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一种抑郁症患者预后药效评估系统及其评估方法技术方案

技术编号:26261318 阅读:29 留言:0更新日期:2020-11-06 17:58
本发明专利技术公开了一种抑郁症患者预后药效评估系统及其评估方法,包括以下步骤:收集和整理数据,构建原始数据集;对原始数据集进行数据预处理得到实验数据集;对实验数据集进行数据挖掘,筛选差异特征,建立输入数据集;将输入据集按照一定比例划分为训练数据集和测试数据集;创建抑郁症患者预后药效评估的深度学习模型,利用训练数据集对创建的深度学习模型进行训练;利用测试数据集对训练好的深度学习模型进行性能评估,并在评估过程中对模型进行不断优化,得到最优模型。本发明专利技术基于患者治疗前特征进行药效预测,辅助指导医护人员做出精准治疗,提高治疗效果。

【技术实现步骤摘要】
一种抑郁症患者预后药效评估系统及其评估方法
本专利技术属于数据识别领域,特别涉及一种抑郁症患者预后药效评估系统及其评估方法。
技术介绍
个体对具体治疗方式的应答效果不同,若能提前预测患者对治疗方式的应答,则可根据预测结果有目标的选择最佳治疗方案,避免盲目的试验治疗并达到节省医疗费用、提高治愈率的效果。在预测抗抑郁药物治疗效果方面,个性化药物的使用仍处于起步阶段。很少有人研究建立预测模型来估计抗抑郁药物治疗反应的方法。
技术实现思路
专利技术目的:针对上述问题,本专利技术提供一种抑郁症患者预后药效评估系统及其评估方法,能够基于患者治疗前特征进行药效预测,辅助指导医护人员做出精准治疗,提高治疗效果。技术方案:本专利技术提出一种抑郁症患者识别系统,包括数据源层、分析处理层和应用层;数据源层:用于将原始数据经过处理和清洗后作为系统的数据源;分析处理层:用于数据挖掘分析和建立预测模型;应用层:用于将分析处理层的分析结果进行展示以及提供预测模型的使用入口。进一步的,所述数据源层包括候选基因甲基化测序数据、临床数据和量表信息;所述分析处理层包括数据挖掘模块和预测模型建立模块;所述应用层包括挖掘结果展示模块和预测模型应用模块。一种如上所述的抑郁症患者预后药效评估系统的评估方法,包括如下步骤:(1)收集和整理数据,构建原始数据集,其中数据包括候选基因甲基化测序数据、临床信息和诊断量表数据;(2)对原始数据集进行数据预处理得到实验数据集;(3)对预处理之后得到的实验数据集进行数据挖掘,筛选差异特征,建立输入数据集;(4)将输入据集划分为训练数据集和测试数据集;(5)创建抑郁症患者预后药效评估的深度学习模型,利用训练数据集对创建的深度学习模型进行训练;(6)利用测试数据集对训练好的深度学习模型进行性能评估,并在评估过程中对模型进行不断优化,得到最优模型。进一步的,所述步骤(1)中收集和整理数据,构建原始数据集合的具体步骤如下:采集符合诊断标准入组的抑郁症患者的跟踪治疗数据,数据包括候选基因甲基化测序数据,临床数据,诊断量表数据。将上述3类数据整理合并作为原始数据集合。进一步的,所述步骤(2)中数据预处理包括类别特征编码、缺失值处理、异常值分析和数据标准化。原始数据集进行数据预处理之后得到实验数据集。进一步的,所述步骤(3)中数据挖掘,筛选差异特征的具体步骤如下:通过统计学方法或机器学习方法对数据进行数据挖掘,筛选出差异特征,并基于这部分特征建立模型;对实验数据集进行特征选择之后得到输入数据集。进一步的,所述步骤(4)中将输入数据集划分为训练数据集和测试数据集的具体步骤如下:将输入数据按比例分割为训练集和测试集,所述训练集和测试集比例通常为0.7:0.3或0.8:0.2。进一步的,所述步骤(5)中创建抑郁症患者预后药效评估的深度学习模型的具体步骤如下:(5.1)为训练数据集中的每一个目标位点构建一个神经网络,所述神经网络是以全连接神经网络模型与输出层sigmoid函数构建,包括输入层、隐藏层和输出层;(5.2)设定所述神经网络模型的输入层,其中,假定训练样本数为m,训练数据集中每个样本的特征数为n,则训练数据集的输入矩阵表示为X(m*n),其中所述的每一行表示一个样本的所有特征,每一列对应所述的特征数据;输入神经元个数设置为N,使用的激活函数为Relu;(5.3)设定所述神经网络每层之间采用全连接的方法,即除输入层外,模型中各个神经元存储的数据与上一层所有神经元有关;即所述神经网络模型的隐藏层,隐藏层的输入数据为输入层的输出数据,隐藏层神经元个数设置为M,使用的激活函数为Relu;(5.4)设定所述神经网络模型的输出层,其中,输出层的输入数据为隐藏层的输出数据,输出层神经元个数设置为C,使用的激活函数为sigmoid;所述sigmoid函数公式为:(5.5)将训练数据集带入构建的深度学习模型中,其中,输入神经元个数N=n=19,隐藏层1神经元个数M=12,隐藏层2神经元个数M=4,输出层神经元个数C=1,以输入向量所对应的输出值作为目标真实值训练模型。进一步的,所述步骤(6)中利用测试集对训练好的深度学习模型进行性能评估的具体步骤如下:将测试集输入到训练好的神经网络中,验证评估过程中调整模型超参数对模型进行不断优化,找到最优模型超参数合集。近年来,机器学习因其可基于患者治疗前基线特征进行疗效预测的功能逐渐被用来指导抑郁症治疗方案的选择。与传统的机器学习方法相比,深度学习表现出更高的分类准确性。基于上述考虑,我们使用深度学习基于候选基因甲基化测序数据、临床基本信息、量表信息构建抑郁症治疗结果的预测模型是可行且有效的。本专利技术采用上述技术方案,具有以下有益效果:本专利技术以多维分析、数据挖掘和深度学习技术为基础,设计能够实现抑郁症预后药效预测的模型及系统,可以揭示数据信息中隐藏的病人情况和治疗结果的趋势,辅助指导医护人员做出精准治疗,提高治疗效果并降低医疗成本。附图说明图1为本专利技术的流程图;图2为具体实施例中抑郁症患者预后药效评估模型示意图;图3为具体实施例中神经网络模型示意图;图4为具体实施例中抑郁症患者预后药效评估模型的准确性示意图;图5为本专利技术的结构示意图。具体实施方式下面结合具体实施例,进一步阐明本专利技术,但是本专利技术要求保护的范围并不局限于此。实施例1如图1~3所示,本专利技术一种基于深度学习的抑郁症患者预后药效评估方法,所述方法包括以下步骤:S1:收集和整理数据,构建原始数据集,数据包括候选基因甲基化测序数据、临床信息和诊断量表数据;S2:对原始数据集进行数据预处理得到实验数据集,数据预处理包括类别特征编码、缺失值处理、异常值分析、数据标准化等;S3:对预处理之后得到的实验数据集进行数据挖掘,筛选差异特征,建立输入数据集;S4:将输入数据集按照一定比例随机划分为训练数据集和测试数据集;S5:创建抑郁症患者预后药效评估的深度学习模型,利用训练数据集对创建的深度学习模型进行训练;S6:利用测试数据集对训练好的深度学习模型进行性能评估,并在评估过程中对模型进行不断优化,得到最优模型。在一些具体的实施例中,所述S1中收集和整理数据,构建初步数据集合的具体步骤如下:采集符合诊断标准入组的抑郁症患者的跟踪治疗数据,数据包括候选基因甲基化数据(开展药物治疗之前对抑郁症患者进行候选基因甲基化测序),临床数据(包括患者年龄、受教育水平、婚姻状况、首次发病年龄、服药状况、发病次数等基本信息),诊断量表数据(包括贝克自杀意念评分、药物不良反应评分、多伦多述情感障碍评分等访谈测评信息)。将上述3类数据整理合并作为原始数据集合。可选的,在其中一个实施例中,所述S2对原始数据集合进行数据预处理得到实验数据集的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种抑郁症患者预后药效评估系统,其特征在于,包括数据源层、分析处理层和应用层;/n数据源层:用于将原始数据经过处理和清洗后作为系统的数据源;/n分析处理层:用于数据挖掘分析和建立预测模型;/n应用层:用于将分析处理层的分析结果进行展示以及提供预测模型的使用入口。/n

【技术特征摘要】
1.一种抑郁症患者预后药效评估系统,其特征在于,包括数据源层、分析处理层和应用层;
数据源层:用于将原始数据经过处理和清洗后作为系统的数据源;
分析处理层:用于数据挖掘分析和建立预测模型;
应用层:用于将分析处理层的分析结果进行展示以及提供预测模型的使用入口。


2.根据权利要求1所述的一种抑郁症患者预后药效评估系统,其特征在于,所述数据源层包括候选基因甲基化测序数据、临床数据和量表数据;
所述分析处理层包括数据挖掘模块和预测模型模块;
所述应用层包括挖掘结果展示模块和预测模型应用模块。


3.一种如权利要求1-2所述的抑郁症患者预后药效评估系统的评估方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)收集和整理数据,构建原始数据集,其中数据包括候选基因甲基化测序数据、临床信息和诊断量表数据;
(2)对原始数据集进行数据预处理得到实验数据集;
(3)对预处理之后得到的实验数据集进行数据挖掘,筛选差异特征,建立输入数据集;
(4)将输入据集划分为训练数据集和测试数据集;
(5)创建抑郁症患者预后药效评估的深度学习模型,利用训练数据集对创建的深度学习模型进行训练;
(6)利用测试数据集对训练好的深度学习模型进行性能评估,并在评估过程中对模型进行不断优化,得到最优模型。


4.根据权利要求2所述的一种抑郁症患者预后药效评估系统的评估方法,其特征在于,所述步骤(2)中数据预处理包括类别特征编码、缺失值处理、异常值分析和数据标准化。


5.根据权利要求2所述的一种抑郁症患者预后药效评估系统的评估方法,其特征在于,所述步骤(3)中数据挖掘,筛选差异特征的具体步骤如下:通过统计学方法或机器学习方法对数据进行数据挖掘,筛选出差异特征,并基于这部分特征建...

【专利技术属性】
技术研发人员:徐治李健胡云云
申请(专利权)人:东南大学
类型:发明
国别省市:江苏;32

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