用于评价和治疗银屑病及相关疾病的标记与方法技术

本发明专利技术提供对受治疗者的皮肤相关疾病（例如银屑病）进行预后或诊断评价的方法，该方法包括将样品中基因的存在与否和／或数量与参比标准相互关联，以确定疾病的存在和／或严重程度和／或对疾病治疗的反应。本发明专利技术的方法能够鉴定出候选疗法的疗效。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及指示皮肤相关疾病(例如活动性银屑病)的表达谱(expression profile)和核酸的鉴定以及这些表达谱和核酸在《艮屑病和相 关疾病诊断中的用途。本专利技术还涉及鉴定和应用调节银屑病的候选药 物和/或耙标的方法。
技术介绍
银屑病是一种慢性炎症性皮肤病，其病理生理学基础十分复杂。 细胞组分包括增生性表皮角化细胞、浸润性单核细胞，包括T细胞、 嗜中性粒细胞、树突细胞和巨噬细胞(Barker, JN. 1994. Baillieres Clin Rheumatol 8:429-)。介导这些疾病的细胞显示出异常产生细胞因子、 趋化因子、翁着分子、蛋白酶和蛋白酶抑制蛋白等数个蛋白质家族。 这些蛋白质的功能从先天免疫和炎症延伸到细胞分化和增殖(Barker ， J等，1991. J Dermatol Sci， 2: 106-; Austin, LM 1999. J Invest Dermatol. 113:752-)。从临床研究到翻译研究显示，这些分子中至少有一些在银 屑病发展和维持中起着关键作用。一般认为，在银屑病中对产生Thl免疫应答非常重要的两种细胞 因子是白介素-12 (IL-12)和IL-23 。这两种细胞因子均由例如巨噬细胞 和树突细胞等抗原呈递细胞产生，并且通过激活T细胞和自然杀伤细 胞而起作用。IL-12和IL-23是可溶性细胞因子异二聚体家族的成员， 在IL-12中由p35/p40蛋白亚基组成，在IL-23中由pl9/p40蛋白亚基 组成。两种细胞因子中任一种的IL-12 p40亚基与存在于免疫细胞表 面的跨膜IL-12受体(31 (IL-12R1)结合。随后IL-12 p35或者IL-23 p19分别与其受体配偶体(即IL-12R2和IL-23R)结合，导致对各细胞因子特异性的免疫信号转导活动。因 此，IL-12 p額L誦12Rl相互作用的中断将抑制IL-12和IL-23两者的 生物学活性。IL-12的功能已经得到充分表征，包括干扰素-(IFN-)的 诱导、Thl细胞的分化和先天抗性与适应性免疫的衔接(Trinchieri, G. 2003 Interleukin-12 and the regulation of innate resistance and adaptive immunity (白介素-12和先天抗性与适应性免疫的调节).Nat Rev Immunol3: 133146)。虽然IL-23的许多免疫后果依然是现行研究中的 课题，但是有研究指出IL-23功能与IL-12的相似但却不完全相同 (Oppmann等，2000 /m麵w砂13: 715-725)。微阵列技术是一种强大的工具，因为它能够同时对数千种基因的 表达进行分析，而且还可以是允许高通量方式的自动化操作。在与复 杂的宿主功能有关的疾病(例如被称为自身免疫性疾病(例如银屑病) 的疾病)中，微阵列的结果能够提供基因表达谱，这可以用来设计新的 疾病诊断和管理方法。这些方法还用来鉴定新的基因以及对迄今为止 与所述疾病或病症尚无关联的未知功能的基因进行论释。基因表达可以按几种不同的方式进行调节，包括应用siRNA、 shRNA、反义分子和DNA核酶。SiRNA和shRNA均通过RNAi途径 进行，并且已经成功地用来抑制基因的表达。最早在蠕虫中发现了 RNAi ， Fire和Mello最先报道了植物中基因沉默与dsRNA相关的现 象，他们认为这是植物细胞抵御RNA病毒感染的一种方式。在这一 途径中，长的dsRNA病毒产物通过DICER样酶被加工成长度为21-25 bp的较小片段，然后双链分子解旋并且插到RNA诱导性沉默复合物 (RISC)中。在哺乳动物细胞中已经鉴定出具有显著差异的类似途径， 为了避免诱导所谓的干扰素应答，dsRNA分子的长度必需小于30 bp， 干扰素应答不是基因特异性的，会导致细胞中蛋白质合成的完全中 断。已经成功设计出选择性靶向单一基因并且可以被体外或体内递 送至细胞内的合成siRNA。 ShRNA是siRNA分子的DNA等同物，具有被掺入细胞基因组的优势，在基因组中在每个有丝分裂周期内进行 复制。DNA核酶还被用来调节基因表达。DNA核酶是切割单链RNA 的催化性DNA分子。它们对靶RNA序列具有高度选择性，因此可通 过靶向信使RNA而用于下调特异性基因。因此，有需要鉴定和表征新的基因标记，用于开发诊断和治疗自专利技术概述本专利技术涉及通过鉴定和使用调节银屑病和/或相关疾病或病症的 候选药物和/或靶标来诊断和/或治疗这些疾病或病症的方法。本专利技术 包括以下发现在银屑病患者和/或用有效减轻银屑病症状的药物进行 治疗的患者体内， 一组36个基因的表达水平发生改变。改变的表达 水平构成了表达谱，可用作指示银屑病的生物标记谱(biomarker profile) 和/或患者对治疗的反应。在一个具体的实施方案中，本专利技术包括根据构成表达谱的36个基因中一个或多个基因的表达模式对治疗银屑病的功效进行测定的 方法。例如，对于受治疗者，这可以在临床反应的其它一般测定显示 出结果之前进行。在一个实施方案中，候选药物的筛选方法包括将候 选药物不存在时的表达水平与候选药物存在时的表达水平进行比较， 其中如果候选药物存在时，候选药物的浓度可以变化，并且其中该项 比较可发生在用候选药物治疗期间或治疗之后。在一个典型的实施方 案中，细胞样本表达至少两个表达谱基因。该表达谱基因可能显示增 力口或减少。在一个实施方案中，银屑病相关基因谱(psoriasis-related gene profile)用来产生用于预后或诊断目的基于阵列的方法，该方法包括(a) 由从患者获得的样本中制备代表性的核酸混合物，用可检 测标记对混合物中的所述样品核酸进行标记；(b) 使样品与包含大量核酸区段的阵列接触，其中每个核酸区段被固定在基质表面不连续的已知地址(address)上，其中 一组银屑病 相关生物标记通过地址被鉴定为阵列的特征(feature)，其中所述阵列在 基质的已知地址上还包括至少一种校准核酸，其中接触是在其中样品 核酸可与固定在阵列上的核酸区段特异性结合的条件下进行的；(c) 将得自经治疗患者的所有试验样品与参比标准进行统计比 较5 和(d) 将试验样品各特征的强度变化模式与是银屑病相关基因谱 成员的特征的强度变化模式进行比较，所述银屑病相关基因谱具有历 史模式，其样品取自从对CNT01275治疗有反应的患者。在一个替代实施方案中，本专利技术包括试剂盒，该试剂盒用于通过 鉴定和使用调节4艮屑病和/或相关疾病或病症的候选药物和/或靶标来 诊断这些疾病或病症，并且用于根据基因表达模式来测定银屑病和/ 或相关疾病或病症的治疗效果。本专利技术的另 一 个实施方案涉及 一 组4艮屑病相关基因 (psoriasis-related gene panel)的基因转录或基因产物的激动剂和/或拮 抗剂以及使用 一组银屑病相关基因的拮抗剂来治疗银屑病或相关疾 病的方法，所述拮抗剂包括针对一组银屑病相关基因的产物的抗体。一方面， 一组银屑病相关基因的拮抗剂是与一组银屑病相关基因 的产物特异性结合的抗体。这种抗体的一个特别优势是它们能够与一 组银屑病相关本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于对受治疗者的皮肤相关疾病进行预后或诊断评价的方法，该方法包括：　ａ）从由受治疗者获得的样本制备核酸样品；　ｂ）使样品与由至少两个选自基因１－３６的成员组成的一组核酸区段接触以检测该组区段的水平；　ｃ）对照参比标准对样品进行评价以测定样品中存在的至少两个成员含量的变化值；和　ｄ）使所述变化值与皮肤相关疾病的存在或消退相互关联。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：B阿梅加奇，J本森，C黄，X李，G刘，
申请(专利权)人：森托科尔公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]