一种扩增水稻产量相关基因位点的多重PCR引物组合及其试剂盒制造技术

本发明专利技术提供了一种扩增水稻产量相关基因位点的多重PCR引物组合、以及采用该多重PCR引物组合的水稻产量相关基因位点的扩增体系和试剂盒，以及采用该扩增体系获取水稻产量相关基因位点的序列的方法和水稻产量相关基因位点的检测方法；采用本发明专利技术的多重PCR引物组合及其扩增体系，能够从水稻基因组上通过单管操作一次性捕获多个水稻产量相关基因位点的序列片段，直接构建测序文库并匹配现有的测序平台；特别是对于水稻育种工作者来说，能够快速、方便且低成本地获取多个水稻产量相关基因信息，便于后续能够更快更准确地设计或验证育种路线，极大地提高了育种的效率。极大地提高了育种的效率。

【技术实现步骤摘要】
No:5、SEQIDNo:7、SEQIDNo:9、SEQIDNo:11、SEQIDNo:13、SEQIDNo:15、SEQIDNo:17、SEQIDNo:19、SEQIDNo:21、SEQIDNo:23、SEQIDNo:25、SEQIDNo:27、SEQIDNo:29、SEQIDNo:31、SEQIDNo:33、SEQIDNo:35所示；
[0009]所述第1～18引物对的下游引物序列分别如SEQIDNo:2、SEQIDNo:4、SEQIDNo:6、SEQIDNo:8、SEQIDNo:10、SEQIDNo:12、SEQIDNo:14、SEQIDNo:16、SEQIDNo:18、SEQIDNo:20、SEQIDNo:22、SEQIDNo:24、SEQIDNo:26、SEQIDNo:28、SEQIDNo:30、SEQIDNo:32、SEQIDNo:34、SEQIDNo:36所示。
[0010]在本专利技术的一个优选实施方案中，所述第1～6引物对与所述第7～18引物对位于两个不同的引物池。
[0011]在本专利技术的另一个优选实施方案中，所述多重PCR引物组合还包括第19～38引物对；
[0012]所述第19～38引物对的上游引物序列分别如SEQIDNo:37、SEQIDNo:39、SEQIDNo:41、SEQIDNo:43、SEQIDNo:45、SEQIDNo:47、SEQIDNo:49、SEQIDNo:51、SEQIDNo:53、SEQIDNo:55、SEQIDNo:57、SEQIDNo:59、SEQIDNo:61、SEQIDNo:63、SEQIDNo:65、SEQIDNo:67、SEQIDNo:69、SEQIDNo:71、SEQIDNo:73、SEQIDNo:75所示；
[0013]所述第19～39引物对的下游引物序列分别如SEQIDNo:38、SEQIDNo:40、SEQIDNo:42、SEQIDNo:44、SEQIDNo:46、SEQIDNo:48、SEQIDNo:50、SEQIDNo:52、SEQIDNo:54、SEQIDNo:56、SEQIDNo:58、SEQIDNo:60、SEQIDNo:62、SEQIDNo:64、SEQIDNo:66、SEQIDNo:68、SEQIDNo:70、SEQIDNo:72、SEQIDNo:74、SEQIDNo:76所示。
[0014]更优选的，所述第1～6引物对与所述第7～18引物对位于两个不同的引物池；所述第19～26引物对与所述第27～38引物对位于两个不同的引物池。
[0015]在本专利技术的一个进一步优选实施方案中，所述多重PCR引物组合还包括第39～55引物对；
[0016]所述第39～55引物对的上游引物序列分别如SEQIDNo:77、SEQIDNo:79、SEQIDNo:81、SEQIDNo:83、SEQIDNo:85、SEQIDNo:87、SEQIDNo:89、SEQIDNo:91、SEQIDNo:93、SEQIDNo:95、SEQIDNo:97、SEQIDNo:99、SEQIDNo:101、SEQIDNo:103、SEQIDNo:105、SEQIDNo:107、SEQIDNo:109所示；
[0017]所述第39～55引物对的下游引物序列分别如SEQIDNo:78、SEQIDNo:80、SEQIDNo:82、SEQIDNo:84、SEQIDNo:86、SEQIDNo:88、SEQIDNo:90、SEQIDNo:92、SEQIDNo:94、SEQIDNo:96、SEQIDNo:98、SEQIDNo:100、SEQIDNo:102、SEQIDNo:104、SEQIDNo:106、SEQIDNo:108、SEQIDNo:110所示。
[0018]更优选的，所述第1～6引物对与所述第7～18引物对位于两个不同的引物池；所述第19～26引物对与所述第27～38引物对位于两个不同的引物池；所述第39～48引物对与所述第49～55引物对位于两个不同的引物池。
[0019]在本专利技术的一个更进一步优选实施方案中，所述多重PCR引物组合还包括第56～64引物对；
[0020]所述第56～64引物对的上游引物序列分别如SEQIDNo:111、SEQIDNo:113、SEQ
IDNo:115、SEQIDNo:117、SEQIDNo:119所示、SEQIDNo:121、SEQIDNo:123、SEQIDNo:125、SEQIDNo:127所示；
[0021]所述第56～64引物对的下游引物序列分别如SEQIDNo:112、SEQIDNo:114、SEQIDNo:116、SEQIDNo:118、SEQIDNo:120所示、SEQIDNo:122、SEQIDNo:124、SEQIDNo:126、SEQIDNo:128所示。
[0022]更优选的，所述第1～6引物对与所述第7～18引物对位于两个不同的引物池；所述第19～26引物对与所述第27～38引物对位于两个不同的引物池；所述第39～48引物对与所述第49～55引物对位于两个不同的引物池；所述第56～60引物对与所述第61～64引物对位于两个不同的引物池。
[0023]更优选的，所述多重PCR引物组合包括第一引物池和第二引物池；所述第1～6引物对、第19～26引物对、第39～48引物对和第56～60引物对位于所述第一引物池；所述第7～18引物对、第27～38引物对、第49～55引物对和第61～64引物对位于所述第二引物池。
[0024]本专利技术第二方面提供了一种水稻产量相关基因位点的扩增体系，其中，所述扩增体系包括用于扩增的缓冲体系和如上述的多重PCR引物组合。
[0025]本专利技术第三方面提供了一种试剂盒，其中，所述试剂盒所采用的引物为上述的多重PCR引物组合。
[0026]本专利技术第四方面提供了一种获取水稻产量相关基因位点的序列的方法，其中，所述方法包括以下依次进行的步骤：
[0027]步骤1)提取水稻基因组DNA；
[0028]步骤2)采用如上述的扩增体系对所述步骤1)所获得的水稻基因组DNA进行PCR扩增，并对获得的扩增产物进行纯化，得到水稻产量相关基因位点的序列片段的混合物。
[0029]在本专利技术的一个优选实施方案中，所述水稻基因组DNA是从水稻种子或水稻叶片中提取的。
[0030]本专利技术第五方面提供了一种水稻产量相关基因位点的检测方法，其中，所述检测方法包括采用如上述的方法获得水稻产量相关基因位点的序列片段的混合物，并以该混合物作为样本构建测序文库，并进行测序分析。
[0031]可以理解的，在本专利技术范围内，本专利技术的上述各项技术特征和在下文(如实施例中)具体描述的各项技术特征之间可以相互组合，从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅，在此不一一赘述。
具体实施方式
[0032]本申请的专利技术人经过广泛而深入地研究，整合分析了目前已公开的水稻品种的产量相关基因信息以及突变信息，设计并通过大量实验验证，获得了覆盖水稻基本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于扩增水稻产量相关基因位点的多重PCR引物组合，其特征在于，所述多重PCR引物组合包括第1～18引物对；所述第1～18引物对的上游引物序列分别如SEQ ID No:1、SEQ ID No:3、SEQ ID No:5、SEQ ID No:7、SEQ ID No:9、SEQ ID No:11、SEQ ID No:13、SEQ ID No:15、SEQ ID No:17、SEQ ID No:19、SEQ ID No:21、SEQ ID No:23、SEQ ID No:25、SEQ ID No:27、SEQ ID No:29、SEQ ID No:31、SEQ ID No:33、SEQ ID No:35所示；所述第1～18引物对的下游引物序列分别如SEQ ID No:2、SEQ ID No:4、SEQ ID No:6、SEQ ID No:8、SEQ ID No:10、SEQ ID No:12、SEQ ID No:14、SEQ ID No:16、SEQ ID No:18、SEQ ID No:20、SEQ ID No:22、SEQ ID No:24、SEQ ID No:26、SEQ ID No:28、SEQ ID No:30、SEQ ID No:32、SEQ ID No:34、SEQ ID No:36所示。2.如权利要求1所述的多重PCR引物组合，其特征在于，所述第1～6引物对与所述第7～18引物对位于两个不同的引物池。3.如权利要求1所述的多重PCR引物组合，其特征在于：所述多重PCR引物组合还包括第19～38引物对；所述第19～38引物对的上游引物序列分别如SEQ ID No:37、SEQ ID No:39、SEQ ID No:41、SEQ ID No:43、SEQ ID No:45、SEQ ID No:47、SEQ ID No:49、SEQ ID No:51、SEQ ID No:53、SEQ ID No:55、SEQ ID No:57、SEQ ID No:59、SEQ ID No:61、SEQ ID No:63、SEQ ID No:65、SEQ ID No:67、SEQ ID No:69、SEQ ID No:71、SEQ ID No:73、SEQ ID No:75所示；所述第19～39引物对的下游引物序列分别如SEQ ID No:38、SEQ ID No:40、SEQ ID No:42、SEQ ID No:44、SEQ ID No:46、SEQ ID No:48、SEQ ID No:50、SEQ ID No:52、SEQ ID No:54、SEQ ID No:56、SEQ ID No:58、SEQ ID No:60、SEQ ID No:62、SEQ ID No:64、SEQ ID No:66、SEQ ID No:68、SEQ ID No:70、SEQ ID No:72、SEQ ID No:74、SEQ ID No:76所示。4.如权利要求3所述的多重PCR引物组合，其特征在于：所述多重PCR引物组合还包括第39～55引物对；所述第39～55引物对的上游引物序列分别如SEQ ID No:77、SEQ ID No:7...

【专利技术属性】
技术研发人员：王攀，方玉，
申请(专利权)人：上海中科荃银分子育种技术有限公司，
类型：发明
国别省市：