【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于4
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羟甲基糠醛及其衍生物的体内合成的方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2019年3月1日提交的标题为“用于4
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羟甲基糠醛及其衍生物的体内合成的方法(METHOD FOR THE IN VIVO SYNTHESIS OF 4
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HYDROXYMETHYLFURFURAL AND DERIVATIVES THEREOF)”的美国临时申请号62/812,904的优先权,该临时申请的公开内容通过引用并入本文。
[0003]本申请涉及用于4
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HMF、2,4
‑
呋喃二甲醇、呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛、4
‑
(羟甲基)糠酸、2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯和2,4
‑
FDCA中的一种或多种的生物合成的重组微生物以及产生所述重组微生物的方法。本申请还涉及在不存在微生物或基本上不含微生物的情况下,用酶促催化剂产生2,4
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呋喃二甲醇、呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛、4
‑
(羟甲基)糠酸、2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯和2,4
‑
FDCA中的一种或多种的方法。 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种通过将甘油醛3
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磷酸(G3P)酶促转化为2,4
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呋喃二羧酸(2,4
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FDCA)以产生2,4
‑
呋喃二羧酸(2,4
‑
FDCA)的方法,所述方法包括:(a)在磷酸甲酯合酶的存在下提供G3P,所述磷酸甲酯合酶催化G3P转化为(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯;(b)向来自(a)的所述(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯提供催化所述(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯转化为4
‑
羟甲基糠醛(4
‑
HMF)的磷酸酶;(c)将来自(b)的所述4
‑
HMF提供给脱氢酶和/或氧化酶,所述脱氢酶和/或氧化酶独立地或协同地催化来自(b)的4
‑
HMF直接地或通过产生中间产物呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛、4
‑
(羟甲基)糠酸、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯、2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯而氧化为2,4FDCA。2.如权利要求1所述的方法,其中所述2,4
‑
FDCA由呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛和/或
‑
(羟甲基)糠酸中间产物产生,其中:(a)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化所述4
‑
HMF转化为呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛和/或4
‑
(羟甲基)糠酸;和/或(b)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(a)的所述呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛转化为4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯;和/或(c)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(a)的所述4
‑
(羟甲基)糠酸转化为4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯;和/或(d)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(a)的所述呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛转化为2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯;和或(e)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(b)和/或(c)的所述4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯或来自(d)的所述2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯转化为2,4
‑
FDCA。3.如权利要求1所述的方法,其中来自(a)的所述磷酸甲酯合酶被分类为EC编号4.2.3.153。4.如权利要求3所述的方法,其中所述磷酸甲酯合酶是(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯合酶。5.如权利要求4所述的方法,其中所述(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯合酶选自MfnB1、MfnB7和MfnB14。6.如权利要求5所述的方法,其中所述(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯合酶包含含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:14的氨基酸序列。7.如权利要求1所述的方法,其中来自(b)的所述磷酸酶被分类为EC编号3.1.3。8.如权利要求5所述的方法,其中所述磷酸酶被分类为卤代酸脱卤酶。9.如权利要求1所述的方法,其中所述磷酸酶是宿主内源性的。10.如权利要求11所述的方法,其中所述宿主内源性的磷酸酶被过表达。11.如权利要求5
‑
8中任一项所述的方法,其中所述磷酸酶是4
‑
HMF磷酸酶。12.如权利要求11所述的方法,其中所述4
‑
HMF磷酸酶源自天蓝色链霉菌、酿酒酵母或大肠杆菌。13.如权利要求11或12所述的方法,其中所述4
‑
HMF磷酸酶由包含SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:40
‑
52中的任一者或SEQ ID NO:53
‑
68中的任一者的氨基酸序列编码。
14.如权利要求1所述的方法,其中来自(c)的所述脱氢酶被分类为EC编号1.1.1.或EC编号1.2.1。15.如权利要求14所述的方法,其中所述脱氢酶是醇脱氢酶或醛脱氢酶。16.如权利要求1所述的方法,其中来自(c)的所述氧化酶被分类为EC编号1.1.3。17.如权利要求16所述的方法,其中所述氧化酶是5
‑
羟甲基糠醛氧化酶。18.如权利要求2所述的方法,其中所述脱氢酶被分类为EC编号1.2.1.或EC编号1.1.1。19.如权利要求18所述的方法,其中所述脱氢酶是醛脱氢酶或和醇脱氢酶。20.如权利要求2所述的方法,其中所述氧化酶被分类为EC编号1.1.3。21.如权利要求20所述的方法,其中所述氧化酶是5
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羟甲基糠醛氧化酶。22.如权利要求1所述的方法,其中所述氧化酶是4
‑
HMF氧化酶。23.如权利要求22所述的方法,其中所述4
‑
HMF氧化酶选自HmfH6和HmfH7。24.如权利要求23所述的方法,其中所述4
‑
HMF氧化酶包含含有SEQ ID NO:85或SEQ ID NO:86的氨基酸序列。25.如权利要求2所述的方法,其中所述脱氢酶被分类为EC编号1.2.1。26.如权利要求25所述的方法,其中所述脱氢酶是醛脱氢酶。27.一种能够从包含碳源的原料产生2,4
‑
呋喃二羧酸(2,4
‑
FDCA)的重组微生物,其中所述重组微生物表达:(a)能够将碳源转化为甘油醛3
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磷酸(G3P)的内源和/或外源核酸分子;(b)编码催化来自(a)的G3P转化为(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯的(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯合酶的至少一种内源或外源核酸分子;(c)编码催化来自(b)的(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯转化为4
‑
羟甲基糠醛(4
‑
HMF)的磷酸酶的至少一种内源或外源核酸分子;(d)编码过加氧酶、脱氢酶或氧化酶的至少一种内源或外源核酸分子,所述过加氧酶、脱氢酶或氧化酶独立地或协同地催化来自(c)的4
‑
HMF直接地或通过产生中间产物呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛、4
‑
(羟甲基)糠酸、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯、4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯、2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯而氧化为2,4FDCA。28.如权利要求27所述的重组微生物,其中所述碳源包含己糖、戊糖、甘油、CO2、蔗糖和/或其组合。29.如权利要求27所述的重组微生物,其中来自(a)的所述磷酸甲酯合酶被分类为EC编号4.2.3.153。30.如权利要求29所述的重组微生物,其中所述合酶是(5
‑
甲酰基呋喃
‑3‑
基)磷酸甲酯合酶。31.如权利要求27所述的重组微生物,其中来自(c)的所述磷酸酶被分类为EC编号3.1.3。32.如权利要求31所述的重组微生物,其中所述磷酸酶被分类为卤代酸脱卤酶。33.如权利要求31所述的重组微生物,其中所述磷酸酶是宿主内源性的。34.如权利要求33所述的重组微生物,其中所述宿主内源性的磷酸酶被过表达。35.如权利要求27所述的重组微生物,其中来自(d)的所述氧化酶被分类为EC编号1.1.3。
36.如权利要求35所述的重组微生物,其中来自(d)的所述氧化酶是5
‑
羟甲基糠醛氧化酶。37.如权利要求36所述的重组微生物,其中来自(d)的所述脱氢酶被分类为EC编号1.1.1.或EC编号1.2.1。38.如权利要求37所述的重组微生物,其中所述脱氢酶是醇脱氢酶或醛脱氢酶。39.如权利要求27所述的重组微生物,其中所述2,4
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FDCA由呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛和/或
‑
(羟甲基)糠酸中间产物产生,其中:(a)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(c)的所述4
‑
HMF转化为呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛和/或4
‑
(羟甲基)糠酸;和/或(b)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(a)的所述呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛转化为4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯;和/或(c)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(b)的所述4
‑
(羟甲基)糠酸转化为4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯;和/或(d)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(c)的所述呋喃
‑
2,4
‑
二甲醛转化为2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯;和或(e)脱氢酶、氧化酶或过加氧酶催化来自(b)和/或(c)的所述4
‑
甲酰基呋喃
‑2‑
羧酸酯或来自(d)的所述2
‑
甲酰基呋喃
‑4‑
羧酸酯转化为2,4
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FDCA。40.如权利要求39所述的重组微生物,其中来自(a)、(b)、(c)、(d)和/或(e)的所述脱氢酶被分类为EC编号1.2.1.或EC编号1.1.1。41.如权利要求40所述的重组微生物,其中所述脱氢酶是醛脱氢酶或醇脱氢酶。42.如权利要求39所述的重组微生物,其中来自(a)、(b)、(c)、(d)和/或(e)的所述氧化酶被分类为EC编号1.1.3。43.如权利要求42所述的重组微生物,其中所述氧化酶是5
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(羟甲基)糠醛氧化酶。44.如权利要求27所述的重组微生物,其中所述一种或多种重组微生物源自选自由以下组成的组的亲本微生物:梭菌属(Clostridium sp.)、永达尔梭菌(Clostridium ljungdahlii)、产乙醇梭菌(Clostridium autoethanogenum)、拉氏梭菌(Clostridium ragsdalei)、粘液真杆菌(Eubacterium limosum)、嗜甲基丁酸杆菌(Butyribacterium methylotrophicum)、热醋穆尔氏菌(Moorella thermoacetica)、谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)、醋酸梭菌(Clostridium aceticum)、伍氏醋酸杆菌(Acetobacterium woodii)、巴...
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