结直肠癌治疗预后生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了结直肠癌治疗预后生物标志物及其应用，所述的生物标志物为DYNLT3和/或ACTR3B。本发明专利技术采用基因芯片检测实验证明了DYNLT3、ACTR3B在白头翁汤治疗后的结直肠癌患者中表达下调。进一步在数据集中验证发现，与正常人相比，DYNLT3、ACTR3B在结直肠癌患者中表达上调，且具有很好的诊断效能。本发明专利技术为诊治结直肠癌、预测结直肠癌患者使用白头翁汤治疗预后提供了新的方法和策略。疗预后提供了新的方法和策略。疗预后提供了新的方法和策略。

【技术实现步骤摘要】
结直肠癌治疗预后生物标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及结直肠癌治疗预后生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]癌症是世界范围的健康问题，也是很多国家人口死亡的主要原因。全球每年都有约140万例恶性肿瘤病例，死亡人数达到70万人。其中，结直肠癌(colorectal carcinoma，CRC)是位居全球恶性肿瘤的第三位，其死亡率位居第四位。最近的一项估计表明，到2030年，预计将增加60％的结直肠癌病例，也就是即将有超过220万例新病例，死亡人数也将达110万[Sierra,Monica,S,et al.Global patterns and trends in colorectal cancer incidence and mortality[J].Gut Journal ofthe British Society ofGastroenterology,2017.]。
[0003]目前，临床治疗结直肠癌的方法以肿瘤的完全切除为主。然而，晚期结直肠癌患者在术后易发生复发和转移，这导致晚期结直肠癌患者的5年生存率小于10％。因此，放射治疗和化疗依然是晚期结直肠癌的主要治疗方法，但是这些治疗方法会导致严重的副作用。将传统的中药治疗作为一种安全的替代疗法已受到越来越多的关注。大多数中药含有多种生物活性成分，有成为新兴抗癌药物的潜力，例如多靶点抗癌药物。在临床研究中，已发现一些中草药对晚期结直肠癌有治疗效果，如白头翁汤。白头翁汤出自《伤寒论》，功用为清热燥湿，解毒凉血止痢。《医方集解
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泻火之剂》：“此足阳明、少阴、厥阴药也。白头翁苦寒能人阳明血分，而凉血止痢；秦皮苦寒性涩，能凉肝益肾而固下焦；黄连凉心清肝，黄柏泻火补水，并能燥湿止痢而厚肠，取寒能胜热，苦能坚肾，涩能断下也。”目前关于白头翁汤治疗结直肠癌的相关作用模式和治疗靶点鲜有报道。通过研究结直肠癌患者使用白头翁汤治疗预后相关生物标志物，为预测结直肠癌患者使用白头翁汤治疗预后提供新方法，有利于针对患者之间的差异选择个体化治疗方案，提高中药治疗结直肠癌的效果。

技术实现思路

[0004]为了有效的诊断、预测结直肠癌，或预测结直肠癌患者使用白头翁汤治疗预后，本专利技术提供了一种生物标志物。
[0005]为实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：
[0006]本专利技术一方面提供了一种试剂，所述的试剂能够特异性检测样本中生物标志物的表达水平。
[0007]术语“生物标志物”是指以可用于预测个体的癌症状态的不同浓度存在于个体中的生物分子。生物标志物可包括，但不限于，核酸、蛋白质及其变体和片段。生物标志物可以是包含编码该生物标志物的全部或部分核酸序列或这类序列的互补体的DNA。可用于本专利技术的生物标志物核酸被认为包括包含任何目的核酸序列的全部或部分序列的DNA和RNA。在本专利技术的具体实施方式中，所述的生物标志物包括DYNLT3和/或ACTR3B。
[0008]如本文中在诸如“A和/或B”的短语中使用的术语“和/或”旨在包括A和B两者；A或
B；A(单独)；以及B(单独)。
[0009]本专利技术中，生物标志物例如DYNLT3(Gene ID:6990)、ACTR3B(Gene ID:57180)包括基因及其编码的蛋白及其同源物，突变，和同等型。该术语涵盖全长，未加工的生物标志物，以及源自细胞中加工的任何形式的生物标志物。该术语涵盖生物标志物的天然发生变体(例如剪接变体或等位变体)。
[0010]本文所述的生物标志物可用于诊断测试中以评估受试者的结直肠癌状态。结直肠癌状态包括结直肠癌存在或不存在。结直肠癌状态还可以包括监测结直肠癌的病程，例如，监测疾病进展。基于受试者的结直肠癌状态，可以指示另外的程序，包括例如另外的诊断测试或治疗程序。
[0011]通常根据测定的准确度、测定的灵敏度、测定的特异性或“曲线下面积”(AUC，例如，接受者操作特征(ROC)曲线下面积)来测量诊断测试正确预测疾病状态的能力。如本文所用，准确度是错误分类的样品的分数的量度。可以将准确度度计算为例如在测试群体中正确分类的样本的总数除以样本的总数。灵敏度是通过测试预测为阳性的“真阳性”的量度，并且可以计算为正确鉴定的结直肠癌样品的数目除以结直肠癌样品的总数。特异性是通过测试预测为阴性的“真阴性”的量度，并且可以计算为正确鉴定的正常样品的数目除以正常样品的总数。AUC是接受者操作特征曲线下面积的量度，其为灵敏度对假阳性率(1
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特异性)的曲线。AUC越大，测试的预测值越强大。测试效用的其他有用量度包括“阳性预测值”和“阴性预测值”两者，“阳性预测值”是测试为阳性的实际阳性的百分比，“阴性预测值”是测试为阴性的实际阴性的百分比。在一个优选的实施方案中，相对于正常受试者，来源于具有不同结直肠癌状态的受试者的样品中一种或多种生物标志物的水平显示出至少p＝0.05，例如p＝0.05，p＝0.01，p＝0.005，p＝0.001等的统计学显著差异，如相对于合适的对照所确定的。在其他优选的实施方案中，单独或组合使用本文所述的生物标志物的诊断测试显示至少约75％的准确度，例如，至少约75％，约80％，约85％，约90％，约95％，约97％，约99％或约100％的准确度。在其他实施方案中，单独或组合使用本文所述的生物标志物的诊断测试显示出至少约75％的特异性，例如至少约75％，约80％，约85％，约90％，约95％，约97％，约99％或约100％的特异性。在其他实施方案中，单独或组合使用本文所述的生物标志物的诊断测试显示出至少约75％的灵敏度，例如至少约75％，约80％，约85％，约90％，约95％，约97％，约99％或约100％的灵敏度。在其他实施方案中，单独或组合地使用本文所述的生物标志物的诊断测试显示出各自至少约75％的特异性和灵敏度，例如，至少约75％，约80％，约85％，约90％，约95％，约97％，约99％或约100％的特异性和灵敏度(例如，至少约80％的特异性和至少约80％的灵敏度，或例如，至少约80％的特异性和至少约95％的灵敏度)。
[0012]在本专利技术中检测生物标志物的试剂包括检测基因转录水平的试剂、检测基因翻译水平的试剂。检测基因转录水平的试剂包括但不限于引物、探针，检测基因翻译水平的试剂包括蛋白的结合剂。
[0013]“引物”是指寡核苷酸，它与靶核酸中的序列(“引物结合位点”)杂交并且能够用作在适用于合成的条件下沿着核酸的互补链启动该合成的点。
[0014]“探针”指能与另一分子的特定序列或亚序列或其它部分结合的分子。除非另有指出，术语“探针”通常指能通过互补碱基配对与另一多核苷酸(往往称为“靶多核苷酸”)结合
的多核苷酸探针。根据杂交条件的严格性，探针能和与该探针缺乏完全序列互补性的靶多核苷酸结合。探针可作直接或间接的标记。杂交方式，包括，但不限于：溶液相、固相、混合相或原位杂交测定法。
[0015]蛋白的结合剂是例如蛋白质的受体、结合蛋白质的凝集素、针对蛋本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂，其特征在于，所述的试剂能够特异性检测样本中生物标志物的表达水平，所述的生物标志物包括DYNLT3和/或ACTR3B。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述的试剂包括引物、探针、蛋白结合剂。3.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述的试剂包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测所述生物标志物的表达水平的试剂。4.一种试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包括权利要求1
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3任一项所述的试剂。5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒还包括下组的一种或多种物质：容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂。6.一种芯片，其特征在于，所述的芯片包括权利要求1
‑
3任一项所述的试剂。7.一种组合物，其特征在于，所述的组合物包括抑制生物标志物表达的试剂，所述的生物标志物包括DYNLT3和/或ACTR3B。8.如下任一项所述的应用：(1)权利要求1
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3任一项所述的试剂在制备预测结直肠癌患者使用白头翁汤治疗预后的产品中的应用；(2)权利要求4或5所述的试剂盒在制备预测结直肠癌患者...

【专利技术属性】
技术研发人员：节阳华，陈卫东，曾凡业，朱艳华，李南，
申请(专利权)人：新疆医科大学第四附属医院，
类型：发明
国别省市：