一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术属于生物医药领域，公开了与高胆固醇血症相关的SNP标志物，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。本发明专利技术还提供了一种评估高胆固醇血症易感性的试剂盒，包括用于检测SOD3基因SNP位点rs8192291的物质。本发明专利技术提供的与高胆固醇血症相关的SNP标志物及其应用，可以准确地评估高胆固醇血症的易感性风险，进行早期鉴别，动态监测，药物疗效评估，耐药监测，复发及预后的辅助判断等，具有良好的临床应用前景。临床应用前景。

【技术实现步骤摘要】
一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物、试剂盒及应用
[0001]本申请要求2021年12月14日提交的，申请号为2021115305892，专利技术名称为“一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物、试剂盒及应用”的中国专利申请的优先权。


[0002]本专利技术属于生物
，涉及一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物、试剂盒及应用，具体涉及一种预测高胆固醇血症的易感性的方法与试剂，更具体的说是通过测定与高胆固醇血症相关基因SOD3的多态性预测受试者对于高胆固醇血症的易感性，该方法可用于疾病的辅助诊断、治疗和新药开发。

技术介绍

[0003]高胆固醇血症(Hypercholesterolemia)以血液中的胆固醇异常升高为特征，是动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)的一个重要危险因素，ASCVD包括脑血管疾病、冠心病和外周动脉疾病。高胆固醇血症和动脉粥样硬化的并发症包括心肌梗死、缺血性心肌病、心脏性猝死、缺血性卒中、勃起功能障碍、跛行和急性肢体缺血等，是我国人口主要的死亡原因之一。高胆固醇血症的危险因素包括饮食、生活习惯、肥胖症、遗传因素、疾病等。
[0004]单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性，在人群中的频率需>1％。SNPs是双等位基因标记，通过检测受检者SNP位点的基因型可预测个体发生某种疾病的风险。在高胆固醇血症遗传因素研究中，已发现LDLR、APOB、PCSK9等基因的SNP位点与高胆固醇血症的发生相关。由于高胆固醇血症是一种多基因参与的疾病，需要更多的SNP位点才能提高预测能力。因此，寻找并检测与高胆固醇血症易感性相关的SNP位点，能够帮助高胆固醇血症易感人群了解其患上高胆固醇血症的风险，提前做好预防工作，避免高胆固醇血症的发生。
[0005]SOD3(Superoxidedismutase，extracellular)基因为胞外过氧化物歧化酶编码基因。SOD3是SOD同工酶的一种，与其他SOD同工酶一样，可以消除体内代谢产生的反应氧族，抵御内外环境中超氧离子的损伤。作为唯一可在胞外表达的SOD，其在脉管系统抵御氧自由基所造成的损伤方面起到重要作用，与冠心病、动脉粥样硬化、高血压等心脑血管疾病密切相关。SOD3基因SNP位点rs8192291的基因型与2型糖尿病等疾病的发生有关，但目前尚无关于SOD3基因SNP位点rs8192291与高胆固醇血症相关联的研究报道。

技术实现思路

[0006]鉴于以上所述现有技术的缺点，本专利技术的目的在于提供一种与高胆固醇血症相关的SNP标志物，以更加准确全面地评估个体对高胆固醇血症的易感性，进行用药预测，实现个体化用药，减少药物不良反应，实现个体精确预后。
[0007]本专利技术首次提出鉴定超氧化物歧化酶3(SOD3)基因第2外显子区SNP位点
rs8192291的TT基因型(NM_003102.4:c.211C>T)与高胆固醇血症易感性之间的关系。通过提取受试者细胞的基因组DNA，测定受试者的SOD3基因第2外显子区SNP位点rs8192291的TT基因型，能够预测受试者对高胆固醇血症的易感性：SOD3基因第2外显子区SNP位点rs8192291的基因型为CC或CT时，受试者发生高胆固醇血症的风险低；基因型为TT时，受试者发生高胆固醇血症的风险高。
[0008]本专利技术的目的之一在于提供一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。
[0009]本专利技术的另一目的在于提供所述SNP标志物在用于高胆固醇血症相关方面非诊断的应用。
[0010]本专利技术的另一目的在于提供与高胆固醇血症相关的SNP标志物在制备用于诊断高胆固醇血症的产品中的应用，为筛选高胆固醇血症易感者提供依据，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。
[0011]本专利技术的另一目的在于提供检测与高胆固醇血症相关的SNP标志物的物质在制备用于诊断高胆固醇血症的产品中的应用，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。
[0012]进一步地，所述检测与高胆固醇血症相关的SNP标志物的物质包括SNP位点rs8192291的特异性扩增引物，其序列包括如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的核苷酸。
[0013]本专利技术的另一目的在于提供扩增引物对，其用于特异性扩增如上所述的SNP标志物。
[0014]本专利技术的另一目的在于提供一种诊断高胆固醇血症的试剂盒，所述的试剂盒含有如上所述的SNP标志物的特异性扩增引物。
[0015]优选地，所述试剂盒中包含所述SOD3基因SNP位点rs8192291的扩增引物对，优选地，所述扩增引物对如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，该引物对特异性强，扩增效果好。
[0016]本专利技术的另一目的在于提供一种如上所述的试剂盒的使用方法：
[0017](1)使用如上所述的试剂盒，通过PCR扩增SOD3基因的第2外显子区部分片段。
[0018](2)通过序列分析仪对SNP分型进行分析确定。
[0019]本专利技术的另一目的在于提供一种评估高胆固醇血症易感性的方法，测定待测样本的SOD3基因SNP位点rs8192291的基因型，若基因型为TT时，则受试者易感高胆固醇血症，反之不易感高胆固醇血症。
[0020]较之现有技术而言，本专利技术具有以下有益效果：
[0021]本专利技术首次阐明了SOD3基因SNP位点与高胆固醇血症的相关性，提出了SOD3基因高胆固醇血症相关的新突变位点，利用本专利技术SOD3基因rs8192291的TT位点的碱基变异，作为生物标志物之一，可用作药物设计的分子靶标的筛选，以帮助寻找具有调节SOD3表达的活性分子，促进高胆固醇血症新药研发。
[0022]本专利技术提供了一种预测高胆固醇血症易感性的试剂盒、测定SOD3基因多态性的方法和测定高胆固醇血症相关基因多态性的基因辅助诊断方法，该试剂盒和方法可用于分析人SOD3基因上的SNP位点rs8192291的基因型，可用于评估个体的高胆固醇血症患病风险，高胆固醇血症的预防、辅助诊断和治疗，以利于开展高胆固醇血症的早期干预和治疗，还可以用于新药研发等。
[0023]本专利技术建立的检测SOD3基因多态性的核酸序列和高胆固醇血症相关位点，可高灵敏度，特异性的应用于高胆固醇血症基因辅助诊断。
[0024]本专利技术只需要少量DNA样品即可测定基因的多态性。
附图说明
[0025]图1为SOD3基因SNP位点rs8192291的PCR扩增产物的琼脂糖电泳图。
[0026]图2为SOD3基因SNP位点rs8192291的CC基因型测序结果。
[0027]图3为SOD3基因SN本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于SOD3基因的与高胆固醇血症相关的SNP标志物，其特征在于，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。2.如权利要求1所述的SNP标志物在用于高胆固醇血症相关方面非诊断的应用。3.与高胆固醇血症相关的SNP标志物在制备用于诊断高胆固醇血症的产品中的应用，其特征在于，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。4.检测与高胆固醇血症相关的SNP标志物的物质在制备用于诊断高胆固醇血症的产品中的应用，其特征在于，所述的SNP标志物包括SOD3基因SNP位点rs8192291。5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述的物质包括SNP位点rs8192291的特异性扩增引物对，序列包括如SEQ ID No.1和SEQ ID No...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑海燕，林清源，季天海，
申请(专利权)人：上海大格生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：