本发明专利技术涉及一种核酸适配体，尤其涉及一种具有靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7，核酸序列如SEQ.NO.1所示。以及所述的核酸适配体H7在制备鳗弧菌抑制剂中的应用。本发明专利技术以鳗弧菌为靶标，选取Cell
【技术实现步骤摘要】
一种具有靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7及其应用
[0001]本专利技术涉及一种核酸适配体，尤其涉及一种具有靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7及其应用。
技术介绍
[0002]前言
[0003]鳗弧菌是水产养殖中最为常见的条件致病菌之一，其引起的水产养殖动物疾病在全球范围内流行，可感染50多种海淡水生物包括虹鳟、鳗鲡、香鱼、鲈鱼、鳕鱼、大菱鲆、牙鲆、黄鱼等。目前随着水产养殖向高密度、集约化发展的同时，养殖动物感染弧菌病数量也日益增加，给水产养殖业带来巨大的经济损失。由于鳗弧菌对水产养殖造成的严重危害，主要使用大量抗生素来防治弧菌，这不仅导致细菌耐药性产生，还给水产品质量安全带来巨大风险和隐患。
[0004]核酸适配体是通过指数富集配体系统进化技术(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)从体外人工合成筛选得到的一种单链寡核苷酸序列包括ssDNA和RNA。它具有亲和特异性高、易于修饰，稳定性高、无免疫原性及毒副作用等特点，已在生命科学研究、靶点鉴定、生物医学、环境监测等多个领域受到广泛关注。随着科学技术水平的提高，核酸适配体作为治疗试剂方面的研究也越来越广泛。1992年Bock LC等人分离了凝血级的蛋白酶凝血酶单链DNA适配体，适配体能在体外抑制凝血酶催化的纤维蛋白-血栓形成。2006年Ng EW等人对适配体Pegaptanib进行临床实验，证明了其在治疗与年龄相关的黄斑变性脉络膜新生血管方面是有效的。这是第一个被批准用于人类的适配体治疗药物。2020年Shuhao Zhu等人发现适配体BT200在体外对人的血管性血友病因子有良好的抑制作用，并能预防非人灵长类动物的动脉阻塞。因此，研究适配体作为抑制剂是一个很有前途的发展，具有潜在的广泛的治疗益处。
技术实现思路
[0005]本专利技术要解决的技术问题，在于提供一种具有靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7及其应用。
[0006]本专利技术是这样实现的：
[0007]本专利技术首先提供了一种靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7，其核酸序列如SEQ.NO.1所示。
[0008]本专利技术还提供了所述核酸适配体H7在制备鳗弧菌抑制剂中的应用。
[0009]优选地，所述核酸适配体H10在抑制剂中的浓度为1μM。
[0010]具体应用时，将核酸适配体H7在95℃水浴变性5min,然后转于冰上放置10min；取1μM核酸适配体H7100μL/孔与200μL/孔OD 0.1的鳗弧菌菌液混合培养。
[0011]进一步地，采用LB液体培养基将鳗弧菌菌液稀释至OD 0.1。
[0012]进一步地，所述核酸适配体H7使用时用1
×
TE缓冲液配制稀释。
[0013]进一步地，所述培养，在光照培养箱中28℃培养72h。
[0014]本专利技术具有如下优点：本专利技术以鳗弧菌为靶标，选取Cell-SELEX技术筛选出的适配体(H7)对其进行抗菌功能进行分析。具有筛选周期短、化学合成简便、能替代抗生素等作用，具有较好的应用前景。为进一步开展抑制性适配体的研究提供理论基础。
附图说明
[0015]下面参照附图结合实施例对本专利技术作进一步的说明。
[0016]图1为鳗弧菌菌膜随时间变化关系图。
[0017]图2为不同适配体的抑菌率。
[0018]图3为其它种类适配体的抑菌率。
[0019]图4为不同浓度适配体的抑菌率。
具体实施方式
[0020]1核酸适配体的SELEX筛选
[0021](1)菌的处理：取培养好的鳗弧菌于离心管中，6000r/min离心5min，弃上清，洗涤菌3次后再加无菌培养液混合均匀，测菌液OD值，然后取含菌量约为4
×
108个的鳗弧菌菌液，6000r/min下离心5min，弃上清，0.9％生理盐水洗涤菌沉淀3次，1
×
结合缓冲液洗涤菌沉淀1次，最后加入100μL的2
×
结合缓冲液重悬。
[0022](2)结合：取ssDNA随机文库，用2
×
结合缓冲液稀释到3μmol/L 100μL，在95℃恒温金属浴中变性5min后冰浴10min，然后加入到前面的菌悬液中，混匀后在30℃，100r/min的摇床中结合2h。
[0023](3)洗涤：结合完成后，6000r/min离心5min，弃上清，含有菌及其结合ssDNA的菌沉淀，用200μL1
×
结合缓冲液洗涤1次。
[0024](4)分离：用100μL1
×
结合缓冲液溶液重悬菌沉淀，95℃加热5min，使ssDNA变性，从而与菌分离，冷却后在15000r/min离心10min，取上清液，则可分离到与目标菌结合的ssDNA，该ssDNA即为获得的筛选产物，将该筛选产物用PCR管分装成每管20μL，放于-20℃保存备用。
[0025](5)扩增：采用不对称PCR扩增来获取下一级ssDNA文库。
[0026](6)电泳检测：将制好的琼脂糖凝胶放置于电泳槽中，加入1
×
TAE电泳缓冲溶液使琼脂糖凝胶完全被覆盖。取2μL的Marker参考，取5μL的不对称PCR产物与2μL的上样缓冲液混合均匀后加入孔中，在电压为90V、45min的条件下进行电泳。最后进行观察和拍照。
[0027](7)重复筛选：如果电泳检测后显示PCR产物中有条带，表明PCR效果可以，则可将该轮PCR产物用作下一轮SELEX筛选的文库，重复上述(1)到(6)的筛选过程。筛选得到的适配体进行抑菌性能的验证。
[0028]2抑菌性能的验证
[0029]2.1材料
[0030]2.1.1核酸适配体
[0031]核酸适配体序列如表1(两端带下划线的是和引物结合的固定序列)。
[0032]上述适配体由生工生物工程股份有限公司合成。合成的冻干粉产物，用1
×
TE缓冲
液配制成浓度为10μmol/L的贮存液，于-20℃冰箱保存备用。
[0033]表1鳗弧菌适配体的序列
[0034][0035]2.1.2实验用菌
[0036]鳗弧菌(Vibrioanguillarum)由集美大学病害实验室鉴定并提供。
[0037]2.1.3培养基和试剂
[0038]LB固体培养基：取胰蛋白胨5g，酵母提取物2.5g，NaCl5g，琼脂粉7.5g。加超纯水溶解，用HCl或NaOH调pH至7.0，总体积至500mL，经121℃灭菌45min后备用。
[0039]20
×
结合缓冲液：取NaCl5.844g、KCl3.725g、Tris-HCl6.06g、MgCl2
·
6H2O 2.033g。加超纯水溶解，用HCl或NaOH调pH至7.0定容至100mL。稀释为2
×
和1
×...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种靶向抑制鳗弧菌的核酸适配体H7，其特征在于：核酸序列如SEQ.NO.1所示。2.如权利要求1所述的核酸适配体H7在制备鳗弧菌抑制剂中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述核酸适配体H7在抑制剂中的浓度为1μM。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：将核酸适配体H7在95
°
C水浴中变性5min,然后转于冰上放置10min;取1μM 核酸适配体H7 1...
【专利技术属性】
技术研发人员：郑江，林筱钧，江兴龙，鄢庆枇，
申请(专利权)人：集美大学，
类型：发明
国别省市：
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