一种大豆高油分相关的分子标记和鉴定高油分大豆的方法技术

本发明专利技术提供了一种大豆高油分相关的分子标记和鉴定高油分大豆的方法，属于生物技术领域。为了快速和准确的筛选高油分优质大豆品种。本发明专利技术提供了一种大豆高油分相关的分子标记，本发明专利技术提供了大豆高油分相关的分子标记SNP1、SNP2、SNP3、SNP4和SNP5，它们对应的核苷酸位点分别为Gm02_45782543、Gm05_34698561、Gm05_40120889、Gm06_38700895和Gm06_38795846。通过对标记的选择来实现对性状的选择，大幅度提高育种效率，实现定向改良大豆品种的作用即可以选择出高蛋白的大豆品种。

【技术实现步骤摘要】
一种大豆高油分相关的分子标记和鉴定高油分大豆的方法
本专利技术属于生物
，具体涉及一种大豆高油分相关的分子标记和鉴定高油分大豆的方法。
技术介绍
大豆有着丰富的营养成分，油分在20％左右。大豆蛋白质中含有8种人体必需氨基酸，人们可以通过食用大豆用以补充所需的营养物质，并且可以预防人体的心血管疾病，大豆同时是重要的油料作物，可以被加工为食用油，可以满足人们的饮食需求，同时主要由五种脂肪酸组成，而脂肪酸可以预防心脏病、癌症等。随着人们的生活水平日益提高，越来越多的人更多的注重于食用健康与食物的营养价值，因此对大豆的需求很大，但我国的大豆更多的是依赖于从其他国家进口，所以我国急需提高大豆油分含量及培育高蛋白、高油大豆品种，满足人们的日常所需。大豆子粒的油分是品质相关性状，是比较复杂的数量性状，受到多个基因控制，一直以来受到遗传特性和育种方法的限制，传统方法过于缓慢，随着科技的不断进步，分子辅助选择被提出，在传统杂交育种方法的基础上利用分子标记与决定目标性状的基因紧密连锁，通过对标记的选择来实现对性状的选择，大幅度提高育种效率，实现定向改良大豆品种的作用即可以选择出高油分的大豆品种。
技术实现思路
本专利技术的目的是为了快速和准确的筛选高油分优质大豆品种，本专利技术提供了一种大豆高油分相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP1，所述SNP1的序列为大豆2号染色体上45.78Mb-46.05Mb位置的的核苷酸序列，且Gm02号染色体的第45782543核苷酸位点为A或T；扩增所述SNP1的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.25或如SEQIDNO.26所示，扩增所述SNP1的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.27所示。本专利技术提供了一种大豆高油分相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP2，所述SNP2的序列为大豆5号染色体上3.79Mb-40.12Mb位置的的核苷酸序列，且Gm05号染色体的第34698561核苷酸位点为A或G；扩增所述的SNP2的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.31或如SEQIDNO.32所示，扩增所述的SNP2的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.33所示。在一种实施方式中，所述SNP2的序列上第40120889核苷酸碱基位点为T和C；扩增所述的SNP2的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.40或如SEQIDNO.41所示，扩所述的SNP2的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.42所示。本专利技术还提供了一种大豆高油分相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列为SNP3，所述SNP3的序列为大豆6号染色体上6.67Mb-38.79Mb位置的的核苷酸序列，且Gm6号染色体的第38700895核苷酸位点为C或G；扩增所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.46或如SEQIDNO.47所示，扩增所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.48所示。在一种实施方式中，所述SNP3的序列上第38795846核苷酸碱基位点为T和G；扩增SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.49或如SEQIDNO.50所示，扩增所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.51所示。本专利技术还提供了一种鉴定高油分含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：(1)提取待检测大豆的DNA；(2)利用SEQIDNO.25或SEQIDNO.26和SEQIDNO.27进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为TT基因型则待检测品种的大豆为高油分含量的大豆，若为GG基因型则待检测品种的大豆为低油分含量的大豆。本专利技术还提供了一种鉴定高油分含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：(1)提取待检测大豆的DNA；(2)利用SEQIDNO.31或SEQIDNO.32和SEQIDNO.33进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为GG基因型则待检测品种的大豆为高油分含量的大豆，若为AA基因型则待检测品种的大豆为低油分含量的大豆。本专利技术还提供了一种鉴定高油分含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：(1)提取待检测大豆的DNA；(2)利用SEQIDNO.40或SEQIDNO.41和SEQIDNO.42进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为TT基因型则待检测品种的大豆为高油分含量的大豆，若为CC基因型为低油分含量的大豆。本专利技术还提供了一种鉴定高油分含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：(1)提取待检测大豆的DNA；(2)利用SEQIDNO.46或SEQIDNO.47和SEQIDNO.48进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为GG基因型则待检测品种的大豆为高油分含量的大豆，若为CC基因型为低油分含量的大豆。本专利技术还提供了一种鉴定高油分含量大豆的方法，所述方法的具体步骤为：(1)提取待检测大豆的DNA；(2)利用SEQIDNO.49或SEQIDNO.50和SEQIDNO.51进行PCR反应，检测待检测品种的大豆为GG基因型则待检测品种的大豆为高油分含量的大豆，若为TT基因型为低油分含量的大豆。有益效果：本研究利用643份经过全基因组重测序的资源群体结合其2年3次重复的大豆子粒贮藏物质的表型数据，利用分层评价的方法筛选出与油分极显著相关的SNP位点，采用SNP分子标记技术中的KASP在162份大豆非测序极端油分资源材料中进行验证，根据其分型结果及其表型数据，开发出与油分相关的分子标记，用以在生产中提前筛选高油分优质品种提供一种高速准确的方法。附图说明图1为2018、2019年资源测序材料油分含量及BLUP分布直方图，其中，图A为2018年油分含量分布直方图，B是2019年油分含量分布直方图，C是2年油分BLUP分布直方图，横坐标是组别，纵坐标是频率；图2为20条染色体上SNP位点数目分布，其中，横坐标是染色体，纵坐标是SNP个数；图3为20条染色体上与油分相关的SNP位点数目分布，其中，横坐标是染色体，纵坐标是SNP个数；图4为与油分相关的SNP位点突变基因组对应等位基因与参考基因组对应表型效应值差值，其中，横坐标是组别，纵坐标是表型效应之差值；图5为与油分相关SNP位点的高油分优异单倍型与低油分单倍型表型均值，其中，横坐标是组别，纵坐标是蛋白质含量；图6为SNP标记在162份个大豆极端油分资源材料中的KASP基因分型。具体实施例大豆油分含量的MQTL记载在文献Qietal.2018Meta-analysisandtranscriptomeprofilingrevealhubgenesforsoybeanseedstoragecompositionduringseeddevelopment。实施例1.实验群体：选取643份东北地区大豆核心种质测序资源作为实验群体，于2018、2019年在吉林省农科院及东北农业大学向阳农场试验田中种植且3本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种大豆高油分相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为SNP1，所述SNP1的序列为大豆2号染色体上45.78Mb-46.05Mb位置的的核苷酸序列，且Gm02号染色体的第45782543核苷酸位点为A或T；/n扩增所述SNP1的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.25或如SEQ ID NO.26所示，扩增所述SNP1的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示。/n

【技术特征摘要】
1.一种大豆高油分相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为SNP1，所述SNP1的序列为大豆2号染色体上45.78Mb-46.05Mb位置的的核苷酸序列，且Gm02号染色体的第45782543核苷酸位点为A或T；
扩增所述SNP1的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.25或如SEQIDNO.26所示，扩增所述SNP1的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.27所示。


2.一种大豆高油分相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为SNP2，所述SNP2的序列为大豆5号染色体上3.79Mb-40.12Mb位置的的核苷酸序列，且Gm05号染色体的第34698561核苷酸位点为A或G；
扩增所述的SNP2的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.31或如SEQIDNO.32所示，扩增所述的SNP2的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.33所示。


3.根据权利要求2所述的分子标记，其特征在于，所述SNP2的序列上第40120889核苷酸碱基位点为T和C；
扩增所述的SNP2的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.40或如SEQIDNO.41所示，扩所述的SNP2的下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.42所示。


4.一种大豆高油分相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为SNP3，所述SNP3的序列为大豆6号染色体上6.67Mb-38.79Mb位置的的核苷酸序列，且Gm6号染色体的第38700895核苷酸位点为C或G；
扩增所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.46或如SEQIDNO.47所示，扩增所述的SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.48所示。


5.根据权利要求4所述的分子标记，其特征在于，所述SNP3的序列上第38795846核苷酸碱基位点为T和G；
扩增SNP3的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.49或如SEQIDNO.50所示，扩增所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员：齐照明，张战国，陈庆山，赵莹，朱荣胜，黄仕钰，刘珊珊，刘春燕，辛大伟，王锦辉，
申请(专利权)人：东北农业大学，
类型：发明
国别省市：黑龙江;23