一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质技术方案

本发明专利技术属于生物医学影像处理技术领域，涉及一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质，包括以下步骤：S1将读入的免疫组化病理切片图片由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间；S2通过预设阈值，从HSI色彩空间的图片中筛选出发生阳性病变组织；S3将HSI色彩空间的图片进行图像预处理与特征识别处理，并根据阳性病变组织计算阳性部分像素面积和平均荧光强度；S4输出阳性部分像素面积和平均荧光强度，并据此进行免疫组化病理分析。其改变了传统方式由临床医生进行肉眼计数与判断荧光强度的方法，同时减少了人眼判断的误差，极大的提高了诊断的准确率与可信度。了诊断的准确率与可信度。了诊断的准确率与可信度。

【技术实现步骤摘要】
一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质


[0001]本专利技术涉及一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质，属于生物医学影像处理


技术介绍

[0002]免疫组化全称是免疫组织化学检查，其定义为：抗原与抗体特异性结合，通过化学反应使标记抗体的显色剂显色，从而确定组织细胞内的抗原(多肽和蛋白质)，并对其进行定位、定性和定量分析。在常规的肿瘤病理诊断中，有一部分病例单靠基本的Hematoxylin
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Eosin染色(苏木精
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伊红染色)很难判断患者的病情，特别是在低分化或未分化的肿瘤鉴别时。为使得诊断准确，需要对病人进行免疫组化检查。免疫组化病理检查具有以下作用：1、恶性肿瘤的诊断与鉴别诊断；2、确定转移性恶性肿瘤的原发部位；3、对某类肿瘤进行进一步的病理分型；4、软组织肿瘤的治疗一般需根据正确的组织学分类，因其种类多、组织形态相像，有时难以区分其组织来源，应用多种标志进行免疫组化研究对软组织肿瘤的诊断是不可缺少的；5、发现微小转移灶，有助于临床治疗方案的确定，包括手术范围的确定；6、为临床治疗方案的选择提供参考。
[0003]免疫组化医学影像需要统计待检标志物阳性表达细胞的个数以及染色的荧光强度，但是传统的检测方法需要通过有经验的医生对免疫组化医学影像进行肉眼计算，判断影像的平均荧光强度。这种方法不仅耗时耗力，而且计数精度不高，计数的准确性依赖于医生的经验，且主观判断荧光强度存在一定的误差。因此亟需研发一种标准化的免疫组化方法。

技术实现思路

[0004]针对上述问题，本专利技术的目的是提供一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质，其改变了传统方式由临床医生进行肉眼计数与判断荧光强度的方法，同时减少了人眼判断的误差，极大的提高了诊断的准确率与可信度。
[0005]为实现上述目的，本专利技术采取以下技术方案：一种免疫组化病理切片图片处理方法，包括以下步骤：S1将读入的免疫组化病理切片图片由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间；S2通过预设阈值，从HSI色彩空间的图片中筛选出发生阳性病变组织；S3将HSI色彩空间的图片进行图像预处理与特征识别，并根据阳性病变组织计算阳性部分像素面积和平均荧光强度；S4输出阳性部分像素面积和平均荧光强度。
[0006]进一步，步骤S1中由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间的转化公式为：
[0007][0008][0009][0010][0011]其中，H是图片的色调，S是图片的饱和度，I是图片的亮度，R、G、B分别为图片的红色值、绿色值和蓝色值，θ是围绕用于表征HSI色彩空间的六棱锥的角度。
[0012]进一步，步骤S2中发生阳性病变组织的筛选公式如下：
[0013][0014]进一步，步骤S3中图像预处理与特征识别处理的公式如下：
[0015][0016]其中，f(x，y)是图片中的像素坐标。
[0017]进一步，在图像预处理与特征识别处理后，判断f(x，y)＝1的像素点的亮度是否大于阈值α，如是则f(x，y)＝1，反之f(x，y)＝0。
[0018]进一步，步骤S3中计算阳性部分像素面积和平均荧光强度的方法为：令初始阳性部分像素面积和阳性部分总的强度为零，若f(x，y)＝1，则阳性部分像素面积加1，阳性部分总的强度加当前阳性部分的对应强度，遍历图片像素矩阵后，获得整个图片的阳性部分像素面积和阳性部分总的强度，将阳性部分总的强度除以整个图片的阳性部分像素面积获得平均荧光强度。
[0019]进一步，步骤S4中输出阳性部分像素面积和平均荧光强度的方法为：将整个图片的阳性部分像素面积与平均荧光强度进行显示，通过将阳性部分像素面积与临床指标阳性细胞面积占据整个切片图片的比例进行对比。
[0020]本专利技术还公开了一种免疫组化病理切片图片处理系统，包括：色彩空间转化模块，用于将读入的免疫组化病理切片图片由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间；阳性部分筛选模块，用于通过预设阈值，从HSI色彩空间的图片中筛选出发生阳性病变组织；数据处理模块，用于将HSI色彩空间的图片进行图像预处理与特征识别处理，并根据阳性病变组织计算阳性部分像素面积和平均荧光强度；显示模块，用于输出阳性部分像素面积和平均荧光强度。
[0021]进一步，数据处理模块中计算阳性部分像素面积和平均荧光强度的方法为：令初始阳性部分像素面积和阳性部分总的强度为零，若f(x，y)＝1，则阳性部分像素面积加1，阳性部分总的强度加当前阳性部分的对应强度，遍历图片像素矩阵后，获得整个图片的阳性部分像素面积和阳性部分总的强度，将阳性部分总的强度除以整个图片的阳性部分像素面积获得平均荧光强度。
[0022]本专利技术还公开了一种计算机可读存储介质，计算机可读存储介质上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行以实现上述任一项的免疫组化病理切片图片处理方法。
[0023]本专利技术由于采取以上技术方案，其具有以下优点：
[0024]1、本专利技术改变了传统方式由临床医生进行肉眼计数与判断荧光强度的方法，同时减少了人眼判断的误差，极大的提高了诊断的准确率与可信度。
[0025]2、本专利技术采用HSI色彩空间，避免了在计算计算面积时，红棕色(阳性)部分夹杂着蓝色色素导致的阴性部分面积变大的问题，使结果更加准确。
[0026]3、本专利技术通过图像预处理与特征识别处理，使阳性部分和阴性部分的界限更加明显，图片更加清晰直观，并通过设置亮度值的阈值α去除杂质干扰，使得结果更加可靠准确。
附图说明
[0027]图1是本专利技术一实施例中免疫组化病理切片图片处理方法的流程图；
[0028]图2是本专利技术一实施例中RGB色彩空间与HSI色彩空间的示意图，图2(a)是RGB色彩空间的示意图，图2(b)是HSI色彩空间的示意图，；
[0029]图3是本专利技术一实施例中的小鼠肺癌免疫组化切片图；
[0030]图4是本专利技术一实施例中设置阈值筛选阳性病变组织后的肺癌图片。
具体实施方式
[0031]为了使本领域技术人员更好的理解本专利技术的技术方向，通过具体实施例对本专利技术进行详细的描绘。然而应当理解，具体实施方式的提供仅为了更好地理解本专利技术，它们不应该理解成对本专利技术的限制。在本专利技术的描述中，需要理解的是，所用到的术语仅仅是用于描述的目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性。
[0032]本专利技术涉及一种免疫组化病理切片图片处理方法、系统与可读介质，其通过对免疫组化病理切片图片的不同病变组织进行采样；根据采样信息的阈值获得活性组织部分；对获得活性组织部分的图片进行图像预处理与特征识别处理；对图像预处理与特征识别处理后的图片进行数据处理，将处理结果进行显示，并进行免疫组化分析。其改变了传统方式由临床医生进行肉眼计数与判断荧光强度的方法，同时减少了人眼判断的误差，极大的提高了诊断的准确率与可信度。下面通过两个实施例对本专利技术的技术方案进行详细说明。
[0033]实施例一
[003本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，包括以下步骤：S1将读入的免疫组化病理切片图片由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间；S2通过预设阈值，从所述HSI色彩空间的图片中筛选出发生阳性病变组织；S3将所述HSI色彩空间的图片进行图像预处理与特征识别处理，并根据所述阳性病变组织计算阳性部分像素面积和平均荧光强度；S4输出所述阳性部分像素面积和平均荧光强度。2.如权利要求1所述的免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，所述步骤S1中由RGB色彩空间转化到HSI色彩空间的转化公式为：RGB色彩空间转化到HSI色彩空间的转化公式为：RGB色彩空间转化到HSI色彩空间的转化公式为：RGB色彩空间转化到HSI色彩空间的转化公式为：其中，H是图片的色调，S是图片的饱和度，I是图片的亮度，R、G、B分别为图片的红色值、绿色值和蓝色值，θ是围绕用于表征HSI色彩空间的六棱锥的角度。3.如权利要求2所述的免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，所述步骤S2中发生阳性病变组织的筛选公式如下：4.如权利要求2所述的免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，所述步骤S3中图像预处理与特征识别处理的公式如下：其中，f(x,y)是图片中的像素坐标。5.如权利要求4所述的免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，在所述图像预处理与特征识别处理后，判断f(x,y)＝1的像素点的亮度是否大于阈值α，如是则f(x,y)＝1，反之f(x,y)＝0。6.如权利要求4所述的免疫组化病理切片图片处理方法，其特征在于，所述步骤S3中计算阳性部分像素面积和平均荧光强度的方法为：令初始阳性部分像素面积和阳性部分总的强度为零，若f(x,y)＝1，则阳性部分像素面积加1，阳性部分总...

【专利技术属性】
技术研发人员：周珩，李金，王菊芳，冯秀，杨鹏飞，
申请(专利权)人：中国科学院近代物理研究所，
类型：发明
国别省市：