一种位于14号染色体的大豆高蛋白含量相关的分子标记和鉴定高蛋白含量大豆的方法技术

本申请为申请号202110583739.X的分案申请，本发明专利技术提供了一种位于14号染色体的大豆高蛋白含量相关的分子标记和鉴定高蛋白含量大豆的方法，属于生物技术领域。为了快速和准确的筛选高蛋白优质大豆品种。本发明专利技术提供了一种大豆高蛋白含量相关的一个分子标记SNP3，其中SNP2对应的核苷酸位点为Gm06_44869874和SNP3对应的核苷酸位点为Gm14_16525645，以及上述这些标记在制备检测大豆高蛋白含量的试剂盒中的应用和筛选方法。通过对标记的选择来实现对性状的选择，大幅度提高育种效率，实现定向改良大豆品种的作用即可以选择出高蛋白的大豆品种。豆品种。豆品种。

【技术实现步骤摘要】
一种位于14号染色体的大豆高蛋白含量相关的分子标记和鉴定高蛋白含量大豆的方法
[0001]本申请为申请号202110583739.X、申请日2021年5月24日、专利技术名称“一种大豆高蛋白含量相关的分子标记和鉴定高蛋白含量大豆的方法”的分案申请。


[0002]本专利技术属于生物
，具体涉及一种位于14号染色体的大豆高蛋白含量相关的分子标记和鉴定高蛋白含量大豆的方法。

技术介绍

[0003]大豆有着丰富的营养成分，蛋白质在40％左右。大豆蛋白质中含有8种人体必需氨基酸，人们可以通过食用大豆用以补充所需的营养物质，并且可以预防人体的心血管疾病，大豆同时是重要的油料作物，可以被加工为食用油，可以满足人们的饮食需求，同时主要由五种脂肪酸组成，而脂肪酸可以预防心脏病、癌症等。随着人们的生活水平日益提高，越来越多的人更多的注重于食用健康与食物的营养价值，因此对大豆的需求很大，但我国的大豆更多的是依赖于从其他国家进口，所以我国急需提高大豆蛋白及培育高蛋白、高油大豆品种，满足人们的日常所需。
[0004]大豆子粒的蛋白是品质相关性状，是比较复杂的数量性状，受到多个基因控制，一直以来受到遗传特性和育种方法的限制，传统方法过于缓慢，随着科技的不断进步，分子辅助选择被提出，在传统杂交育种方法的基础上利用分子标记与决定目标性状的基因紧密连锁，通过对标记的选择来实现对性状的选择，大幅度提高育种效率，实现定向改良大豆品种的作用即可以选择出高蛋白的大豆品种。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是为了快速和准确的筛选高蛋白优质大豆品种，本专利技术提供了一种大豆高蛋白含量相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP1，所述SNP1的序列为大豆1号染色体上50.84Mb
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50.87Mb位置的的核苷酸序列，且Gm01号染色体的第50861576核苷酸位点为A或C。
[0006]在一种实施方式中，扩增SNP1的引物为Gm01_50861576
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F和Gm01_50861576
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R，所述Gm01_50861576
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.15或如SEQ ID NO.16所示；所述Gm01_50861576
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示。
[0007]本专利技术还提供了一种大豆高蛋白含量相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP2，所述SNP2的序列为大豆6号染色体上38.49Mb
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47.89Mb位置的的核苷酸序列，且Gm06号染色体的第44869874核苷酸位点为A或G。
[0008]在一种实施方式中，扩增SNP2的引物为Gm06_44869874
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F和Gm14_16525645
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R，所述Gm06_44869874
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.51或如SEQ ID NO.52所示；所述Gm06_44869874
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R核苷酸序列如SEQ ID NO.53所示。
[0009]本专利技术还提供了一种大豆高蛋白含量相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP3，所述SNP3的序列为大豆14号染色体上16.13Mb
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16.66Mb位置的的核苷酸序列，且Gm14号染色体的第16525645核苷酸位点为A或T。
[0010]在一种实施方式中，扩增SNP3的引物为Gm14_16525645
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F和Gm14_16525645
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R，所述Gm14_16525645
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.84或如SEQ ID NO.85所示；所述Gm14_16525645
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R核苷酸序列如SEQ ID NO.86所示。
[0011]本专利技术还提供了一种SNP1、SNP2和SNP3分子标记在制备鉴定高蛋白含量的大豆的试剂盒中的应用，用(a)～(c)任一组引物扩增SNP1、SNP2和SNP3分子标记：
[0012](a)扩增SNP1的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.15或如SEQ ID NO.16所示；扩增SNP1的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示；
[0013](b)扩增权利SNP2的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.51或如SEQ ID NO.52所示；扩增SNP2的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.53所示；
[0014](c)扩增SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.84或如SEQ ID NO.85所示；扩增SNP3的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.86所示。
[0015]本专利技术还提供了一种鉴定高蛋白含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：
[0016](1)提取待检测大豆的DNA；
[0017](2)利用SNP1分子标记的引物进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为CC基因型则待检测品种的大豆为高蛋白含量的大豆，若为AA基因型则待检测品种的大豆为低蛋白含量的大豆。
[0018]本专利技术还提供了一种鉴定高蛋白含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：
[0019](1)提取待检测大豆的DNA；
[0020](2)利用SNP2分子标记的引物进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为GG基因型则待检测品种的大豆为高蛋白含量的大豆，若为AA基因型则待检测品种的大豆为低蛋白含量的大豆。
[0021]本专利技术还提供了一种鉴定高蛋白含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：
[0022](1)提取待检测大豆的DNA；
[0023](2)利用SNP3分子标记的引物进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为AA基因型则待检测品种的大豆为高蛋白含量的大豆，若为TT基因型为低蛋白含量的大豆。
[0024]有益效果：本研究利用643份经过全基因组重测序的资源群体结合其2年3次重复的大豆子粒贮藏物质的表型数据，利用分层评价的方法筛选出与大豆子粒蛋白、油分极显著相关的SNP位点，采用SNP分子标记技术中的KASP在151份大豆非测序极端蛋白资源材料及162份大豆非测序极端油分资源材料中进行验证，根据其分型结果及其表型数据，开发出与大豆蛋白、油分相关的分子标记，用以在生产中提前筛选高蛋白、高油分优质品种提供一种高速准确的方法。
附图说明
[0025]图1为2018、2019年资源测序材料蛋白、油分含量及BLUP分布直方图，其中，图A为2018年蛋白含量分布直方图，B是2019年蛋白含量分布直方图，C是2年蛋白BLUP分布直方图，横坐标是组别，纵坐标是频率；
[0026]图2为20条染色体上SNP位点数目分布，其中，横坐标是染色体，纵坐标是SNP个数；
[0027]图3为20条染色体上与蛋白相关的SNP位点数目分布，其中，横坐标是染色体，纵坐标是SNP个数；<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种位于14号染色体的大豆高蛋白含量相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为SNP3，所述SNP3的序列为大豆14号染色体上16.13Mb
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16.66Mb位置的核苷酸序列，且Gm14号染色体的第16525645核苷酸位点为A或T。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，扩增权利要求1所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.84或如SEQ ID NO.85所示，扩增权利要求1所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID N...

【专利技术属性】
技术研发人员：齐照明，赵莹，朱荣胜，黄仕钰，刘珊珊，刘春燕，辛大伟，王锦辉，陈庆山，
申请(专利权)人：东北农业大学，
类型：发明
国别省市：