【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于猫科动物微生物组变化的监测和诊断方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2019年1月18日提交的英国专利申请第1900754.1号的优先权，该专利申请的内容通过引用整体并入本文。
[0003]本公开内容涉及用于测定猫科动物微生物组的年龄状态并在其中评估动物健康的监测工具和诊断方法的领域。
技术介绍
[0004]近年来，人们对微生物组及其对健康影响的了解显著增加。微生物组的变化及其与免疫、内分泌和神经系统的相互作用与多种疾病相关，从炎症性肠病[1
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3]到癌症[4]以及宿主健康的行为方面[5；6]。
[0005]微生物组的建立与免疫系统的发育同时发生，并在肠道生理和调节中发挥作用。肠道微生物群的初步建立是新生儿发育的重要步骤，影响婴儿期的免疫发育和整个生命的健康。因此，在人类和许多哺乳动物中，肠道微生物组发育的早期建立阶段发生了多样性的快速增加[7]。
[0006]成年肠道微生物组可以适应群落结构的巨大变化，并且在人类和其他哺乳动物中，它被认为在整个成年生活中相对稳定。这种“成年微生物组”被认为代表了猫的健康肠道微生物组且具有比其他生命阶段更强的恢复力。在生命早期阶段，小猫具有未发育好的肠道屏障，这包括胃肠道微生物组以及组织学和肠道相关免疫功能。因此，小猫和幼年猫更容易出现诸如腹泻和生病等胃肠道疾病。较老的猫和老年猫也更容易出现腹泻和胃肠道并发症，部分原因可能是肠道微生物组的恶化。
[0007]鉴于微生物组对健康和幸福的重要性，由于肠...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种测定猫科动物的微生物组的年龄状态的方法，所述方法包括：(a)检测从所述猫科动物获得的样品中的一种或多种细菌物种；(b)将所述样品中的所述一种或多种细菌物种与对照数据集相比较；以及(c)确定所述微生物组的年龄状态。2.如权利要求1所述的方法，其中所述对照数据集包括猫科动物在不同时间或生命阶段的微生物组数据。3.如权利要求2所述的方法，其中所述对照数据包括来自猫科动物的至少两个、至少三个或四个生命阶段的微生物组数据，所述猫科动物选自由幼年猫科动物、青年猫科动物、成年猫科动物、较老的猫科动物和老年猫科动物所组成的列表。4.如权利要求3所述的方法，其中幼年猫科动物被定义为至多1.0岁，青年猫科动物被定义为大于1.0岁且至多4.5岁，成年猫科动物被定义为大于4.5岁且至多9.5岁，较老的猫科动物被定义为大于9.5岁且至多13.5岁以及老年猫科动物被定义为大于13.5岁。5.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法包括定量所述一种或多种细菌物种。6.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述细菌物种来自选自由下述组成的组的属：索拉杆菌属(Solobacterium)、欧尔森氏菌属(Olsenella)、厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum)、布劳特氏菌属(Blautia)、霍尔德曼氏菌属(Holdemanella)、柯林斯氏菌属(Collinsella)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、真杆菌属(Eubacterium)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、小杆菌属(Dialister)、拟杆菌属(Bacteroides)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、阿德勒克罗伊茨菌属(Adlercreutzia)、罕见小球菌属(Subdoligranulum)、梭菌属(Clostridium)、艰难杆菌属(Mogibacterium)、塞利单胞菌属(Sellimonas)、链球菌属(Streptococcus)、罕见小球菌属(Subdoligranulum)以及拉克氏梭状芽胞杆菌属(Lachnoclostridium)，或者来自毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)的细菌物种。7.如权利要求6所述的方法，其中所述细菌物种选自由下述组成的组：索拉杆菌属的种(Solobacterium sp.)、欧尔森氏菌属的种(Olsenella sp.)、马赛菌
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P2300(Marseille
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P2300)、产琥珀酸厌氧螺菌(Anaerobiospirillum succiniciproducens)、活泼布劳特氏菌(Blautia gnavus)、双形霍尔德曼氏菌(Holdemanella biforme)、罗讷河口柯林斯氏菌(Collinsella bouchesdurhonensis)、双歧杆菌属的种(Bifidobacterium sp.)、短真杆菌(Eubacterium brachy)、田中柯林斯氏菌(Collinsella tanakaei)、粪便柯林斯氏菌(Collinsella stercoris)、卵形布劳特氏菌(Blautia obeum)、圆柱状真杆菌(Eubacterium cylindroides)、溶木聚糖拟杆菌/小杆菌(Dialister/Bacteroides xylanisolvens)、瘤胃乳酸杆菌(Lactobacillus ruminis)、阿德勒克罗伊茨菌属的种(Adlercreutzia sp.)、罕见小球菌属的种(Subdoligranulum sp.)、产气荚膜杆菌(Clostridium perfringens)、马赛艰难杆菌(Mogibacterium massiliense)、塞利单胞菌属的种(Sellimonas sp.)、黄体链球菌(Streptococcus luteciae)、毛螺旋菌属的种(Lachnospiraceae sp.)、变形罕见小球菌(Subdoligranulum variabile)、嗜琥珀酸小杆菌(Dialister succinatiphilus)、拉克氏柔嫩梭菌(Lachnoclostridium[Clostridium]leptum)、拉克氏海莱蒙梭菌(Lachnoclostridium[Clostridium]hylemonae)以及产粪甾醇
ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6以及SEQ ID NO:7中任一条的序列具有至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或100％的同一性。22.如权利要求6
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20中任一项所述的方法，所述方法还包括检测或定量真杆菌属的种(Eubacterium sp.)、柯林斯氏菌属的种(Collinsella sp.)、布劳特氏菌属的种(Blautia sp.)、小杆菌/拟杆菌属的种(Dialister/Bacteroides sp.)、乳酸杆菌属的种(Lactobacillus sp.)、阿德勒克罗伊茨菌属的种(Adlercreutzia sp.)、罕见小球菌属的种(Subdoligranulum sp.)；优选地检测或定量短真杆菌(Eubacterium brachy)、田中柯林斯氏菌(Collinsella tanakaei)、粪便柯林斯氏菌(Collinsella stercoris)、卵形布劳特氏菌(Blautia obeum)、圆柱状真杆菌(Eubacterium cylindroides)、溶木聚糖拟杆菌/小杆菌(Dialister/Bacteroides xylanisolvens)、瘤胃乳酸杆菌(Lactobacillus ruminis)、阿德勒克罗伊茨菌属的种(Adlercreutzia sp.)以及罕见小球菌属的种(Subdoligranulum sp.)。23.如权利要求22所述的方法，其中所述细菌物种具有16S rDNA，所述16S rDNA与SEQ ID NO:9
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18中任一条的序列具有至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或100％的同一性。24.如权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中步骤(b)包括使用偏最小二乘判别分析将所述样品中的所述一种或多种细菌物种与对照数据集相关联。25.如权利要求24所述的方法，其中所述细菌物种来自选自由以下组成的组的属：索拉杆菌属(Solobacterium)、真杆菌属(Eubacterium)、布劳特氏菌属(Blautia)、拉克氏梭状芽胞杆菌属(Lachnoclostridium)、欧尔森氏菌属(Olsenella)、氨基酸球菌属(Acidaminococcus)、厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum)、巨球型菌属(Megasphaera)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、红蝽菌科(Coriobacteriaceae)、链状杆菌属(Catenibacterium)、德兰库尔特菌属(Drancourtella)、塞利单胞菌属(Sellimonas)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、多尔氏菌属(Dorea)、柯林斯氏菌属(Collinsella)、霍尔德曼氏菌属(Holdemanella)、艰难杆菌属(Mogibacterium)以及厌氧杆菌属(Anaerostipes)。26.如权利要求25所述的方法，其中所述细菌物种选自由下述组成的组：索拉杆菌属的种(Solobacterium sp.)、短真杆菌(Eubacterium brachy)、卵形布劳特氏菌(Blautia obeum)、拉克氏柔嫩梭菌(Lachnoclostridium[Clostridium]leptum)、拉克氏海莱蒙梭菌(Lachnoclostridium[Clostridium]hylemonae)、欧尔森氏菌属的种(Olsenella sp.)、发酵氨基酸球菌(Acidaminococcus fermentans)、泰门氨基酸球菌(Acidaminococcus timonensis)、产琥珀酸厌氧螺菌(Anaerobiospirillum succiniciproducens)、印度巨球型菌(Megasphaera indica)、埃氏巨球形菌(Megasphaera elsdenii)、巨球型菌属的种(Megasphaera sp.)、鸡双歧杆菌(Bifidobacterium gallinarum)、小鸡双歧杆菌(Bifidobacterium pullorum)、世纪双歧杆菌(Bifidobacterium saeculare)、纤细双歧杆菌(Bifidobacterium subtile)、红蝽菌科的种(Coriobacteriaceae sp.)、双歧杆菌属的种(Bifidobacterium sp.)、光冈氏链状杆菌(Catenibacterium mitsuokai)、马赛德兰库尔特菌(Drancourtella massiliense)、肠道塞利单胞菌(Sellimonas intestinalis)、瘤胃球菌属的种(Ruminococcus sp.)、毛螺旋菌属的种(Lachnospiraceae sp.)、多尔氏菌属的种(Dorea sp.)、生产布劳特氏菌(Blautia producta)、红蝽菌属的种
(Coriobacteriaceae sp.)、柯林斯氏菌属(Collinsella sp.)、双形霍尔德曼氏菌(Holdemanella biforme)、马赛艰难杆菌(Mogibacterium massiliense)、庞大厌氧杆菌(Anaerostipes hadrus)、厌氧杆菌属的种(Anaerostipes sp.)、活泼布劳特氏菌(Blautia gnavus)、粪便/肠道柯林斯氏菌(Collinsella stercoris/intestinalis)、双歧杆菌属的...
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