子宫内膜息肉甲基化标志物组合、检测试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术首次提出子宫内膜息肉甲基化标志物组合，包括以下基因标志物IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2，通过检测来自受试者的待测样品中基因标志物的甲基化水平，能够有效诊断子宫内膜息肉，特异性达87.27％，灵敏度达91.11％。

【技术实现步骤摘要】
子宫内膜息肉甲基化标志物组合、检测试剂盒及应用
本专利技术涉及医学诊断领域，更具体地，涉及子宫内膜息肉甲基化标志物组合、检测试剂盒及应用。
技术介绍
子宫内膜息肉(endometrialpolyps)是妇科的常见病，是由子宫内膜局部过度增生所致，表现为突出于子宫腔内的单个或多个光滑肿物，蒂长短不一；可引起不规则阴道流血、不孕。从育龄期到绝经后的女性，都是子宫内膜息肉的高发人群。妇女一生中患子宫内膜息肉的概率约70％，在这类患者中，约有15％发生在育龄阶段，育龄阶段的子宫内膜息肉可能导致不孕不育。子宫内膜息肉常用的检查方法是妇科检查、超声检查、宫腔镜检查、病理检查等。根据患者的症状、妇科检查和超声检查，可初步做出诊断。宫腔镜引导下取病变组织做病理检查可确诊。这样的方法需要患者到专业的医疗机构由专业的医生进行检查，这样的时间成本和经济成本较高，而且宫腔镜检查还会造成一定的创伤。血液游离DNA(cell-freeDNA，cfDNA)是人体组织排放到血液里的DNA片段，在健康人体内，血浆中可以发现少量的游离DNA。健康人血浆中的游离DNA主要来源于凋亡细胞。DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，S-腺苷基甲硫氨酸(SAM)为甲基供体，将甲基转移到特定的碱基上的过程。而DNA甲基化与人类发育和疾病有密切关系。
技术实现思路
本专利技术目的在于提供子宫内膜息肉甲基化标志物组合、试剂盒以及其在制备诊断子宫内膜息肉产品中的应用。本专利技术提供下述至少一种技术方案：检测基因标志物甲基化水平的试剂在制备诊断子宫内膜息肉产品中的应用；其中，所述基因标志物包括IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2。可选地，所述试剂包括特异性结合基因标志物的引物和/或探针。可选地，所述引物包括SEQIDNO:1-40所示的核苷酸序列。可选地，所述试剂用于检测来自待测样品的DNA。可选地，所述DNA为cfDNA。可选地，所述DNA经甲基化处理。基因标志物组合，包括IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2，所述基因标志物的甲基化水平用于诊断子宫内膜息肉。检测基因标志物的引物组，包括SEQIDNO:1-40所示的核苷酸序列。诊断子宫内膜息肉试剂盒，包括检测基因标志物的引物组。可选地，还包括甲基化处理试剂和测序建库试剂。本专利技术取得的有益效果：本专利技术首次提出子宫内膜息肉甲基化标志物组合，包括以下基因标志物IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2，通过检测来自受试者的待测样品中基因标志物的甲基化水平，能够有效诊断子宫内膜息肉，特异性达87.27％，灵敏度达91.11％。具体实施方式现将详细地提供本专利技术实施方式的参考，其一个或多个实施方式描述于下文。对本领域技术人员而言，显而易见的是，可以对本专利技术进行多种修改和变化，而不背离本专利技术的范围或精神。例如，作为一个实施方式的部分而说明或描述的特征可以用于另一实施方式中，来产生更进一步的实施方式。在一些实施方式中，本专利技术涉及检测基因标志物甲基化水平的试剂在制备诊断子宫内膜息肉产品中的应用；其中，所述基因标志物包括IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2。在一些实施方式中，每种基因标志物中包含至少1个甲基化CpG位点。甲基化水平的检测方式不作具体限定，例如对包含基因标志物DNA进行甲基化处理分辨DNA样品中甲基化修饰水平。例如重亚硫酸盐法，该方法用重亚硫酸盐处理DNA，未发生甲基化的胞嘧啶经历化学修饰，转变为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶由于甲基的保护作用，不会发生变化；再通过测序或qPCR等方式分析甲基化水平。例如酶法；例如采用TET酶处理，TET酶是生物体内存在的一种α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶，具有将5-mC转化为5-hmC的能力，再经测序分析甲基化水平。此外，还可以采用甲基化敏感性内切酶法、特异性识别甲基化修饰DNA的抗体或蛋白、质谱或色谱等方式。在一些实施方式中，所述试剂包括特异性结合基因标志物的引物和/或探针。利用引物和/或探针可以捕获或检测基因标志物，以实现检测甲基化水平的目的。在一些实施方式中，可将引物或探针制备于承载物上，如固相芯片。在一些实施方式中，所述引物包括SEQIDNO:1-40所示的核苷酸序列。在一些实施方式中，所述试剂用于检测来自待测样品的DNA。样品为受试者离体样品，样品为含DNA的任何样品形式，例如细胞、组织、体液、排泄物等；例如血浆、血清、全血。在一些实施方式中，所述DNA为cfDNA。cfDNA为循环DNA，游离于细胞外的部分降解了的机体内源性DNA。在一些实施方式中，所述DNA经甲基化处理。在一些实施方式中，本专利技术还涉及基因标志物组合，包括GF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2，所述基因标志物的甲基化水平用于诊断子宫内膜息肉。在一些实施方式中，本专利技术还涉及检测任一实施方式所述基因标志物的引物组，包括SEQIDNO:1-40所示的核苷酸序列。在一些实施方式中，本专利技术还涉及诊断子宫内膜息肉试剂盒，包括任一实施方式所述的引物组。在一些实施方式中，所述试剂盒还包括甲基化处理试剂和测序建库试剂。甲基化处理试剂为对DNA样本进行甲基化处理的试剂。在一些实施方式中，甲基化处理试剂包括TET处理试剂、TET2反应终止试剂、DNA变性试剂、胞嘧啶脱氨基试剂。在一些实施方式中，测序建库试剂包括与测序平台适配的测序引物(例如实验方法中的通用引物P5和P7)、反应液(例如实验方法中的MultiplexMix)。在一些实施方式中，所述试剂盒还包括实现基因标志物扩增或捕获的PCR体系，例如反应液(包括dNTPs、盐、聚合酶、缓冲等)。在一些实施方式中，检测基因标志物的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测基因标志物甲基化水平的试剂在制备诊断子宫内膜息肉产品中的应用；其中，所述基因标志物包括IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2。/n

【技术特征摘要】
1.检测基因标志物甲基化水平的试剂在制备诊断子宫内膜息肉产品中的应用；其中，所述基因标志物包括IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂包括特异性结合基因标志物的引物和/或探针。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述引物包括SEQIDNO:1-40所示的核苷酸序列。


4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂用于检测来自待测样品的DNA。


5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘斌，夏渝东，陆美茵，郑子鹏，李晓红，沈俊芳，
申请(专利权)人：深圳市宝安区妇幼保健院，广州迈森致远基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44