物可为通过下述至少一种方法确定QTLqGL3B.1的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测小麦基因组中QTLqGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度中的应用；所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为P1或P2：P1、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的第22
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43位的单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的第22
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43位的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组；P2、所述PCR引物为由核苷酸序列是SEQ ID No.2的单链DNA、核苷酸序列是SEQ ID No.3的单链DNA和核苷酸序列是SEQ ID No.4的单链DNA组成的引物组。2.检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在制备鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度产品中的应用；所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为权利要求1所述P1或权利要求1所述P2。3.检测小麦基因组中QTL qGL3B.1位点的多态性或基因型的组合物在小麦育种中的应用或在制备小麦育种产品中的应用，所述QTL qGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或A，为SEQ ID No.1第178位核苷酸；所述组合物包含所述PCR引物，所述PCR引物为权利要求1所述P1或权利要求1所述P2。4.鉴定或辅助鉴定小麦籽粒长度的方法，包括检测待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦的籽粒长度；所述基因型为小麦基因组中所述QTLqGL3B.1位点的基因型；所述QTLqGL3B.1位点是小麦基因组中的一个SNP位点...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵杰，张颖君，胡梦芸，孙丽静，赵芸，杨锴，李辉，
申请(专利权)人：河北省农林科学院粮油作物研究所，
类型：发明
国别省市：