本发明专利技术涉及病毒学领域。本发明专利技术提供分离的属于冠状病毒的实质为哺乳动物的正义单链ＲＮＡ病毒（ＳＡＲＳ）及其组分。分析了ＰＥＧ化的干扰素－α对ＳＡＲＳ感染的影响。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及病毒学领域，更具体涉及新的冠状病毒。具体提供编码病毒蛋白(部分)的序列。此外，本专利技术涉及用于诊断、预防和/或治疗疾病，具体是呼吸道疾病(非典型肺炎)，具体是哺乳动物的，更具体是人的该疾病的诊断方式和方法，预防方式和方法和治疗方式和方法。本专利技术的另一实施方案涉及干扰素的用途，优选聚乙二醇化的干扰素用于预防或治疗感染冠状病毒的动物，优选脊椎动物，更优选鸟类或哺乳动物，尤其是人，猿或啮齿动物，更具体是感染SARS相关的冠状病毒(SARS-CoV)的动物，优选人。最近，由于一种新的病毒在人体的致病作用结合相对容易的飞沫传播而导致全球健康危机。该病毒首先在中国广东省发现，在2003年2月传播到香港，在两个月内其扩散到全世界数个国家，导致2300例感染者中78例死亡(New Scientist Online News 1325 02 April2003)。该病毒被命名为SARS(严重急性呼吸综合症)病毒并导致人的呼吸疾病(非典型肺炎)。该病症通常以发热开始，有时伴随寒冷或其他症状，包括头疼、皮疹、腹泻、感觉不适(不舒服)和躯体疼痛。一些人还在发病初期感受到轻微的呼吸综合症。2到7天后，SARS病人发展为干咳，伴随有或发展到没有充足的氧气进入血液，可见为呼吸急促。在10％到20％的情况中，病人需要机械强制呼吸，最终该疾病可能导致病人死亡。医院人员，儿童，老人和患有例如糖尿病或心脏病的人，或免疫系统低下的人形成高危人群。看起来经常发生与其他病原体的共同感染，尤其是与机会致病微生物，如人肺炎后病毒(human metapneumovirus)(hMPV)，衣原体等。该病毒的潜伏期通常为2-7天，该疾病通过感染SARS的病人咳嗽或打喷嚏的飞沫在空气中传播。目前尚未知该疾病是否可治愈。已经使用了数种抗病毒疗法，但结果各不相同。此外，为防止疾病的传播，重要的是能够在早期识别该疾病。只有这样才可以采取充分的措施隔离病人并开始隔离检疫。目前还没有适当诊断工具。因此，对开发该疾病的诊断工具和治疗有着很大的需求。本专利技术提供属于冠状病毒的分离的实质为哺乳动物的正义单链RNA病毒的核苷酸序列，该RNA病毒是SARS的致病因子。从该病毒序列(附图说明图1)的系统发生分析来看，该病毒处于一方面由TGEV(传染性胃肠炎病毒)，PEDV(猪流行性腹泻病毒)和229E(人冠状病毒229E)形成的组，和另一方面由BoCo(牛冠状病毒)和MHV(鼠肝炎病毒)形成的组，以及另外一方面AIBV(禽感染性支气管病毒)之间的中间物。总的来说，牛冠状病毒看起来更相似(至少对于病毒复制酶蛋白而言)。尽管系统发生学分析提供了鉴定病毒如SARS病毒的方便方法，此处还提供其他几种虽然有些粗糙但可能更直接的鉴定所述病毒或所述病毒的蛋白和核酸的方法。根据经验，SARS病毒可以通过将待鉴定的病毒、蛋白或核酸与此处鉴定的病毒蛋白或核酸的序列同源性百分比而鉴定。已知病毒种类，尤其RNA病毒，经常构成其中一群所述病毒显示与其他成员异质性的准种类。因此预期各分离株可能与此处提供的分离株的序列具有一定百分比的差异。当试图将病毒分离株与图2所列的序列进行比较时，本专利技术提供属于冠状病毒的分离的实质为哺乳动物的正义单链RNA病毒(SARS)，该病毒还可以通过测定所述病毒的核酸序列，以及测定该核酸序列与图2所列的序列的核酸一致性百分数，比与BoCo，AIPV和PEDV的鉴定的核酸一致性百分数高，从而鉴定与冠状病毒在系统发生上是对应的。相似的，属于冠状病毒的分离的实质为哺乳动物的正义单链RNA病毒(SARS)，其还可以通过测定所述病毒的氨基酸序列，以及测定该氨基酸序列与图2所列的氨基酸序列的同源性百分比，基本上比此处提供的与BoCo，AIPV和PEDV比较的百分比高，从而鉴定与冠状病毒在系统发生上是对应的。在该SARS病毒序列信息的基础上，本专利技术提供用于诊断、预防和/或治疗疾病，尤其是呼吸疾病(非典型肺炎)，具体是哺乳动物，更具体是人的呼吸疾病的诊断方式和方法，预防方式和方法和治疗方式和方法。在病毒学中，最提倡的是特定病毒感染的诊断、预防和/或治疗以对导致所述感染的特定病毒最特异性的试剂来进行。这种情况下这表明优选SARS病毒感染的诊断、预防和/或治疗以对SARS病毒最特异性的试剂来完成。然而这不排除特异性稍弱但足够交叉反应的试剂被替代使用，例如，由于它们最容易获得和足以解决紧迫的问题。例如本专利技术提高动物，具体是哺乳动物，更具体是人类的SARS感染的病毒学诊断的方法，包括通过将样品与SARS特异性核酸与本专利技术的抗体反应来测定所述动物的样品中病毒分离株或其组分的存在；以及血清学诊断哺乳动物SARS感染的方法，包括通过将所述样品与本专利技术的SARS病毒特异的蛋白类(proteinaceous)分子或其片段或抗原反应来测定所述哺乳动物样品中特异性针对SARS病毒或其组分的抗体的存在。本专利技术还提供诊断SARS感染的试剂盒，包含本专利技术的SARS病毒，SARS病毒特异的核酸，蛋白类分子或其片段，抗原和/或抗体，优选是检测所述SARS病毒，SARS病毒特异的核酸，蛋白类分子或其片段，抗原和/或抗体的方式，所述方式例如包括本领域使用的可激发的基团如荧光团和酶检测系统(合适的诊断试剂盒形式的例子包括IF，ELISA，中和分析，RT-PCR分析)。为测定是否尚未鉴定的病毒组分或其合成的类似物例如核酸，蛋白类分子或其片段可以被鉴定为SARS病毒特异的，使用例如此处提供的系统发生分析，通过序列同源性比较，将所述组分的核酸或氨基酸序列，例如一段核酸或氨基酸，优选至少10个，更优选至少25个，更优选至少40个核苷酸或氨基酸(分别)，与提供的SARS病毒序列比较，和与已知的非SARS病毒序列(优选使用BoCo)比较来分析是足够的。根据与SARS或非SARS病毒序列相关程度，可以鉴定组分或合成的类似物。因此本专利技术提供新的致病因子的核苷酸序列，分离的属于冠状病毒科的实质为哺乳动物的正义单链RNA病毒(此处也称作SARS病毒)，和SARS病毒特异的组分或其合成的类似物。冠状病毒首先在1937年从鸡中分离到，而第一个人冠状病毒的体外增殖由Tyrell和Bonoe在1965年完成。现在这一家族大约有13个种，其感染牛，猪，啮齿动物，猫，狗，鸟和人。冠状病毒颗粒是不规则形状的，直径大约60-220nm，具有带区别性‘棒状’的包膜粒(在远端为大约20nm长和10nm宽)的外膜。该“冠状”的外观使得这一家族命名为冠状病毒。外膜带有两种糖蛋白S，与细胞融合相关的刺突糖蛋白，其是主要的抗原，和M，膜糖蛋白，其与出芽和外膜形成有关。基因组与命名为N的碱性磷蛋白有关。冠状病毒的基因组，单链正义RNA，长度通常为27-31Kb并包含5＇甲基化的帽和3′poly-A尾，通过该RNA能直接在受感染的细胞中起mRNA作用。起初5′ORF 1(大约20Kb)被翻译产生病毒聚合酶，其然后产生全长负义链。负义链被用作模板产生作为“嵌套组”转录本的mRNA，所有的mRNA都具有相同的72核苷酸的5′非翻译的前导序列和一致的3′多聚腺苷酸化的末端。如此产生的各mRNA是单顺反子的，5′端的基因从最长的mRNA开始翻译等等。这些不平常本文档来自技高网...
【技术保护点】
分离的实质为哺乳动物的正义单链ＲＮＡ病毒（ＳＡＲＳ），含有图２的一个或多个序列。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：巴托洛梅乌斯莱昂纳德斯哈格曼斯，泰斯库伊肯，罗纳尔杜斯阿德里亚努斯马里亚富希耶，艾伯塔斯多米尼克斯马尔切利纳斯叶拉，
申请(专利权)人：科罗诺瓦蒂夫股份有限公司，
类型：发明
国别省市：NL[荷兰]
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