一种影响母猪繁殖性能的分子标记、检测方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种影响种猪繁殖性能的分子标记、检测方法及其应用。一种影响种猪繁殖性能的分子标记、检测方法及其应用，所述分子标记位于种猪METTL23基因外显子4第62个位点，且具有A/G多态性，GG基因型个体的总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数均最高。一种早期筛选种猪品系的方法，其特征在于包括检测种猪METTL23基因外显子4第62个位点的多态性，选择GG型个体留种。该方法可提高种猪的产仔数，用于早期选种，从而加快种猪选育进程。从而加快种猪选育进程。从而加快种猪选育进程。

【技术实现步骤摘要】
一种影响母猪繁殖性能的分子标记、检测方法及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物学领域，涉及一种影响母猪繁殖性能的分子标记、检测方法及其应用。

技术介绍

[0002]伴随着“新冠”与“非瘟”双疫情的发生，猪活体运输面临极大的风险，在猪场从外部引种困难的条件下，提高自身猪场母猪繁殖性能成为当前迫切需要解决的关键问题。松辽黑猪是以杜洛克猪、长白猪、民猪为亲本培育而成的中国北方第一个瘦肉型母系新品种，自育成以来为猪育种提供了优质种源，缓解了高端市场缺少优质黑母猪的问题。虽然松辽黑猪综合了各亲本的优点，但与其母本民猪比较，繁殖性能仍有选育提高的空间。众所周知，繁殖性状属于低遗传力性状，采用常规育种手段其遗传进展十分缓慢，如果与标记辅助选择相结合，便可以提高动物繁殖性状的改良速率。
[0003]猪的甲基转移酶23(methyltransferase
‑
like 23，METTL23)基因位于 12号染色体上，含有5个外显子，编码190个氨基酸。哺乳动物体内有Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ共3种类型的精氨酸甲基转移酶(arginine methyltransferases,PRMTs)， METTL23属于Ⅰ型PRMTs，能够催化组蛋白H3R47的不对称二甲基化，参与调控RNA代谢、细胞增殖以及信号转导等生物学过程，在动物的生长、发育等过程起着非常重要的作用。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于克服母猪育种过程常规育种手段遗传进展十分缓慢的缺陷，提供一种种猪繁殖性状相关的METTL23基因分子标记选择方法，用于母猪分子育种，可以提高种猪总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数，加快种猪新品种培育进程。
[0005]本专利技术的目的可通过以下技术方案实现：
[0006]一种影响种猪繁殖性能的分子标记，所述分子标记位于种猪METTL23 基因外显子4第62个位点，且具有A/G多态性，GG型个体具有提高总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数的性能。
[0007]本专利技术所述的分子标记在种猪育种中的应用。
[0008]一种用于检测本专利技术所述的分子标记引物对，上游引物F4如序列SEQID NO:1(CTGGAAATCTGTCAGCGTA)所示，下游引物R4如序列SEQIDNO：2(TTTGTTGAGGTCGTGGGTA)所示。
[0009]本专利技术所述的引物对在种猪育种中的应用。
[0010]一种检测本专利技术所述的分子标记的方法，包含PCR扩增种猪基因组中含有权利要求1所述的分子标记的一段序列，对扩增产物进行测序，判读 METTL23基因外显子4第62位点A/G的多态性。
[0011]一种早期筛选种猪品系的方法，包括检测种猪METTL23基因62位点的多态性，选择GG型个体留种。
[0012]本专利技术早期筛选种猪品系的方法，包括以下步骤：
[0013]1)提取种猪基因组DNA；
[0014]2)利用检测权利要求1所述的分子标记的引物对PCR扩增METTL23 基因序列，得到898bp扩增产物；所述的引物对,其上游引物F4如序列SEQ ID NO:1所示，下游引物R4如序列SEQ ID NO：2所示；
[0015]3)对扩增METTL23基因序列进行测序；
[0016]4)选择GG型个体留种。
[0017]其中，PCR反应体系20μL：DNA 1μL，上、下引物各0.5μL，2
ꢀ×
Taq MasterMix 10μL，ddH2O 8μL。PCR反应程序：95℃预变性3min； 95℃变性30s，退火(退火温度56℃)30s，72℃延伸(延伸时间27s)，共34个循环；72℃延伸5min；4℃保存。
[0018]其中，测序采用Sanger法测序。
[0019]有益效果
[0020]种猪的繁殖性能是评价种猪的重要指标，具有极高的经济价值，传统的表型选择准确性低，其表型选择需要在种猪繁育后才能统计出来，周期很长，无法在早期进行选择，遗传进展缓慢。本专利技术采用PCR
‑
Sanger法检测METTL23基因外显子4第62位点A/G多态性，将基因型与种猪繁育性能进行关联分析，发现METTL23基因外显子4第62位点GG型种猪总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数均有提高。该多肽位点可以用于种猪的辅助选择，提高选择的优良性，同时可以在种猪出生时就通过检测基因型进行选择，加快育种进程，降低生产成本。
附图说明
[0021]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
[0022]图1METTL23基因外显子4PCR产物电泳检测结果图；
[0023]M，DL2000 DNA Marker；1～6，METTL23
‑
4引物PCR扩增产物
[0024]图2松辽黑猪METTL23基因外显子4序列比对结果图；
[0025]图3松辽黑猪METTL23基因外显子4不同基因型测序图；
具体实施方式
[0026]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。
[0027]以下结合实施例对本专利技术的特征和性能作进一步的详细描述。
[0028]实施例1
[0029]种猪METTL23基因外显子4第62位点A/G分子标记选择方法。
[0030]材料与方法：
[0031]1.1样品采集
[0032]松辽黑猪由公主岭国家农业科技园区飞马斯牧业有限公司提供，随机选取178头2～4产健康松辽黑猪母猪。用耳钳夹采集耳组织，放入含75％乙醇的1.5mL离心管中，标记好耳号和日期带回实验室，将耳组织样放― 20℃冰箱保存备用。同时收集所选母猪相关繁殖数据(总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数、初生重、3周龄重、断奶重、乳头数)。
[0033]1.2主要试剂及仪
[0034]基因组DNA提取试剂盒购自Axygeno公司；2
×
Taq MasterMix购自北京康为世纪生物科技有限公司；无水乙醇及双蒸水均购自长春鼎国生物技术责任有限公司。耳钳夹购自法国安乐福集团公司；超微量分光光度计 Quawell(Q5000)购自北京鼎盛生物技术有限责任公司；普通PCR仪(T100) 购自上海伯乐生命医学产品有限公司；电泳仪DYY
‑
6C和凝胶成像分析仪 WD
‑
9413A均购自北京市六一仪器厂。
[0035]1.3方法
[0036]1.3.1基因组DNA提取 根据基因组DNA提取试剂盒说明书提本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种影响种猪繁殖性能的分子标记，其特征在于所述分子标记位于种猪METTL23基因外显子4第62个位点，且具有A/G多态性，GG型个体具有总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数多的性能。2.权利要求1所述的分子标记在种猪育种中的应用。3.检测权利要求1所述的分子标记的引物对在培育种猪的应用；所述的引物对,其上游引物F4如序列SEQ ID NO:1所示，下游引物R4如序列SEQ ID NO:2所示。4.一种检测权利要求1所述的分子标记的方法，其特征在于包含PCR扩增种猪基因组中含有权利要求1所述的分子标记的一段序列，对扩增产物进行测序，判读METTL23基因外显子4第62位点的A/G多态性。5.一种早期筛选种猪品系的方法，其特征在于包括检测种猪METTL23基因外显子4第62位点的多态性，选择GG型个体留种。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于包括...

【专利技术属性】
技术研发人员：张琪，张树敏，李娜，于永生，刘庆雨，张庆，
申请(专利权)人：吉林省农业科学院，
类型：发明
国别省市：