抗CD33免疫细胞癌症疗法制造技术

技术编号:29598809 阅读:126 留言:0更新日期:2021-08-06 20:02
本文在一些实施例中提供了用于治疗癌症如CD33

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】抗CD33免疫细胞癌症疗法相关申请的交叉引用本申请要求享有2018年11月7日提交的美国临时申请号62/756,718、2018年11月14日提交的美国临时申请号62/767,388、2018年11月14日提交的美国临时申请号62/767,395、2019年3月29日提交的美国临时申请号62/826,643和2019年3月29日提交的美国临时申请号62/826,648的提交日期的权益。将每个先前申请的全部内容通过引用并入本文。
技术介绍
嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法使用经基因修饰的T细胞来更特异性和有效地靶向和杀伤癌细胞。从血液中收集T细胞后,对细胞进行工程化,使其表面上包含CAR。可以使用CRISPR/Cas9基因编辑技术将CAR引入T细胞。将这些同种异体CART细胞注射入患者体内时,受体使T细胞能够杀伤癌细胞。
技术实现思路
急性髓细胞性白血病(AML)是一种由髓系祖细胞中积累的突变引起的血液肿瘤,可造成过度增殖和分化受阻,从而导致髓系母细胞在造血组织中积累。尽管最初对标准诱导化疗的反应很高,但大多数AML患者的复发较常见且预后较差(Talati和Sweet,2018)。近年来,很少有用于AML的新疗法获得批准。CD33(也称为Siglec3、唾液酸结合Ig样凝集素3、gp67或p67)是治疗AML和其他白血病(例如T细胞白血病)的吸引关注的靶标。它在发病和复发时都在大多数AML母细胞和亚群(免疫表型定义的白血病干细胞)上表达(Haubner等人,2018)。据认为其表达仅限于正常单核细胞、粒细胞、造血祖细胞和免疫表型定义的造血干细胞群体中的一些细胞(Haubner等人,2018)。小鼠中CD33的敲除不会导致任何明显的表型(Brikman-VanderLinden等人,2003)。此外,该抗CD33抗体-药物缀合物吉妥单抗(gemtuzumabozogmicin,GO)被批准用于AML人类患者中使用,并且具有可接受的安全性。但是,GO仅显示了总体存活率的适度提高(Talati和Sweet,2018)。靶向具有更强有效载荷的表达CD33的细胞(如抗CD33CAR-T细胞)相对于GO可能在AML中证明更高的疗效。此外,抗CD33CAR-T细胞代表了对其他表达CD33的恶性肿瘤的有效治疗选择。本披露内容的一些方面提供了工程化T细胞,该工程化T细胞包含编码嵌合抗原受体(CAR)的核酸,其中该CAR包含特异性结合CD33的胞外结构域。在一些实施例中,工程化T细胞包含被破坏的T细胞受体α链恒定区(TRAC)基因。例如,可以通过插入编码CAR的核酸来破坏TRAC基因。在一些实施例中,工程化T细胞包含被破坏的β-2-微球蛋白(β2M)基因。在一些实施例中,该工程化T细胞进一步包含被破坏的CD33基因。在一些实施例中,工程化T细胞包含被破坏的TRAC基因、被破坏的β2M基因、被破坏的CD33基因和编码包含抗CD33抗原结合片段的CAR的核酸。在一些实施例中,工程化T细胞包含被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR(该CAR包含抗CD33抗原结合片段)的核酸、被破坏的β2M基因和被破坏的CD33基因。在一些实施例中,该CAR包含(a)包含抗CD33抗原结合片段的胞外结构域,(b)CD8跨膜结构域,和(c)包含41BB共刺激结构域和CD3z共刺激结构域的胞内结构域。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含SEQIDNO:104所示的氨基酸序列;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实例中,此类工程化T细胞包含野生型CD33基因。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含SEQIDNO:104所示的氨基酸序列;(ii)被破坏的β2M基因;以及被破坏的CD33基因。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,其中该核酸序列与SEQIDNO:56至少90%相同并且编码SEQIDNO:104的CAR;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,其中该核酸序列与SEQIDNO:56至少90%相同并且编码SEQIDNO:104的CAR;(ii)被破坏的β2M基因;以及(iii)被破坏的CD33基因。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含SEQIDNO:55的核酸序列;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实施例中,该工程化T细胞包含野生型CD33。在一些实施例中,该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含SEQIDNO:55的核酸序列;(ii)被破坏的β2M基因;以及(iii)被破坏的CD33基因。在一些实施例中,本披露提供了包含工程化T细胞的细胞群体,其中该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含(a)包含抗CD33抗原结合片段的胞外结构域,(b)CD8跨膜结构域,和(c)包含41BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的胞内结构域;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实例中,该工程化T细胞包含野生型CD33。在一些实施例中,本披露提供了包含工程化T细胞的细胞群体,其中该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含(a)包含抗CD33抗原结合片段的胞外结构域,(b)CD8跨膜结构域,和(c)包含41BB共刺激结构域和CD3ζ信号传导结构域的胞内结构域;(ii)被破坏的β2M基因;以及(iii)被破坏的CD33基因。在一些实施例中,本披露提供了包含工程化T细胞的细胞群体,其中该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含SEQIDNO:104所示的氨基酸序列;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实例中,该工程化T细胞包含野生型CD33。在一些实施例中,本披露提供了包含工程化T细胞的细胞群体,其中该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,所述CAR包含SEQIDNO:104所示的氨基酸序列;(ii)被破坏的β2M基因;以及(iii)被破坏的CD33基因。在一些实施例中,本披露提供了包含工程化T细胞的细胞群体,其中该工程化T细胞包含:(i)被破坏的TRAC基因,其中该被破坏的TRAC基因包含编码CAR的核酸,其中该核酸序列与SEQIDNO:56至少90%相同并且编码SEQIDNO:104的CAR;以及(ii)被破坏的β2M基因。在一些实例中,该工程化T细胞包含本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种工程化T细胞,该工程化T细胞包含编码嵌合抗原受体(CAR)的核酸,其中该CAR包含特异性结合CD33的胞外结构域。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20181107 US 62/756,718;20181114 US 62/767,395;20181.一种工程化T细胞,该工程化T细胞包含编码嵌合抗原受体(CAR)的核酸,其中该CAR包含特异性结合CD33的胞外结构域。


2.如权利要求1所述的工程化T细胞,该工程化T细胞进一步包含被破坏的T细胞受体α链恒定区(TRAC)基因。


3.如权利要求2所述的工程化T细胞,其中将编码该CAR的核酸插入该TRAC基因中。


4.如权利要求1-3中任一项所述的工程化T细胞,该工程化T细胞进一步包含被破坏的β-2-微球蛋白(β2M)基因。


5.如权利要求1-4中任一项所述的工程化T细胞,其中该CAR的胞外结构域包含抗CD33抗体。


6.如权利要求5所述的工程化T细胞,其中该抗CD33抗体是抗CD33单链可变片段(scFv)。


7.如权利要求6所述的工程化T细胞,其中该抗CD33scFv包含与参考抗体相同的重链可变结构域(VH)互补决定区(CDR)和相同的轻链可变结构域(VL)CDR,其中该参考抗体包含:
(i)SEQIDNO:65所示的VH和SEQIDNO:66所示的VL,
(ii)SEQIDNO:77所示的VH和SEQIDNO:78所示的VL,或
(iii)SEQIDNO:89所示的VH和SEQIDNO:90所示的VL。


8.如权利要求7所述的工程化T细胞,其中该抗CD33scFv包含与该参考抗体相同的VH和VL链。


9.如权利要求7所述的工程化T细胞,其中该抗CD33scFv包含SEQIDNO:73、75、85、87、97或99中任一项的氨基酸序列。


10.如权利要求1-9中任一项所述的工程化T细胞,其中该CAR进一步包含CD28共刺激结构域或41BB共刺激结构域。


11.如权利要求10所述的工程化T细胞,其中该CAR进一步包含CD3ζ细胞质信号传导结构域。


12.如权利要求3-11中任一项所述的工程化T细胞,其中该TRAC基因包含SEQIDNO:49、51、53、55、57、59、61、63、109、112、115或118中任一项的核苷酸序列,和/或其中该CAR由SEQIDNO:50、52、54、56、58、60、62、64、110、113、116或119中任一项的核苷酸序列编码。


13.如权利要求4-12中任一项所述的工程化T细胞,其中该被破坏的β2M基因包含至少一个选自SEQIDNO:9-14中任一项的核苷酸序列。


14.如权利要求1-13中任一项所述的工程化T细胞,其中这些T细胞包含野生型CD33基因。


15.如权利要求1-13中任一项所述的工程化T细胞,其中这些T细胞进一步包含被破坏的CD33基因。


16.如权利要求15所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因包含AGTTCATGGTACTGGTTCC(SEQIDNO:187)、AGTTCATGGTTCC(SEQIDNO:188)、AGTTCATGTACTGGTTCC(SEQIDNO:189)、AGTTCATGGTTTACTGGTTCC(SEQIDNO:190)、AGTTCC、AGTACTGGTTCC(SEQIDNO:191)、AGTTCATACTGGTTCC(SEQIDNO:192)、AGTTCATGGTATACTGGTTCC(SEQIDNO:193)和/或AGTTACTGGTTCC(SEQIDNO:194)的核苷酸序列。


17.如权利要求15或16所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因缺少包含AGTTCATGGTTACTGGTTCC(SEQIDNO:186)的片段。


18.如权利要求15所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因包含AAATCCTGGCACT(SEQIDNO:300)、AAATCCCTGGCACT(SEQIDNO:301)、AAATCCTCATTCCCTGGCACT(SEQIDNO:302)、AAATCCTCACCCTGGCACT(SEQIDNO:304)、AAATCCTCCCCTGGCACT(SEQIDNO:305)、AAATCCTCCCTGGCACT(SEQIDNO:306)、AAATCCCCTGGCACT(SEQIDNO:307)、ACATCCTCATTCCCTGGCACT(SEQIDNO:308)、ACATCCTGGCACT(SEQIDNO:309)、AAATCCTCTCCCTGGCACT(SEQIDNO:310)、AAATCCTCATCTGGCACT(SEQIDNO:311)、AAATCCT、AAACCCTGGCACT(SEQIDNO:312)、AAATCCTCTGGCACT(SEQIDNO:313)、AAATCCCCCTGGCACT(SEQIDNO:314)、AAATCCTCACT(SEQIDNO:315)、ACATCCCTGGCACT(SEQIDNO:316)和/或AAAT的核苷酸序列。


19.如权利要求18所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因缺少包含AAATCCTCATCCCTGGCACT(SEQIDNO:299)的片段。


20.如权利要求18或19所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因缺少以下片段,该片段的3’区段包含AAATCCTCAT(SEQIDNO:317)、AAATCCTCATCCCT(SEQIDNO:318)、AAATCCTCATCCCTGG(SEQIDNO:320)、AAATCCTCATC(SEQIDNO:322)或AAATCCTCATCCCTGGCA(SEQIDNO:324)的核苷酸序列。


21.如权利要求18-20中任一项所述的工程化T细胞,其中该被破坏的CD33基因缺少以下片段,该片段的5’区段包含CTCATCCCTGGCACT(SEQIDNO:323)的核苷酸序列。


22.一个包含如权利要求1-21中任一项所述的工程化T细胞的工程化T细胞群体,其中该群体的至少25%或至少50%的工程化T细胞表达该CAR。


23.如权利要求22所述的群体,其中该群体的至少70%的工程化T细胞表达该CAR。


24.如权利要求22所述的群体,其中该群体的至少25%的工程化T细胞在至少7天或至少14天的体外增殖后表达该CAR。


25.如权利要求22-24中任一项所述的群体,其中该群体的至少50%的工程化T细胞不表达可检测水平的T细胞受体(TCR)蛋白。


26.如权利要求25所述的群体,其中该群体的至少90%的工程化T细胞不表达可检测水平的TCR蛋白。


27.如权利要求22-26中任一项所述的群体,其中该群体的至少50%的工程化T细胞不表达可检测水平的β2M蛋白。


28.如权利要求27所述的群体,其中该群体的至少70%的工程化T细胞不表达可检测水平的β2M蛋白。


29.如权利要求22-28中任一项所述的群体,其中该群体的至少20%的工程化T细胞不表达可检测水平的CD33蛋白。


30.如权利要求29所述的群体,其中该群体的至少50%的工程化T细胞不表达可检测水平的CD33蛋白。


31.如权利要求22-30中任一项所述的群体,其中当与表达CD33的癌细胞群体在体外共培养时,该群体的工程化T细胞诱导该群体的至少10%、至少25%或至少50%的癌细胞的细胞裂解。


32.如权利要求31所述的群体,其中当与表达CD33的癌细胞群体在体外共培养时,该群体的工程化T细胞诱导该癌细胞群体的至少70%、至少80%或至少90%的细胞裂解。


33.如权利要求31或32所述的群体,其中当与癌细胞群体在体外共培养时,该群体的工程化T细胞分泌IFNγ。


34.如权利要求31-33中任一项所述的群体,其中工程化T细胞与癌细胞的比率为1:1至2:1。


35.如权利要求31-34中任一项所述的群体,其中这些癌细胞包括白血病细胞。


36.如权利要求31-34中任一项所述的群体,其中这些癌细胞包括急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)和慢性髓细胞性白血病(CML)。


37.一种方法,该方法包括向受试者施用如权利要求22-36中任一项所述的工程化T细胞群体。


38.如权利要求37所述的方法,其中该受试者是人类受试者。


39.如权利要求37或38所述的方法,其中所述受试者患有癌症。


40.如权利要求39所述的方法,其中该癌症是白血病,任选地是急性淋巴母细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)和慢性髓细胞性白血病(CML)。


41.如权利要求39或40所述的方法,其中该癌症包括表达CD33的癌细胞。


42.如权利要求39-41中任一项所述的方法,其中向受试者施用该工程化T细胞群体导致癌性肿瘤体积相对于基线对照的减小。

【专利技术属性】
技术研发人员:JA特雷特J萨格特D卡雷齐迪斯
申请(专利权)人:克里斯珀医疗股份公司
类型:发明
国别省市:瑞士;CH

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