流动池和测序试剂盒制造技术

本申请涉及流动池和测序试剂盒。在一个示例中，流动池包括基底、定位于基底上的电极和定位于电极上的图案化材料。在该示例中，图案化材料包括由间隙区域分隔的凹陷部，并且电极的官能化表面在凹陷部中的每一个处被暴露。在该示例中，流动池还包括在凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面的引物。在另一个示例中，流动池包括基底和定位于基底上的图案化电极。在该其他示例中，图案化电极包括由间隙区域分隔的凹陷部，以及在凹陷部中的每一个处被暴露的基底的官能化表面。在该其他示例中，引物在凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面。凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面。凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面。

【技术实现步骤摘要】
流动池和测序试剂盒
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2018年12月17日提交的美国临时申请序列号 62/780,602的权益，该美国临时申请的内容通过引用以其整体并入本文。


[0003]本申请总体上涉及流动池和测序试剂盒。

技术介绍

[0004]生物或化学研究中的各种方案涉及在局部支撑表面上或在预先界定的反应室内进行大量受控反应。然后可以观察或检测指定的反应，并且随后的分析可以帮助识别或揭示参与反应的化学物质的性质。例如，在一些多重测定中，具有可识别标记物(例如荧光标记物)的未知分析物可以在受控条件下暴露于数以千计的已知的探针。每个已知的探针可以沉积到微孔板(microplate)的对应孔中。观察在孔中的已知的探针和未知分析物之间发生的任何化学反应可以帮助识别或揭示分析物的性质。这类方案的其他示例包括已知的DNA测序方法，例如合成测序(SBS)或循环阵列测序 (cyclic-array sequencing)。利用多核苷酸测序技术，分析可以帮助识别或揭示参与反应的多核苷酸的性质。

技术实现思路

[0005]本文公开的第一方面是第一流动池(flow cell)，第一流动池包括基底；电极，该电极定位于基底上；图案化材料，该图案化材料定位于电极上，该图案化材料包括由间隙区域分隔的凹陷部；电极的官能化表面(functionalized surface)，该官能化表面在凹陷部中的每一个处被暴露；和引物(primer)，该引物在凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面。
[0006]在第一方面的示例中，电极包括金，并且官能化表面包括硫醇接头 (thiol linker)或胺接头；或者电极包括氧化铟锡，并且官能化表面包括硅烷接头。
[0007]在第一方面的示例中，电极是透明的；基底是透明的；并且流动池还包括与基底接触的检测装置，检测装置包括与凹陷部中的每一个可操作地相关联的相应的光电二极管以及电连接到相应的光电二极管的装置电路。
[0008]应当理解，本文公开的第一流动池的任何特征可以以任何合意的方式和/或配置组合在一起。
[0009]本文公开的第二方面是测序试剂盒，该测序试剂盒包括如在第一方面中所定义的流动池和待引入流动池中的被标记的核苷酸，每个被标记的核苷酸包括具有3
’
OH封闭基团的核苷酸、附接到核苷酸的碱基或糖的连接分子和附接到连接分子的电化学发光标记物(electrochemiluminescentlabel)。
[0010]在第二方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区
别的发射光谱。
[0011]在第二方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的氧化电势或还原电势。
[0012]在第二方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射寿命。
[0013]在第二方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射强度。
[0014]应当理解，此测序试剂盒的任何特征可以以任何合意的方式组合在一起。此外，应当理解，此测序试剂盒和/或流动池的特征的任何组合可以一起使用，和/或与本文公开的任何示例组合。
[0015]本文公开的第三方面是另一种流动池，该流动池包括基底；图案化电极，该图案化电极定位于基底上，该图案化电极包括由间隙区域分隔的凹陷部；基底的官能化表面，该官能化表面在凹陷部中的每一个处被暴露；以及引物，该引物在凹陷部中的每一个中被接枝到官能化表面。
[0016]在第三方面的示例中，基底的官能化表面包括附接到硅烷基团的聚合物层，该硅烷基团附接到基底。
[0017]在第三方面的示例中，基底的官能化表面包括附接到基底的羟基基团。
[0018]在第三方面的示例中，基底是透明的；并且流动池还包括与基底接触的检测装置，检测装置包括与凹陷部中的每一个可操作地相关联的相应的光电二极管和电连接到相应的光电二极管的装置电路。
[0019]应当理解，此流动池的任何特征可以以任何合意的方式组合在一起。此外，应当理解，此流动池和/或测序试剂盒和/或其他流动池的特征的任何组合可以一起使用，和/或与本文公开的任何示例组合。
[0020]本文公开的第四方面是测序试剂盒，测序试剂盒包括如在第三方面中所定义的流动池和待引入流动池中的被标记的核苷酸，每个被标记的核苷酸包括具有3
’
OH封闭基团的核苷酸、附接到核苷酸的碱基或糖的连接分子和附接到连接分子的电化学发光标记物。
[0021]在第四方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的发射光谱。
[0022]在第四方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的氧化电势或还原电势。
[0023]在第四方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射寿命。
[0024]在第四方面的示例中，被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并
且其中至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射强度。
[0025]应当理解，此测序试剂盒的任何特征可以以任何合意的方式组合在一起。此外，应当理解，此测序试剂盒和/或流动池和/或其他测序试剂盒中任一个的特征的任何组合可以一起使用，和/或与本文公开的任何示例组合。
[0026]本文公开的第五方面是一种方法，该方法包括：将包含聚合酶和核苷酸的流体引入流动池，该流动池包括部分地界定凹陷部的电极，该凹陷部包括附接在凹陷部中的模板多核苷酸链，其中核苷酸中的至少一些是被标记的核苷酸，至少一些被标记的核苷酸中的每一个包括具有3
’
OH封闭基团的核苷酸、附接到核苷酸的碱基或糖的连接分子和附接到连接分子的电化学发光标记物，在其中核苷酸中的一个并入到与模板多核苷酸链互补的新生链中；向电极施加电势；以及检测响应于所施加的电势的光学发射。
[0027]在第五方面的示例中，核苷酸中的并入的一个核苷酸是被标记的核苷酸中的一个，并且其中电势的施加引发氧化还原反应路径，氧化还原反应路径涉及被标记的核苷酸中的并入的一个被标记的核苷酸的电化学发光标记物。在一个示例中，流体包括至少三种不同的被标本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种流动池，包括：基底；电极，所述电极定位于所述基底上；图案化材料，所述图案化材料定位于所述电极上，所述图案化材料包括由间隙区域分隔的凹陷部；所述电极的官能化表面，所述官能化表面在所述凹陷部中的每一个处被暴露；以及引物，所述引物在所述凹陷部中的每一个中被接枝到所述官能化表面。2.如权利要求1所述的流动池，其中：所述电极包括金，并且所述官能化表面包括硫醇接头或胺接头；或者所述电极包括氧化铟锡，并且所述官能化表面包括硅烷接头。3.如权利要求1所述的流动池，其中：所述电极是透明的；所述基底是透明的；并且所述流动池还包括：与所述基底接触的检测装置，所述检测装置包括：与所述凹陷部中的每一个可操作地相关联的相应的光电二极管；以及电连接到所述相应的光电二极管的装置电路。4.一种测序试剂盒，包括：如权利要求1所述的流动池；以及待引入所述流动池中的被标记的核苷酸，每个被标记的核苷酸包括：具有3
’
OH封闭基团的核苷酸；附接到所述核苷酸的碱基或糖的连接分子；以及附接到所述连接分子的电化学发光标记物。5.如权利要求4所述的测序试剂盒，其中所述被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中所述至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的发射光谱。6.如权利要求4所述的测序试剂盒，其中所述被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中所述至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的氧化电势或还原电势。7.如权利要求4所述的测序试剂盒，其中所述被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中所述至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射寿命。8.如权利要求4所述的测序试剂盒，其中所述被标记的核苷酸包括至少三种不同的被标记的核苷酸，并且其中所述至少三种不同的被标记的核苷酸中的每一种的相应的电化学发光标记物具有有区别的电化学发光发射强度。9.一种流动池，包括：基底；...

【专利技术属性】
技术研发人员：海登，
申请(专利权)人：伊鲁米那股份有限公司，
类型：新型
国别省市：