靶向识别抗新冠病毒中和抗体N-IgY-pAbs的核心氨基酸序列组及应用制造技术

具体公开了一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N

【技术实现步骤摘要】
靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
‑
IgY
‑
pAbs的核心氨基酸序列组及应用


[0001]本申请涉及生物医药领域，更具体地说，它涉及一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
‑
IgY
‑
pAbs的核心氨基酸序列组及应用。

技术介绍

[0002]新型冠状病毒肺炎（简称新冠肺炎）疫情是当今全球最为关注的突发急性传染病事件，自疫情在全球爆发至今,还未得到有效地完全遏制。新型冠状病毒（简称新冠病毒）感染人数众多，传播性极强，病死率较高。截止目前为止，在新冠肺炎疫苗研制和治疗手段上有了长足进展，疫苗已经得到推广和上市应用，但仍尚无针对新冠病毒的特效治疗药物。因此，探索新型新冠肺炎疫情防御和诊治的新方法、新手段及新工具仍是迫切需要的。
[0003]基于病毒感染和产生抗体的基本免疫学机制，利用新型冠状病毒特异性抗体可以起到中和病毒作用，从而阻止病毒粘附、入侵宿主细胞。新冠病毒感染机体首先通过刺突蛋白（S蛋白）上的受体结合结构域（RBD）与宿主细胞的受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合，介导病毒进入宿主细胞。因此，在免疫原选择方面，采用新冠病毒S蛋白胞外区（S
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ECD）是一个理想和有效的免疫抗原，可有效地诱导中和抗体的产生。
[0004]在抗体种类上，禽类或鸟类的IgY抗体具有优势。IgY被动免疫治疗策略曾用于人类和动物的病原体感染防御和治疗上。其中，病毒S蛋白是呼吸道冠状病毒抗体类药物优选的靶标蛋白。对于过去发生的呼吸道烈性病毒性传染病治疗药物开发中，例如中东呼吸综合征冠状病毒（MARS
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CoV）,有学者使用重组 MERS
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CoV S亚基蛋白制备了IgY多克隆抗体，并进行了体外中和试验及在体动物模型检测，均发现该IgY抗体能有效中和MERS
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CoV的感染效果。还有研究采用核衣壳蛋白 (N蛋白) 制备的IgY 多抗，也显示了强大的与N蛋白的高亲和能力。然而，IgY多抗识别新冠病毒蛋白组中哪些特异靶标位点仍然未知。
[0005]抗新冠病毒抗体通常可分为两大类，即中和抗体（NAbs，Neutralizing Antibodies）和非中和病毒结合抗体（BAbs, Binding Antibodies）。新冠病毒S蛋白是NAbs的关键靶点，因为新冠病毒是通过其S蛋白与宿主细胞表面ACE2蛋白的相互作用侵入宿主细胞的。而BAbs则可以与新冠病毒的所有蛋白质成分结合，包括S、N、E和M蛋白。NAbs是预测新冠疫苗成功与否的最重要标准之一。
[0006]在目前新冠病毒防治形势下，尽管新冠疫苗已经开发上市，用于应对新冠肺炎大流行，但是，目前仍无特效的新冠治疗药物。在新冠疫苗和药物持续性开发过程中，目前面临的一个严重挑战是新冠病毒频繁出现突变，这些突变可导致病毒免疫逃逸或增强适应性。新突变株易引起疫情反复，削弱疫苗保护作用，从而恶化疫情全球蔓延形势。因此，针对病毒突变，在新冠病毒检测和治疗靶点设计上，应避开突变热点区域，选择保守区域和序列。
[0007]自2019年12月至2020年12月，新冠病毒以不同的速度发生着突变，研究学者分析了27个不同蛋白质在不同时期的突变率，发现新冠病毒不同蛋白的突变率是截然不同的，
观察到新冠病毒疫苗和治疗中的S蛋白和N蛋白是具有最高的突变变异性，例如 D614G（S蛋白）、P323L（NSP12）和 R203K/G204R（N蛋白）。最近的突变又发现了其他位点，例如 A222V（S蛋白）、L18F（S蛋白）和A220V（N蛋白）(Vilar S , Isom D G . One Year of SARS
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CoV
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2: How Much Has the Virus Changed. Biology,2021,10:91)。对于近来的新冠病毒Delta变异株，其突变至少有13个位点，主要在S蛋白，例如D614G、T478K、L452R、P681R、E484Q（S蛋白）。
[0008]在新冠疫苗和治疗药物开发研究中，因为主要靶点和研究焦点在S蛋白和N蛋白上，而S蛋白和N蛋白具有最高的突变变异性，增加了在S蛋白和N蛋白上选择靶序列的难度，尤其是针对S蛋白。
[0009]因此，专利技术人认为，在抗体特异性结合靶序列评估中，是否存在突变区，是否包含突变点，是一项效能评价的重要指标，面对目前新冠病毒高频突变的不利形势，在S蛋白上发现与特异性抗体尤其是中和抗体结合的保守氨基酸序列有着重要的意义和应用价值。

技术实现思路

[0010]为了有效应对目前新冠病毒高频突变的不利形势，本申请提供一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
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IgY
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pAbs的核心氨基酸序列组及应用。
[0011]第一方面，本申请提供的一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
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IgY
‑
pAbs的核心氨基酸序列组采用如下的技术方案：一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
‑
IgY
‑
pAbs的核心氨基酸序列组，包括以下氨基酸序列：位于S
‑
ECD区域的氨基酸序列按照蛋白质序列编号如下：S
‑
NTD：
21
RTQLPPAYTNSFTRG
35
,
141
LGVYYHKNNKSWMES
155
,
261
GAAAYYVGYLQPRTF
275
和
291
CALDPLSETKCTLKS
305
；S
‑
RBD：
411
APGQTGKIADYNYKL
425
和
461
LKPFERDISTEIYQA
475
；S
‑
CTD1：
561
PFQQFGRDIADTTDA
575
,
571
DTTDAVRDPQTLEIL
585
和
581
TLEILDITPCSFGGV
595
；S
‑
CTD2：
661
ECDIPIGAGICASYQ
675
；S1/S2交界区域：
741
YICGDSTECSNLLLQ
755
,
811
KPSKRSFIEDLLFNK
825
和
821
LLFNKVTLADAGFIK
835
；S
‑
HR2：
1161
SPDVDLGDISGINAS
1175
；S
‑
HR2
‑
TM：
1201
QELGKYEQYIK本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种靶向识别抗新冠病毒中和抗体N
‑
IgY
‑
pAbs的核心氨基酸序列组，其特征在于，包括以下氨基酸序列：位于S
‑
ECD区域的氨基酸序列按照蛋白质序列编号如下：S
‑
NTD：
21
RTQLPPAYTNSFTRG
35
,
141
LGVYYHKNNKSWMES
155
,
261
GAAAYYVGYLQPRTF
275
和
291
CALDPLSETKCTLKS
305
；S
‑
RBD：
411
APGQTGKIADYNYKL
425
和
461
LKPFERDISTEIYQA
475
；S
‑
CTD1：
561
PFQQFGRDIADTTDA
575
,
571
DTTDAVRDPQTLEIL
585
和
581
TLEILDITPCSFGGV
595
；S
‑
CTD2：
661
ECDIPIGAGICASYQ
675
；S1/S2交界区域：
741
YICGDSTECSNLLLQ
755
,
811
KPSKRSFIEDLLFNK
825
和
821
LLFNKVTLADAGFIK
835
；S
‑
HR2：
1161
SPDVDLGDISGINAS
1175
；S
‑
HR2
‑
TM:
1201
QELGKYEQYIKWPWY
1215
；位于非结构蛋白区域的氨基酸序列按照蛋白质序列编号如下：ORF1ab：
1361<...

【专利技术属性】
技术研发人员：黑爱莲，李劲，梁特，王祥斌，于晓波，艾伦何，斯文斯库格，周际，
申请(专利权)人：华瑞同康生物技术深圳有限公司，
类型：发明
国别省市：