B*07限制肽和肽组合的抗癌免疫治疗和相关方法技术

本发明专利技术涉及用于免疫治疗方法的肽、蛋白质、核酸和细胞。特别是，本发明专利技术涉及癌症的免疫疗法。本发明专利技术还涉及单独使用或与其他肿瘤相关肽(刺激抗肿瘤免疫反应或体外刺激T细胞和转入患者的疫苗复合物的活性药物成分)联合使用的肿瘤相关T细胞(CTL)肽表位。与主要组织相容性复合体(MHC)分子结合的肽或与此同类的肽也可能是抗体、可溶性T细胞受体和其他结合分子的靶标。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】B*07限制肽和肽组合的抗癌免疫治疗和相关方法本专利技术涉及用于免疫治疗方法的肽、蛋白质、核酸和细胞。特别是，本专利技术涉及癌症的免疫疗法。本专利技术还涉及单独使用或与其他肿瘤相关肽(刺激抗肿瘤免疫反应或体外刺激T细胞和转入患者的疫苗复合物的活性药物成分)联合使用的肿瘤相关T细胞(CTL)肽表位。与主要组织相容性复合体(MHC)分子结合的肽或与此同类的肽也可能是抗体、可溶性T细胞受体和其他结合分子的靶标。本专利技术涉及数种新型肽序列及其变体，它们源自人肿瘤细胞的HLA-I类分子，可用于引发抗肿瘤免疫反应的疫苗组合物中或作为开发药物/免疫活性化合物和细胞的目标。专利技术背景根据世界卫生组织(WHO)的数据，癌症是2012年全球范围内四大非传染性致命疾病之一。同年，结直肠癌、乳腺癌和呼吸道癌症在高收入国家被列为前10位死亡原因内。2012年，估计全球有1410万新增癌症病例、3260万癌症患者(5年之内确诊)和820万癌症死亡病例(Brayetal.,2013；Ferlayetal.,2013)。在脑癌、白血病和肺癌群组内，本专利技术特别分别着重于胶质母细胞瘤(GBM)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)和急性髓性白血病(AML)、非小细胞和小细胞肺癌(NSCLC和SCLC)。GBM是在美国最常见的中枢神经系统恶性肿瘤，年龄调整发病率为每10万居民3.19人。GBM预后极差，1年生存率为35％，5年生存率低于5％。男性性别、较大年龄和种族似乎是GBM的危险因子(Thakkaretal.,2014)。CLL是西方世界最常见的白血病，大约占全部白血病病例的三分之一。美国和欧洲的发病率相似，估计每年新增病例约有16,000名。CLL在白种人中比在非裔人口中更常见，在西班牙裔和美国原住民中较少见，在亚裔人口中很少见。在亚裔人口中，CLL的发生率比白种人低3倍(Gunawardanaetal.,2008)。CLL患者的五年总生存率约为79％。AML在成人和儿童中皆为第二常被诊断的白血病类型。在美国，估计的新增病例每年约21,000例。AML患者的五年生存率约为25％。肺癌是全世界最常见的癌症类型，在很多国家是癌症死亡的首要原因。肺癌分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌。NSCLC包括组织学类型腺癌、鳞状细胞癌、大细胞癌，在美国，约占所有肺癌病例的85％。NSCLC的发生与吸烟史密切相关，包括目前和之前吸烟者，据报告，五年生存率为15％(Molinaetal.,2008；WorldCancerReport,2014)。考虑到与治疗癌症相关的严重副作用和费用，有必要识别可用于治疗一般癌症的因子，尤其是治疗急性髓性白血病、乳腺癌、胆管细胞癌、慢性淋巴细胞白血病、结直肠癌、胆囊癌、胶质母细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、黑色素瘤、非霍奇金淋巴瘤、肺癌(包括非小细胞肺癌腺癌、鳞状细胞非小细胞肺癌、小细胞肺癌)、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、膀胱癌、子宫和子宫内膜癌。还需要确定代表一般癌症，尤其是急性髓性白血病、乳腺癌、胆管细胞癌、慢性淋巴细胞白血病、结直肠癌、胆囊癌、胶质母细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、黑色素瘤、非霍奇金淋巴瘤、肺癌(包括非小细胞肺癌腺癌、鳞状细胞非小细胞肺癌、小细胞肺癌)、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、膀胱癌、子宫和子宫内膜癌生物标志物的因素，从而可以更好地诊断癌症、评估预后、预测治疗成功率。癌症免疫治疗代表了癌症细胞特异性靶向作用的一个选项，同时最大限度地减少副作用。癌症免疫疗法利用存在的肿瘤相关抗原。肿瘤相关抗原(TAA)的目前分类主要包括以下几组：a)癌-睾丸抗原：T细胞能够识别的最先确认的TAA属于这一类抗原，由于其成员表达于组织学相异的人肿瘤中、正常组织中、仅在睾丸的精母细胞/精原细胞中、偶尔在胎盘中，因此，它最初被称为癌-睾丸(CT)抗原。由于睾丸细胞不表达HLAI类和II类分子，所以，在正常组织中，这些抗原不能被T细胞识别，因此在免疫学上可考虑为具有肿瘤特异性。CT抗原大家熟知的例子是MAGE家族成员和NY-ESO-1。b)分化抗原：肿瘤和正常组织(肿瘤源自该组织)都含有TAA。大多数已知的分化抗原发现于黑色素瘤和正常黑色素细胞中。许多此类黑色素细胞谱系相关蛋白参与黑色素的生物合成，因此这些蛋白不具有肿瘤特异性，但是仍然被广泛用于癌症的免疫治疗。例子包括，但不仅限于，黑色素瘤的酪氨酸酶和Melan-A/MART-1或前列腺癌的PSA。c)过量表达的TAA：在组织学相异的肿瘤中以及许多正常组织中都检测到了基因编码被广泛表达的TAA，一般表达水平较低。有可能许多由正常组织加工和潜在提呈的表位低于T细胞识别的阈值水平，而它们在肿瘤细胞中的过量表达能够透过打破先前确立的耐受性而引发抗癌反应。这类TAA的典型例子为Her-2/neu、生存素、端粒酶或WT1。d)肿瘤特异性抗原：这些独特的TAA产生于正常基因(如β-catenin、CDK4等)的突变。这些分子变化中有一些与致瘤性转化和/或进展相关。肿瘤特异性抗原一般可在不对正常组织带来自体免疫反应风险的情况下诱导很强的免疫反应。另一方面，这些TAA在多数情况下只与其上确认了有TAA的确切肿瘤相关，并且通常在许多个体肿瘤之间并不都共用TAA。在含有肿瘤特定(相关)同种型蛋白的情况下，如果肽源自肿瘤(相关)外显子也可能出现肽肿瘤特异性(或相关性)。e)由异常翻译后修饰产生的TAA：此类TAA可能由肿瘤中既不具有特异性也不过量表达的蛋白产生，但其仍然具有肿瘤相关性(该相关性由主要对肿瘤具有活性的翻译后加工所致)。此类TAA产生于变糖基化模式的改变，导致肿瘤产生针对MUC1的新型表位或在降解过程中导致诸如蛋白拼接的事件，这可能具有也可能不具有肿瘤特异性。f)肿瘤病毒蛋白：这些TTA是病毒蛋白，可在致癌过程中发挥关键作用，并且由于它们是外源蛋白(非人源蛋白)，所以能够激发T细胞反应。这类蛋白的例子有人乳头状瘤16型病毒蛋白、E6和E7，它们在宫颈癌中表达。基于T细胞的免疫治疗靶向作用于主要组织相容性复合体(MHC)分子提呈的来源于肿瘤相关蛋白或肿瘤特异性蛋白的肽表位。肿瘤特异性T淋巴细胞所识别的抗原，即其表位，可以是源自所有蛋白类型的分子，如酶、受体、转录因子等，它们在相应肿瘤的细胞中被表达，并且与同源未变的细胞相比，其表达通常上调。MHC分子有两类：MHCI类和MHCII类。MHCI类分子由一条α重链和β-2-微球蛋白，MHCII类分子由一条α和一条β链组成。其三位构造形成一个结合槽，用于与肽进行非共价相互作用。大部分有核细胞上都可发现MHC-I类分子。他们提呈主要为内源性的蛋白、缺陷核糖体产物(DRIP)和较大肽裂解生成的肽。然而，源自内体结构或外源性来源的肽也经常在MHC-I类分子上发现。这种I-类分子非经典提呈方式在文献中被称为交叉提呈(BrossartandBevan,1997；Rocketal.,1990)。MHCII类分子主要发现于专业抗原提呈本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种肽，其包括选自SEQ ID No.1至SEQ ID No.383和SEQ ID No.448至SEQ IDNo.499组成群组的一个氨基酸序列、以及与SEQ ID No.1至SEQ ID No.383和SEQ IDNo.448至SEQ ID No.499具有至少88％同源性的其变体序列、其中所述变体与主要组织相容性复合体(MHC)结合和/或诱导与该变体肽发生T细胞交叉反应，及其一种药用盐，其中所述肽的长度最长16个氨基酸。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180731 DE 102018118550.2;20180810 DE 102018119551.一种肽，其包括选自SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499组成群组的一个氨基酸序列、以及与SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499具有至少88％同源性的其变体序列、其中所述变体与主要组织相容性复合体(MHC)结合和/或诱导与该变体肽发生T细胞交叉反应，及其一种药用盐，其中所述肽的长度最长16个氨基酸。


2.根据权利要求1中所述的肽，其中所述肽有能力与MHC-I或-II类分子结合，其中所述肽与MHC结合时能够被CD4和/或CD8T细胞识别。


3.根据权利要求1或2中所述的肽或其变体，其中氨基酸序列包括任意SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499的一个连续的氨基酸延伸区。


4.根据权利要求1至3任一项中所述的肽或其变体，其中所述肽或其变体的总长度为8至16个氨基酸、最优选为该肽该肽系由或基本系由根据任一SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499的氨基酸序列组成。


5.根据权利要求1至4任一项中所述的肽或其变体，其中所述肽被修饰和/或包含非肽键。


6.根据权利要求1至5任一项所述的肽或其变体，其中所述肽为融合蛋白的一部分，尤其包含HLA-DR抗原相关不变链(Ii)的N-端氨基酸。


7.一种抗体，特别是可溶性或膜结合性抗体，优选为单克隆抗体或其片段，其特异性地识别根据权利要求1至5任一项所述的肽或其变体，与MHC分子结合时优选为根据权利要求1至5中任一项所述的肽或变体。


8.一种T细胞受体，优选为可溶性或膜结合性受体或其片段，其与HLA配体反应，其中所述配体是根据权利要求1至5任一项所述的肽或其变体，与MHC分子结合时优选为根据权利要求1至5中任一项所述的肽或变体。


9.根据权利要求8所述的T细胞受体，其中所述配体氨基酸序列与SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499中任一个至少88％相同，或其中所述配体氨基酸序列包括SEQIDNo.1至SEQIDNo.383和SEQIDNo.448至SEQIDNo.499任何之一。


10.根据权利要求8或9中任何一项所述的T细胞受体，其中所述T细胞受体作为可溶性分子提供并任选具有进一步的效应子功能，如免疫刺激结构域或毒素。


11.一种适体，其特异性地识别根据权利要求1至5中的肽或其变体，优选为根据权利要求1至5中任一项所述的、与MHC分子结合的肽或变体。


12.一种核酸，其编码根据权利要求1至5中任一项所述的肽或其变体，根据权利要求7所述的抗体或其片段，根据权利要求8或9所述的T细胞受体或其片段，任选连接到异源启动子序列或表达所述核酸的表达载体。


13.一种重组宿主细胞，其包含根据权利要求1至6中任一项所述的肽，根据权利要求7所述的抗体或其片段，根据权利要求8或9所述的T细胞受体或其片段，或根据权利要求12所述的核酸或表达载体，其中所述宿主细胞优选为选自抗原提呈细胞，例如树突细胞、T细胞或NK细胞。


14.一种体外制备启动的T淋巴细胞的方法，该方法包括将T细胞与载有抗原的人I或II类MHC分子进行体外连接，这些分子在合适的抗原提呈细胞表面或人工类比的抗原提呈细胞结构表面上表达足够的一段时间从而以抗原特异性方式启动T细胞，其中所述抗原为权利要求1至4任一项中所述的肽。


15.根据权利要求14中所述的方法制成的启动T淋巴细胞，其有选择性地识别一种细胞，该细胞提呈含权利要求1至4任一项中给定氨基酸序列的多肽。


16.一种药物组合物，其包括至少一种活性成分，该成分选自根据权利要求1至6任一项中所述的肽、根据权利要求7中所述的抗体或其片段、根据权利要求8或9中所述的T细胞受体或其片段、根据权利要求11中所述的适体、根据权利要求12中所述的核酸或表达载体、根据权利要求13中所述的宿主细胞或根据权利要求15中所述的活化T淋巴细胞，或共轭或标记的活性成分以及一种药用载体和任选的药用赋形剂和/或稳定剂。


17.一种用于制备根据权利要求1至6任一项中所述的肽或其变体、根据权利要求7所述的抗体或其片段或根据权利要求8或9所述的T细胞受体或其片段的方法，所述方法包括培养根据权利要求13所述的宿主细胞以及从所述宿主细胞和/或其培养基中分离出所述肽或其变体、所述抗体或其片段或所述T细胞受体或其片段。


18.根据权利要求1至6任一项中所述的肽、根据权利要求7中所述的抗体或其片段、根据权利要求8或9中所述的T细胞受体或其片段、根据权利要求11中所述的适体、根据权利要求12中所述的核酸或表达载体、根据权利要求13中所述的宿主细胞或根据权利要求15中所述的活化T淋巴细胞在药物中的用途。


19.一种杀灭患者体内靶向细胞的方法，其中靶向细胞提呈一种多肽，该多肽...

【专利技术属性】
技术研发人员：H·舒斯特，D·瓦勒夫斯基，O·朔尔，J·弗里奇，T·温申克，H·辛格，G·希姆马克，M·厄默，
申请(专利权)人：伊玛提克斯生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：德国;DE