玉米花期基因的SNP分子标记的开发及应用制造技术

本发明专利技术公开了玉米花期基因的SNP分子标记的开发及应用，属于坩埚技术领域。它包括检测待测玉米的基因型，根据待测玉米的基因型鉴定或辅助鉴定玉米花期；所述基因型为玉米基因组中KASP_D8位点的基因型；所述KASP_D8位点是玉米基因组中的一个SNP位点，位于玉米1号染色体272694744位，所述SNP位点是核苷酸种类为C或者G，为SEQ ID No.4的第101位核苷酸。与玉米花期基因D8紧密连锁的KASP标记KASP_D8，该标记基于KASP技术开发，可高通量检测玉米基因组1号染色体的第272694744位碱基。本发明专利技术应用KASP技术对玉米花期基因D8进行基因型鉴定，具有操作简便、成本低廉、检测周期短、标记稳定、绿色环保等优点，可精准检测玉米花期基因D8，对促进玉米花期育种具有重要意义。对促进玉米花期育种具有重要意义。对促进玉米花期育种具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
玉米花期基因的SNP分子标记的开发及应用


[0001]本专利技术涉及生物
，尤其是涉及与玉米花期基因相关的SNP分子标记的开发及应用。

技术介绍

[0002]开花是植物从营养生长阶段到生殖生长的重要生理转变。较早进入开花阶段，缩短作物栽培周期，可以降低田间管理成本，提升产值，对提高百姓收入有重要的意义。通过培育早花期玉米品种是缩短玉米栽培周期的最高效、经济、环保的方法(王迪.玉米花期及雄穗相关性状的QTL定位与遗传基础研究[D].中国农业科学院,2011.)。
[0003]目前，部分玉米花期基因已被克隆，如ZCN8基因和D8基因(田丰,郭丽,王雪涵.玉米开花期基因ZCN8的两个特异性分子标记及其应用:,CN108866227A[P].2018.；欧杨虹,吴雯雯,邵元健,等.CAPS标记开发及其在D8基因功能标记开发中的应用[J].分子植物育种,2016(10):2716
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2721.)。同时，也开发了与基因连锁的分子标记，通过分子标记辅助选择技术(Marker
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assisted Selection，MAS)进行玉米花期改良育种，弥补了传统育种中出现的诸多弊端，成为解决品种选育难这一问题的有效途径。
[0004]然而，玉米花期相关基因的连锁标记虽然可以用于分子标记辅助选择，但多为CAPS标记、SSR标记、InDel标记或酶切标记，检测效率低，同时还可能会产生气溶胶污染环境，不适用于高通量的分子检测平台(田丰,郭丽,王雪涵.玉米开花期基因ZCN8的两个特异性分子标记及其应用:,CN108866227A[P].2018；欧杨虹,吴雯雯,邵元健,等.CAPS标记开发及其在D8基因功能标记开发中的应用[J].分子植物育种,2016(10):2716
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2721.)。因此，开发低成本、可高通量检测的分子标记是促进玉米早花期基因鉴定、增加早花期育种准确度与提高育种效率的迫切需求。
[0005]KASP(Kompetitive Allele
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Specific PCR，竞争性等位基因特异性PCR)通过荧光探针特异性识别基因位点达到基因分型的效果，可快速检测SNP位点。与SSR、RFLP、InDel等分子标记相比，KASP标记具有检测快速，成本低，易于规模化应用等特点，KASP标记不需要根据DNA片段大小进行分型，能够摆脱传统凝胶电泳这种步骤相对繁琐，低通量，价格又较贵的检测方法，更加适用于现阶段飞速发展的高通量分子检测平台。因此，开发低成本、适合于高通量分子检测平台的玉米花期基因KASP分子标记对于推广普及分子标记技术的应用、提高我国玉米早花期育种效率和育种水平具有重要意义。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的是提供一种与玉米花期基因D8紧密连锁的SNP标记及其应用方法。
[0007]本专利技术提供一种与玉米花期基因D8紧密连锁的SNP分子标记KASP_D8，所述分子标记KASP_D8是基于玉米花期基因D8中一个SNP位点开发的标记，所述SNP位点是核苷酸种类为C或者G，为序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸。
[0008]所述与玉米花期基因D8紧密连锁的KASP分子标记在C1、C2、C3或C4中的应用也应
在本专利技术的保护范围之内：
[0009]C1、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米花期中的应用；
[0010]C2、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米花期的产品中的应用；
[0011]C3、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在玉米辅助育种或制备玉米辅助育种产品中的应用；
[0012]C4、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在选育早花期玉米资源中的应用。
[0013]本专利技术还提供一种鉴定或辅助鉴定玉米花期的方法，包括检测待测玉米的基因型，根据待测玉米的基因型鉴定或辅助鉴定玉米花期；所述基因型为玉米基因组中KASP_D8的基因型；所述KASP_D8位点是核苷酸种类为C或G，为序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸。
[0014]其中，所述KASP_D8位点的基因型为GG基因型或CG基因型时，玉米为早花期或者候选为早花期；所述KASP_D8位点的基因型为CC基因型时，玉米为晚花期或者候选为晚花期；其中，所述GG基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G的纯合型；所述CC基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为C的纯合型；所述GC基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G和C的杂合型。
[0015]检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在A1、A2、A3或A4中的应用也应在本专利技术的保护范围之内：
[0016]A1、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米花期中的应用；
[0017]A2、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米花期的产品中的应用；
[0018]A3、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在玉米辅助育种或制备玉米辅助育种产品中的应用；
[0019]A4、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在选育早花期玉米资源中的应用。
[0020]本专利技术还提供一种选育早花期的玉米资源的方法，包括选择KASP_D8位点的基因型为GG基因型或GC的玉米进行育种，其中，所述基因型为玉米基因组中D8的KASP_D8位点的基因型；所述KASP_D8位点是核苷酸种类为G或C，为序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸；所述GG基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G的纯合型；所述GC基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G和C的杂合型。
[0021]本专利技术提供一种含有检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质的产品，为C1)
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C4)中任一种产品：
[0022]C1)检测与玉米花期相关的SNP多态性或基因型的产品；
[0023]C2)鉴定或辅助鉴定玉米花期的产品；
[0024]C3)用于玉米辅助育种的产品；
[0025]C4)用于选育早花期的玉米资源的产品。
[0026]含有检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质的产品在B1、B2、B3或B4中的应用也应在本专利技术的保护范围之内：
[0027]B1、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米花期中的应用；
[0028]B2、检测玉米基因组中KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米花期的产品中的应用；
[0029]B3、检测玉米基因组中KASP_D8位本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.玉米花期基因的SNP分子标记的开发方法，其特征在于：包括检测待测玉米的基因型，根据待测玉米的基因型鉴定或辅助鉴定玉米花期；所述基因型为玉米基因组中KASP_D8位点的基因型；所述KASP_D8位点是玉米基因组中的一个SNP位点，位于玉米1号染色体272694744位，所述SNP位点是核苷酸种类为C或者G，为SEQ ID No.4的第101位核苷酸；所述KASP_D8位点的基因型为GG基因型或GC基因型的待测玉米的花期早于或者候选早于所述KASP_D8位点的基因型为CC基因型的待测玉米；所述KASP_D8位点的基因型为GC基因型的待测玉米与所述KASP_D8位点的基因型为GG基因型的待测玉米在花期上无显著差异；其中，所述GG基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G的纯合型；所述CC基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为C的纯合型；所述GC基因型表示玉米基因组中所述KASP_D8位点的核苷酸种类为G和C的杂合型。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，应用在玉米育种中。3.根据权利要求1中玉米花期基因的SNP分子标记的开发方法，其特征在于，所述KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米花期中的应用。4.根据权利要求1中玉米花期基因的SNP分子标记的开发方法，其特征在于，所述KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米花期的产品中的应用。5.根据权利要求1中玉米花期基因的SNP分子标记的开发方法，其特征在于，所述KASP_D8位点的多态性或基因型的物质在玉米辅助育种或制备玉米辅助育种产品中的应用。6.玉米育种的方法，其特征在于，包括选择权利要求1中所述KASP_D8位点的基因型为GG或者基因型为GC的玉米作为亲本进行育种...

【专利技术属性】
技术研发人员：张恩盈，程丽巧，
申请(专利权)人：青岛农业大学，
类型：发明
国别省市：