【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于ARSA基因转移的腺相关病毒组合物和其使用方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请案要求2019年6月10日提交的美国临时申请案第62/859,539号、2019年6月25日提交的美国临时申请案第62/866,374号、2019年10月15日提交的美国临时申请案第62/915,523号、2020年1月13日提交的美国临时申请案第62/960,487号、2020年3月10日提交的美国临时申请案第62/987,858号及2020年4月16日提交的美国临时申请案第63/010,970号的权益,其各自以全文引用的方式并入本文中。
[0003]序列表
[0004]本申请案含有序列表,其已以ASCII格式、以电子方式提交并以全文引用的方式并入本文中(所述ASCII副本创建于2020年4月16日,命名为“705151_HMW
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030
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6_ST25.txt”并且大小为295,995个字节)。
技术介绍
[0005]异染性脑白质营养不良(Metachromatic leukodystrophy,MLD)是一种具有较高的未满足的医学需求的致死性溶酶体贮积症。此神经退化性疾病以三种形式(婴儿晚期、青少年及成年人)存在并且由溶酶体酶芳基硫酸酯酶
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A(ARSA)不足引起。ARSA位于称为溶酶体的细胞结构中,其在溶酶体中有助于分解硫苷脂。此酶的不足可引起脑部、脊髓和周边器官中硫苷脂的大量积聚,这导致髓鞘的严重损伤,髓鞘是神经纤维的主要保护层髓鞘产生细胞 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于在细胞中表达芳基硫酸酯酶A(ARSA)多肽的方法,所述方法包含用重组腺相关病毒(rAAV)转导所述细胞,所述重组腺相关病毒包含:(a)AAV衣壳,其包含AAV衣壳蛋白;和(b)转移基因组,其包含可操作地连接于以沉默方式改变的ARSA编码序列的转录调节元件。2.根据权利要求1所述的方法,其中所述细胞是神经元和/或神经胶质细胞,任选地其中所述细胞是中枢神经系统和/或周围神经系统的神经元和/或神经胶质细胞。3.根据权利要求1所述的方法,其中所述细胞为选自由以下组成的群组的中枢神经系统区域的细胞:脊髓、运动皮质、感觉皮质、海马、壳核、小脑,任选地小脑核,和其任何组合。4.根据权利要求1所述的方法,其中所述细胞为选自由以下组成的群组的细胞:运动神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞、中枢神经系统中的大脑皮质的细胞、周围神经系统的感觉神经元、施万细胞(Schwann cell)和其任何组合。5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述细胞在哺乳动物受试者中并且以有效转导所述受试者中的所述细胞的量向所述受试者施用所述AAV。6.一种用于治疗患有异染性脑白质营养不良(MLD)的受试者的方法,所述方法包含向所述受试者施用有效量的rAAV,所述rAAV包含:(a)AAV衣壳,其包含衣壳蛋白;和(b)转移基因组,其包含可操作地连接于以沉默方式改变的ARSA编码序列的转录调节元件。7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述以沉默方式改变的ARSA编码序列编码SEQ ID NO:23中所阐述的氨基酸序列。8.根据权利要求7所述的方法,其中所述以沉默方式改变的ARSA编码序列包含SEQ ID NO:14、62或72中所阐述的核苷酸序列。9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转录调节元件包含选自由以下组成的群组的一种或多种元件:巨细胞病毒(CMV)增强子元件、鸡β
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肌动蛋白(CBA)启动子、小型鸡β
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肌动蛋白(SmCBA)启动子、钙调蛋白1(CALM1)启动子、蛋白脂质蛋白质1(PLP1)启动子、胶质细胞原纤维酸性蛋白(GFAP)启动子、突触蛋白2(SYN2)启动子、金属硫蛋白3(MT3)启动子和其任何组合。10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转录调节元件包含与选自由以下组成的群组的序列至少90%一致的核苷酸序列:SEQ ID NO:25、32、36、54、55和58。11.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转录调节元件包含选自由以下组成的群组的核苷酸序列:SEQ ID NO:25、32、36、54、55和58。12.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转录调节元件从5'到3'包含SEQ ID NO:58、25和32中所阐述的核苷酸序列。13.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转录调节元件包含SEQ ID NO:36中所阐述的核苷酸序列。14.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组还包含位于所述以沉默方式改变的ARSA编码序列3'的聚腺苷酸化序列。15.根据权利要求14所述的方法,其中所述聚腺苷酸化序列为外源性聚腺苷酸化序列。
16.根据权利要求15所述的方法,其中所述外源性聚腺苷酸化序列为SV40聚腺苷酸化序列。17.根据权利要求16所述的方法,其中所述SV40聚腺苷酸化序列包含SEQ ID NO:42中所阐述的核苷酸序列。18.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组还包含填充序列。19.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组还包含位于所述以沉默方式改变的ARSA编码序列3'的填充序列。20.根据权利要求18或19所述的方法,其中所述填充序列位于所述聚腺苷酸化序列3'。21.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组包含选自由以下组成的群组的序列:SEQ ID NO:41、44、46、65、67、75和79。22.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组还包含所述基因组5'的5'反向末端重复(5'ITR)核苷酸序列,和所述基因组3'的3'反向末端重复(3'ITR)核苷酸序列。23.根据权利要求22所述的方法,其中所述5'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:18具有至少95%序列一致性,并且所述3'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:19具有至少95%序列一致性。24.根据权利要求22所述的方法,其中所述5'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:26具有至少95%序列一致性,并且所述3'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:27具有至少95%序列一致性。25.根据权利要求22所述的方法,其中所述5'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:18具有至少95%序列一致性,并且所述3'ITR核苷酸序列与SEQ ID NO:57具有至少95%序列一致性。26.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述转移基因组包含选自由以下组成的群组的核苷酸序列:SEQ ID NO:47、48、49、68、69、76和80。27.根据权利要求5至25中任一项所述的方法,其中异染性脑白质营养不良与芳基硫酸酯酶A(ARSA)基因突变相关。28.根据权利要求6至27中任一项所述的方法,其中所述受试者是人类受试者。29.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:2、3、4、6、7、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸203
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736的氨基酸序列具有至少95%序列一致性的氨基酸序列。30.根据权利要求29所述的方法,其中:所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸206的氨基酸为C;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸312的氨基酸为Q;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸468的氨基酸为S;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸590的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G或Y;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸690的氨基酸为K;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C;或所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G。
31.根据权利要求30所述的方法,其中:(a)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G;(b)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;(c)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;(d)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;或(e)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C。32.根据权利要求30所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含SEQ ID NO:2、3、4、6、7、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸203
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736的氨基酸序列。33.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、9、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸138
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736的氨基酸序列具有至少95%序列一致性的氨基酸序列。34.根据权利要求33所述的方法,其中:所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸151的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸160的氨基酸为D;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸206的氨基酸为C;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸312的氨基酸为Q;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸468的氨基酸为S;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸590的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G或Y;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸690的氨基酸为K;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C;或所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G。35.根据权利要求34所述的方法,其中:(a)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G;(b)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;
(c)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;(d)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;或(e)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C。36.根据权利要求34所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、9、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸138
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736的氨基酸序列。37.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸1
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736的氨基酸序列具有至少95%序列一致性的氨基酸序列。38.根据权利要求37所述的方法,其中:所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸2的氨基酸为T;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸65的氨基酸为I;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸68的氨基酸为V;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸77的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸119的氨基酸为L;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸151的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸160的氨基酸为D;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸206的氨基酸为C;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸312的氨基酸为Q;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸468的氨基酸为S;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸590的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G或Y;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸690的氨基酸为K;所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C;或所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G。39.根据权利要求38所述的方法,其中:(a)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸2的氨基酸为T,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸312的氨基酸为Q;(b)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸65的氨基酸为I,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为Y;(c)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸77的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸690的氨基酸为K;(d)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸119的氨基酸为L,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸468的氨基酸为S;(e)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸626的氨基酸为G,并且所述衣壳蛋
白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸718的氨基酸为G;(f)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸296的氨基酸为H,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸464的氨基酸为N,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸681的氨基酸为M;(g)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸687的氨基酸为R;(h)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸346的氨基酸为A,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R;或(i)所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸501的氨基酸为I,所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸505的氨基酸为R,并且所述衣壳蛋白中对应于SEQ ID NO:16的氨基酸706的氨基酸为C。40.根据权利要求38所述的方法,其中所述衣壳蛋白包含SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、15、16或17的氨基酸1
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736的氨基酸序列。41.一种rAAV,其包含:(a)AAV衣壳,其包含AAV衣壳蛋白;和(b)转移基因组,其包含可操作地连接于以沉默方式改变的ARSA编码序列的转录调节元件。42.根据权利要求41所述的rAAV,其中所...
【专利技术属性】
技术研发人员:TB圣马丁,AB西摩尔,H鲁宾,
申请(专利权)人:同源药物公司,
类型:发明
国别省市:
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