本发明专利技术公开了与鸡屠体性状相关的CRELD1基因分子标记及应用，涉及生物技术领域。所述分子标记为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683326G>A SEQ IDNO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683378G>A、SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683497T>C、SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683588A>G。上述4个分子标记均与鸡的屠体性状呈显著相关。因此，本发明专利技术可以准确鉴定鸡屠体性状，为分子标记辅助选择育种提供新的分子标记。子标记。子标记。
【技术实现步骤摘要】
与鸡屠体性状相关的CRELD1基因分子标记及应用
[0001]本专利技术涉及生物
，特别是涉及与鸡屠体性状相关的CRELD1基因分子标记及应用。
技术介绍
[0002]单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)是指基因组水平上由单个核苷酸的插入、缺失、颠换和转换等而引起的基因组DNA序列的多态性。SNP是动物可遗传变异中最常见的一种，在动物基因组中广泛存在，具有稳定遗传，易于检测等特性。在动物生产实践中，SNP可用于分子标记辅助选择(Molecular Mark
‑
assist Selection，MAS)从而突破传统育种的瓶颈来提高选种的准确性和目标性状的选育效果。
[0003]表皮生长因子家族富含半胱氨酸蛋白结构域1基因(Cysteine rich with EGF like domains 1，CRELD1)是第一个发现的先天性心脏房室间隔缺损症发病相关基因，其编码的CRELD1蛋白是胚胎发育过程的重要调节因子。CRELD1在胚胎发育过程的重要作用对成年畜禽的屠体性状的表型也有一定的影响。但是目前还没有CRELD1基因与禽类屠体性状相关的SNP分子标记相关的报道。
技术实现思路
[0004]本专利技术的目的是提供与鸡屠体性状相关的CRELD1基因分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，发现CRELD1基因序列的SNP位点，并将其与鸡的屠体性状关联分析，为MAS提供新的SNP分子标记
[0005]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0006]本专利技术提供与鸡屠体性状相关的分子标记，所述分子标记为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4，所述SNP1为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683326G>A；所述SNP2为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683378G>A；所述SNP3为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683497T>C；所述SNP4为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683588A>G。
[0007]优选的是，所述SNP1分为GG、GA和AA基因型；所述SNP2分为GG、GA和AA基因型；所述SNP3分为TT、TC和CC基因型；所述SNP4分为AA、AG和GG基因型。
[0008]本专利技术还提供一种扩增所述的分子标记的引物，其为如SEQ ID NO:2所示上游引物和如SEQ ID NO:3所示下游引物。
[0009]本专利技术还提供一种鉴别鸡屠体性状的试剂盒，包含所述的引物。
[0010]本专利技术还提供一种鉴别鸡屠体性状的方法，包括以下步骤：
[0011](1)以待测鸡基因组DNA为模板，利用所述的引物扩增目的片段，获取扩增产物；
[0012](2)对所得扩增产物测序，检测相应单核苷酸多态性位点的基因型，根据基因型判断鸡屠体性状。
[0013]优选的是，扩增体系为：模板DNA 2μL、2
×
Es Taq MasterMix(Dye)25μL、上游引物
2μL、下游引物2μL和ddH2O 19μL。
[0014]优选的是，反应程序为：94℃预变性2min；94℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸30s，32个循环；72℃最终延伸3min；4℃保存。
[0015]优选的是，所述屠体性状包括活体重、胫长、泄殖腔皮肤黄度值、胸肌重、屠体重、胫围和半净膛率。
[0016]本专利技术还提供所述的分子标记或者所述的引物对或者所述的试剂盒或者所述的方法在鸡育种中的应用。
[0017]优选的是，应用于鸡屠体性状的选育中。
[0018]本专利技术公开了以下技术效果：
[0019]本专利技术通过分析CRELD1基因，发现该基因有多个与鸡屠体性状显著相关的SNP位点，为MAS提供新的SNP分子标记，并且通过试验验证：分子标记NC_052543.1:g.11683326G>A位点与胸肌重、活体重、屠体重、胫长、胫围、泄殖腔皮肤黄度值存在显著相关(p<0.05)；分子标记NC_052543.1:g.11683378G>A位点与半净膛率存在显著相关(p<0.05)；分子标记NC_052543.1:g.11683497T>C位点与半净膛率存在显著相关(p<0.05)；分子标记NC_052543.1:g.11683588A>G位点与半净膛率和胫围存在显著相关(p<0.05)。可见，本专利技术发现4个分子标记均和鸡屠体性状相关，并且可以准确的鉴定鸡屠体性状，从而为鸡的选育提供科学依据。
附图说明
[0020]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0021]图1为CRELD1引物配对位置及产物长度示意图；
[0022]图2为CRELD1基因序列SNP位点基因型分型图。
具体实施方式
[0023]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本专利技术的限制，而应理解为是对本专利技术的某些方面、特性和实施方案的更详细的描述。
[0024]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本专利技术。另外，对于本专利技术中的数值范围，应理解为还具体公开了该范围的上限和下限之间的每个中间值。在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本专利技术内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内。
[0025]除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本专利技术所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义。虽然本专利技术仅描述了优选的方法和材料，但是在本专利技术的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料。本说明书中提到的所有文献通过引用并入，用以公开和描述与所述文献相关的方法和/或材料。在与任何并入的文献冲突时，以本说明书的内容为准。
[0026]在不背离本专利技术的范围或精神的情况下，可对本专利技术说明书的具体实施方式做多种改进和变化，这对本领域技术人员而言是显而易见的。由本专利技术的说明书得到的其他实施方式对技术人员而言是显而易见的。本申请说明书和实施例仅是示例性的。
[0027]关于本文中所使用的“包含”、“包括”、“具有”、“含有”等等，均为开放性的用语，即意指包含但不限于。
[0028]实施例1
[0029]1、材料与方法
[0030]1.1动物样品
[0031]试验动物为450本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.与鸡屠体性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4，所述SNP1为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683326G>A；所述SNP2为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683378G>A；所述SNP3为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683497T>C；所述SNP4为SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052543.1:g.11683588A>G。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述SNP1分为GG、GA和AA基因型；所述SNP2分为GG、GA和AA基因型；所述SNP3分为TT、TC和CC基因型；所述SNP4分为AA、AG和GG基因型。3.一种扩增权利要求1所述的分子标记的引物，其特征在于，其为如SEQ ID NO:2所示上游引物和如SEQ ID NO:3所示下游引物。4.一种鉴别鸡屠体性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的引物。5.一种鉴别鸡屠...
【专利技术属性】
技术研发人员：聂庆华，周震，蔡柏林，蔡丹凤，孔少芬，徐海平，马曼婷，张静，
申请(专利权)人：华南农业大学，
类型：发明
国别省市：
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