小柳-原田综合症标志基因及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种小柳

【技术实现步骤摘要】
小柳
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原田综合症标志基因及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体的，本专利技术涉及小柳
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原田综合症标志基因及其应用，更具体的，本专利技术涉及一种试剂盒、试剂在制备试剂盒中的用途、用于预防或者治疗小柳
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原田综合症的药物组合物或者食品组合物、确定个体是否患有小柳
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原田综合症方法、确定个体是否患有小柳
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原田综合症的装置、一种装置、一种筛选药物的方法。

技术介绍

[0002]小柳
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原田综合症(Vogt
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Koyanagi
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Harada，VKH)又称葡萄膜大脑炎(Uveoencephalitis)综合征，也称色素膜脑膜炎或眼
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脑
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耳
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皮综合征。是一种自身免疫反应引起的攻击黑色素细胞抗原的致盲眼病，往往还会侵袭耳、脑(脊)膜、毛发以及皮肤等器官。起病多发于青壮年，发病率与性别无明显的关系，黄种人种较为常见。小柳
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原田综合症的病因前尚未完全明确，文献报告有内分泌学说、病毒学说和免疫学说等三种学说。
[0003]小柳
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原田综合症一般起病比较隐匿，临床上一般分为三期，分别是前驱期、眼病期、恢复期。前驱期有感冒样的症状，如发热、头痛、耳鸣、听力异常、颈项僵硬、头皮过敏等。由于病情较轻，病人大多会误，致使病情延误，失去最佳治疗时机。
[0004]小柳/>‑
原田综合症的诊断标准定为：
①
病前无眼球外伤或手术史；
②
临床与实验室排除了其他病因的葡萄膜炎；
③
双眼累及具有小柳
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原田综合症的急性或慢性期，眼前节或后节的表现；
④
有神经、耳部症状或脑脊液细胞增多；
⑤
皮肤、毛发改变。虽然临床表现加上器械检查可以对病做出正确诊断，但是大部分需要患者还要通过病史、眼科常规检查、造影、光学成像等作出诊断。目前，小柳
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原田综合症的早期诊断主要是用血常规、超声显微镜、眼底血管造影、X射线检查等技术进行检查，检查过程较复杂。
[0005]随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为小柳
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原田综合症诊断的方向，对于发现小柳
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原田综合症潜在人群很有优势。有研究表明与小柳
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原田综合症相关的多基因在肠道免疫中起重要作用，如TLR受体能够识别病原微生物配体，随即引发自身免疫反应响应。途径的基因对肠道健康的调节起重要作用(Kawai T et al.,2010)。到目前为止，还没有小柳
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原田综合症患者基因标记物的相关报道。

技术实现思路

[0006]本专利技术旨在至少在一定程度上解决上述技术问题之一或至少提供一种商业选择。
[0007]依据本专利技术的第一方面，提供一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA20_GI_0078082、VA34_GI_0040061、N29_GI_0014293和BA20_GI_0050287，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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7所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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7中的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂盒，包含可以准确的检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，因此，可以准确检测生物样品中是否包含第一基因集中的至少一种基因的试剂，更进一步地，可以
准确区分或诊断小柳
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原田综合症患者和健康个体。
[0008]在本专利技术的第二方面，本专利技术提出了试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒用于诊断小柳
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原田综合症或检测小柳
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原田综合症的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA20_GI_0078082、VA34_GI_0040061、N29_GI_0014293和BA20_GI_0050287，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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7所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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7中的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂制备的试剂盒，可以准确的检测生物样品中是否包含所述第一基因集中的至少一种基因，极准确的区分小柳
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原田综合症患者和健康个体，由此，可以有效的在早期进行小柳
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原田综合症诊断，或用于检测治疗过程中小柳
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原田综合症的变化。
[0009]在本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种用于预防或者治疗小柳
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原田综合症的药物组合物或者食品组合物。根据本专利技术的实施例，含有提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：N58_GI_0017314和N44_GI_0089468，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：8、9所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：8、9中的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术实施例的小柳
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原田综合症标志基因中第二基因集的基因可以非侵入性的在早期发现或辅助检测小柳
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原田综合症，确定个体患有小柳
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原田综合症的概率高低或者个体处于健康状态的概率高低；同时，提高小柳
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原田综合症高风险人群或已小柳
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原田综合症患者肠道内的所述第二基因集中的各种基因的丰度，可以降低患小柳
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原田综合症的概率或减缓、治愈小柳
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原田综合症，因此，所述包含提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的药物或者食品组合物能够有效预防或治疗小柳
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原田综合症。
[0010]在本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有小柳
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原田综合症的方法。根据本专利技术的实施例，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有小柳
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原田综合症；其中，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA20_GI_0078082、VA34_GI_0040061、N29_GI_0014293和BA20_GI_0050287，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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7所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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7中的核酸序列具有不小于90％的同一性。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二基因集中的至少一个基因的试剂，所述第二基因集由以下基因组成：N58_GI_0017314和N44_GI_0089468，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：8、9所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：8、9中的核酸序列具有不小于90％的同一性。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二基因集中全部所述基因的试剂。5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因，所述试剂盒用于诊断小柳
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原田综合症或者检测小柳
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原田综合症的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA20_GI_0078082、VA34_GI_0040061、N29_GI_0014293和BA20_GI_0050287，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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7所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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7中的核酸序列具有不小于90％的同一性。6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二基因集中的至少一种基因，所述第二基因集由以下基因组成：N58_GI_0017314和N44_GI_0089468，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：8、9所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：8、9中的核酸序列具有不小于90％的同一性。7.一种用于预防或者治疗小柳
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原田综合症的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有提高第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：N58_GI_0017314和N44_GI_0089468，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：8、9所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：8、9中的核酸序列具有不小于90％的同一性。8.一种确定个体是否患有小柳
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原田综合症的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有小柳
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原田综合症；其中，所述第一基因集由以下基因组成：BA15_GI_0053852、VA1_GI_0075627、BA16_GI_0058798、BA20_GI_0078082、VA34_GI_0040061、N29_GI_0014293和BA20_GI_0050287，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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7所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID N...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈翔，刘晶，马玮，
申请(专利权)人：上海金翌生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：