一种血栓与出凝血性疾病检测panel及其应用制造技术

本申请公开了一种血栓与出凝血性疾病检测panel及其应用。本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，包括检测或杂交捕获血栓与出凝血性疾病相关的86个基因的特异性杂交探针。本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，可用于检测血栓与出凝血相关的多种基因结构，有助于解释血栓与出凝血性疾病分子机制，为开展出凝血疾病功能学、遗传性家系验证、发病分子机制等研究提供较全面的框架和基础。本申请panel涵盖的基因信息全面，能直接对多种血栓与出凝血性疾病进行联合检测，应用于出凝血疾病的伴随诊断，所得精准靶向测序结果能够准确评估血栓与出凝血性疾病的遗传风险、复发性风险、患病风险等。病风险等。

【技术实现步骤摘要】
一种血栓与出凝血性疾病检测panel及其应用


[0001]本申请涉及基因检测检测领域，特别是涉及一种血栓与出凝血性疾病检测 panel及其应用。

技术介绍

[0002]高通量测序技术(Next Generation Sequence，NGS)，也称为二代测序。可一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，其核心思想是边合成边测序，通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列。具有高输出量以及高解析度等优势，能够迅速读取序列，在提供丰富的遗传学信息的同时，还能够起到缩短测序时间的作用。NGS技术可提供满足评估目标靶向基因所需的扩展性、速度和分辨率，可以同时对许多样本中的多个基因进行评估，可运行多个独立的分析，从而节省时间并降低成本。另外，与范围更广的方法相比，如相比于全基因组测序，Panel靶向基因测序生成的数据量更少，更易管理，检测成本低，因而分析起来更加轻松。
[0003]基因测序主要被应用在科学研究、临床研究、医院诊断、生物医药几大场景。其中科学研究仍旧是基因测序主流应用场景，市场占比达到55％以上；而临床研究、医院诊断、生物医药三大应用领域占比分别为17％、14％、10％，三者总占比达到41％。NGS作为第二代基因测序核心技术自问世以来主要在易感基因检测、伴随诊断、个性化用药等领域得到应用，是伴随诊断行业主要发展方向。
[0004]全球每年脑血栓、脑梗塞、心肌梗塞、冠心病、动脉粥样化等心脑血管疾病死亡人数达1200万，接近世界总死亡人数的四分之一，心脑血管疾病已经成了超越恶性肿瘤的“头号杀手”。而心脑血管疾病的主要发病机制就是血栓。
[0005]出凝血指标虽然是人体健康的一个直观指标，但是，若疾病根源并不在凝血系统，比如由白血病、创伤、感染等因素引发的凝血功能问题，则不能作为治疗中的唯一靶点。
[0006]研究发现，基因变异在血栓形成中起重要的决定作用，苏州大学附属第一医院2017年至2020年对912例出凝血疾病患者基因检测结果统计显示：395例患者确诊遗传缺陷，确诊率43.3％，发现新致病基因位点51例，共计66个位点。 NGS对血液病的诊断、分型、危险度分层、治疗靶点筛选、疗效判断和血液病微小病灶残留(MRD)监测有重要意义。
[0007]余自强等收集了22例血管性血友病(VWD)患者，并对患者的外周血标本以及临床和实验室检查资料等，均进行了NGS检测，其中11例患者同时采用 Sanger法对VWF基因进行了测序。结果显示22例患者中，1型VWD 4例，2A 型VWD 1例，2B型VWD 2例，2M型VWD 3例，3型VWD 12例。综合分析 NGS检测和Sanger法的测序数据，从22例VWD患者中共发现25种VWF基因突变，其中8种为未见报道的新的基因突变。1型和2型VWD患者以杂合突变为主，3型患者主要表现为复合杂合突变。并且，NGS检测在10例VWD患者中发现了14种VWF基因突变，检出率为91％。
[0008]研究证明NGS提供了一个有效的用于分析单个大基因的实验室检测手段，其便捷性、准确性都有大幅提高，对于VWD基因诊断策略的改进具有重要意义。然而，目前尚未有比
较全面覆盖的特别针对血栓与出凝血性疾病检测的专用 Panel。

技术实现思路

[0009]本申请的目的是提供一种新的全面覆盖，且特别针对血栓与出凝血性疾病检测的panel及其应用。
[0010]本申请采用了以下技术方案：
[0011]本申请的一方面公开了一种血栓与出凝血性疾病检测panel，该panel包括检测或杂交捕获血栓与出凝血性疾病相关基因的特异性杂交探针；其中，血栓与出凝血性疾病相关基因包括86个基因。
[0012]需要说明的是，本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，涵盖抗凝系统、止血系统、纤溶系统、血小板相关基因、个性化用药基因等相关基因，能够全面覆盖现有的血栓与出凝血性疾病。本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，通过二代测序，能够准确、全面、有效的检测出凝血疾病相关基因及其突变情况，进而实现出血和血栓性疾病的诊断和风险评估，是血栓与出凝血性疾病检测的首创，填补了血栓与出凝血性疾病二代测序检测领域的空白。
[0013]还需要说明的是，本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，可用于检测血栓与出凝血相关的多种基因结构，有助于解释血栓与出凝血性疾病分子机制。并且，本申请的panel包括的基因信息全面，能够直接对多种血栓与出凝血性疾病进行联合检测，应用于出凝血疾病的伴随诊断，所得精准靶向测序结果能够准确评估血栓与出凝血性疾病的遗传风险、复发性风险、患病风险等。
[0014]优选的，本申请的86个基因包括A2M、ABCB1、ABCG2、ABCG5、ABCG8、 ABO、ACE、ACTN1、ADAMTS13、ADGRB3、ADTRP、ANKRD26、ANO6、ANXA3、AP3B1、AP3D1、APOH、APOM、ARPC1B、ATOH1、B3GAT2、BAZ1B、 BDKRB2、BLOC1S3、BLOC1S6、BLZF1、C3、C4BPA、C4BPB、CADM1、 CALR、CBS、CES1、CES1、CETP、CFB、CFD、CFH、CFP、CHST14、COL1A1、 COL28A1、COL3A1、COL5A1、COL5A2、CPB2、CYCS、CYP2C19、CYP2C9、 CYP3A4、CYP4F2、CYP4V2、DIAPH1、DTNBP1、EDEM2、EDN1、ETV6、 F10、F11、F12、F13A1、F13B、F2、F3、F5、F7、F8、F9、FERMT3、FGA、 FGB、FGG、FLI1、FLNA、FTO、FYB1、GATA1、GCKR、GFI1B、GGCX、 GNE、GP1BA、GP1BB、GP6、GP9和HABP2。
[0015]优选的，本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，其特异性杂交探针覆盖血栓与出凝血性疾病相关基因的基因编码区、非编码区、启动子区、3
’
UTR区和5
’
URT区。
[0016]优选的，本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，其特异性杂交探针覆盖血栓与出凝血性疾病相关基因的基因突变，这些基因突变包括SNV、CNV、Indel 和基因融合。
[0017]需要说明的是，本申请的特异性杂交探针可以根据需求，对86个基因进行全覆盖，即覆盖率100％；也可以根据使用情况，仅仅对86个基因中的已知突变进行100％覆盖。
[0018]优选的，本申请的血栓与出凝血性疾病检测panel，其特异性杂交探针由 12000条探针组成。
[0019]需要说明的是，本申请的12000条探针是采用探针设计原则和软件，针对 86个基因设计的100％覆盖的探针，采用这12000条探针能够对86个基因进行全面、有效的捕获和检测。可以理解，本申请的12000条探针都是按照常规方案设计，具体序列也可以根据参数设置的不同而改变，只要能够对86个基因进行1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种血栓与出凝血性疾病检测panel，其特征在于：所述panel包括检测或杂交捕获血栓与出凝血性疾病相关基因的特异性杂交探针；所述血栓与出凝血性疾病相关基因包括86个基因。2.根据权利要求1所述的血栓与出凝血性疾病检测panel，其特征在于：所述86个基因包括A2M、ABCB1、ABCG2、ABCG5、ABCG8、ABO、ACE、ACTN1、ADAMTS13、ADGRB3、ADTRP、ANKRD26、ANO6、ANXA5、AP3B1、AP3D1、APOH、APOM、ARPC1B、ATOH1、B3GAT2、BAZ1B、BDKRB2、BLOC1S3、BLOC1S6、BLZF1、C3、C4BPA、C4BPB、CADM1、CALR、CBS、CES1、CES1、CETP、CFB、CFD、CFH、CFP、CHST14、COL1A1、COL28A1、COL3A1、COL5Al、COL5A2、CPB2、CYCS、CYP2C19、CYP2C9、CYP3A4、CYP4F2、CYP4V2、DIAPH1、DTNBP1、EDEM2、EDN1、ETV6、F10、F11、F12、F13A1、F13B、F2、F3、F5、F7、F8、F9、FERMT3、FGA、FGB、FGG、FLI1、FLNA、FTO、FYB1、GATA1、GCK...

【专利技术属性】
技术研发人员：苏畅，冯莹，张冬雷，李翠红，肖扬，
申请(专利权)人：广州知力医学诊断技术有限公司，
类型：发明
国别省市：