【技术实现步骤摘要】
一种同时扩增人34个STR基因座的引物组、试剂盒及其应用
本专利技术涉及分子遗传学
,尤其涉及一种同时扩增人34个STR基因座的引物组、试剂盒及其应用。
技术介绍
STR(shorttandemrepeats,短串连重复序列)又称微卫星序列,是大量存在于人类基因组DNA中的短串连重复序列,重复单位为2~6个核苷酸。由于具有高度多态性和稳定性,并且与AMP-FLP和VNTR等分型方法相比,STR基因分型方法所扩增的产物长度小得多(小于500bp),因此对于模板质量要求较低,即使降解的DNA模板也可以进行分析。此外,STR分型适用于多种DNA纯化方法所纯化的DNA,而这些纯化方法所获得的DNA量往往不够作Southern印迹分析。鉴于以上这些特点,STR分型技术已经广泛应用于法医身份识别鉴定。法医DNA数据库是集成现代DNA检验技术、信息技术、网络技术和科学管理等要素。法医DNA数据库的核心在于所收录的STR数据信息,一个完善的法医DNA数据库应该包含常染色体STR数据库和Y染色体STR数据库。Y染色体STR数据为案件提供侦查线索,缩小侦查范围,可以预测罪犯可能存在的地区、种族甚至姓氏,常染色体STR数据用于最后罪犯个体的筛查及确认。目前公布的20个常染色体STR核心基因座(20个基因座,包含Amelogenin、CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、FGA、TH01、TPOX、vWA、D2S1338、D ...
【技术保护点】
1.一种同时扩增人34个STR基因座的引物组,所述34个STR基因座包括29个常染色体STR基因座、1个Y染色体STR基因座和4个性别鉴定基因座;所述29个常染色体STR基因座分别为:D3S1358,TH01,D21S11,D18S51,D2S1338,D15S659,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,CSF1PO,Penta E,D6S1043,D22S1045,D19S433,D1S1656,D12S391,D10S1248,D2S441,vWA,D8S1179,TPOX,FGA,D3S3045,D10S1435,D19S253,D6S477,D8S1132和PentaD;所述1个Y染色体STR基因座为:DYS391;所述4个性别鉴定基因座分别为:RS759551978,RS2032678,RS771783753和Amelogenin;/n用于扩增RS759551978的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;/n用于扩增RS2032678的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,下游引 ...
【技术特征摘要】
1.一种同时扩增人34个STR基因座的引物组,所述34个STR基因座包括29个常染色体STR基因座、1个Y染色体STR基因座和4个性别鉴定基因座;所述29个常染色体STR基因座分别为:D3S1358,TH01,D21S11,D18S51,D2S1338,D15S659,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,CSF1PO,PentaE,D6S1043,D22S1045,D19S433,D1S1656,D12S391,D10S1248,D2S441,vWA,D8S1179,TPOX,FGA,D3S3045,D10S1435,D19S253,D6S477,D8S1132和PentaD;所述1个Y染色体STR基因座为:DYS391;所述4个性别鉴定基因座分别为:RS759551978,RS2032678,RS771783753和Amelogenin;
用于扩增RS759551978的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示;
用于扩增RS2032678的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:3所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:4所示;
用于扩增D3S1358的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:5所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:6所示;
用于扩增TH01的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:7所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:8所示;
用于扩增D21S11的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:9所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:10所示;
用于扩增D18S51的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:11所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:12所示;
用于扩增D2S1338的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:13所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:14所示;
用于扩增D15S659的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:15所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:16所示;
用于扩增RS771783753的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:17所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:18所示;
用于扩增Amelogenin的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:19所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:20所示;
用于扩增D5S818的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:21所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:22所示;
用于扩增D13S317的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:23所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:24所示;
用于扩增D7S820的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:25所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:26所示;
用于扩增D16S539的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:27所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:28所示;
用于扩增CSF1PO的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:29所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:30所示;
用于扩增PentaE的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:31所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:32所示;
用于扩增D6S1043的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:33所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:34所示;
用于扩增D22S1045的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:35所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:36所示;
用于扩增D19S433的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:37所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:38所示;
用于扩增D1S1656的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:39所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:40所示;
用于扩增DYS391的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:41所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:42所示;
用于扩增D12S391的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:43所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:44所示;
用于扩增D10S1248的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:45所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:46所示;
用于扩增D2S441的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:47所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:48所示;
用于扩增vWA的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:49所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:50所示;
用于扩增D8S1179的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:51所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:52所示;
用于扩增TPOX的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:53所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:54所示;
用于扩增FGA的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:55所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:56所示;
用于扩增D3S3045的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:57所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:58所示;
用于扩增D10S1435的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:59所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:60所示;
用于扩增D19S253的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:61所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:62所示;
用于扩增D6S477的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:63所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:64所示;
用于扩增D8S1132的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:65所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:66所示;
用于扩增PentaD的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:67所示,下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO:68所示。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述34个STR基因座分为五组,其中,
第一组包括:RS759551978,RS2032678,D3S1358,TH01,D21S11,D18S51,D2S1338和D15S659;
第二组包括:RS771783753,Amelogenin,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,CSF1PO和PentaE;
第三组包括:D6S1043,D22S1045,D19S433,D1S1656,DYS391,D12S391和D10S1248;
第四组包括:D2S441,vWA,D8S1179,TPOX和FGA;
第五组包括:D3S3045,D10S1435,D19S253,D6S477,D8S1132和PentaD;
所述第一组到第五组STR基因座的引物采用的荧光染料彼此不同。
3.一种包括权利要求1或2所述引物组的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应预混液和去离子水。
5.根据权利要求3或4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括分子量内标和等位基因阶梯。
6.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述引物组中,
SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示引物的浓度独立为0.3~0.4μM;
SEQIDNO:3和SEQIDNO:4所示引物的浓度独立为0.12~0.18μM;
SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示引物的浓度独立为0.08~0.13μM;
SEQIDNO:7和SEQIDNO:8所示引物的浓度独立为0.1~0.15μM;
SEQIDNO:9和SEQIDNO:10所示引物的浓度独立为0.2~0.25μM;
SEQIDNO:1...
【专利技术属性】
技术研发人员:冉凌飞,蒿杰,刘甲乾,路瑶,赵亚楠,
申请(专利权)人:百特元生物科技北京有限公司,
类型:发明
国别省市:北京;11
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