【技术实现步骤摘要】
山羊绒蛋白标记方法及其差异表达蛋白的肽段序列
[0001]本专利技术属于纤维鉴别
,具体涉及一种山羊绒蛋白标记方法及其差异表达蛋白的肽段序列。
技术介绍
[0002]蛋白质组学(Proteomics)是研究蛋白质的结构、功能、组成、表达及其活动规律的一门科学。包括蛋白的定性及定量、蛋白的结构与功能、蛋白翻译后修饰等内容。定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量的一门科学。它可用于筛选和寻找任何因素下所引起的样本之间的差异表达蛋白,定量蛋白质组学可分为标记定量组学和非标记定量组学两种。非标记定量即Label
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free定量,通常用于分析大规模蛋白的鉴定和定量,不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号就可得到样品间蛋白表达量的差异。常见方法有IDA(information dependent acquisition)和SWATH(sequential windowed acquisition ofall theoretical fragment ions)。SWATH是较为新颖的一种非标记高通量蛋白定量技术。目前为止,SWATH技术允许完整和永久地记录生物样本中肽前体中所有可检测的碎片离子。在一次进样分析中可以同时得到一个较高质量的定量结果和蛋白质组学样品中每个肽段的数据。这种采集模式将以25Dalton为一个系列区间进行扫描,在扫描范围内通过高速度的 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种山羊绒蛋白标记方法,包括:提取绒山羊的绒和毛的蛋白质,测定总蛋白浓度;总蛋白的酶解,记录酶解情况及其蛋白含量,采用高效液相色谱二级质谱方法分析肽段组成和含量;将SWATH质谱获取的肽段数据作为非目标数据,IDA模式的无标记定量方法获取的肽段数据作为目标数据;测定差异表达蛋白含量,利用差异表达蛋白含量进行绒和毛的鉴别。2.如权利要求1所述的山羊绒蛋白标记方法,其特征在于,在液相色谱串联质谱技术系统上,采用IDA模式的无标记定量方法和SWATH所有碎片离子的顺序窗口采集;依据Transition峰面积计算出肽段含量,通过肽段含量得出绒和毛中蛋白质的含量。3.如权利要求1所述的山羊绒蛋白标记方法,其特征在于,以差异表达基因分析来筛选差异表达蛋白。4.如权利要求1所述的山羊绒蛋白标记方法,其特征在于,差异表达蛋白的肽段序列为:MSRHFSSRSGYRCGGGGGGFSSGSAGVVSYQRRSTSSSVRRSGGGGGRFSGGVCGGGAGGGFGSRSLINLGGSKSISISVAGGGGRGGFGGGYGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGFGGGGFGGGGFGGGGFPVCPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKIKSQEREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQINTSTRTYSLEPFFEAYISNLRRNVDQLKSDRSRLDSELKNMQDLVEDYRSKYEDEINKRTNAENEFVGIKKDVDAAYITKVDLQAKFDNLLQEIDFFKTLFQAELSQMQTHISDTNVILSMDNNRNLDLNSIIDEVKNQYEEIAQRSKAEAEALYQTKYEELQITAGQHGDSLKNTKMEISELNRVIQRLRSEIDSVKKQISSLQQAISDAEQRGENAIKDAQNKLNELEDALQKAKEDMARLLRDYQELMNTKLALDVEIATYRTLLEGEESRMSGECVPNVSVSVSTSHTSISGGGGRGGGGFSSGGGGYSSGGGGGYGSGGGGGYGSGGGSSYGSRGGGSYGSGGGSSGSRRGGSGGGGGGSGGSFSSSGGRASSTKTSGGSSSVKFVSTSYSRGTR。5.如权利要求4所述的山羊绒蛋白标记方法,其特征在于,用来对羊绒羊毛进行鉴别的差异表达蛋白的肽段包括:FSGGVCGGGAGGGFGSR、QSLLQPLNVEIDPEIQK、SLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQINTSTRTYSLEPFFEAYISNLR、NMQDLVEDYR、TNAENEFVGIKKDVDAAYITK、FDNLLQEIDFFKTLFQAELSQMQTHISDTNVILSMD...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘志红,王志新,张崇妍,谢遇春,秦箐,
申请(专利权)人:内蒙古农业大学,
类型:发明
国别省市:
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