一组诊断宫颈癌变的指标及应用制造技术

本发明专利技术公开了一组用于宫颈癌检测的基因及应用，属生物和医学检验领域。所涉及的基因包括：LGALS7B，ANXA8，CDKN2A，CALML3，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSG3，DSC3，GPR87，CLCA2，PITX1，IRF6，FAM83A，AURKB，CKMT1A，MMP13，ALG1L，RHOV，SDC1，TRIM29，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT5，KRT6A，KRT7，KRT16，KRT6B，KRT15，S100A2，S100A14，S100A9，S100A8，SFN，SERPINB3，LAD1，FXYD3，TACSTD2，PI3，CXCL17，MAL2，CSTA，PDZK1IP1，LAMB3，RAB25，C19orf33，ELF3，GJB3，SPINT1，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3等55个基因。涉及检测上述基因(单个或任意组合)产物表达量的改变来筛查、鉴别宫颈是否癌变的一种分子生物学方法。联合应用上述基因鉴别宫颈癌，在特异性大于99％时，灵敏度可达95％以上；为分子生物学技术检测宫颈癌变提供了一种可靠的方法。癌变提供了一种可靠的方法。

【技术实现步骤摘要】
一组诊断宫颈癌变的指标及应用


[0001]本专利技术属生物和医学检验领域，通过检测单个或任意组合的相关基因产物(蛋白质、RNA)在宫颈病变组织、体液等中表达量的改变来鉴别宫颈是否发生癌变的一种分子生物学方法及应用。所涉及的基因包括：LGALS7B，ANXA8，CDKN2A，CALML3，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSG3，DSC3，GPR87，CLCA2，PITX1，IRF6，FAM83A，AURKB，CKMT1A，MMP13，ALG1L，RHOV，SDC1，TRIM29，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT5，KRT6A，KRT7，KRT16，KRT6B，KRT15，S100A2，S100A14，S100A9，S100A8，SFN，SERPINB3，LAD1，FXYD3，TACSTD2，PI3，CXCL17，MAL2，CSTA，PDZK1IP1，LAMB3，RAB25，C19orf33，ELF3，GJB3，SPINT1，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3等55个基因。

技术介绍

[0002]宫颈癌(Cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma，CESC)作为最常见的妇科恶性肿瘤，早发现、早治疗是降低该病死亡率的重要手段。目前，宫颈癌的早期筛查、诊断，主要采取“宫颈三步诊断法”。第一步，宫颈脱落细胞学检查，即宫颈刮片筛查，通过在显微镜下检查宫颈刮片中的脱落细胞中是否存在异形细胞或可疑癌细胞。该方法简单、快速，但主观性强，检查效率较低。出现可疑细胞后，需进行第二步的检查
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阴道镜检查来准确地判断它来自宫颈的什么部位，在阴道镜对图像放大功能的指导下，钳取可疑病变组织作标本。然后第三步就是将钳取的组织送病理活检，进行确诊。这个三步法耗时长、主观性强，而且病理形态改变往往滞后于癌前病变，容易错过早发现的时机。因此，寻找早期、快速鉴别宫颈癌的分子生物学方法迫在眉睫。在本专利技术中，我们基于宫颈癌变相关基因产物(蛋白、RNA)表达量的改变来诊断宫颈癌，为宫颈癌的大规模筛查提供一种简单、快速、高通量的方法。本专利技术中，我们通过对宫颈癌基因表达谱的大规模筛查，找到一组与宫颈癌变相关的基因：LGALS7B，ANXA8，CDKN2A，CALML3，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSG3，DSC3，GPR87，CLCA2，PITX1，IRF6，FAM83A，AURKB，CKMT1A，MMP13，ALG1L，RHOV，SDC1，TRIM29，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT5，KRT6A，KRT7，KRT16，KRT6B，KRT15，S100A2，S100A14，S100A9，S100A8，SFN，SERPINB3，LAD1，FXYD3，TACSTD2，PI3，CXCL17，MAL2，CSTA，PDZK1IP1，LAMB3，RAB25，C19orf33，ELF3，GJB3，SPINT1，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3等55个基因。与正常宫颈组织相比，上述基因在癌变宫颈组织中的表达量极度增高，上述部分基因与宫颈癌的类型、预后等具有紧密联系。上述基因的联合应用有利于宫颈癌的筛查和鉴别。
[0003]基于现有技术的研究基础与现状，本申请的专利技术人拟提供一种用于宫颈癌筛查和鉴别的指标和方法。本专利技术涉及通过上述基因组(单个或二种及以上任意组合)在宫颈病变组织中的表达量改变，来检测宫颈组织是否发生癌变、癌组织类型、预后等。尤其是通过多种基因联合形成阵列，再与提取、检测宫颈病变组织中蛋白质(如免疫比浊、胶体金、免疫化学发光等)或RNA(如RT
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PCR、荧光定量PCR、RNA array、RNA Sequencing等)相结合，可以为宫颈癌的预测、分类、分子分型及预后评估等提供一种快速、高通量、有效、客观的方法。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于为“快速、高效的鉴别宫颈癌、分子分型及预后评估等”提供指标及方法。通过检测与宫颈癌变相关基因的表达谱，来辅助宫颈癌变的鉴别、分子分型及预后评估等的一种分子学方法。
[0005]本专利技术基于大规模基因表达谱的分析，筛选出与正常宫颈组织相比，在宫颈癌组织中表达量显著性增高的一组基因，包括：LGALS7B，ANXA8，CDKN2A，CALML3，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSG3，DSC3，GPR87，CLCA2，PITX1，IRF6，FAM83A，AURKB，CKMT1A，MMP13，ALG1L，RHOV，SDC1，TRIM29，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT5，KRT6A，KRT7，KRT16，KRT6B，KRT15，S100A2，S100A14，S100A9，S100A8，SFN，SERPINB3，LAD1，FXYD3，TACSTD2，PI3，CXCL17，MAL2，CSTA，PDZK1IP1，LAMB3，RAB25，C19orf33，ELF3，GJB3，SPINT1，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3等55个基因。所述的宫颈癌筛查、鉴别、分子分型及预后评估与上述基因(单个或任意组合)在宫颈组织癌变前后出现表达量改变相关，可用于预测宫颈组织是否发生癌变、分子分型、耐药性、药物筛选、病人预后评估等。
[0006]S1单独利用上述基因中“LGALS7B，ANXA8，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSC3，GPR87，CKMT1A，RHOV，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT6A，KRT6B，KRT15，LAD1，C19orf33，ELF3，GJB3，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3”等表达量改变来判断宫颈是否癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等；
[0007]S2联合上述基因(2个及2个以上的任意组合)表达量改变来检测宫颈癌变、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等；
[0008]S3上述单个基因或任意组合后再与其它指标相结合后，来预测宫颈癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等；
[0009]本专利技术涉及到检测上述基因表达产物包括：蛋白质和RNA。
[0010]本专利技术涉及到检测的上述基因产物，既包括肿瘤细胞中的，也包括各种原因进入体液中的mRNA、蛋白质以及外泌体中的，包括是完整和片段。
[0011]本专利技术所述检测对象包括：子宫组织、肿瘤组织、体液(包括血液、尿液、穿刺液等)、宫颈脱落细胞、穿刺、宫颈刮片等，作为预测宫颈癌变、肿瘤恶性程度、靶向药物筛选、转移能力、分子分型、生存期等预后评估指标；
[0012]本专利技术所涉及的体液包括血液、尿液、盆腔积液、肿瘤穿刺液、淋巴液等。
[0013]本专利技术所涉及的血液包括全血、血清、血浆、分离有核细胞、血液中的循环肿瘤细胞、外泌体等。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组宫颈癌(Cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma，CESC)诊断、分子分型及预后评估等的分子生物学指标及应用，所涉及的基因包括：LGALS7B，ANXA8，CDKN2A，CALML3，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSG3，DSC3，GPR87，CLCA2，PITX1，IRF6，FAM83A，AURKB，CKMT1A，MMP13，ALG1L，RHOV，SDC1，TRIM29，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT5，KRT6A，KRT7，KRT16，KRT6B，KRT15，S100A2，S100A14，S100A9，S100A8，SFN，SERPINB3，LAD1，FXYD3，TACSTD2，PI3，CXCL17，MAL2，CSTA，PDZK1IP1，LAMB3，RAB25，C19orf33，ELF3，GJB3，SPINT1，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3等55个基因，通过检测宫颈病变组织、癌组织、体液(血液、尿液等)、宫颈刮片、脱落细胞等生物样品中上述基因产物(蛋白、RNA)表达量，来诊断宫颈是否发生癌变、癌症分类、分子分型、耐药性、药物筛选、肿瘤恶性程度、病人预后评估等；S1单独利用上述基因中“LGALS7B，ANXA8，PKP1，SERPINB5，SERPINB4，KIAA0101，DSC3，GPR87，CKMT1A，RHOV，LYPD3，FGFBP1，PVRL4，KRT6A，KRT6B，KRT15，LAD1，C19orf33，ELF3，GJB3，PKP3，SERINC2，CENPW，CDH3”等表达量改变来确定宫颈癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等；S2联合上述基因(2个及2个以上的任意组合)表达量改变来检测宫颈癌变、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等；S3上述单个基因或任意组合后再与其它指标相结合后，来检测宫颈癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等。2.权利要求1所述的用途，其特征在于，所述检测对象...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘春芳，马展，
申请(专利权)人：复旦大学附属华山医院，
类型：发明
国别省市：