本发明专利技术提供了奥沙利铂个体化用药基因的指导方法及试剂盒，具体的本发明专利技术考虑不同癌症患者用药疗效的差异性，筛选出与奥沙利铂个体化用药相关基因的SNP位点的组合，利用核酸质谱仪对奥沙利铂相关的遗传学标识进行广泛(高通量检测位点、高通量检测样本)筛查和检验。通过本发明专利技术的方法检出成功率高、技术重现性好、性价比高，可实现单个小样本多基因的检测，满足小样本最大化使用；本发明专利技术的方法具有高准确性、高灵敏性的技术优势，检测结果稳定，提高了检测阳性率。检测阳性率。
【技术实现步骤摘要】
奥沙利铂个体化用药基因的指导方法及试剂盒
[0001]本专利技术属于生物
，具体地说，本专利技术涉及一种用于奥沙利铂个体化用药基因的指导方法及试剂盒。
技术介绍
[0002]奥沙利铂(乐沙定)是第3代铂类抗癌药，在早期、晚期大肠癌的治疗中，表现出优越的治疗效果和良好的安全性。除了大肠癌，奥沙利铂也广泛用于胃癌、卵巢癌等恶性肿瘤的化疗。但在其副作用中，周围神经病是剂量限制性毒性之一。这会影响约50％至70％的患者。另外和其他化疗药物一样，同一种药物在不同患者身上的效果差异巨大。因此，研究奥沙利铂在临床用药中用药指导方法以及确认其使用安全性具有重要的意义。
[0003]单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNPs)是一种遗传标记，是指基因组水平上由于单核苷酸的变异，而引起的DNA序列的多态性。在人群中的发生频率大于1％，包括单碱基的转换、颠倒以及单碱基的插入或缺失等形式表现，是一种新的遗传标志，可以为疾病的预测、诊断、治疗以及新型药物的研制提供可靠的有效的科学根据。
[0004]SNP发生在编码区，能够影响蛋白功能，从而影响人体健康或药物代谢，主要表现在疾病易感性方面的个体差异、同一药物治疗疗效的个体差异、同一药物的不良反应的个体差异。药物遗传学或药物基因组学方法对于解决药物疗效的个体差异非常重要，尤其是在精密医学时代。
[0005]结直肠癌(colorectal cancer，CRC)是全世界第四大常见癌症。据统计，2015年全球结直肠癌患者人数为165万例，而引起死亡人数达到83.5万例。最重要的是，30％结直肠患者出现同步转移，而50
‑
60％患者发生化疗后转移。虽然药物治疗显著提高了患者的总体生存，但是肿瘤耐药仍然是治疗失败的常见原因。对奥沙利铂的耐药性可通过多种途径介导如细胞摄取减少、DNA加合物形成受损、DNA修复基因(比如ERCC1和XRCC1)改变、凋亡缺陷及转运蛋白(如ATP7A和ATP7B)表达修饰。已有研究表明，核苷酸切除修复(NER)途径基因中的遗传变异可能会改变基因组完整性和基于奥沙利铂的化疗在结直肠癌中的疗效。参考基因检测的结果，医生可以在开处方时，在药品选择、剂量控制及联合用药等方面提出适合每个患者自己的个体化用药方案，最终达到提高药物疗效、降低药物毒，让患者走出用药盲区，用准药，用好药，把握最佳治疗时期。目前临床尚未有十分有效的奥沙利铂用药指导方法，因此亟需建立一种高灵敏，经济，简单的分子技术筛查方法，填补国内空白。
技术实现思路
[0006]本专利技术的目的在于提供一种奥沙利铂个体化用药基因的指导方法及试剂盒。
[0007]本专利技术的第一方面，提供了一种奥沙利铂个体化用药基因的指导试剂盒，所述试剂盒包括PCR扩增引物对组，所述PCR扩增引物对组包括特异性扩增选自下组的SNP位点的引物对：rs3783819、rs1043953、rs3917412、rs1801133、rs2567608、rs2278107、rs11615、rs5030740和rs13181。
[0008]在另一优选例中，所述试剂盒基于多重PCR飞行时间质谱检测奥沙利铂个体化用药基因SNP基因突变位点。
[0009]在另一优选例中，所述试剂盒还包括单碱基延伸引物组。
[0010]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs3783819的引物对如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2所示。
[0011]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs1043953的引物对如SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4所示。
[0012]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs3917412的引物对如SEQ ID NO.5至SEQ ID NO.6所示。
[0013]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs1801133的引物对如SEQ ID NO.7至SEQ ID NO.8所示。
[0014]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs2567608的引物对如SEQ ID NO.9至SEQ ID NO.10所示。
[0015]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs2278107的引物对如SEQ ID NO.11至SEQ ID NO.12所示。
[0016]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs11615的引物对如SEQ ID NO.13至SEQ ID NO.14所示。
[0017]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs5030740的引物对如SEQ ID NO.15至SEQ ID NO.16所示。
[0018]在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs13181的引物对如SEQ ID NO.17至SEQ ID NO.18所示。
[0019]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs3783819的延伸引物如SEQ ID NO.19所示。
[0020]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs1043953的延伸引物如SEQ ID NO.20所示。
[0021]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs3917412的延伸引物如SEQ ID NO.21所示。
[0022]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs1801133的延伸引物如SEQ ID NO.22所示。
[0023]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs2567608的延伸引物如SEQ ID NO.23所示。
[0024]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs2278107的延伸引物如SEQ ID NO.24所示。
[0025]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs11615的延伸引物如SEQ ID NO.25所示。
[0026]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs5030740的延伸引物如SEQ ID NO.26所示。
[0027]在另一优选例中，所述单碱基延伸引物组中，针对rs13181的延伸引物如SEQ ID NO.27所示。
[0028]在另一优选例中，所述试剂盒包括第一容器，所述第一容器内含有所述PCR扩增引物对组。
[0029]在另一优选例中，所述试剂盒包括第二容器，所述第二容器内含有所述单碱基延伸引物组。
[0030]在另一优选例中，所述试剂盒包括第三容器，所述第三容器内含有PCR预混液，所述PCR预混液主要包括热启动Taq酶、dNTPs、MgCl2、PCR缓冲液。
[0031]在另一优选例中，所述试剂盒包括第四容器，所述第四容器内含有虾碱性磷酸酶(SAP Enzyme)。
[0032]在另一优选例中，所述试剂盒包括第五容器，所述第五容器内含有SAP缓冲液。
[0033]在另本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种奥沙利铂个体化用药基因的指导试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括PCR扩增引物对组，所述PCR扩增引物对组包括特异性扩增选自下组的SNP位点的引物对：rs3783819、rs1043953、rs3917412、rs1801133、rs2567608、rs2278107、rs11615、rs5030740和rs13181。2.如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括单碱基延伸引物组。3.如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述PCR扩增引物对组中：特异性扩增rs3783819的引物对如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2所示；特异性扩增rs1043953的引物对如SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4所示；特异性扩增rs3917412的引物对如SEQ ID NO.5至SEQ ID NO.6所示；特异性扩增rs1801133的引物对如SEQ ID NO.7至SEQ ID NO.8所示；特异性扩增rs2567608的引物对如SEQ ID NO.9至SEQ ID NO.10所示；特异性扩增rs2278107的引物对如SEQ ID NO.11至SEQ ID NO.12所示；特异性扩增rs11615的引物对如SEQ ID NO.13至SEQ ID NO.14所示；特异性扩增rs5030740的引物对如SEQ ID NO.15至SEQ ID NO.16所示；和/或特异性扩增rs13181的引物对如SEQ ID NO.17至SEQ ID NO.18所示。4.如权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述单碱基延伸引物组中：针对rs3783819的延伸引物如SEQ ID NO.19所示；针对rs1043953的延伸引物如SEQ ID NO.20所示；针对rs3917412的延伸引物如SEQ ID NO.21所示；针对rs1801133的延伸引物如SEQ ID NO.22所示；针对rs2567608的延伸引物如SEQ ID NO.23所示；针对rs2278107的延伸...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈涛，张静，代新，林金飞，
申请(专利权)人：广东南芯医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。