电镜可解析性评估方法及装置、电子设备和存储介质制造方法及图纸

技术编号:33205798 阅读:14 留言:0更新日期:2022-04-24 00:51
本公开涉及一种电镜可解析性评估方法及装置、电子设备和存储介质,所述方法包括:获取待评估蛋白质结构的蛋白质电镜图像的参数;在图像的分辨率小于或等于预设分辨率阈值的情况下,确定待评估蛋白质结构中是否包括预设蛋白质结构;在包括预设蛋白质结构的情况下,根据预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果。根据本公开的实施例的电镜可解析性评估方法,可通过蛋白质电镜图像的分辨率、预设蛋白质结构及其分子量等参数在解析前评估蛋白质的电镜可解析性,可筛选出电镜可解析的蛋白质结构进行解析,以节省时间和经济成本,减少在不可解析的蛋白质结构中浪费的成本。并可为建立蛋白质靶点的数据库提供有效信息。息。息。

【技术实现步骤摘要】
电镜可解析性评估方法及装置、电子设备和存储介质


[0001]本公开涉及计算机
,尤其涉及一种电镜可解析性评估方法及装置、电子设备和存储介质。

技术介绍

[0002]目前,冷冻电镜作为在生物学和材料科学的研究中有很广泛的应用,研究人员可以通过它获得样品的电子显微图像,重构出蛋白质或材料样品的三维结构。冷冻电镜技术还提供了在微纳米尺度甚至在原子级分辨率下,无损表征对空气和电子束敏感的能源材料的可能性,为研究电池的基础化学和物理性质提供了极大助力。
[0003]目前,冷冻电镜作为蛋白样品解析的常用工具,具有较优秀的分析和评价蛋白功能。但是,冷冻电镜分析蛋白质费用非常昂贵,且周期长,并且由于各种条件限制,经常有大量的蛋白质在冷冻电镜解析后不能获得结构(即解析失败),经常有大量的蛋白质在解析过程中失败,从而使得用户消耗了大量的时间和经济成本,也难以获得有效的结果。

技术实现思路

[0004]本公开提出了一种电镜可解析性评估方法及装置、电子设备和存储介质。
[0005]根据本公开的一方面,提供了一种电镜可解析性评估方法,包括:获取待评估蛋白质结构的蛋白质电镜图像的参数;在所述蛋白质电镜图像的分辨率小于或等于预设分辨率阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构中是否包括预设蛋白质结构;在所述待评估蛋白质结构中包括预设蛋白质结构的情况下,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,其中,电镜可解析性表示通过冷冻电镜是否能够解析蛋白结构。
[0006]在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在所述蛋白质电镜图像的分辨率大于预设分辨率阈值的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为电镜可解析。
[0007]在一种可能的实现方式中,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,包括:确定所述预设蛋白质结构的第一分子量;在所述第一分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述预设蛋白质结构的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0008]在一种可能的实现方式中,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,还包括:在所述第一分子量小于或等于分子量阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构的蛋白复合体和/或蛋白单体的第二分子量;在所述第二分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述蛋白复合体和/或蛋白单体的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0009]在一种可能的实现方式中,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,还包括:在所述蛋白表达系统为非预设系统的情况下,将所述电镜可
解析性评估结果确定为电镜不可解析。
[0010]在一种可能的实现方式中,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,还包括:在所述第二分子量小于或等于分子量阈值,或者不存在所述蛋白复合体的情况下,确定所述待评估蛋白质结构是否存在对应的抗体;在所述待评估蛋白质结构存在对应的抗体的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0011]在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:确定所述待评估蛋白质结构是否为人源蛋白;在所述待评估蛋白质结构不是人源蛋白的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定电镜不可解析。
[0012]根据本公开的一方面,提供了一种电镜可解析性评估装置,包括:图像参数获取模块,用于获取待评估蛋白质结构的蛋白质电镜图像的参数;结构确定模块,用于在所述蛋白质电镜图像的分辨率小于或等于预设分辨率阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构中是否包括预设蛋白质结构;评估模块,用于在所述待评估蛋白质结构中包括预设蛋白质结构的情况下,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,其中,电镜可解析性表示通过冷冻电镜是否能够解析蛋白结构。
[0013]在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:分辨率判别模块,在所述蛋白质电镜图像的分辨率大于预设分辨率阈值的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为电镜可解析。
[0014]在一种可能的实现方式中,所述评估模块进一步用于:确定所述预设蛋白质结构的第一分子量;在所述第一分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述预设蛋白质结构的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0015]在一种可能的实现方式中,所述评估模块还用于:在所述第一分子量小于或等于分子量阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构的蛋白复合体和/或蛋白单体的第二分子量;在所述第二分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述蛋白复合体和/或蛋白单体的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0016]在一种可能的实现方式中,所述评估模块还用于:在所述蛋白表达系统为非预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为电镜不可解析。
[0017]在一种可能的实现方式中,所述评估模块还用于:在所述第二分子量小于或等于分子量阈值,或者不存在所述蛋白复合体的情况下,确定所述待评估蛋白质结构是否存在对应的抗体;在所述待评估蛋白质结构存在对应的抗体的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。
[0018]在一种可能的实现方式中,所述装置还包括:人源蛋白判别模块,用于确定所述待评估蛋白质结构是否为人源蛋白;在所述待评估蛋白质结构不是人源蛋白的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定电镜不可解析。
[0019]根据本公开的一方面,提供了一种电子设备,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为调用所述存储器存储的指令,以执行上述方法。
[0020]根据本公开的一方面,提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,所述计算机程序指令被处理器执行时实现上述方法。
[0021]根据本公开的实施例的电镜可解析性评估方法,可通过待评估蛋白质结构是否为人源蛋白、蛋白质电镜图像的分辨率、预设蛋白质结构及其分子量等参数在解析前评估蛋白质的电镜可解析性,可筛选出电镜可解析的蛋白质结构进行解析,以节省时间和经济成本,减少在不可解析的蛋白质结构中浪费的成本。并可为建立蛋白质靶点的数据库提供有效信息。
[0022]应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,而非限制本公开。根据下面参考附图对示例性实施例的详细说明,本公开的其它特征及方面将变得清楚。
附图说明
[0023]此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分,这些附图示出了符合本公开的实施例,并与说明书一起用于说明本公开的技术方案。
[0024]图1示出根据本公开实施例的电镜可解析性评估方法的流程图;
[0025本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种电镜可解析性评估方法,其特征在于,包括:获取待评估蛋白质结构的蛋白质电镜图像的参数;在所述蛋白质电镜图像的分辨率小于或等于预设分辨率阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构中是否包括预设蛋白质结构;在所述待评估蛋白质结构中包括预设蛋白质结构的情况下,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,其中,电镜可解析性表示通过冷冻电镜是否能够解析蛋白结构。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:在所述蛋白质电镜图像的分辨率大于预设分辨率阈值的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为电镜可解析。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,包括:确定所述预设蛋白质结构的第一分子量;在所述第一分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述预设蛋白质结构的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,还包括:在所述第一分子量小于或等于分子量阈值的情况下,确定所述待评估蛋白质结构的蛋白复合体和/或蛋白单体的第二分子量;在所述第二分子量大于分子量阈值的情况下,确定所述蛋白复合体和/或蛋白单体的蛋白表达系统;在所述蛋白表达系统为预设系统的情况下,将所述电镜可解析性评估结果确定为在人工干预下电镜可解析。5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,根据所述预设蛋白质结构的分子量,确定蛋白质的电镜可解析性评估结果,还包...

【专利技术属性】
技术研发人员:李梦鹤夏溪辰管峥倪晓丹刘传
申请(专利权)人:水木未来北京科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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