T细胞受体及其使用方法技术

技术编号：31372732 阅读：20 留言：0更新日期：2021-12-15 10:26

本公开涉及能够结合NY

全部详细技术资料下载

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】T细胞受体及其使用方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]此PCT申请要求2019年3月4日提交的美国临时申请号62/813,644的优先权权益，所述临时申请以引用的方式整体并入本文中。
[0003]对经由EFS
‑
WEB以电子方式提交的序列表的引用
[0004]以电子方式提交的序列表(名称：4285_003PC01_Seqlisting_ST25.txt，大小：28,117字节；并且创建日期：2020年3月3日)的内容以引用的方式整体并入本文中。

[0005]本公开提供特异性地结合人NY
‑
ESO
‑
1的重组T细胞受体(“TCR”)及其用途。
[0006]专利技术背景
[0007]在与包括癌症的多种疾病的斗争中免疫疗法作为关键工具而出现。T细胞疗法处于免疫治疗剂发展的最前方，并且抗肿瘤T细胞的过继转移已显示在癌症患者中诱导临床应答。虽然许多T细胞疗法靶向突变的肿瘤抗原，但对于各患者而言绝大多数新抗原并非共同拥有的而为独特的。
[0008]潜在非突变抗原超出突变抗原数目多个数量级。阐明源自共同拥有的抗原的T细胞表位可促进较大群组癌症患者轻易可获得的有效且安全的过继T细胞疗法的稳健发展。然而，非突变抗原的绝对数目和HLA基因的高多态性可能已妨碍了对非突变抗原的抗肿瘤T细胞应答的特异性的综合分析。
[0009]本公开提供非突变抗原NY
‑
ESO
‑
1的新颖表位和能够特异性地结...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种核酸分子，所述核酸分子包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性地结合人NY
‑
ESO
‑
1的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗NY
‑
ESO
‑
1TCR”)；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR与参考TCR交叉竞争结合于人NY
‑
ESO
‑
1，所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。2.一种核酸分子，所述核酸分子包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性地结合人NY
‑
ESO
‑
1的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗NY
‑
ESO
‑
1TCR”)；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR与参考TCR结合人NY
‑
ESO
‑
1的相同表位或重叠表位，所述参考TCR包含α链和β链，其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。3.如权利要求1或2所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR结合于NY
‑
ESO
‑
1的由如SEQ ID NO:13中所列的氨基酸序列组成的表位。4.如权利要求2或3所述的核酸分子，其中所述表位与HLA I类分子复合。5.如权利要求4所述的核酸分子，其中所述HLA I类分子为HLA
‑
A、HLA
‑
B、HLA
‑
C、HLA
‑
E、HLA
‑
F或HLA
‑
G等位基因。6.如权利要求4所述的核酸分子，其中所述HLA I类分子为HLA
‑
B*07等位基因。7.如权利要求4至6中任一项所述的核酸分子，其中所述HLA I类分子选自HLA
‑
B*07:02等位基因、HLA
‑
B*07:03等位基因、HLA
‑
B*03:04等位基因、HLA
‑
B*07:05等位基因和HLA
‑
B*07:06等位基因。8.如权利要求4至7中任一项所述的核酸分子，其中所述HLA I类分子为HLA
‑
B*07:02等位基因。9.如权利要求1至8中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。10.如权利要求9所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。11.如权利要求1至8中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。12.如权利要求11所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。13.如权利要求9至12中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:5中所列的氨基酸序列。
14.如权利要求9至13中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:8中所列的氨基酸序列。15.如权利要求9至14中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:6中所列的氨基酸序列。16.如权利要求9至15中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:9中所列的氨基酸序列。17.如权利要求9至16中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链可变结构域包含SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。18.如权利要求9至17中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链可变结构域包含SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。19.如权利要求9至18中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述α链的内源性恒定区。20.如权利要求9至19中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链还包含恒定区，其中所述α链恒定区包含与SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。21.如权利要求19或20所述的核酸分子，其中所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。22.如权利要求9至21中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述β链的内源性恒定区。23.如权利要求9至22中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链还包含恒定区，其中所述β链恒定区包含与SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。24.如权利要求22或23所述的核酸分子，其中所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。25.如权利要求9至24中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列。26.如权利要求9至25中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。27.如权利要求1至26中任一项所述的核酸分子，其中所述第二核苷酸序列为降低内源性TCR的表达的一种或多种siRNA。28.如权利要求27所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA与编码所述内源性TCR的恒定区的核苷酸序列内的靶序列互补。29.如权利要求27或28所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA包含选自由SEQ ID NO:53
‑
56组成的组的一个或多个核苷酸序列。30.如权利要求1至29中任一项所述的核酸分子，其中所述第二核苷酸序列编码Cas9。
31.如权利要求1至30中任一项所述的核酸分子，其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR包含α链恒定区、β链恒定区或两者；并且其中所述α链恒定区、所述β链恒定区或两者包含相对于内源性TCR的对应氨基酸序列在所述靶序列内具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个取代的氨基酸序列。32.一种载体，所述载体包含权利要求1至31中任一项所述的核酸分子。33.如权利要求32所述的载体，所述载体为病毒载体、哺乳动物载体或细菌载体。34.如权利要求32或33所述的载体，所述载体为逆转录病毒载体。35.如权利要求32至34中任一项所述的载体，所述载体选自由以下组成的组：腺病毒载体、慢病毒、仙台病毒载体、杆状病毒载体、爱泼斯坦巴尔病毒载体、乳多空病毒载体、痘苗病毒载体、单纯疱疹病毒载体、杂合载体和腺相关病毒(AAV)载体。36.如权利要求32至35中任一项所述的载体，所述载体为慢病毒。37.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分，其包含权利要求9至31中任一项所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述α链可变结构域和权利要求9至31中任一项所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR的所述β链可变结构域。38.一种特异性地结合人NY
‑
ESO
‑
1的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗NY
‑
ESO
‑
1TCR”)，其与参考TCR交叉竞争结合于人NY
‑
ESO
‑
1；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中(i)所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或(ii)所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。39.一种特异性地结合人NY
‑
ESO
‑
1的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗NY
‑
ESO
‑
1TCR”)，其与参考TCR结合人NY
‑
ESO
‑
1的相同表位或重叠表位；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗NY
‑
ESO
‑
1TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中(i)所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或(ii)所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少个5氨基酸取代的氨基酸序列。40.如权利要求38或39所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR，其结合于NY
‑
ESO
‑
1的由如SEQ ID NO:13中所列的氨基酸序列组成的表位。41.如权利要求39或40所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR，其中所述表位与HLA I类分子复合。42.如权利要求41所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR，其中所述HLA I类分子为HLA
‑
A、HLA
‑
B、HLA
‑
C、HLA
‑
E、HLA
‑
F或HLA
‑
G等位基因。
43.如权利要求41或42所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR，其中所述HLA I类分子为HLA
‑
B*07等位基因。44.如权利要求41至43中任一项所述的抗NY
‑
ESO
‑
1TCR，其中所述HLA I类分子选自HLA
‑
B*07:02等位基因、HLA
‑
B*07:03等位基因、HLA
‑
B*07:04等位基因、HLA
‑
B*07:05等...

【专利技术属性】
技术研发人员：平野直人，村田健二，佐生嘉代子，
申请(专利权)人：大学健康网络，
类型：发明
国别省市：

全部详细技术资料下载我是这个专利的主人