EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒制造技术

技术编号:25885984 阅读:40 留言:0更新日期:2020-10-09 23:20
本发明专利技术提供了一种EGFR基因第19号外显子E746‑A750dell缺失突变检测试剂盒,具有这样的特征,包括:用于对EGFR基因进行扩增的第一引物组,该第一引物组包括第一上游引物与第一下游引物,其中,第一上游引物的序列为GGATTTCCTTGTTGGCTTTCGGAGATGTTTTG,第一下游引物的序列为ATGCCTCCATTTCTTCATCC。

【技术实现步骤摘要】
EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒
本专利技术涉及一种基因检测试剂盒,具体涉及一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒。
技术介绍
E746-A750dell缺失突变是肺癌的一种,为EGFR第19号外显子缺失突变。EGFR表达于正常上皮细胞表面,而在一些肿瘤细胞中常过表达,EGFR的过表达与肿瘤细胞的转移、侵润、预后有关。因此,检测E746-A750dell缺失有助于筛选适合人群用于靶向治疗,以及判断酪氨酸激酶抑制剂(TKI)药物的疗效。现有技术中,一般采用荧光定量与二代测序相结合的方法对E746-A750dell缺失突变进行检测。但是,上述方法对于实验环境要求非常严格,操作起来十分复杂,并且检测成本高,应用、推广起来较为困难。
技术实现思路
本专利技术是为了解决上述问题而进行的,目的在于提供一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒。本专利技术提供了一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,具有这样的特征,包括:用于对EGFR基因进行扩增的第一引物组,该第一引物组包括第一上游引物与第一下游引物,其中,第一上游引物的序列为GGATTTCCTTGTTGGCTTTCGGAGATGTTTTG,第一下游引物的序列为ATGCCTCCATTTCTTCATCC。在本专利技术提供的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒中,还可以具有这样的特征,还包括:用于对EGFR基因进行扩增的第二引物组,该第二引物组包括第二上游引物与第二下游引物,其中,第二上游引物的序列为GCCTAGACGCAGCATCATAA,第二下游引物的序列与第一下游引物的序列相同。在本专利技术提供的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒中,还可以具有这样的特征:其中,第一上游引物的浓度为8μM~12μM,第一下游引物在的浓度为8μM~12μM。在本专利技术提供的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒中,还可以具有这样的特征,还包括:其中,PCR混合液,其中,PCR混合液由PCR缓冲液、三磷酸脱氧核苷酸、TaqDNA聚合酶、KCL以及UDG酶混合而成。在本专利技术提供的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒中,还可以具有这样的特征:其中,PCR混合液中PCR缓冲液的浓度为20mM,三磷酸脱氧核苷酸的浓度为500μM,TaqDNA聚合酶的浓度为0.1U,KCL的浓度为100mM,UDG酶的浓度为0.1U/μL。专利技术的作用与效果根据本专利技术所涉及的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,因为该试剂盒包括第一引物组,第一引物组具有第一上游引物,该第一上游引物包括23个碱基,其中前29个碱基与EFGR序列完全互补,后3个碱基(TTG)与746-A750dell缺失后的碱基相互补并且与746-A750dell野生型的碱基不互补,因此通过该第一上游引物能够对746-A750dell缺失的DNA进行特异性扩增,然后只需要对扩增产物进行测序后就能够判断所检测的DNA是否发生了EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变。此外,通过本专利技术的试剂盒对DNA进行E746-A750dell缺失突变检测时,只需要进行PCR以及测序即可,这一过程仅需普通实验环境即可进行,操作方法简单易行,成本低,易于推广应用。附图说明图1是本专利技术的实施例二中用第二引物组对纯野生型DNA进行检测的检测结果图;图2是本专利技术的实施例二中用第二引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:1的混合DNA进行检测的检测结果图;图3是本专利技术的实施例二中用第二引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:10的混合DNA进行检测的检测结果图;图4是本专利技术的实施例二中用第二引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:100的混合DNA进行检测的检测结果图;图5是本专利技术的实施例二中用第一引物组对纯野生型DNA进行检测的检测结果图;图6是本专利技术的实施例二中用第一引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:1的混合DNA进行检测的检测结果图;图7是本专利技术的实施例二中用第一引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:10的混合DNA进行检测的检测结果图;以及图8是本专利技术的实施例二中用第一引物组对野生型DNA:突变型DNA=1:100的混合DNA进行检测的检测结果图。具体实施方式为了使本专利技术实现的技术手段、创作特征、达成目的与功效易于明白了解,以下实施例结合附图对本专利技术EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒作具体阐述。以下实施例中,所使用的DNA提取试剂盒(血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒(DP304),购自天根生化科技(北京)有限公司)为市售试剂盒。<实施例一>本实施例提供了一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,用于对DNA进行EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测,包括第一引物组、第二引物组以及PCR混合液。第一引物组包括第一上游引物和第一下游引物。第一上游引物的序列为GGATTTCCTTGTTGGCTTTCGGAGATGTTTTG。第一上游引物的前29个碱基与能够与DNA上的EFGR序列完全互补,后3个碱基(TTG)与746-A750dell缺失突变后的碱基相互补并且与746-A750dell野生型(即,未发生746-A750dell缺失突变)的碱基不互补,因此,第一上游引物能够对746-A750dell缺失突变的DNA进行特异性扩增。第一下游引物的序列为ATGCCTCCATTTCTTCATCC。第一下游引物为EGFR基因161111-161131区域的互补序列。因此,该第一下游引物对746-A750dell缺失突变与野生型无区分作用。第一上游引物的浓度为8μM~12μM,第一下游引物的浓度为8μM~12μM。在本实施例中,第一上游引物的浓度为10μM,第一下游引物的浓度为10μM。所以,通过第一引物组能够对发生了746-A750dell缺失突变的DNA进行扩增。第二引物组包括第二上游引物与第二下游引物。第二上游引物的序列为GCCTAGACGCAGCATCATAA。第二上游引物为EGFR基因160395-160414区域的碱基。因此,该第二上游引物对746-A750dell缺失突变与野生型无区分作用。第二下游引物的序列与第一下游引物的序列相同。所以,通过第二引物组既能够对发生了746-A750dell缺失突变的DNA进行扩增,又能够对未发生746-A750dell缺失突变的(野生型)DNA进行扩增。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,其特征在于,包括:/n用于对EGFR基因进行扩增的第一引物组,该第一引物组包括第一上游引物与第一下游引物,/n其中,所述第一上游引物的序列为GGATTTCCTTGTTGGCTTTCGGAGATGTTTTG,/n所述第一下游引物的序列为ATGCCTCCATTTCTTCATCC。/n

【技术特征摘要】
1.一种EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,其特征在于,包括:
用于对EGFR基因进行扩增的第一引物组,该第一引物组包括第一上游引物与第一下游引物,
其中,所述第一上游引物的序列为GGATTTCCTTGTTGGCTTTCGGAGATGTTTTG,
所述第一下游引物的序列为ATGCCTCCATTTCTTCATCC。


2.根据权利要求1所述的EGFR基因第19号外显子E746-A750dell缺失突变检测试剂盒,其特征在于,还包括:
用于对EGFR基因进行扩增的第二引物组,该第二引物组包括第二上游引物与第二下游引物,
其中,所述第二上游引物的序列为GCCTAGACGCAGCATCATAA,
所述第二下游引物的序列与所述第一下游引物的序列相同。


3.根据权利要求1所...

【专利技术属性】
技术研发人员:梁晓飞孙开宇
申请(专利权)人:苏州举健生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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