用于提高峰的检测的过滤装置和方法制造方法及图纸

技术编号:2618707 阅读:127 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了用于在质谱数据中提高峰的识别的过滤器和方法。尤其是,本发明专利技术包括为了纯化用于生成质谱数据的生物液体的目的而使用排孔过滤器的方法。本发明专利技术的方法可以用于在质谱数据中强化相关的峰,所述质谱数据是用于识别和诊断疾病或者用于预测对具体疾病治疗产生反应的。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】 专利
本专利技术涉及在质谱数据中提高峰的识别的方法,所述质谱数据是 用于在人类中早期预测、检测疾病以及对疾病治疗的反应的。
技术介绍
细胞和有机体的健康是通过蛋白质及其所含有的其它分子所反映 的。蛋白质以及其它分子例如脂质体和碳水化合物的检测、识别和定 量可以促进疾病机理的阐明,疾病的早期;险测,疾病的预测和对治疗 的评价。基因组研究的新发展已经成功地识别出与各种疾病相关的许多基 因。然而,虽然基因组研究能够识别与疾病之间具有遗传性倾向的基 因,但是仍然需要表征和识别可能存在于单独患者中的标记例如蛋白 质。"标记" 一般是指多肽或者其它分子,它们的生物学状态不同于其 它个体。最近开发的分子检测方法已经能够测定这些分子中的大部分, 这样可以开发大量的新的指标方法用于疾病的4企测、预防和治疗。为 了有效地实施,这样的方法通常需要具有在低浓度的情况下,从数百 或数千个不同化合物的混合物中识别单独分子或标记的能力。质语方法的使用代替了凝胶作为生物鉴定所选择的方法。示例'性的质谱形式包括基质辅助激光解吸/离子化质谱(MALDI),参见,例 如美国专利No. 5,118,937和美国专利No. 5,045,694,以及表面强化激 光解吸/离子化质语(SELDI),参见,例如美国专利No. 5,719,060。在 全面检测和监视细胞功能的微小变化方面,质谱相对于其它技术的优 势在于具有迅速廉价地测量几微升生物液体中数千个成分的能力。例 如,由于基因改变所导致的疾病过程,例如癌症,产生了改变的蛋白 质产物,其在血液中以改变了大小的多肽和其它分子的形式循环。质 谱能够4企测这样的产物继而诊断和分析疾病。虽然许多混合液体例如血清的质谱图难于进行目测分析,但是已 经能够使用计算的方法辨别来自受影响个体与未受影响个体的图之间 的细微差别。改善实验灵敏度的努力已经导致在生物样品相关性的分析中应用大量的质谱形式。除了质谱技术方面的改革以外,人们还研 究了吸附被分析物("片段")的底物,改进了早期的设计。然而,迄 今为止,这些方法已经被证明是不足以将质镨检验的灵敏度改善到可 接受水平的。因而,随着它们净皮用于早期疾病诊断,疾病预测,监一见疾病进展 或者对治疗产生反应的方法中以及用于识别哪些患者可能受益于具体 的治疗,仍需要改善质谱检验灵敏度的方法。专利技术简述本专利技术涉及在质谱数据中提高峰的识别的方法,所述质谱数据是 用于在人类中早期预测、才企测疾病以及对疾病治疗的反应的。本专利技术的 一个实施方式包括测定疾病发生积无率的方法。该方法可以包括通过排孔过滤器(hole array filter)过滤生物液体的步骤,由过 滤的生物液体生成质语数据的步骤,以及将该质语数据与数据库进行 比较的步骤。法。该方法可以包括在通过排孔过滤器过滤第一套样品之后,由来自 对疾病A的治疗产生反应的人群的第一套样品生成第一套质谱数据的 步骤,和在通过排孔过滤器过滤笫二套样品之后,由来自对疾病A的 相同治疗不产生反应的人群的第二套样品生成第二套质谱数据的步 骤。该方法也可以包括将第 一 套和第二套质语数据中的相应峰进行比 较的步骤,其中相应峰中的差异表示,所述峰代表了至少一种标记, 其表示对疾病A的治疗产生反应的可能性。在识别至少一种标记之后, 可以^使用所述至少一种标记来预测对疾病治疗产生反应的可能性。在 一个实施方式中,过滤第一套样品的排孔过滤器结构和过滤第二套样 品的排孔过滤器结构基本上是相同的。在另一个实施方式中,过滤第 一套样品的排孔过滤器和过滤第二套样品的排孔过滤器是分离的排孔 过滤器。在另一个实施方式中,各个样品是通过分离的排孔过滤器过 滤的。本专利技术的另 一 个实施方式包括在质语方法中提高峰的识别的方 法。该方法可以包括通过排孔过滤器过滤样品的步骤和由该样品产生 质谱数据的步骤。本专利技术的又一个实施方式可以包括在疾病检测中增加灵敏度和特 异性的方法。该方法可以包括在通过排孔过滤器过滤第一套生物液体样品之后,由来自患有疾病A的人群的第一套生物液体样品生成第一套质谱数据的步骤,和在通过排孔过滤器过滤第二套生物液体样品之后,由来自没有疾病A的人群的第二套生物液体样品生成第二套质谱 数据的步骤。该方法还可以包括将第 一套和第二套质谱数据进行比较 的步骤,其中第一套和第二套质谱数据中相应峰之间的差异表示至少 一种疾病A的阴性标记。在一个实施方式中,过滤第一套样品的排孔 过滤器结构和过滤第二套样品的排孔过滤器结构基本上是相同的。在 另一个实施方式中,过滤第一套样品的排孔过滤器和过滤第二套样品 的排孔过滤器是分离的排孔过滤器。在另一个实施方式中,各个样品 是通过分离的排孔过滤器过滤的。进一步地,本专利技术的一个实施方式可以包括一种过滤生物液体的 装置,其是用于预测对疾病治疗的反应的,所述装置包括至少一个排 孔过滤器。来自对疾病A治疗产生反应的人群的第一套样品可以通过 至少一个排孔过滤器过滤,并且第一套质谱数据可以在通过至少一个 排孔过滤器过滤之后由第一套样品生成。来自对疾病A相同治疗不产 生反应的人群的第二套样品也可以通过至少一个排孔过滤器过滤,并 且第二套质镨数据可以在通过至少一个排孔过滤器过滤之后由第二套样品生成。另外,可以比较第一套和第二套质谱数据中的相应峰,其 中相应峰的差异表示,所述峰代表了至少一种标记,其表示对疾病A 的治疗产生反应的可能性。在一个实施方式中,至少一个排孔过滤器 包括至少一个笫一排孔过滤器和至少一个笫二排孔过滤器,它们各自 具有基本上相同的结构。至少一个第一排孔过滤器可以用于过滤第一 套样品,至少一个第二排孔过滤器可以用于过滤第二套样品。每种样 品可以通过分离的排孔过滤器过滤。进一步地,本专利技术的一个实施方式可以包括一种过滤生物液体的 装置,其是用于通过测量过滤后生物液体的质谱数据检测疾病的,所 述装置包括至少一个排孔过滤器。来自患有疾病A的人群的第一套生 物液体样品可以通过至少 一 个排孔过滤器过滤,并且第 一 套质谱数据 可以在通过至少一个排孔过滤器过滤之后由第一套生物液体样品生 成。来自没有疾病A的人群的第二套生物液体样品也可以通过至少一个排孔过滤器过滤,并且第二套质谱数据可以在通过至少一个排孔过 滤器过滤之后由第二套生物液体样品生成。另外,可以比较第一套和 第二套质谱数据,其中笫 一套和第二套质谱数据相应峰之间的差异表 示至少一个疾病A的阴性标记。在一个实施方式中,至少一个排孔过 滤器包括至少一个第一排孔过滤器和至少一个第二排孔过滤器,它们 各自具有基本上相同的结构。至少一个第一排孔过滤器可以用于过滤 第一套样品,至少一个第二排孔过滤器可以用于过滤第二套样品。每 种样品可以通过分离的排孔过滤器过滤。进一步地,本专利技术的一个实施方式可以包括一种过滤生物液体的 装置,其是用于在质谱方法中提高峰的识别的,所述装置包括排孔过 滤器。生物液体样品可以通过排孔过滤器过滤,质谱数据可以由过滤 后的生物液体样品生成。进一步地,本专利技术的一个实施方式可以包括一种才企测至少一种阴 性标记的方法,所述阴性标记是用于才企测疾病的。该方法可以包括在 通过排孔过滤器过滤第一套生物液体样品之后,由来自患有疾病人群 的第 一 套生物液体样品生成第 一 套质谱数据本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测疾病可能性的方法,所述方法包括: 通过排孔过滤器过滤生物液体; 由过滤后的生物液体生成质谱数据;和 将该质谱数据与数据库进行比较。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:C穆恩高野敦
申请(专利权)人:坎根生物科技公司大日本印刷株式会社
类型:发明
国别省市:US[美国]

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